基因總覽
TEAD1 是蛋白質編碼基因,產物 TEA domain transcription factor 1 屬於轉錄因子。其名稱反映蛋白質具有 TEA domain;此蛋白質也能辨識特定 DNA 調控序列。來源指出它參與 Hippo 訊息傳遞,並與心臟發育相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000527636 ★ | 12,674,421–12,944,737 | 13 |
| ENST00001141915 | 12,674,371–12,944,751 | 13 |
| ENST00000334310 | 12,674,381–12,944,751 | 12 |
| ENST00000527575 | 12,674,381–12,944,751 | 11 |
| ENST00000527376 | 12,674,617–12,764,434 | 2 |
| ENST00000526600 | 12,879,443–12,944,751 | 8 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEAD1 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子。此路徑參與器官大小控制與腫瘤抑制,其核心包含激酶級聯反應:MST1/MST2 與調節蛋白 SAV1 形成複合體,磷酸化並活化 LATS1/2;LATS1/2 再與調節蛋白 MOB1 形成複合體,進而磷酸化並抑制致癌蛋白 YAP1 及 WWTR1/TAZ。
TEAD1 透過調節 YAP1 與 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與控制細胞增殖與遷移,並調節上皮-間質轉化(EMT)的誘導。來源描述其對這些過程的調控,並未提供更細的分子步驟或方向性細節。
在 DNA 調控方面,TEAD1 可結合 M-CAT motif,並以專一且協同的方式結合 SPH 與 GT-IIC enhansons(5'-GTGGAATGT-3')。它能在體內活化轉錄,但此作用具有細胞特異性;來源指出,轉錄活化似乎由一種量有限、且具細胞特異性的轉錄中介因子(TIF)介導。
此外,TEAD1 與心臟發育有關。來源未進一步說明其在心臟發育中的具體作用機制,因此不宜據此推定特定發育階段或細胞效應。
Promoter 與基因調控
>TEAD1 ENST00000527636 GRCh38 chr11:12673421-12674521 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAAATAATTATAACAATCACCCGAAACTTTAGACGGTTCTGTCCCCAGTGGGTCGATTTTACCCGTTTTC TGATTTACCGACTGCGTCTATGTCACTTTTGCGTCACTACCTCCAATGGCAGGGTTAAAATGATTCCTTT AATAATGAAATGAAGTTTCTCAATAATGAAAGGGCTAACTTAAAGTCGCCGGATGCAGCATTTCAAAGTT TAGGAAGTTACTTTTGAAAAGTACAACCGGCAGAGATGAGTGAACTTAGTTTTTTAACTGACTTGGAGAA GACCTTGCTAGCAGGGCAGGTTTATTACGAACTCTGTAATTATCCTTCTTTGCTAAGCTAAAGGTTTTCC TTTCCCAACCGTAAGACAGATTTCGACTTGAGTGAGAGCTGTGAACTTTTATAAAAGTGAAAGGGAAGAG AAGAAATGGCAGGCTGGGAATCTGGCCCGGAGACGGCGTCCACCGCGCTCGAGAGCAACAATCTGCATCA CCAGAAAGGCAACTTCTCTACCCTACACTTGCAGACTTCCGCGAGTCCGGGAGCACTCAACGCAGTCACC CGCGCTTCCGCGTCCCGGACTAGGGAAACTGAGGCACGGTAGGCGCGTCGCGCGCAACTCCCGCCTCGGC GCCTGCCCCCTGGAAGAAACCCAGGCTTCCAGAGTTCTTCGCGCGAGCGCAGGGACTTCCAAGCCGCGCA GCTCCCGTCCGCCCCGCCCCGCCCCGCCCCGGCTCGGGACAAAGCCCGGAGCCCGCGCCGGGAGACGGAG GGCGGCTCCCGCGCGAGCCACGCTCCCCCGTGGGCGCGAGACTCCGCCCAGCTGCCGAAAGCCCGCGCCC CAACGGCGAAGCAGCCGCGCCGGTCCGCCCCGATTCCCCATGACGTCACCGGCGGCGGCAGGCCCCGCCT CCAGCCCCGGGCGGCAGGCCGCATGACGTCACCGAGGCCCCACCCCTCCGGAGCGAGTTCGGTCCTGGCG TTCATTTCATTCCTGTCCTCATTCCGAACATTCTTAGCATCGCTCGCGCCGCGCCGCGCCGCCTGAGCCG AGCCGAGCCTCTGCTGCCGCCGCCGCGGCCCCGCCGCCCGCCGCGGGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEAD1_1 ↗ | 11:12,674,421 | 正股 | 12,674,372–12,674,431 |
| TEAD1_3 ↗ | 11:12,675,093 | 正股 | 12,675,044–12,675,103 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_8D3K9 · enhancer · 12670069–12670311 · regulatory
ENSR11_8D3KN · enhancer · 12670814–12670996 · regulatory
ENSR11_972SB · promoter · 12673931–12674431 · regulatory
ENSR11_972SL · promoter · 12675013–12675513 · regulatory
ENSR11_C38XZ · enhancer · 12675514–12676830 · regulatory
ENSR11_B4HX5 · enhancer · 12677051–12677744 · regulatory
ENSR11_7Q5GW · enhancer · 12678195–12678303 · regulatory
ENSR11_972TS · enhancer · 12679304–12679788 · regulatory
· motif · 12673944–12673955 · motif
· motif · 12673944–12673955 · motif
· motif · 12673983–12673994 · motif
· motif · 12673983–12673994 · motif
· motif · 12674298–12674311 · motif
· motif · 12674298–12674311 · motif
· motif · 12674351–12674364 · motif
· motif · 12674351–12674364 · motif
· motif · 12675469–12675480 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:426 aa
TEAD1 蛋白質長 426 個胺基酸。其 TEA DNA 結合區位於第 28–104 位胺基酸;第 1–31 位被註記為無序區,與 DNA 結合區部分重疊。轉錄活化區域位於第 167–426 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- RAD51Q06609 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- vgQ26366 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- A2MP01023 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTSDP07339 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PINK1Q9BXM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNCAP37840 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM3O75382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL3A8MV65-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WWTR1Q9GZV5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TEAD1 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用;來源未進一步界定此處交互作用的複合體組成或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
TEAD1 與 Sveinsson chorioretinal atrophy(SCRA)相關;來源指出,影響此基因的變異會造成該疾病。SCRA 的特徵為自視神經盤向外放射的對稱性病灶,涉及視網膜與脈絡膜。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEAD1 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子;該路徑藉限制增殖並促進細胞凋亡,參與器官大小控制與腫瘤抑制。TEAD1 調節 YAP1、WWTR1/TAZ 的基因表現,進而涉及細胞增殖、遷移及 EMT 誘導;它也能結合特定 DNA 調控序列並在體內活化轉錄,此作用具有細胞特異性,且似乎由量有限的細胞特異性 TIF 介導。另與心臟發育有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds specifically and cooperatively to the SPH and GT-IIC 'enhansons' (5'-GTGGAATGT-3') and activates transcription in vivo in a cell-specific manner. The activation function appears to be mediated by a limiting cell-specific transcriptional intermediary factor (TIF). Involved in cardiac development. Binds to the M-CAT motif PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗ |
| 交互作用 | TEAD1 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用;此敘述未提供更進一步的結合條件或複合體資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TEAD1 的細胞內定位為細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 TEAD1 的基因變異會造成 Sveinsson chorioretinal atrophy(SCRA)。此疾病以自視神經盤放射狀延伸的對稱病灶為特徵,病灶涉及視網膜與脈絡膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sveinsson chorioretinal atrophy SCRA Characterized by symmetrical lesions radiating from the optic disk involving the retina and the choroid. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 108985 PMID 15016762 ↗ · PMID 18579750 ↗ · PMID 20123905 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATTCCGAACATTCTTAGCATCGCTCGCGCCGCGCCGCGCC40GCCTGAGCCGAGCCGAGCCTCTGCTGCCGCCGCCGCGGCC80CCGCCGCCCGCCGCGGGCGCCCACCAAGCACTTTGCAGAC120TCGCTTCCACCCTGCGGGCCATTCCGCGCGGCGGGGCCCG160GGCCCGGGGCGGCCGCGTCCAGGCACAGGCCATGCAGTGA200CGCCCCCCCACCCCTCCACCTTTGCCCGGAGCGCGGGCAG240CAGCCCAGCGCGCCAGCCGGCCCCGGGGCAGGAGCGGTGC280TAGGCAGGGGTGGGGTGGCCGGGCCCAGGGACCGGGAGCC320GGGGAGGGAGCCGGGCACCGAGCAGAGGGCGGGGGAAGCG360GCGCCGAAGTTTGCCTCGGACTCGCCGGGCGCTGCGGTGG400CTCCCTGGGCCGAGGACTGTTGCTGCCGCTGCCGCCGCCG440CTTCATTGCACATTCAAGTGGAAAATTTTCAGGAGTCAGC480AGAAACATTGTGTCCAAAAAAGACTGAGTCGCAGTTACCA520CCAAACCCAGGAGGAGACTCTCCCTGGAAAACTTCCCTTC560CCTTTCGGTTTATTTTCTTGAAAAGGCTCCAGGCTTCGGC600TTGGAAAATCCCACCGCCAAAATTGAGCCCAGCAGCTGGA640GCGGCAGTGAGAGCCCTGCCGAAAACATGGAAAGGATGAG680TGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGG720GTCTGGAGCCCCGACATCGAGCAAAGCTTTCAGGAGGCCC760TGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTT800ATCAGACGAAGGCAAAATGTATGGTAGGAATGAATTGATA840GCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCA880GAAAACAGGTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAG920GAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGATCAGACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。