基因總覽
TDO2 是人類的蛋白質編碼基因，正式名稱為 tryptophan 2,3-dioxygenase。其產物屬於 tryptophan 2,3-dioxygenase 家族，是一種含血基質的雙加氧酶。每個亞基可結合一個 heme group；蛋白質以同源四聚體形式組成，四聚體由兩個二聚體構成。這些性質說明 TDO2 產物具有含輔基的酵素組成與多亞基結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000536354 ★ | 155,903,696–155,920,406 | 12 |
| ENST00000506072 | 155,854,762–155,910,110 | 8 |
| ENST00000507590 | 155,854,771–155,910,062 | 7 |
| ENST00000874684 | 155,903,683–155,920,414 | 11 |
| ENST00000874685 | 155,903,683–155,920,414 | 8 |
| ENST00000874686 | 155,903,683–155,920,405 | 12 |
| ENST00000874687 | 155,903,683–155,920,414 | 12 |
| ENST00000874688 | 155,903,683–155,920,414 | 12 |
| ENST00000874689 | 155,903,683–155,920,414 | 4 |
| ENST00001121006 | 155,903,683–155,920,405 | 12 |
| ENST00001121007 | 155,903,683–155,920,404 | 12 |
| ENST00001121008 | 155,903,683–155,920,414 | 11 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TDO2 產物催化 L-tryptophan 的氧化裂解，反應中涉及其吡咯環與 indole moiety，並將 L-tryptophan 轉換為 N-formyl-L-kynurenine。這項反應是 L-tryptophan 經 kynurenine pathway 分解的起始步驟之一，來源將其標示為通往 L-kynurenine 的第 1／2 步。
反應以 L-tryptophan 和 O2 為底物，生成 N-formyl-L-kynurenine，屬於胺基酸分解代謝的一環。每個亞基結合一個 heme group；此含血基質特徵與其雙加氧酶身分相符。現有資料支持其催化反應、底物與產物，以及在 kynurenine pathway 中的位置，但未提供更多反應調控或其他生理作用細節。
Promoter 與基因調控
>TDO2 ENST00000536354 GRCh38 chr4:155902696-155903796 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCTTGGGGCAATTGTTTAGAGCTTAGATTAATAAATGATGTTTCAAGGAAGAATATTTTTATCACTGAC ACTGTATAGAATTATGGGCACATGGCTATTATTGGTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTTG TTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTGCCATGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCT CCACCTCCTGGGTTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCACCAC CTTGCCTGGCTAATTTTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATAGAGTTTCGCTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGA ACTACTGTTTTAAAATTCTATATAGGCAATGTATGCTAATGTGGATGACTGCTAGCTACCCTGTCATTGG TATGCCACAGATGAATAGTAAACTGATAATGTTCATTTAAATTCCAATACAATGTGTTGAGAGCTTAACT GCTGCTGATTATTACATGATATTTAGGTCAGAAGAACTCTGATGATTGAATGGAAGTGGGCTTTGAGCAT GTACCCAGACTTTATTATACAGTTAATTTCCCTAGAGGTGTTAAATTTCAGTTTTTGGTCTAGAAGCTGT AAGAATATTCAAATTTGAGAGAATACATATTTGTTTTTTACAAGCTCATCATCTTATGTATCCTAATACT ATGCCAAATGTTTTCTTGGGATTGAATAAATGTAATTTTTTTAACTTGGCCTCTGTTGATTCATTGGATG TTTGTTACTTTGAATATAAAAGCAGAACTTGGCAAGTCATACAACTCAATTTGGCAGATCACTCACTCTT AGCAAATGAACTGTGCCCAACATAAATCCACTCTAAAGTTTACAGAGGTTCAGTTCTGTACCAATGGAAA TGAGAAGTTAGCTAAGAGTACAAGAAGCATGCTGATTGGCTGATGCAGGGTAAGCAGGCTACATAAAAGG CAGCTGTAGAACATCTGGGAAGGTCAATGATAGCATCTGCCTAGAGTCAAACCTCCGTGCTTCTCAGACA GTGCCTTTTCACCATGAGTGGGTGCCCATTTTTAGGAAACAACTTTGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TDO2_2 ↗ | 4:155,854,734 | 正股 | 155,854,685–155,854,744 |
| TDO2_1 ↗ | 4:155,903,696 | 正股 | 155,903,647–155,903,706 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_B35XD3 · enhancer · 155900236–155900882 · regulatory
ENSR4_B35XDZ · enhancer · 155906598–155907482 · regulatory
· motif · 155900672–155900686 · motif
· motif · 155900672–155900686 · motif
· motif · 155900679–155900690 · motif
· motif · 155900711–155900725 · motif
· motif · 155904407–155904416 · motif
· motif · 155904407–155904416 · motif
· motif · 155907033–155907055 · motif
· motif · 155907033–155907055 · motif
· motif · 155907057–155907072 · motif
· motif · 155907058–155907072 · motif
· motif · 155907059–155907072 · motif
· motif · 155907126–155907139 · motif
· motif · 155907126–155907139 · motif
· motif · 155908570–155908582 · motif
· motif · 155908573–155908580 · motif
· motif · 155908573–155908587 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：406 aa
tryptophan 2,3-dioxygenase 屬於 tryptophan 2,3-dioxygenase 家族。每個亞基結合一個 heme group；來源未提供其他結構域或序列區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- AHCYL1O43865 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASMTLO95671 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- CALRP27797 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDH1P12830 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLSTP36957 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- NEK7Q8TDX7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NGBQ9NPG2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- NMNAT1Q9HAN9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NR1D1P20393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PM20D2Q8IYS1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SDCBP2Q9H190 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZFYVE26Q68DK2-5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TDO2 蛋白質由四個相同亞基構成同源四聚體，組裝方式為兩個二聚體。資料描述的是其亞基組成與複合體結構，未列出其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
TDO2 相關變異被列為高色胺酸血症（Hypertryptophanemia）的致病原因。此病為常染色體隱性遺傳，特徵是持續性高色胺酸血症與高血清素血症。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TDO2 產物是依賴 heme 的雙加氧酶，可催化 L-tryptophan 吡咯環的氧化裂解，將 L-tryptophan 轉換為 N-formyl-L-kynurenine；此反應也涉及 indole moiety 的氧化裂解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heme-dependent dioxygenase that catalyzes the oxidative cleavage of the L-tryptophan (L-Trp) pyrrole ring and converts L-tryptophan to N-formyl-L-kynurenine. Catalyzes the oxidative cleavage of the indole moiety PMID 25066423 ↗ · PMID 27762317 ↗ · PMID 28285122 ↗ |
| 分子活性 | L-tryptophan + O2 = N-formyl-L-kynurenine | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 每個亞基可結合一個 heme group。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | TDO2 參與胺基酸分解代謝，並使 L-tryptophan 經 kynurenine pathway 分解；來源將由 L-tryptophan 通往 L-kynurenine 的位置標示為第 1／2 步。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Amino-acid degradation; L-tryptophan degradation via kynurenine pathway; L-kynurenine from L-tryptophan: step 1/2 |
| 交互作用 | TDO2 由相同亞基構成同源四聚體，並以兩個二聚體組成。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 高色胺酸血症是一種常染色體隱性疾病，特徵為持續性高色胺酸血症與高血清素血症；來源指出，影響該條目所代表基因的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hypertryptophanemia HYPTRP An autosomal recessive condition characterized by persistent hypertryptophanemia and hyperserotoninemia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 600627 PMID 28285122 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGGTCAATGATAGCATCTGCCTAGAGTCAAACCTCCGTGC40TTCTCAGACAGTGCCTTTTCACCATGAGTGGGTGCCCATT80TTTAGGAAACAACTTTGGATATACTTTTAAAAAACTCCCC120GTAGAAGGCAGCGAAGAAGACAAATCACAAACTGGTGTGA160ATAGAGCCAGCAAAGGAGGTCTTATCTATGGGAACTACCT200GCATTTGGAAAAAGTTTTGAATGCACAAGAACTGCAAAGT240GAAACAAAAGGAAATAAAATCCATGATGAACATCTTTTTA280TCATAACTCATCAAGCTTATGAACTCTGGTTTAAGCAAAT320CCTCTGGGAGTTGGATTCTGTTCGAGAGATCTTTCAGAAT360GGCCATGTCAGAGATGAAAGGAACATGCTTAAGGTTGTTT400CTCGGATGCACCGAGTGTCAGTGATCCTGAAACTGCTGGT440GCAGCAGTTTTCCATTCTGGAGACGATGACAGCCTTGGAC480TTCAATGACTTCAGAGAGTACTTATCTCCAGCATCAGGCT520TCCAGAGTTTGCAATTCCGACTATTAGAAAACAAGATAGG560TGTTCTTCAGAACATGAGAGTCCCTTATAACAGAAGACAT600TATCGTGATAACTTCAAAGGAGAAGAAAATGAACTGCTAC640TTAAATCTGAGCAGGAAAAGACACTTCTGGAATTAGTGGA680GGCATGGCTGGAAAGAACTCCAGGTTTAGAGCCACATGGA720TTTAACTTCTGGGGAAAGCTTGAAAAAAATATCACCAGAG760GCCTGGAAGAGGAATTCATAAGGATTCAGGCTAAAGAAGA800GTCTGAAGAAAAAGAGGAACAGGTGGCTGAATTTCAGAAG840CAAAAAGAGGTGCTACTGTCCTTATTTGATGAGAAACGTC880ATGAACATCTCCTTAGTAAAGGTGAAAGACGGCTGTCATA920CAGAGCACTTCAGGGAGCATTGATGATATATTTTTACAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。