基因總覽
TCTA（T cell leukemia translocation altered）是位於人類第 3 號染色體 3p21.31 的蛋白質編碼基因。現有資料將其產物與破骨細胞生成期間的細胞融合可能相關聯；此描述指出的是可能需要參與該過程，未提供更詳細的分子機制或其他生物學角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000273590 ★ | 49,412,423–49,416,476 | 3 |
| ENST00000908965 | 49,412,213–49,416,476 | 3 |
| ENST00000934100 | 49,412,213–49,416,476 | 3 |
| ENST00000998604 | 49,412,213–49,416,476 | 3 |
| ENST00001141804 | 49,412,213–49,416,476 | 3 |
| ENST00000998605 | 49,412,416–49,416,474 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCTA 的產物可能是破骨細胞生成期間細胞融合所需的因子。這項註釋將其功能指向細胞融合，並限定在破骨細胞生成的情境中；「可能需要」表示資料未將此作用表述為已確立的必要機制。
目前提供的功能資訊沒有進一步說明 TCTA 如何促進融合、涉及哪些分子步驟，或其作用對破骨細胞生成有何具體影響，因此不宜據此推定其結合對象、調控方式或其他細胞功能。
Promoter 與基因調控
>TCTA ENST00000273590 GRCh38 chr3:49411423-49412523 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAACTCCGACAGCCACGCGCGCTTTCAGCGGCCGGCTACACTGCGCGGTCGCGGGGCCCGGCCCAAAGCC CCCGCCCTGCCCGGCGCCGCTGGGAGAGGAAGCTCCGGGGACCGAGGGCGGGCAGGCGGGCAGCCTGGGC TCCACCAGGCCCGGCCGGGCGGGGGAAGGGGCACAGGAGACTACCGGGCGCGCTTCCGGGGACTGCGCGG GCGGGGTCGCCGCTTGGGGCGCGGGGCCCGGGCTGGGAGTCAGGTCAAGGGTCAGGGGCCAGGGGCGGCT CGGCCACGAGCAGCCGGTGGGGCGCGGCCGCGGCGGTGCGGCGGCCTGCCGGCCGGAAGAGTACCGGGCT GGCGGGCCTGGGGCCCCGCGGCGCCTGGAGGGAACCCTTCCGCTCACCTCAGGCAACGAATCCGAGTCCA GCCTCTTCGCGCCGGGGACGCCGGTCCGCGAGTCGCAAACTCGGAGACGAAGGCGGGTAGCTGAAGACCA GACCGTGGACTAACGAGAGAACCGACGGAGGACCGCGGGCGGCGGGAGGGTAGCGCGAGAGAGCGAGGGC GGGCGGCGGCGGGAGGGCGGGGAACGACGTGCGCGCCTCCGAGTGCCCAGCGGGCTCGAGCCGGCACAGG TCGCGGCCCCGCGCACGCGCGCGCACTCACAGCTCATCCACTATTGCTCAGGAGCCCGTCCACGCCCTAA AAGCAAAACCCTTAACCAATCATTGCAGCCGCGTGGGGCATCACGGGAACTCCGGGGCTATAAAAGACCT GGTTGCTATTTTGTACTCCCGGAGTCACTCATCCCTTAAGCAAGCAGGGTGGGGTTAGGTGCGCGTGCGC GGTTTTAATACTCCTCCCCGAACTGCCAACTCTTCACGCACGCGAAGTAGGCCCCACCCTGGCTGGGTTT ACGCGTGCGCACTAACGGGCCTGGTCCCGGAAGACCACACGCGTGCGTGGTGGGGACTACGGTGACAGTA CCCCGGGTGGGGCGAGGGCCAGTCATGGCGGAGTCCTGGTCTGGGCAGGCCTTGCAGGCTCTGCCGGCCA CGGTGCTGGGCGCGCTGGGCAGCGAGTTCTTGCGGGAGTGGGAGGCGCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCTA_1 ↗ | 3:49,412,213 | 正股 | 49,412,164–49,412,223 |
| TCTA_2 ↗ | 3:49,412,423 | 正股 | 49,412,374–49,412,433 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_83G835 · enhancer · 49410569–49410737 · regulatory
ENSR3_BCRQM · enhancer · 49410920–49411917 · regulatory
ENSR3_BCRQQ · promoter · 49411918–49412433 · regulatory
ENSR3_5FLRKC · CTCF_binding_site · 49412012–49412033 · regulatory
ENSR3_9PLJN · promoter · 49412528–49413028 · regulatory
ENSR3_C6WDN · enhancer · 49415535–49416945 · regulatory
· motif · 49411582–49411595 · motif
· motif · 49411613–49411622 · motif
· motif · 49411613–49411624 · motif
· motif · 49411671–49411683 · motif
· motif · 49411673–49411686 · motif
· motif · 49411678–49411690 · motif
· motif · 49411680–49411693 · motif
· motif · 49412014–49412030 · motif
· motif · 49412062–49412073 · motif
· motif · 49412062–49412073 · motif
· motif · 49412064–49412075 · motif
· motif · 49412066–49412077 · motif
· motif · 49412066–49412077 · motif
· motif · 49412252–49412263 · motif
· motif · 49412252–49412263 · motif
· motif · 49412297–49412308 · motif
· motif · 49412332–49412343 · motif
· motif · 49412332–49412343 · motif
· motif · 49412355–49412371 · motif
· motif · 49412370–49412381 · motif
· motif · 49412370–49412381 · motif
· motif · 49412425–49412435 · motif
· motif · 49412547–49412564 · motif
· motif · 49412571–49412584 · motif
· motif · 49415374–49415389 · motif
· motif · 49415408–49415422 · motif
· motif · 49416203–49416216 · motif
· motif · 49416203–49416216 · motif
· motif · 49416253–49416265 · motif
· motif · 49416256–49416263 · motif
· motif · 49416422–49416435 · motif
· motif · 49416461–49416474 · motif
· motif · 49416463–49416474 · motif
· motif · 49416463–49416474 · motif
· motif · 49416465–49416474 · motif
· motif · 49416475–49416492 · motif
· motif · 49416484–49416492 · motif
· motif · 49416556–49416569 · motif
· motif · 49416556–49416569 · motif
· motif · 49416590–49416603 · motif
· motif · 49417047–49417058 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：103 aa
TCTA 屬於 TCTA family，所列蛋白質長度為 103 個胺基酸。序列註釋指出其具有兩段螺旋型跨膜區域，並包含胞外與胞質拓撲區域；第 71 至 103 位胺基酸另被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCTA 被註記為膜蛋白及多次跨膜蛋白。 資料未提供定位隨條件改變的資訊，也未指出不同異構型之間的定位差異。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- BMP10O95393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM7Q96FZ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC35A1P78382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YIPF6Q96EC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
涉及 TCTA 的染色體異常與 T 細胞急性淋巴性白血病（T-ALL）相關，所列異常為易位 t(1;3)(p34;p21)。此資料描述的是關聯，未指出 TCTA 對疾病具有因果作用。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCTA 可能是破骨細胞生成期間細胞融合所需的因子；此註釋限定其可能作用於該生物學情境，但未說明作用機制或其必要性是否已確立。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TCTA 被註記為膜蛋白及多次跨膜蛋白；此項定位資料未提供特定條件下的定位變化或異構型間的差異。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 涉及 TCTA 的染色體異常與 T 細胞急性淋巴性白血病（T-ALL）相關，所列異常為 t(1;3)(p34;p21) 易位；此資訊指出疾病關聯，並未主張該易位或 TCTA 對疾病具有因果作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving TCTA is associated with T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Translocation t(1;3)(p34;p21) |
核酸與蛋白質序列
AGTCATGGCGGAGTCCTGGTCTGGGCAGGCCTTGCAGGCT40CTGCCGGCCACGGTGCTGGGCGCGCTGGGCAGCGAGTTCT80TGCGGGAGTGGGAGGCGCAGGACATGCGCGTGACCCTCTT120CAAGCTGCTGCTGCTGTGGTTGGTGTTAAGTCTCCTGGGC160ATCCAGCTGGCGTGGGGGTTCTACGGGAATACAGTGACCG200GGTTGTATCACCGTCCAGGTCTGGGTGGTCAGAATGGATC240CACGCCTGATGGCTCCACGCATTTCCCTTCGTGGGAAATG280GCAGCAAACGAACCTCTCAAAACCCACAGAGAATAAGGGA320AGGCAGCAGAGGGTCTCCAAGGGCATCACTGGGTCTGCTG360GCTTCTACACTGGGTTCTGCTACTCCCCAGACCTCAGGGA400CAACTGCCGGGGGTTCAGGGTTGGTAGCAGGGAGTACCCA440GTGCCTACAGGGCTGGGCCTCTTCTGCCTCTTAAGCCTGC480TCCCTCACCCAGGCACTGGGCAAGTGAAGAGTTTGCCTGT520ACTCTTATCTGGGTGCCTTAAGGAGAGAGATTGTGTTCTT560CCTCTCTCAGGGGTGATAACTCAGGAAGCCTCTGGGTTGG600GAAGACCATCAGTTCTTTTGTCTTAGGTTTCTTTTCCTGT640CCCTCTTCCATCCCCAAGATGTGACCCCATAAAAATTTTT680CCTGAGTTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC720AACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAG760GAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAAACCCCAT800CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAC840ACACCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAG880ATTTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAA920GATTGCGCCGTTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。