基因總覽
TCP10L(t-complex 10 like)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 TCP10 家族。其序列長度為 215 個胺基酸,包含一段 leucine zipper 區域;序列註解也指出其 N 端與 C 端區域具有無序特徵。現有資料將它與轉錄調控及肝細胞癌細胞中的腫瘤抑制作用相連結,但未提供足以進一步界定其整體生理角色的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300258 ★ | 32,573,721–32,585,523 | 5 |
| ENST00000985740 | 32,572,441–32,585,556 | 5 |
| ENST00001131525 | 32,573,721–32,585,556 | 5 |
| ENST00000674156 | 32,576,659–32,585,556 | 6 |
| ENST00000472557 | 32,576,659–32,585,545 | 4 |
| ENST00001098975 | 32,576,659–32,585,556 | 5 |
| ENST00000985741 | 32,576,662–32,585,556 | 6 |
| ENST00000897540 | 32,576,663–32,587,182 | 4 |
| ENST00000897541 | 32,576,663–32,585,506 | 5 |
| ENST00000985742 | 32,576,663–32,585,556 | 6 |
| ENST00000582575 | 32,576,849–32,587,373 | 5 |
| ENST00000673699 | 32,577,783–32,585,523 | 3 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCP10L 可能參與轉錄調控;體外實驗顯示,它具有抑制轉錄的活性。這項結果支持 TCP10L 可影響轉錄過程,但來源未說明受影響的特定基因、分子機制或細胞條件,因此不宜據此推定其調控範圍或作用方式。
在肝細胞癌(HCC)細胞中,TCP10L 被描述為具有腫瘤抑制作用。現有資料未詳述此作用所涉及的細胞表型、下游途徑或實驗條件,也未提供足以判定轉錄抑制活性是否直接造成腫瘤抑制效果的資訊。因此,這些描述支持其在該細胞背景中的功能關聯,但不能據此延伸為其他癌症或生理情境中的作用主張。
Promoter 與基因調控
>TCP10L ENST00000300258 GRCh38 chr21:32585423-32586523 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTTAGGACCCACACACAACCACTCACACACCTTAGGACCCACACACAACCTCTCACACACCTTAGGACC CACACACAACCACTCACACACCTTAGGACCCACACACAACCTCTCACACACCTCAGGGACCCACACACAA CCACTCACACACCTCAGGACCCACACACACCTCATACACCTCAGGGACACACACAACCCCTCACATACCT CAGAAACCTATATAAACTCTCACACACTTCAGGACAAACATACAACCTCTCACGCACCTCAGGACACACA CACACACACTCGCACACCTCAGGACACACACACACACTCTCACAGTTAGAATGACACATGGGGACAAAAG TGCCTTCTGTTTCCTCTTTGTAGTATTCTCTTCATTCATTCATGACGTCGGCATTTACTGCCTATTGCAT GCGAATCGCTTGCAGAACTATCCAAGTGACACACGTCCCAAGCAGGCTCAGGTGAGCCCCAGGTGTATGT TGTCCACACGCAGCACCATGGATGAGAAGGACAGCCAGGGTTTAACAGGAATATCGACTCTTGCTTGCTC CTCATTCTCTTCTCTATCACAAAAATCACACGGACAATTCAGATGGAGATGCATTTAGTGAAATGATGAA ACTTTGAATCCTGTCTCCTATTTAAACTCACATATATTATTTTCCCTTCATAAAAATGTTTTTTCTAGTA AATAATTTGATATCCGAAGAAAGTTTGTATTTCTCCAAGAATGTATGCTCAGAGAAATGAGCTCTTACTA CACGTTGCGTATTGAAGACTGGATATAAAACACATGGTTTTTGTCAATTTGGAGGAGTAGTTTGACTCTC TCCAATGTCCTTTGTGGATGGATGGACTCCACTGACGATGAGCTTCTATATTAAGAATTGCAGGTTTGGG GATGTTTAATTATTATCTGAGCTGGTACAGTGGTGACGCTGAGTGAGACGTTCATGTCCCTTTAAGACAG AAAGTCCGTTGGAACTGTCCGCTGCTCTCTGGTCTCTGGATATGAGGCAGGAGGGCTTGGGGACAACTGT GGGGACATGGCCCAGATGATCTGATCCTGGCAGTAGTGACTGTTGGGGACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCP10L_2 ↗ | 21:32,585,523 | 負股 | 32,585,513–32,585,572 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 32584707–32584716 · motif
· motif · 32584739–32584748 · motif
· motif · 32584800–32584809 · motif
· motif · 32586802–32586817 · motif
· motif · 32586802–32586817 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:215 aa
TCP10L 長 215 個胺基酸,屬於 TCP10 家族。其第 75 至 96 位胺基酸為 leucine zipper 區域;第 1 至 25 位及第 150 至 215 位則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCP10L 的定位註解為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 34 個夥伴
- BACE2Q9Y5Z0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C2CD6Q53TS8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC102BQ68D86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC57Q2TAC2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC70Q6NSX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIAO1O76071 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYAAP02489 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAPK3O43293 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIPAP1Q4V328 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GRNP28799-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLK6Q92876 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO2P25791-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAPK9P45984 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFAP1P55081 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MXD4Q14582 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLI6L9F6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TCP10L 可透過 leucine zipper 與自身結合,也可透過 leucine zipper 與 ZIPK/DAPK3 互作;來源同時將 ZIPK/DAPK3 的參與區域標為 leucine zipper。此外,TCP10L 也與 MAD4 互作,但未提供其結合區域或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCP10L 可能參與轉錄調控,且在體外具有抑制轉錄的活性;在肝細胞癌(HCC)細胞中,TCP10L 被描述為具有腫瘤抑制作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源May be involved in transcriptional regulation. Has in vitro transcription inhibition activity. Acts as a tumor suppressor in hepatocellular carcinoma (HCC) cells PMID 14586771 ↗ · PMID 24565846 ↗ |
| 交互作用 | TCP10L 可透過 leucine zipper 與自身結合,也透過 leucine zipper 與 ZIPK/DAPK3 互作;此外,TCP10L 也與 MAD4 互作,來源未說明其互作方式。 | 含實驗來源 | 證據與來源Self-associates (via leucine zipper). Interacts (via leucine zipper) with ZIPK/DAPK3 (via leucine zipper). Interacts with MAD4 PMID 15469726 ↗ · PMID 15910542 ↗ · PMID 17377852 ↗ |
| 細胞定位 | TCP10L 的細胞內定位註解為細胞核;來源未提供定位變化的條件或其他定位資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTGCTCTCTGGTCTCTGGATATGAGGCAGGAGGGCTTGG40GGACAACTGTGGGGACATGGCCCAGATGATCTGATCCTGG80CAGTAGTGACTGTTGGGGACCAGGATGCTGGCAGGTCAAC120TCGAGGCCAGGGACCCCAAAGAGGGCACCCACCCAGAGGA160CCCGTGCCCAGGAGCTGGGGCTGTCATGGAGAAGACAGCT200GTGGCAGCCGAGGTTCTCACGGAGGACTGCAACACTGGGG240AGATGCCACCATTACAGCAGCAGATCATCAGACTCCACCA280AGAGCTTGGGAGACAGAAGTCTCTGTGGGCTGATGTTCAT320GGAAAACTCCGGAGTCATATAGATGCTTTGAGGGAGCAGA360ACATGGAGCTCCGAGAAAAGCTGAGAGCTCTGCAGCTGCA400GCGGTGGAAAGCCAGGAAGAAATCTGCAGCGTCCCCACAC440GCGGGGCAAGAATCGCACACTCTGGCATTGGAACCTGCTT480TTGGAAAAATTTCACCTCTGTCAGCTGATGAAGAGACAAT520ACCCAAATACGCTGGCCACAAGAATCAGAGTGCCACTCTC560CTGGGACAAAGATCGTCATCTAACAATTCAGCTCCTCCAA600AGCCAATGAGTTTAAAGATAGAAAGAATTAGCTCGTGGAA640AACACCACCACAGGAAAATAGAGATAAAAATCTTTCCAGG680AGACGTCAAGACAGAAGAGCAACACCTACTGGAAGGCCAA720CTCCCTGTGCAGAGAGACGGGGGGGTGTCTGAAGATGGAA760AGGTGGCCTCGGACACCTGTGTCACTCTACACTGGCCCCT800TGGAAAATTCAGATTCAGATAAAGTTCCACTTAGGTCTAA840TAAAAGTACTCAATTTGTTATTCAAAATAGACCTAGTAAT880TTATTAAACTAATTATGTTTCTATAGATAAAAACTTGAAG920TTCTTCAGACATGTCTCTAATGCTATAAAAGCAAACAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。