基因總覽
TCN1 是蛋白質編碼基因，其產物 transcobalamin 1 屬於真核生物 cobalamin transport proteins 家族。這種蛋白質能結合 vitamin B12；其結構包含 N 端球狀 alpha domain、柔性連接區，以及 C 端球狀 beta domain。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000257264 ★ | 59,852,808–59,866,487 | 9 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
transcobalamin 1 可結合 vitamin B12，結合親和力達飛摩爾級。這項結合也能保護 vitamin B12，使其免受胃部酸性環境影響。來源未提供其他功能機制或生物學過程的說明。
Promoter 與基因調控
>TCN1 ENST00000257264 GRCh38 chr11:59866387-59867487 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGTTTTGATTTTTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCAATGTATGTCTTTCTGTGCCTGGCTTATT TCACTTAACATAATTATCTCCAGTTCCATCCATTTTGTCACAACTGACAGGATTTCATTCTTTTATATGG CTGAATAGTACTCCATTGTGTATATGTACATTTGCTGTGTTCATTTATCTGTTGATAGACACTTAGCTTG CTTCCAAATCTTGGTTATTGTAAACAGTGCTGCAACAAACATGGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACT GGTCTTCTTTCTTTTGGGTATATAGCCAGCAGTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTATGTTTAGTT TTTTGAGGAAGCTCCAAACTGTTCTCCATAGTGATTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTACAAG GCTTCCCTTTTCTCTACATCCGTGCCAGCATTTGTTATTGCCTGTGTTTTGAATAAAGCCATTTTTAGCT GAGATGAGAGGATATCTCATTGTAGCTTTGATTTCCATTTATCTGATGATCAATGATGTTAAGCACCTTT TCAAGCACTTTTTCATATGCCTGCTTCCCATTTGGATGTCTTCTTTTACTTCCATTTTTATATGTTGTAT GTGTTTGCATGATCAAATCTACTTTATCAGGAAACATAAAACATAAAGTGAAACGGAAAAAAAAGGAAAG ATTATAGGAAACAGTCATTTGCCTAATATATCTTCACTGCACGGAAGGCAAATAATAGATATGAAACCCG AAGGTTTAGGACAGGAGACAAAGGAAAGTTATTGCCTTATTCTCCCTAACCACATCCTTCAAGTCTTCTT CCTTATTTATTACATCACATGGACAAATACACTTGACCACACCTCCTGACATTGCTCAATATTTGCTTGA GTGAAAAGAGGCTGAGGCAACCTGAAGGAGGAGCTCTCATTACCTTCTGCCCATCACTTAATAAATAGCC AGCCAATTCATCAACATTCTGGTACACTGTTGGAGAGATGAGACAGTCACACCAGCTGCCCCTAGTGGGG CTCTTACTGTTTTCTTTTATTCCAAGCCAACTATGCGAGATTTGTGGTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCN1_1 ↗ | 11:59,866,487 | 負股 | 59,866,477–59,866,536 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_9TQK5 · enhancer · 59865107–59865367 · regulatory
ENSR11_5J476G · CTCF_binding_site · 59866436–59866457 · regulatory
ENSR11_83QJ62 · promoter · 59866477–59866725 · regulatory
· motif · 59862442–59862455 · motif
· motif · 59866438–59866454 · motif
· motif · 59866588–59866597 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：433 aa
transcobalamin 1 長 433 個胺基酸，N 端含訊號序列（第 1–23 位），其後為球狀 N-terminal alpha domain（第 24–310 位）、柔性連接區（第 311–332 位）及球狀 C-terminal beta domain（第 333–433 位）。
蛋白質三維結構
細胞內定位
transcobalamin 1 的定位註記為分泌。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGTACACTGTTGGAGAGATGAGACAGTCACACCAGCTGCC40CCTAGTGGGGCTCTTACTGTTTTCTTTTATTCCAAGCCAA80CTATGCGAGATTTGTGAGGTAAGTGAAGAAAACTACATCC120GCCTAAAACCTCTGTTGAATACAATGATCCAGTCAAACTA160TAACAGGGGAACCAGCGCTGTCAATGTTGTGTTGTCCCTC200AAACTTGTTGGAATCCAGATCCAAACCCTGATGCAAAAGA240TGATCCAACAAATCAAATACAATGTGAAAAGCAGATTGTC280AGATGTAAGCTCGGGAGAGCTTGCCTTGATTATACTGGCT320TTGGGAGTATGTCGTAACGCTGAGGAAAACTTAATATATG360ATTACCACCTGATCGACAAGCTAGAAAATAAATTCCAAGC400AGAAATTGAAAATATGGAAGCACACAATGGCACTCCCCTG440ACTAACTACTACCAGCTCAGCCTGGACGTTTTGGCCTTGT480GTCTGTTCAATGGGAACTACTCAACCGCCGAAGTTGTCAA520CCACTTCACTCCTGAAAATAAAAACTATTATTTTGGTAGC560CAGTTCTCAGTAGATACTGGTGCAATGGCTGTCCTGGCTC600TGACCTGTGTGAAGAAGAGTCTAATAAATGGGCAGATCAA640AGCAGATGAAGGCAGTTTAAAGAACATCAGTATTTATACA680AAGTCACTGGTAGAAAAGATTCTGTCTGAGAAAAAAGAAA720ATGGTCTCATTGGAAACACATTTAGCACAGGAGAAGCCAT760GCAGGCCCTCTTTGTATCATCAGACTATTATAATGAAAAT800GACTGGAATTGCCAACAAACTCTGAATACAGTGCTCACGG840AAATTTCTCAAGGAGCATTCAGCAATCCAAACGCTGCAGC880CCAGGTCTTACCTGCCCTGATGGGAAAGACCTTCTTGGAT920ATTAACAAAGACTCTTCTTGCGTCTCTGCTTCAGGTAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。