基因總覽
TCL1B 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 TCL1 family AKT coactivator B。其產物屬於 TCL1 family;現有資料未提供蛋白質長度、結構域組成或其他序列特徵。已知的基本角色與 AKT1、AKT2 有關,但具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000340722 ★ | 95,686,426–95,692,628 | 4 |
| ENST00000916734 | 95,686,397–95,692,630 | 4 |
| ENST00000916735 | 95,686,397–95,692,630 | 4 |
| ENST00000916736 | 95,686,397–95,692,638 | 4 |
| ENST00001137998 | 95,686,397–95,692,628 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCL1B 的資料所述功能與 AKT1、AKT2 有關:它可增強這兩種蛋白質的磷酸化及活化。這項描述指出 TCL1B 對兩者的磷酸化與活化具有促進作用;來源未進一步說明該作用發生的生物學條件、下游過程或功能結果,因此不宜延伸推論其影響範圍。
Promoter 與基因調控
>TCL1B ENST00000340722 GRCh38 chr14:95685426-95686526 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATCATCTCAATACTAATCTTCACTTGAACTAGAAGAATCATGCTTGTGGTTTTCAAAAGGAAAAGGTTCC TATTCATGGTGCATTTAGAAGCAGCCCAGGGTGCTTATAGAACGGACCTGCTTCTTGCTATGTTCTTGAG CTTCTGAGGCCTCTTGACAAAGTCGAGCAAGTAAGACGACCAGGCCAAGTGGGCACTCTGGGCCCCATGG CCAAGGATGGGCTGGCCAGGTGGCCACGTGGCCTCCGGTGGCCTTGTTTCTGTGGGCTTTATCTGATCCT GAGCTCAGATGCTGATAGTGCACTGGCTTATTTTCTAAGGAGAGGGAGCTTGATTTGTGCAGGATGCGCC TTCACCAGATACCTCCAGGGGCAAGAGTCCACTGAGGTTACAGCGCCCCCCGCCCCCCATGCCTCTAAGC TCTAAGCTCAGAGAAGGGTCCCTGACACAGAGTCCTGTTAAAGGAATGGCCACAGGGATAGGAGAGACCA GGGTCGTGCATGCCAGCTCAGGATCTGGGGCAGGATGGTTGGCAGGGGGTCGTGGGGAGCAAAGGAGGGG AATCACCTGACAGAAAATTGGGCAGGGGTGCTCAGGGAGGAGGCTGCGGAGGGACTGGGACCAGTGGAAG GGAGGTGGAATAGGTCTTAGGAGCCAAATTCCTTGCAGAGGCCTGGGGTGAAGCCTGGGCAGCTCTATCC CCGGGAGCCGCCCTTTTGCCTCCAGCAGCTGCCGGTCCAGCCACAGCCCCTCCAGGAGACCCAGGCCGGG TTCCTAACTCCGCTGCTCTTTGGCCTCGTCCCTGCCTAGCCCCTGCTGCAGGTTGCTTTTTTCCCCCCTC CTCCTCCTCCCTCCTCCCTCCTCCCTCCTCCCCCTTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCGACTGGCCCCG CCCCCACTGCCGGCCCCGCCCCCACTGCCGGCCCGGGCCCCACCCACGCCGGAGCTGCTCCATTTAAGGA GATTGCGCAGCTGGAAAGCTACACGTGTGAGCCTAGAGGCGGGTCCCGGTTGCAGACTTGCCATGGCCTC CGAAGCTTCTGTGCGTCTAGGGGTGCCCCCTGGCCGTCTGTGGATCCAGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCL1B_1 ↗ | 14:95,686,426 | 正股 | 95,686,377–95,686,436 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_93DZFB · enhancer · 95683755–95684165 · regulatory
ENSR14_5SHMP6 · CTCF_binding_site · 95683920–95683941 · regulatory
ENSR14_5SHMPJ · CTCF_binding_site · 95684003–95684024 · regulatory
ENSR14_84RXW3 · promoter · 95686263–95686436 · regulatory
· motif · 95683922–95683938 · motif
· motif · 95683928–95683943 · motif
· motif · 95683935–95683943 · motif
· motif · 95684005–95684021 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- BAG4O95429 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFCAB2Q5VUJ9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- LSM7Q9UK45 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNRPGP62308 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF330Q9Y3S2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TCL1B 與 AKT1、AKT2 互作,並透過 PH domain 與之作用;資料指出它不與 AKT3 互作。來源未說明這些互作是否涉及特定複合體,故不將功能關係延伸為複合體描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCL1B 可增強 AKT1 與 AKT2 的磷酸化及活化。此敘述只指出對這兩種蛋白質磷酸化和活化的促進作用,未提供額外條件或下游結果。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TCL1B 透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 互作,但不與 AKT3 互作。此敘述區分了互作的 AKT 蛋白種類,未提供其他互作條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACACGTGTGAGCCTAGAGGCGGGTCCCGGTTGCAGACTTG40CCATGGCCTCCGAAGCTTCTGTGCGTCTAGGGGTGCCCCC80TGGCCGTCTGTGGATCCAGAGGCCTGGCATCTACGAAGAT120GAGGAGGGGAGAACCTGGGTGACTGTGGTCGTGCGGTTCA160ATCCCTCGCGTAGGGAATGGGCCAGGGCCTCCCAGGGCAG200CAGATATGAACCCAGCATCACAGTGCACTTGTGGCAGATG240GCAGTGCATACCCGGGAGCTACTCTCCTCCGGCCAGATGC280CCTTCTCCCAGCTGCCCGCCGTGTGGCAGCTCTACCCCGG320GAGGAAGTACCGAGCAGCGGATTCCAGTTTCTGGGAAATA360GCAGACCATGGCCAGATTGACTCTATGGAGCAGCTGGTCC400TAACATATCAGCCGGAGAGGAAAGACTGACACTGGGAGTG440GCTGGCCCTGCTGGCCCTGCCTCTTCTGGCCTGGTGTCTC480CTCATGCCCCCTCAGTGAGGATCTTCATGTACCTGCTCTT520CTGTTTGCACACCCAGCATAGCCTCCTTGCAGGCAGAAGG560CAGTAGGGCCCCTGCACACTCAGTTTCTCTCGTTTTCCTT600AGTTATCAGTCCTGTCCTGTCCCACTCAGGTCTGTACTTA640GGGCAGCTGGCCTGGATGGGCTTCACTGGGGCCCTGTCTG680TGTGCTGAGCCAGTTTCCCCTGCTGGCTGCAAGCTGTGGG720TTCTTTCTCCTCTGTGCCCCTCATGCTGATCTTCTAGATG760CCACTCCCAAATCCCCTTCATACCCACCAGGATGTGTGCC800CAGCCAGGCCTCCAGCACCCCCAGTGCAGCTCGTGATTGG840AAACTCACCATCGGCAGGCAGTGGTTCGGTTTAAGAGATG880GCATTAGAGGGAGCCCAGTCTGGATGTGGACTTGGATGCC920CTGTGGGTATCAGTTCTGCTGACACTTTGGCCCGAAATAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。