演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TCL1BTML1

TCL1 family AKT coactivator B

TCL1B 是編碼 TCL1 family AKT coactivator B 的蛋白質編碼基因,其產物屬於 TCL1 family,並可增強 AKT1 與 AKT2 的磷酸化及活化。

Homo sapiens14q32.13UniProt O95988
OFFICIAL SYMBOL
TCL1B
CHROMOSOME
14
UNIPROT
O95988
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TCL1B 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 TCL1 family AKT coactivator B。其產物屬於 TCL1 family;現有資料未提供蛋白質長度、結構域組成或其他序列特徵。已知的基本角色與 AKT1、AKT2 有關,但具體作用方式見功能說明。

Official symbol
TCL1B
Gene name
TCL1 family AKT coactivator B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11649
UniProt
O95988
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TML1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q32.13
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegTCL1Bpq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:95,686,397–95,692,638
Gene span
6,242 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000340722 ★95,686,426–95,692,6284
ENST0000091673495,686,397–95,692,6304
ENST0000091673595,686,397–95,692,6304
ENST0000091673695,686,397–95,692,6384
ENST0000113799895,686,397–95,692,6284

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TCL1B 的資料所述功能與 AKT1、AKT2 有關:它可增強這兩種蛋白質的磷酸化及活化。這項描述指出 TCL1B 對兩者的磷酸化與活化具有促進作用;來源未進一步說明該作用發生的生物學條件、下游過程或功能結果,因此不宜延伸推論其影響範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 95686426 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TCL1B ENST00000340722 GRCh38 chr14:95685426-95686526 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATCATCTCAATACTAATCTTCACTTGAACTAGAAGAATCATGCTTGTGGTTTTCAAAAGGAAAAGGTTCC
TATTCATGGTGCATTTAGAAGCAGCCCAGGGTGCTTATAGAACGGACCTGCTTCTTGCTATGTTCTTGAG
CTTCTGAGGCCTCTTGACAAAGTCGAGCAAGTAAGACGACCAGGCCAAGTGGGCACTCTGGGCCCCATGG
CCAAGGATGGGCTGGCCAGGTGGCCACGTGGCCTCCGGTGGCCTTGTTTCTGTGGGCTTTATCTGATCCT
GAGCTCAGATGCTGATAGTGCACTGGCTTATTTTCTAAGGAGAGGGAGCTTGATTTGTGCAGGATGCGCC
TTCACCAGATACCTCCAGGGGCAAGAGTCCACTGAGGTTACAGCGCCCCCCGCCCCCCATGCCTCTAAGC
TCTAAGCTCAGAGAAGGGTCCCTGACACAGAGTCCTGTTAAAGGAATGGCCACAGGGATAGGAGAGACCA
GGGTCGTGCATGCCAGCTCAGGATCTGGGGCAGGATGGTTGGCAGGGGGTCGTGGGGAGCAAAGGAGGGG
AATCACCTGACAGAAAATTGGGCAGGGGTGCTCAGGGAGGAGGCTGCGGAGGGACTGGGACCAGTGGAAG
GGAGGTGGAATAGGTCTTAGGAGCCAAATTCCTTGCAGAGGCCTGGGGTGAAGCCTGGGCAGCTCTATCC
CCGGGAGCCGCCCTTTTGCCTCCAGCAGCTGCCGGTCCAGCCACAGCCCCTCCAGGAGACCCAGGCCGGG
TTCCTAACTCCGCTGCTCTTTGGCCTCGTCCCTGCCTAGCCCCTGCTGCAGGTTGCTTTTTTCCCCCCTC
CTCCTCCTCCCTCCTCCCTCCTCCCTCCTCCCCCTTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCGACTGGCCCCG
CCCCCACTGCCGGCCCCGCCCCCACTGCCGGCCCGGGCCCCACCCACGCCGGAGCTGCTCCATTTAAGGA
GATTGCGCAGCTGGAAAGCTACACGTGTGAGCCTAGAGGCGGGTCCCGGTTGCAGACTTGCCATGGCCTC
CGAAGCTTCTGTGCGTCTAGGGGTGCCCCCTGGCCGTCTGTGGATCCAGAG
TCL1B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TCL1B_1 ↗14:95,686,426正股95,686,377–95,686,436

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_93DZFB · enhancer · 95683755–95684165 · regulatory

ENSR14_5SHMP6 · CTCF_binding_site · 95683920–95683941 · regulatory

ENSR14_5SHMPJ · CTCF_binding_site · 95684003–95684024 · regulatory

ENSR14_84RXW3 · promoter · 95686263–95686436 · regulatory

· motif · 95683922–95683938 · motif

· motif · 95683928–95683943 · motif

· motif · 95683935–95683943 · motif

· motif · 95684005–95684021 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:128 aa

TCL1B 蛋白質屬於 TCL1 family。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步描述。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95988…

AlphaFold · O95988

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 13 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TML1TCL1BBAG4EFCAB2GLRX3LSM1LSM5LSM7MARK1MEIS3MKRN3PLEKHA3PNMA1SNRPGZNF330
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TCL1B 與 AKT1、AKT2 互作,並透過 PH domain 與之作用;資料指出它不與 AKT3 互作。來源未說明這些互作是否涉及特定複合體,故不將功能關係延伸為複合體描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TCL1B 可增強 AKT1 與 AKT2 的磷酸化及活化。此敘述只指出對這兩種蛋白質磷酸化和活化的促進作用,未提供額外條件或下游結果。含實驗來源
證據與來源

Enhances the phosphorylation and activation of AKT1 and AKT2

PMID 10983986 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TCL1B 透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 互作,但不與 AKT3 互作。此敘述區分了互作的 AKT 蛋白種類,未提供其他互作條件。含實驗來源
證據與來源

Interacts with AKT1 and AKT2 (via PH domain). Does not interact with AKT3

PMID 10983986 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000340722 · 1,142 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACACGTGTGAGCCTAGAGGCGGGTCCCGGTTGCAGACTTG40
41CCATGGCCTCCGAAGCTTCTGTGCGTCTAGGGGTGCCCCC80
81TGGCCGTCTGTGGATCCAGAGGCCTGGCATCTACGAAGAT120
121GAGGAGGGGAGAACCTGGGTGACTGTGGTCGTGCGGTTCA160
161ATCCCTCGCGTAGGGAATGGGCCAGGGCCTCCCAGGGCAG200
201CAGATATGAACCCAGCATCACAGTGCACTTGTGGCAGATG240
241GCAGTGCATACCCGGGAGCTACTCTCCTCCGGCCAGATGC280
281CCTTCTCCCAGCTGCCCGCCGTGTGGCAGCTCTACCCCGG320
321GAGGAAGTACCGAGCAGCGGATTCCAGTTTCTGGGAAATA360
361GCAGACCATGGCCAGATTGACTCTATGGAGCAGCTGGTCC400
401TAACATATCAGCCGGAGAGGAAAGACTGACACTGGGAGTG440
441GCTGGCCCTGCTGGCCCTGCCTCTTCTGGCCTGGTGTCTC480
481CTCATGCCCCCTCAGTGAGGATCTTCATGTACCTGCTCTT520
521CTGTTTGCACACCCAGCATAGCCTCCTTGCAGGCAGAAGG560
561CAGTAGGGCCCCTGCACACTCAGTTTCTCTCGTTTTCCTT600
601AGTTATCAGTCCTGTCCTGTCCCACTCAGGTCTGTACTTA640
641GGGCAGCTGGCCTGGATGGGCTTCACTGGGGCCCTGTCTG680
681TGTGCTGAGCCAGTTTCCCCTGCTGGCTGCAAGCTGTGGG720
721TTCTTTCTCCTCTGTGCCCCTCATGCTGATCTTCTAGATG760
761CCACTCCCAAATCCCCTTCATACCCACCAGGATGTGTGCC800
801CAGCCAGGCCTCCAGCACCCCCAGTGCAGCTCGTGATTGG840
841AAACTCACCATCGGCAGGCAGTGGTTCGGTTTAAGAGATG880
881GCATTAGAGGGAGCCCAGTCTGGATGTGGACTTGGATGCC920
921CTGTGGGTATCAGTTCTGCTGACACTTTGGCCCGAAATAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。