演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TCL1ATCL1

TCL1 family AKT coactivator A

TCL1A 編碼 TCL1 family AKT coactivator A,屬於 TCL1 family,能增強 AKT 蛋白的活化,並與細胞增殖及存活相關。

Homo sapiens14q32.13UniProt P56279
OFFICIAL SYMBOL
TCL1A
CHROMOSOME
14
UNIPROT
P56279
PDB / ALPHAFOLD
1JSG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TCL1A 是位於人類第 14 號染色體 14q32.13 的蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 TCL1 family AKT coactivator A。此蛋白屬於 TCL1 family,主要與 AKT 家族蛋白及細胞存活相關。現有資料未提供其蛋白質長度、結構域或其他序列層級的結構特色,因此不據此補充其分子結構。

Official symbol
TCL1A
Gene name
TCL1 family AKT coactivator A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11648
UniProt
P56279
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TCL1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q32.13
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegTCL1Apq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:95,694,156–95,714,196
Gene span
20,041 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000402399 ★95,709,947–95,714,1254
ENST0000109187995,694,156–95,714,1964
ENST0000109188095,694,156–95,714,1964
ENST0000055401295,709,947–95,714,1964
ENST0000055704395,709,947–95,712,7224
ENST0000113696995,709,947–95,714,1964
ENST0000055645095,710,056–95,714,1964
ENST0000055520295,711,447–95,714,1963

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TCL1 family AKT coactivator A 可增強 AKT1、AKT2 與 AKT3 的磷酸化及活化,顯示它能促進這些 AKT 蛋白的活性。來源未進一步說明此作用的具體分子步驟或條件,因此不延伸推定其如何影響磷酸化過程。

對 AKT1 而言,TCL1 family AKT coactivator A 也會促進其轉位至細胞核。這項作用指出兩者的功能關聯包含 AKT1 的細胞內移動;資料未提供轉位發生的特定刺激或細胞情境。

在細胞層次,TCL1 family AKT coactivator A 與細胞增殖增加、粒線體膜電位穩定,以及細胞存活促進相關。這些作用共同呈現其對細胞生長與存活的支持性功能,但來源未交代各項結果之間的先後關係,也未指出特定細胞類型或實驗條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 95714125 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TCL1A ENST00000402399 GRCh38 chr14:95714025-95715125 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGCCTGGTCAGAGAACTGGGAAAGAGCTGGAAGATGAGACACCAAACTCCATCCCATGGTGATGTTTGA
ACCAGGCTGGAGCTGGTTTCACATGTTTTTCATTGTGCATGACTTTCTTAATTGCCTTAGTGGGAATGCG
TTACTGCAAAATAAAGTGAAATTGTTTTCCTTATTGCTTGTAATTTACAGAGGGGTGGTTTTGATCATAT
AAACCAGGCACTTTTCAAATCCATTGATCTTAGGGTGGAAGGAGGGATTTCTTTTTAAGTATTCATTTCG
AACTATGCTTTCACTAGTAAACTCAAAGCCCAAGGGCAAAAACCCATGATTCTCCATTTTGTAATAGCTA
TTAGATGTCCACAGCACATCAGACCTGTGGAAAACGCATGCTTTGTGTATGGAAGAGGGAGAGGGAGCGT
CAGGAGTTGTCCTTTGCCAAAAAACGTACTCTGACACTCAAAGGCACAGGCTGGTGGAGATCCAGGGAAC
CCGGGAAAGCCCAGGCCTAACTCAGGCCCGCGCGGGTCTCTTCTGATCCCATAAGATGAGGAGTGGGTCC
TGGCTCTGGGCATCCTGGTGTCGACTGTGAGTTCCCAGCAGAGGCCCAGAGTCCCGGTCCGGCAGCCGAG
GGAAGCGGGGGGGTCTTCCAGAAGAAGAAAGGGCCAAGGTCACCCCGGTGCCTCTCCAGCAGCAGCAGAG
GGCGGCGGTCGGTGTCGCTGCTGGCCGGGGCCTCGAGGAAGGCGCGGGCCAGCTGGGGCCGGGTCTGCGT
TCCCAGGAGCTGCCACCGTTCCAGGGAGCAAGTCAGGCCGGGACGTAGCGCCTGCGCGGGACCCTCACTT
GCCACCAAGACCCCCACAAACCCCGCCCCATCCTGCCTTACGCCCCGCCCCAAGGTCGTTCTCCCGACCC
GGGGTCCCGCCCCAAGGCCGTCCTCCCGCCCCGCCGCTTGGTGGCGGCCGCATGCTGCCCGGATATAAAG
GGTCGGCCCCACATCCCAGGGACCAGCGAGCGGCCTTGAGAGGCTCTGGCTCTTGCTTCTTAGGCGGCCC
GAGGACGCCATGGCCGAGTGCCCGACACTCGGGGAGGCAGTCACCGACCAC
TCL1A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TCL1A_1 ↗14:95,714,121負股95,714,111–95,714,170

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_BNZTK · promoter · 95714088–95714653 · regulatory

ENSR14_5SHSW7 · CTCF_binding_site · 95714166–95714187 · regulatory

ENSR14_6F8WZ6 · CTCF_binding_site · 95714405–95714439 · regulatory

· motif · 95712146–95712163 · motif

· motif · 95712422–95712442 · motif

· motif · 95713403–95713425 · motif

· motif · 95713403–95713425 · motif

· motif · 95713506–95713518 · motif

· motif · 95713750–95713758 · motif

· motif · 95714014–95714031 · motif

· motif · 95714054–95714070 · motif

· motif · 95714168–95714184 · motif

· motif · 95714197–95714213 · motif

· motif · 95714407–95714423 · motif

· motif · 95714420–95714436 · motif

· motif · 95714450–95714462 · motif

· motif · 95714454–95714467 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:114 aa

TCL1 family AKT coactivator A 屬於 TCL1 family。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步資訊。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1JSG…

PDB · 1JSG

X-ray · 2.50 A · A=1-114

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Microsome;Endoplasmic reticulum

TCL1 family AKT coactivator A 的註解列出細胞質、細胞核、微粒體與內質網等位置,也包含微粒體組分。 資料未說明其在不同位置間變動的條件或定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Microsome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 39 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TCL1TCL1AAKT1AKT1AKT1CADPSCALCOCO2CARD9CASP8AP2CCDC13CEP55DDIT4LDNMT3AEP300FLACC1FOSGOLGA2INCA1JUNJUNBLNX1LSM3NFKBIANFKBIDNIF3L1NTAQ1PPP1R13BPRTFDC1RELTAX1BP1TCF4TEPSINTNKSTP53BP2TRAF1TRAF2TRMT61ATTC33TXLNATXLNBWDR47
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 39 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TCL1 family AKT coactivator A 可形成同源二聚體,並透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 及 AKT3 互作。它也與 PNPT1 互作,但此互作不影響 PNPT1 的核酸外切酶活性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

可活化 TCL1A 的染色體異常見於慢性 T 細胞白血病(T-CLL)。相關異常包括 t(14;14)(q11;q32)、t(7;14)(q35;q32) 易位,以及涉及 T-cell receptor alpha/delta loci 的 inv(14)(q11;q32) 倒位;資料指出這些染色體變化與 TCL1A 活化相關,未據此建立其對疾病的因果關係。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TCL1 family AKT coactivator A 能增強 AKT1、AKT2 與 AKT3 的磷酸化及活化,促進 AKT1 轉位至細胞核,並與細胞增殖增加、粒線體膜電位穩定及細胞存活促進相關。含實驗來源
證據與來源

Enhances the phosphorylation and activation of AKT1, AKT2 and AKT3. Promotes nuclear translocation of AKT1. Enhances cell proliferation, stabilizes mitochondrial membrane potential and promotes cell survival

PMID 10716693 ↗ · PMID 10983986 ↗ · PMID 11707444 ↗ · PMID 11839817 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TCL1 family AKT coactivator A 可形成同源二聚體,並透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 及 AKT3 互作;它也與 PNPT1 互作,但此互作不影響 PNPT1 的核酸外切酶活性。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with AKT1, AKT2 and AKT3 (via PH domain). Interacts with PNPT1; the interaction has no effect on PNPT1 exonuclease activity

PMID 10716693 ↗ · PMID 10983986 ↗ · PMID 11707444 ↗ · PMID 11839817 ↗ · PMID 16934922 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TCL1 family AKT coactivator A 的定位註解包括細胞質、細胞核、微粒體與內質網,並列有微粒體組分;資料未指出定位變化的條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Microsome; Endoplasmic reticulum; Microsomal fraction

PMID 7987816 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯可活化 TCL1A 的染色體異常見於慢性 T 細胞白血病(T-CLL),包括 t(14;14)(q11;q32) 與 t(7;14)(q35;q32) 易位,以及涉及 T-cell receptor alpha/delta loci 的 inv(14)(q11;q32) 倒位;此處描述的是關聯。資料庫紀錄
證據與來源

Chromosomal aberrations activating TCL1A are found in chronic T-cell leukemias (T-CLL). Translocation t(14;14)(q11;q32); translocation t(7;14)(q35;q32); inversion inv(14)(q11;q32) that involves the T-cell receptor alpha/delta loci

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000402399 · 1,345 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACCAGCGAGCGGCCTTGAGAGGCTCTGGCTCTTGCTTCT40
41TAGGCGGCCCGAGGACGCCATGGCCGAGTGCCCGACACTC80
81GGGGAGGCAGTCACCGACCACCCGGACCGCCTGTGGGCCT120
121GGGAGAAGTTCGTGTATTTGGACGAGAAGCAGCACGCCTG160
161GCTGCCCTTAACCATCGAGATAAAGGATAGGTTACAGTTA200
201CGGGTGCTCTTGCGTCGGGAAGACGTCGTCCTGGGGAGGC240
241CTATGACCCCCACCCAGATAGGCCCAAGCCTGCTGCCTAT280
281CATGTGGCAGCTCTACCCTGATGGACGATACCGATCCTCA320
321GACTCCAGTTTCTGGCGCTTAGTGTACCACATCAAGATTG360
361ACGGCGTGGAGGACATGCTTCTCGAGCTGCTGCCAGATGA400
401CTGATGTATGGTCTTGGCAGCACCTGTCTCCTTTCACCCC440
441AGGGCCTGAGCCTGGCCAGCCTACAATGGGGATGTTGTGT480
481TTCTGTTCACCTTCGTTTACTATGCCTGTGTCTTCTCCAC520
521CACGCTGGGGTCTGGGAGGAATGGACAGACAGAGGATGAG560
561CTCTACCCAGGGCCTGCAGGACCTGCCTGTAGCCCACTCT600
601GCTCGCCTTAGCACTACCACTCCTGCCAAGGAGGATTCCA640
641TTTGGCAGAGCTTCTTCCAGGTGCCCAGCTATACCTGTGC680
681CTCGGCTTTTCTCAGCTGGATGATGGTCTTCAGCCTCTTT720
721CTGTCCCTTCTGTCCCTCACAGCACTAGTATTTCATGTTG760
761CACACCCACTCAGCTCCGTGAACTTGTGAGAACACAGCCG800
801ATTCACCTGAGCAGGACCTCTGAAACCCTGGACCAGTGGT840
841CTCACATGGTGCTACGCCTGCATGTAAACACGCCTGCAAA880
881CGCTGCCTGCCGGTAAACACGCCTGCAAACGCTGCCTGCC920
921CGTAAACACGCCTGCAAACGCTGCCTGCCCACACAGGTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。