基因總覽
TCL1A 是位於人類第 14 號染色體 14q32.13 的蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 TCL1 family AKT coactivator A。此蛋白屬於 TCL1 family,主要與 AKT 家族蛋白及細胞存活相關。現有資料未提供其蛋白質長度、結構域或其他序列層級的結構特色,因此不據此補充其分子結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000402399 ★ | 95,709,947–95,714,125 | 4 |
| ENST00001091879 | 95,694,156–95,714,196 | 4 |
| ENST00001091880 | 95,694,156–95,714,196 | 4 |
| ENST00000554012 | 95,709,947–95,714,196 | 4 |
| ENST00000557043 | 95,709,947–95,712,722 | 4 |
| ENST00001136969 | 95,709,947–95,714,196 | 4 |
| ENST00000556450 | 95,710,056–95,714,196 | 4 |
| ENST00000555202 | 95,711,447–95,714,196 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCL1 family AKT coactivator A 可增強 AKT1、AKT2 與 AKT3 的磷酸化及活化,顯示它能促進這些 AKT 蛋白的活性。來源未進一步說明此作用的具體分子步驟或條件,因此不延伸推定其如何影響磷酸化過程。
對 AKT1 而言,TCL1 family AKT coactivator A 也會促進其轉位至細胞核。這項作用指出兩者的功能關聯包含 AKT1 的細胞內移動;資料未提供轉位發生的特定刺激或細胞情境。
在細胞層次,TCL1 family AKT coactivator A 與細胞增殖增加、粒線體膜電位穩定,以及細胞存活促進相關。這些作用共同呈現其對細胞生長與存活的支持性功能,但來源未交代各項結果之間的先後關係,也未指出特定細胞類型或實驗條件。
Promoter 與基因調控
>TCL1A ENST00000402399 GRCh38 chr14:95714025-95715125 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTGCCTGGTCAGAGAACTGGGAAAGAGCTGGAAGATGAGACACCAAACTCCATCCCATGGTGATGTTTGA ACCAGGCTGGAGCTGGTTTCACATGTTTTTCATTGTGCATGACTTTCTTAATTGCCTTAGTGGGAATGCG TTACTGCAAAATAAAGTGAAATTGTTTTCCTTATTGCTTGTAATTTACAGAGGGGTGGTTTTGATCATAT AAACCAGGCACTTTTCAAATCCATTGATCTTAGGGTGGAAGGAGGGATTTCTTTTTAAGTATTCATTTCG AACTATGCTTTCACTAGTAAACTCAAAGCCCAAGGGCAAAAACCCATGATTCTCCATTTTGTAATAGCTA TTAGATGTCCACAGCACATCAGACCTGTGGAAAACGCATGCTTTGTGTATGGAAGAGGGAGAGGGAGCGT CAGGAGTTGTCCTTTGCCAAAAAACGTACTCTGACACTCAAAGGCACAGGCTGGTGGAGATCCAGGGAAC CCGGGAAAGCCCAGGCCTAACTCAGGCCCGCGCGGGTCTCTTCTGATCCCATAAGATGAGGAGTGGGTCC TGGCTCTGGGCATCCTGGTGTCGACTGTGAGTTCCCAGCAGAGGCCCAGAGTCCCGGTCCGGCAGCCGAG GGAAGCGGGGGGGTCTTCCAGAAGAAGAAAGGGCCAAGGTCACCCCGGTGCCTCTCCAGCAGCAGCAGAG GGCGGCGGTCGGTGTCGCTGCTGGCCGGGGCCTCGAGGAAGGCGCGGGCCAGCTGGGGCCGGGTCTGCGT TCCCAGGAGCTGCCACCGTTCCAGGGAGCAAGTCAGGCCGGGACGTAGCGCCTGCGCGGGACCCTCACTT GCCACCAAGACCCCCACAAACCCCGCCCCATCCTGCCTTACGCCCCGCCCCAAGGTCGTTCTCCCGACCC GGGGTCCCGCCCCAAGGCCGTCCTCCCGCCCCGCCGCTTGGTGGCGGCCGCATGCTGCCCGGATATAAAG GGTCGGCCCCACATCCCAGGGACCAGCGAGCGGCCTTGAGAGGCTCTGGCTCTTGCTTCTTAGGCGGCCC GAGGACGCCATGGCCGAGTGCCCGACACTCGGGGAGGCAGTCACCGACCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCL1A_1 ↗ | 14:95,714,121 | 負股 | 95,714,111–95,714,170 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_BNZTK · promoter · 95714088–95714653 · regulatory
ENSR14_5SHSW7 · CTCF_binding_site · 95714166–95714187 · regulatory
ENSR14_6F8WZ6 · CTCF_binding_site · 95714405–95714439 · regulatory
· motif · 95712146–95712163 · motif
· motif · 95712422–95712442 · motif
· motif · 95713403–95713425 · motif
· motif · 95713403–95713425 · motif
· motif · 95713506–95713518 · motif
· motif · 95713750–95713758 · motif
· motif · 95714014–95714031 · motif
· motif · 95714054–95714070 · motif
· motif · 95714168–95714184 · motif
· motif · 95714197–95714213 · motif
· motif · 95714407–95714423 · motif
· motif · 95714420–95714436 · motif
· motif · 95714450–95714462 · motif
· motif · 95714454–95714467 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:114 aa
TCL1 family AKT coactivator A 屬於 TCL1 family。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCL1 family AKT coactivator A 的註解列出細胞質、細胞核、微粒體與內質網等位置,也包含微粒體組分。 資料未說明其在不同位置間變動的條件或定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Microsome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 39 個夥伴
- AKT1A0A0S2Z3D6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKT1B0LPE5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CADPSA2RRN7 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- CARD9Q9H257 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CASP8AP2A0AAG2UWT9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC13Q8IYE1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP55Q53EZ4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNMT3AQ9Y6K1 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- EP300Q09472 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FLACC1Q96Q35 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOSP01100 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JUNP05412 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- JUNBP17275 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LSM3P62310 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- NFKBIAP25963 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFKBIDQ8NI38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NIF3L1Q9GZT8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PPP1R13BQ96KQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TCL1 family AKT coactivator A 可形成同源二聚體,並透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 及 AKT3 互作。它也與 PNPT1 互作,但此互作不影響 PNPT1 的核酸外切酶活性。
疾病與遺傳關聯
可活化 TCL1A 的染色體異常見於慢性 T 細胞白血病(T-CLL)。相關異常包括 t(14;14)(q11;q32)、t(7;14)(q35;q32) 易位,以及涉及 T-cell receptor alpha/delta loci 的 inv(14)(q11;q32) 倒位;資料指出這些染色體變化與 TCL1A 活化相關,未據此建立其對疾病的因果關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCL1 family AKT coactivator A 能增強 AKT1、AKT2 與 AKT3 的磷酸化及活化,促進 AKT1 轉位至細胞核,並與細胞增殖增加、粒線體膜電位穩定及細胞存活促進相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Enhances the phosphorylation and activation of AKT1, AKT2 and AKT3. Promotes nuclear translocation of AKT1. Enhances cell proliferation, stabilizes mitochondrial membrane potential and promotes cell survival PMID 10716693 ↗ · PMID 10983986 ↗ · PMID 11707444 ↗ · PMID 11839817 ↗ |
| 交互作用 | TCL1 family AKT coactivator A 可形成同源二聚體,並透過 PH domain 與 AKT1、AKT2 及 AKT3 互作;它也與 PNPT1 互作,但此互作不影響 PNPT1 的核酸外切酶活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with AKT1, AKT2 and AKT3 (via PH domain). Interacts with PNPT1; the interaction has no effect on PNPT1 exonuclease activity PMID 10716693 ↗ · PMID 10983986 ↗ · PMID 11707444 ↗ · PMID 11839817 ↗ · PMID 16934922 ↗ |
| 細胞定位 | TCL1 family AKT coactivator A 的定位註解包括細胞質、細胞核、微粒體與內質網,並列有微粒體組分;資料未指出定位變化的條件。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 可活化 TCL1A 的染色體異常見於慢性 T 細胞白血病(T-CLL),包括 t(14;14)(q11;q32) 與 t(7;14)(q35;q32) 易位,以及涉及 T-cell receptor alpha/delta loci 的 inv(14)(q11;q32) 倒位;此處描述的是關聯。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Chromosomal aberrations activating TCL1A are found in chronic T-cell leukemias (T-CLL). Translocation t(14;14)(q11;q32); translocation t(7;14)(q35;q32); inversion inv(14)(q11;q32) that involves the T-cell receptor alpha/delta loci |
核酸與蛋白質序列
GACCAGCGAGCGGCCTTGAGAGGCTCTGGCTCTTGCTTCT40TAGGCGGCCCGAGGACGCCATGGCCGAGTGCCCGACACTC80GGGGAGGCAGTCACCGACCACCCGGACCGCCTGTGGGCCT120GGGAGAAGTTCGTGTATTTGGACGAGAAGCAGCACGCCTG160GCTGCCCTTAACCATCGAGATAAAGGATAGGTTACAGTTA200CGGGTGCTCTTGCGTCGGGAAGACGTCGTCCTGGGGAGGC240CTATGACCCCCACCCAGATAGGCCCAAGCCTGCTGCCTAT280CATGTGGCAGCTCTACCCTGATGGACGATACCGATCCTCA320GACTCCAGTTTCTGGCGCTTAGTGTACCACATCAAGATTG360ACGGCGTGGAGGACATGCTTCTCGAGCTGCTGCCAGATGA400CTGATGTATGGTCTTGGCAGCACCTGTCTCCTTTCACCCC440AGGGCCTGAGCCTGGCCAGCCTACAATGGGGATGTTGTGT480TTCTGTTCACCTTCGTTTACTATGCCTGTGTCTTCTCCAC520CACGCTGGGGTCTGGGAGGAATGGACAGACAGAGGATGAG560CTCTACCCAGGGCCTGCAGGACCTGCCTGTAGCCCACTCT600GCTCGCCTTAGCACTACCACTCCTGCCAAGGAGGATTCCA640TTTGGCAGAGCTTCTTCCAGGTGCCCAGCTATACCTGTGC680CTCGGCTTTTCTCAGCTGGATGATGGTCTTCAGCCTCTTT720CTGTCCCTTCTGTCCCTCACAGCACTAGTATTTCATGTTG760CACACCCACTCAGCTCCGTGAACTTGTGAGAACACAGCCG800ATTCACCTGAGCAGGACCTCTGAAACCCTGGACCAGTGGT840CTCACATGGTGCTACGCCTGCATGTAAACACGCCTGCAAA880CGCTGCCTGCCGGTAAACACGCCTGCAAACGCTGCCTGCC920CGTAAACACGCCTGCAAACGCTGCCTGCCCACACAGGTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。