演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TCHHTHH

trichohyalin

TCHH 編碼的 trichohyalin 是與中間絲相關的蛋白質,參與毛囊內根鞘及表皮顆粒層的角蛋白中間絲排列,並可能協助細胞包膜組織。

Homo sapiens1q21.3UniProt Q07283
OFFICIAL SYMBOL
TCHH
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q07283
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TCHH(trichohyalin)是蛋白質編碼基因,產物屬於 S100-fused protein family。trichohyalin 是與中間絲相關的蛋白質,來源描述其主要分布於毛囊內根鞘細胞及表皮顆粒層,並與其中的角蛋白中間絲(KIF)形成規則排列。其序列具有 EF-hand 1 與 EF-hand 2 兩個區域,也包含多段串聯重複序列;部分區域被註記為無序區。這些結構註解提供了認識此蛋白質的基本線索,但來源未進一步說明各區域的個別作用。

Official symbol
TCHH
Gene name
trichohyalin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11791
UniProt
Q07283
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
THH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegTCHHpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:152,106,317–152,115,444
Gene span
9,128 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000614923 ★152,106,317–152,115,4443

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

trichohyalin 是中間絲相關蛋白,在毛囊內根鞘細胞與表皮顆粒層中,會與角蛋白中間絲(KIF)形成規則排列。這種排列關係把 trichohyalin 帶入角蛋白絲構成的細胞骨架環境;來源指出它之後會透過異二肽鍵與 KIF 交聯,顯示兩者的關聯可由有序並列進一步轉為共價連結。

這種交聯可能有助於穩定細胞結構。trichohyalin 可能與 involucrin 一同作為支架蛋白,參與細胞包膜的組織;來源也提出,它甚至可能將細胞包膜錨定到 KIF 網絡。這些角色以「可能」描述,表示其作為支架或錨定物的功能尚非確定結論,不宜視為已證實的唯一作用。

來源另指出,trichohyalin 可能參與自身的鈣依賴性轉譯後加工,且此過程與終末分化相關。這使它除了和角蛋白中間絲形成結構聯繫外,也可能在細胞走向終末分化時經歷受鈣調控的加工。不過,來源沒有進一步交代加工的具體形式、調控步驟,或其與交聯及細胞包膜形成之間的先後關係,因此不能據此推定更細緻的分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 152115444 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TCHH ENST00000614923 GRCh38 chr1:152115344-152116444 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATCCAATTCCTTACAATAAAACAGCACTGAAATTTGCAAATGATCAACCAGATTGAGAAAGCCCTGATGG
ATATAATGGGCTAGAATGACCAATTACCTCAATGTACTTCCAGGAGAAGCAGACTCAAGTGTTTAGGTGT
CATAATCATTAGTAACTTAGGCTGAGCAGGATGATTATATCTACAATAATACATTACACCAGCTCTTTTT
CCCCAGGGGCATCAATATGCTAATGAGAAAACTAATGAACAAACTTCATTTAGGTTTAATGTCTCTAAGA
ATGAAATTTCACAGATTTCAAGTTTTCTTATGAACGGTTTAATAAAAATATATTTCCAAGGTACCCTTCC
AAACTTTACTGAGGAGGCAGTCCCCAATCTGTAGGAAAACCATCATAAGACCCGGGAGACAAATGTAAAA
ATTTTTCCCACCTGCATTTTTAGAGAAGAAACTAACCAATTCTTTACAGCTCTCTCATTGCCCTAGAATT
GAAGCAACTGCTTCTGGCAGGGCTTATGAGCAGCTCACCATGGACTGTCACATCCCATGGAGAAATTAAT
TGGTTTTCATCACTTTATTTCAAAGTTTCTGCTTAATCCCAAACTAGAGATTGTATCTTTTATAAAGCAA
ATGGCTTAGAGTTTACTCCTTTGTAATGAAGTAATAATCAATTAAGATTGTGAACATTTAATACCTTTGT
TTTATTATTTAATTTACTTTTAACAATTTAAGAAAATTGGAGATTCTGCCAAATATTCTACCCTCCCATG
TTAGGTGGGGCTGGTACCCTGACTGTCAGGAGGCAAGGTCTGTGAACCTCGTGCCAAATAGCTACGTGAG
CAAATAGTGAGATAAACAAGCCATTTGTGGAGACAGAGGTGGAGCTGGGCTTGGTTAGGAATGAATCAGG
CCATCCCACAGAGTGGGTGTCTCCTTCCCAAGTTGCTTTCCAGGGCACAATTAAAACCCCTATAAAAGGC
CCAGCTCCCAGTTACCCAGTACACTTGCCTGTGGTGTCAGCAAGCACTGTCGACTTCTTCCTCTGGTGAA
GTGGGTAAGTCCCATTCTGTGGGATCGTGGTCTTCTTTATGATTCTCCATT
TCHH 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_53BR24D · CTCF_binding_site · 152110729–152110750 · regulatory

ENSR1_53BR2FS · CTCF_binding_site · 152112772–152112793 · regulatory

· motif · 152110731–152110747 · motif

· motif · 152111100–152111114 · motif

· motif · 152112774–152112790 · motif

· motif · 152114554–152114565 · motif

· motif · 152114664–152114675 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1943 aa

1 aa1943 aa結構域功能區域重複區
依 Q07283 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

trichohyalin 全長為 1,943 個胺基酸,屬於 S100-fused protein family。序列 N 端註有 S-100-like 區域及兩個 EF-hand;另有多組串聯重複序列,包括不同長度的重複片段。多段區域被註記為無序區。這些特徵為序列註解,來源未說明其各自的生化作用。

結構域EF-hand 123–48 aa
結構域EF-hand 249–84 aa
重複區1-1; approximate314–326 aa
重複區1-2; approximate327–339 aa
重複區1-3; approximate340–351 aa
重複區1-4352–364 aa
重複區1-5365–377 aa
重複區2-1378–383 aa
重複區2-2384–389 aa
重複區2-3390–395 aa
重複區2-4396–401 aa
重複區2-5402–407 aa
重複區2-6408–413 aa
重複區2-7414–419 aa
重複區2-8420–425 aa
重複區4-1906–935 aa
重複區4-2936–965 aa
重複區4-3966–995 aa
重複區4-4996–1025 aa
重複區4-51026–1055 aa
重複區4-61056–1085 aa
重複區4-71086–1115 aa
重複區4-81116–1145 aa
重複區4-91146–1175 aa
重複區4-101176–1204 aa
功能區域S-100-like1–91 aa
功能區域Disordered110–164 aa
功能區域Disordered186–209 aa
功能區域Disordered222–274 aa
功能區域5 X 13 AA tandem repeats of R-R-E-Q-E-E-E-R-R-E-Q-Q-L314–377 aa
功能區域8 X 6 AA tandem repeats of R-R-E-Q-Q-L378–425 aa
功能區域9 X 28 AA approximate tandem repeats425–683 aa
功能區域Disordered426–485 aa
功能區域Disordered509–546 aa
功能區域Disordered608–819 aa
功能區域Disordered837–872 aa
功能區域10 X 30 AA tandem repeats906–1204 aa
功能區域Disordered950–1000 aa
功能區域Disordered1046–1120 aa
功能區域Disordered1137–1162 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q07283…

AlphaFold · Q07283

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
THHTCHH
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料將 trichohyalin 標示為 Monomer,未列出其蛋白質次單元或複合體成員。功能描述提到它與角蛋白中間絲(KIF)形成規則排列並在之後交聯,也提出它可能與 involucrin 一同參與細胞包膜組織;這些屬功能性描述,來源未明確將其列為直接結合夥伴或特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TCHH 與 Uncombable hair syndrome 3(UHS3)相關;來源將此疾病描述為影響頭皮毛髮梳理的狀況,並指出其由影響該基因的變異造成。患者毛束排列紊亂,毛幹橫切面可呈三角形、腎形或心形,沿毛幹也可能有溝槽、管狀凹陷或扁平處。多數患者在幼年發病,頭髮可能乾燥、捲曲、有光澤且顏色較淡,並逐漸變得難以梳理;生長速度可較慢或正常,病況會隨年齡改善。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能trichohyalin 是中間絲相關蛋白,在毛囊內根鞘細胞及表皮顆粒層中與角蛋白中間絲(KIF)形成規則排列,之後會以異二肽鍵與 KIF 交聯。它可能與 involucrin 一同作為支架參與細胞包膜組織,甚至將細胞包膜錨定於 KIF 網絡;此外也可能在終末分化期間參與自身的鈣依賴性轉譯後加工。資料庫紀錄
證據與來源

Intermediate filament-associated protein that associates in regular arrays with keratin intermediate filaments (KIF) of the inner root sheath cells of the hair follicle and the granular layer of the epidermis. It later becomes cross-linked to KIF by isodipeptide bonds. It may serve as scaffold protein, together with involucrin, in the organization of the cell envelope or even anchor the cell envelope to the KIF network. It may be involved in its own calcium-dependent postsynthetic processing during terminal differentiation

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交互作用Monomer推論支持
證據與來源

Monomer

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Uncombable hair syndrome 3(UHS3)是一種毛髮難以梳理的疾病,與影響 TCHH 的基因變異相關。患者頭皮毛束排列紊亂,毛幹橫切面可呈三角形、腎形至心形,沿全長可能出現溝槽、管狀凹陷或扁平;多數幼年發病,頭髮可呈乾燥、捲曲、有光澤、顏色較淡且逐漸難以梳理。毛髮生長速度可慢至正常,病況會隨年齡改善。含實驗來源
證據與來源

Uncombable hair syndrome 3 UHS3 A form of uncombable hair syndrome, a condition characterized by scalp hair that is impossible to comb due to the haphazard arrangement of the hair bundles. A characteristic morphologic feature is a triangular to reniform to heart shape on cross-sections, and a groove, canal or flattening along the entire length of the hair. Most individuals are affected early in childhood and the hair takes on a spun-glass appearance with the hair becoming dry, curly, glossy, lighter in color, and progressively uncombable. The hair growth rate can range from slow to normal, and the condition improves with age. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617252

PMID 27866708 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000614923 · 6,985 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACACTTGCCTGTGGTGTCAGCAAGCACTGTCGACTTCTTC40
41CTCTGGTGAAGTGGGTTTACTTGAACTTGAAGGAAAGAAA80
81AAAAAATGTCTCCACTTCTGAGAAGCATCTGTGACATCAC120
121TGAAATTTTCAATCAGTATGTCTCTCATGATTGTGATGGA160
161GCAGCATTAACTAAGAAAGACCTGAAGAACCTCCTTGAAA200
201GGGAATTTGGAGCTGTGCTTCGGAGACCACATGACCCTAA240
241GACGGTAGATCTGATCCTGGAACTTCTGGATCTTGACAGT280
281AATGGGCGTGTCGATTTCAACGAATTCCTCCTATTTATTT320
321TCAAAGTGGCTCAAGCTTGTTACTATGCTCTCGGCCAGGC360
361CACGGGACTGGATGAGGAGAAGCGAGCCCGGTGTGACGGA400
401AAGGAGAGCCTGTTACAAGATCGCAGGCAAGAAGAAGACC440
441AAAGGAGATTCGAGCCCCGGGACAGACAACTGGAAGAAGA480
481ACCTGGGCAACGACGCAGGCAGAAGAGGCAGGAACAGGAG520
521AGGGAGCTAGCTGAGGGAGAGGAGCAAAGTGAGAAACAAG560
561AGCGACTTGAACAGCGCGACAGGCAGCGCCGCGACGAGGA600
601GCTGTGGCGGCAAAGGCAAGAATGGCAAGAACGGGAAGAG640
641CGCCGTGCAGAGGAAGAGCAGCTGCAGAGTTGCAAAGGTC680
681ACGAAACTGAGGAGTTTCCAGACGAAGAGCAACTGCGAAG720
721GCGGGAGCTGCTGGAGCTGAGGAGGAAGGGCCGCGAGGAG760
761AAACAGCAGCAAAGGCGAGAGCGGCAAGACAGAGTGTTCC800
801AGGAGGAAGAAGAGAAAGAGTGGAGGAAGCGCGAGACAGT840
841GCTCCGGAAGGAAGAAGAGAAGTTGCAGGAAGAGGAGCCG880
881CAGCGGCAAAGAGAGCTCCAGGAGGAAGAAGAGCAGCTAC920
921GGAAGCTGGAGCGGCAAGAGCTGAGGAGGGAGCGCCAGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。