演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TCFL5Figlb

transcription factor like 5

TCFL5 編碼 transcription factor like 5,屬推定的轉錄因子。其第 3 號異構型可能參與精子形成早期階段。

Homo sapiens20q13.33UniProt Q9UL49
OFFICIAL SYMBOL
TCFL5
CHROMOSOME
20
UNIPROT
Q9UL49
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TCFL5(transcription factor like 5)是蛋白質編碼基因,產物為 Transcription factor-like 5 protein。此蛋白質被註記為推定的轉錄因子,並具有 bHLH 結構域;來源未提供更完整的家族分類或其他結構資訊。TCFL5 有不同異構型,其中第 3 號異構型被提出可能與精子形成早期階段有關,但這項功能描述仍保留可能性。

Official symbol
TCFL5
Gene name
transcription factor like 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11646
UniProt
Q9UL49
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FiglbE2BP-1CHAbHLHe82

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q13.33
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegTCFL5pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:62,840,997–62,861,840
Gene span
20,844 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000335351 ★62,841,005–62,861,8226
ENST0000089500762,840,997–62,861,8346
ENST0000089500862,840,997–62,861,8343
ENST0000094932362,840,997–62,861,7754
ENST0000102838962,840,997–62,861,8345
ENST0000102839062,840,997–62,861,8345
ENST0000113219662,840,997–62,861,8346
ENST0000102839262,843,577–62,861,8346
ENST0000102839462,843,579–62,861,8343
ENST0000021716262,845,138–62,861,8346
ENST0000106667762,851,488–62,861,8346
ENST0000106667862,851,488–62,861,8346

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TCFL5 的產物被註記為推定的轉錄因子,表示其轉錄調控角色尚以推定性質描述。來源未提供其調控哪些基因、如何影響轉錄,或參與哪些其他生物過程的資訊,因此不能據此延伸出特定的分子機制。

功能描述特別提到第 3 號異構型可能參與精子形成早期階段。這項說法限定於特定異構型與生殖細胞發育的早期階段,且以「可能」表述;來源並未說明其作用方式、作用對象或對精子形成的具體影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 62861822 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TCFL5 ENST00000335351 GRCh38 chr20:62861722-62862822 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGGAATGTGGGTGAGAGGTTAAGTACAGGAATTATTTCAAGATTGCAAAAATAAGTCTCTTAAAGACCA
CATATTGCATAGTTCCCTTAACAGGGAAGGCCCAGCCTAGGCAAACTCCTGGACACAGAAGATTAGTGGC
TGCAGGCGGGGGAGGGGCAGTGTGCTGACTGCTACAGGAGACCGGTGGTGAATGCAGCGGTGGAGGCGGG
CCCAGCGCTGGGAATGTACCACCACCGTCGCGCTGTGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGAAGTCTGGC
TCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGC
GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCACTACCACGTCCAGCTAATTTTTG
TATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGATCTCCTGACCTCCTGATCCAC
CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGAACCCGGCCATGCGCTGCGCATTT
TACGCGGATGAAGCGGATGGCCTGGGCACTGTGGACTGTGGGTCCAGGGAGCTGTTTTGACAACGTCTTC
ATTCCTGCCGCTGTAATGGGGCGCACGTGCACGCACGGACGTGGCTTCTCCCCAGGGTGTCACCGCGTAG
GTATCACGCTGATTCCAGCGCAGCCGCCCTCGCCGGGCCTCAGCGGGGAGTGGCCGGGCAGCAGGGGCGT
GGCTGGGAACCGGGCGTGGCCTGAGCTGGGGGCGTGGCCTAGCTGTGGGGGCGTGGCTGGGCCGTGGGGG
CGGGCCCTCCGCGCAAGCATCCGCCGACGTGGGGCGGGGCCGGGCGTGCGGGCGGTTGGGCGGGGGCGGG
GCCGGCGGCGGCGGGTAACGGAGGGGGCGGGGCTGGCGCAGGGGTGGGGTTGCCGTTGCGGGGCGGGGCG
GCGCAGGCGCTGTGCGCGGCACTCAGCGGTTTTCCCTCCCCCAACGGCGCGCCGGCTGTGGCCGGCGCAG
AGTAGTGCTCGGGCCGGGGGTCGCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCGCCTCCCG
TCFL5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TCFL5_1 ↗20:62,861,822負股62,861,812–62,861,871

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_5JR7JT · CTCF_binding_site · 62860497–62860518 · regulatory

ENSR20_BGGSH · promoter · 62860906–62861474 · regulatory

ENSR20_BGGSL · promoter · 62861753–62862312 · regulatory

ENSR20_BGGSQ · enhancer · 62862502–62863206 · regulatory

· motif · 62857361–62857369 · motif

· motif · 62860499–62860515 · motif

· motif · 62861832–62861843 · motif

· motif · 62861832–62861843 · motif

· motif · 62861882–62861895 · motif

· motif · 62861913–62861926 · motif

· motif · 62861939–62861952 · motif

· motif · 62861979–62861992 · motif

· motif · 62861998–62862011 · motif

· motif · 62862133–62862146 · motif

· motif · 62862133–62862146 · motif

· motif · 62862162–62862173 · motif

· motif · 62862393–62862404 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:500 aa

1 aa500 aa結構域功能區域
依 Q9UL49 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Transcription factor-like 5 protein 長 500 個胺基酸,含有位於第 400 至 450 個胺基酸的 bHLH 結構域。序列另有三段被註記為無序區,分別位於第 1–34、191–211 及 365–410 個胺基酸。第 347–356 個胺基酸區段為可被 Chagas 抗體辨識的 R3 表位;第 481–500 個胺基酸區段則為可被 Chagas 抗體辨識的 R1 表位。

結構域bHLH400–450 aa
功能區域Disordered1–34 aa
功能區域Disordered191–211 aa
功能區域R3 epitope (recognized by Chagas's antibodies)347–356 aa
功能區域Disordered365–410 aa
功能區域R1 epitope (recognized by Chagas's antibodies)481–500 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UL49…

AlphaFold · Q9UL49

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

TCFL5 的定位註記為細胞核;來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間存在差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FiglbTCFL5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TCFL5 有效結合 DNA 需要與另一個 bHLH 蛋白二聚化。來源未指出該 bHLH 蛋白的身分,也未提供特定複合體或其他互作資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TCFL5 被描述為推定的轉錄因子;其第 3 號異構型可能參與精子形成的早期階段。此描述只指出可能的角色,未提供具體作用機制或其他異構型的相關功能。含實驗來源
證據與來源

Putative transcription factor. Isoform 3 may play a role in early spermatogenesis

PMID 9763657 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TCFL5 有效結合 DNA 需要與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體。此敘述指出二聚化是有效 DNA 結合的必要條件,但未指明另一個蛋白的身分,也未說明其他互作或功能結果。資料庫紀錄
證據與來源

Efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TCFL5 的細胞定位註記為細胞核。此項資訊僅指出其定位,未說明定位變化的條件、不同異構型的差異,或定位與其他蛋白質的關係。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 9763657 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000335351 · 2,625 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCAGCGGTTTTCCCTCCCCCAACGGCGCGCCGGCTGTG40
41GCCGGCGCAGAGTAGTGCTCGGGCCGGGGGTCGCCTCCCG80
81CCTCCCGCCTCCCGCCTCCCGCCGCCCGCCGCCCGCGTCG120
121CCCTCGCCGCCGTTGGGCCGCGCCGCGCCGCCATGTCGGG160
161CCCCGGACCGCGGGAGCCGCCGCCGGAGGCAGGCGCGGCA200
201GGCGGCGAGGCGGCCGTCGAGGGCGCGGGCGGCGGGGACG240
241CGGCGCTGGGCGAGCCGGGGCTGAGCTTCACGACCACCGA280
281CCTGAGCCTGGTGGAGATGACGGAGGTGGAGTACACGCAG320
321CTGCAGCACATCCTCTGCTCGCACATGGAGGCGGCGGCTG360
361ACGGCGAGCTCGAGACGCGCCTCAACTCGGCGCTGCTGGC400
401GGCGGCGGGCCCGGGCGCAGGCGCGGGCGGCTTCGCGGCG440
441GGCGGTCAGGGGGGCGCGGCGCCCGTGTACCCCGTGCTGT480
481GCCCGTCCGCGCTGGCGGCCGACGCGCCCTGCCTGGGCCA520
521CATCGACTTCCAGGAGCTGCGCATGATGCTGCTAAGCGAG560
561GCGGGCGCGGCGGAGAAGACGTCGGGCGGCGGGGACGGAG600
601CGAGGGCCCGGGCCGACGGCGCCGCCAAGGAGGGCGCGGG640
641CGCGGCTGCGGCTGCGGCTGGACCCGACGGCGCGCCCGAG680
681GCCCGGGCCAAGCCGGCCGTGCGCGTCCGCCTGGAGGACC720
721GCTTCAACAGCATCCCCGCCGAGCCGCCGCCCGCGCCGCG760
761CGGCCCCGAGCCCCCCGAGCCGGGCGGGGCGCTCAACAAT800
801TTGGTAACTCTCATTCGACATCCATCTGAACTAATGAATG840
841TTCCTCTTCAGCAACAAAACAAATGTACAGCATTAGTGAA880
881AAATAAAACTGCGGCTACAACTACTGCTTTGCAATTTACA920
921TACCCACTGTTTACTACAAATGCTTGCTCTACTAGTGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。