基因總覽
TCF7L2（transcription factor 7 like 2）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 TCF/LEF 家族的轉錄因子。蛋白質長 619 個胺基酸，具有 HMG box DNA 結合區，也包含多個具功能註記的區域，例如 CTNNB1 結合區及啟動子特異性活化區。其功能具有情境依賴性：在 CTNNB1 缺乏或存在時，轉錄調控方向有所不同。這些特徵使 TCF7L2 能參與基因表現調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000355995 ★ | 112,950,247–113,167,678 | 15 |
| ENST00000627217 | 112,950,015–113,167,678 | 14 |
| ENST00000277945 | 112,950,015–113,167,678 | 13 |
| ENST00000534894 | 112,950,015–113,167,678 | 11 |
| ENST00000538897 | 112,950,015–113,167,678 | 14 |
| ENST00000369397 | 112,950,015–113,167,678 | 14 |
| ENST00000355717 | 112,950,015–113,167,678 | 13 |
| ENST00000352065 | 112,950,015–113,165,612 | 15 |
| ENST00000369395 | 112,950,015–113,165,612 | 15 |
| ENST00000545257 | 112,950,015–113,166,160 | 15 |
| ENST00000867562 | 112,950,015–113,167,678 | 14 |
| ENST00000867563 | 112,950,015–113,167,678 | 13 |
顯示 12/68 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCF7L2 參與 Wnt 訊號路徑，並以序列特異性的方式結合 MYC 啟動子，調節 MYC 表現。其轉錄調控方向取決於 CTNNB1：沒有 CTNNB1 時，TCF7L2 作為抑制因子；CTNNB1 存在時則可作為活化因子。在 CTNNB1 存在的條件下，TCF7L2 也能活化含有多個 Tcf 基序 5'-CCTTTGATC-3' 的啟動子轉錄。
TLE1、TLE2、TLE3 與 TLE4 可抑制由 TCF7L2/TCF4 和 CTNNB1 介導的轉錄活化，顯示這類轉錄輸出可受其他調控因子限制。來源亦指出，表現顯性負向突變體會造成細胞週期停滯於 G1 期；這項結果描述的是該突變體表現與細胞週期變化之間的關係。
在小腸中，TCF7L2 對維持上皮幹細胞區室是必要的。這項作用與其轉錄調控功能相呼應，但來源未進一步說明該維持作用的完整分子機制。
Promoter 與基因調控
>TCF7L2 ENST00000355995 GRCh38 chr10:112949247-112950347 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTGTAGCCCAACTGATCCCAGGGGTTGGTGAACTTTCAGTTTTATTTTCCCTGACGGTGTTAACGCCCA AACTTTTCACCTCCTAAGTCAAAAAGGACTTTGACTCTAGCTCATTTCCTACTACCTCCAACGTCAGTTA AAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAACACCACTCTACATTTAAAAGAATCATATATTTTTCCTTAAGGATACT TTTAATGTTTCTGACATTTAGCATTTGTTTTTTGCATAAAAAGTCGTTTTGGCATATCCATCCTAGTGGG ACTTAACATTTCATGAAATGATTCACTACTAATAAACAAAAAAGGGAGGAGGGAGGCCTCATGGGTTAAT AGTTTCTTTCATTGTAGATGACCAGGAACTTTGACCAGCCCCTTCACTTCCCCAAGCTCTCTGAAAGTGG AGGGTTGATCTTTCCTTTTGACCACTTTTGTCGCATCCCGTCTAAGGGTGGCTGATTTCACTGCTGAATT AACCACCAAGCACCCCCCCACCCCCTCCCCCAGCCACCACTTTCTCAAATACTACCCTTCCTTTTCCCCC TCCCTTAAGACTTATTTCTAATATTTCTAAAGTGCACTGTTTTGGGCCTCTCCCCATCCCCGCCCCCCAA GTGGGCTTTCCTTCCGCCTTCCTCGGCTCGGATTCCTGACTTGGTCGCCACCCCCTTCTCCTCCTCTCCC ACCCCGCATTGTCTTTCTGAAACCGCCCCCTCCCGGAGCAAGTCCCTGCACCCTCGCCCAGAATCCCGGG CTCGCACACACTCCGCGCAGGCCGCTCCCCCTGCACACTCCTCCCTCCGTCTCCCCCCGGCTTCCCCGCC CCTCTCTTCCTCCTTCTTTCCCTCCTCCCTCTCCCGGCGCCCGAAAGGATCATTGTTAGCCGCCCCCGCC CCGCCCACCCCGGCTGTTTATTTATGCACACGTCACTGGGCCGGCCCCGCCCTCCGGCATCTCATTAAGG CAGTGTGTTCCTCTCGCCCTGTCAATAATCTCCGCTCCCAGACTACTCCGTTCCTCCGGATTTCGATCCC CCTTTTTCTATCTGTCAATCAGCGCCGCCTTTGAACTGAAAAGCTCTCAGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCF7L2_1 ↗ | 10:112,950,247 | 正股 | 112,950,198–112,950,257 |
| TCF7L2_4 ↗ | 10:112,950,361 | 正股 | 112,950,312–112,950,371 |
| TCF7L2_2 ↗ | 10:112,950,493 | 正股 | 112,950,444–112,950,503 |
| TCF7L2_3 ↗ | 10:112,950,671 | 正股 | 112,950,622–112,950,681 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_93MSF6 · enhancer · 112945985–112946269 · regulatory
ENSR10_85BMSJ · enhancer · 112946399–112946584 · regulatory
ENSR10_85BMSP · enhancer · 112946726–112946886 · regulatory
ENSR10_BSF86 · promoter · 112949757–112950767 · regulatory
ENSR10_5ZKB9K · CTCF_binding_site · 112949966–112949987 · regulatory
ENSR10_5ZKBB7 · CTCF_binding_site · 112950107–112950128 · regulatory
ENSR10_93MSGW · promoter · 112951865–112952365 · regulatory
ENSR10_BSF8P · enhancer · 112953366–112954348 · regulatory
ENSR10_D7LBH · enhancer · 112954889–112957127 · regulatory
· motif · 112949339–112949354 · motif
· motif · 112949339–112949354 · motif
· motif · 112949619–112949634 · motif
· motif · 112949629–112949639 · motif
· motif · 112949745–112949755 · motif
· motif · 112949747–112949757 · motif
· motif · 112949751–112949761 · motif
· motif · 112949753–112949763 · motif
· motif · 112949757–112949767 · motif
· motif · 112949829–112949844 · motif
· motif · 112949863–112949873 · motif
· motif · 112949966–112949976 · motif
· motif · 112949968–112949984 · motif
· motif · 112950037–112950047 · motif
· motif · 112950050–112950060 · motif
· motif · 112950079–112950089 · motif
· motif · 112950109–112950125 · motif
· motif · 112950149–112950159 · motif
· motif · 112950154–112950164 · motif
· motif · 112950200–112950210 · motif
· motif · 112950320–112950334 · motif
· motif · 112950403–112950413 · motif
· motif · 112951469–112951479 · motif
· motif · 112951933–112951943 · motif
· motif · 112955091–112955101 · motif
· motif · 112955093–112955103 · motif
· motif · 112955095–112955105 · motif
· motif · 112955149–112955159 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：619 aa
TCF7L2 蛋白質長 619 個胺基酸，屬於 TCF/LEF 家族。其 HMG box 位於第 350–418 個胺基酸，為 DNA 結合區；第 1–53 個胺基酸區段註記為 CTNNB1 結合區。第 459–505 個胺基酸區段是啟動子特異性活化區，另有核定位訊號。多個區段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCF7L2 位於細胞核，可呈瀰漫分布，也可見於 PML 核體。 在部分 PML 核體中，TCF7L2 與 SUMO1 及 PIAS4 共定位；來源未提供此定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 31 個夥伴
- CTNNB1P35222 · UniProt INTERACTION · 27 experiments
- DAXXQ9UER7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HIC1Q14526 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RUNX3Q13761 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- TNIKQ9UKE5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- XRCC6P12956 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- ACTMAPQ5BKX5-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BPIFA1Q9NP55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNFNQ9BYD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRXO43186 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM168BA1KXE4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INTS11Q5TA45 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JUPP14923 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-5Q3LI72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-7Q3SYF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP21-2Q3LI59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-1Q3LI64 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-2Q3LI66 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP6-3Q3LI67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP7-1Q8IUC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MSX2P35548 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHB1Q9UF11-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TCF7L2 與 CTNNB1 透過 armadillo repeat 相互作用，並形成穩定的轉錄複合體；也有資料指出此複合體可與 PML-4 互動，且 TCF7L2 曾與 CTNNB1、FERMT2 一同在複合體中被鑑定。另有記載其與 EP300、NLK、TNIK、ZIPK/DAPK3、XIAP/BIRC4、TLE3、DDIT3/CHOP、SPIN1 及 TGFB1I1（By similarity）互動。CCDC85B 可能透過 HMG box 與 TCF7L2 互動，並阻止其與 CTNNB1 相互作用；MAD2L2 則會阻止 TCF7L2/TCF4 與啟動子結合，負向調節其轉錄活性。TCF7L2 與 C11orf84/SPINDOC 的互動依賴 SPIN1；其與 DAZAP2 的互動則使 DAZAP2 定位至細胞核。
疾病與遺傳關聯
來源指出，持續活化及其後續的標的基因轉錄活化，可能使原本應終末分化的細胞維持幹細胞特徵，包括持續增殖與長期存活；這被描述為結直腸癌的主要轉化事件。另有資料指出，影響 TCF7L2 的基因變異與第二型糖尿病易感性相關，屬風險關聯，並非因果證明。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCF7L2 參與 Wnt 訊號路徑，並以序列特異性方式結合 MYC 啟動子以調節其表現；無 CTNNB1 時具抑制作用，有 CTNNB1 時則可活化轉錄。TLE1、TLE2、TLE3、TLE4 會抑制其與 CTNNB1 介導的轉錄活化。表現顯性負向突變體會使細胞週期停滯於 G1 期，且 TCF7L2 對維持小腸上皮幹細胞區室是必要的。 | 含實驗來源 | 證據與來源Participates in the Wnt signaling pathway and modulates MYC expression by binding to its promoter in a sequence-specific manner. Acts as a repressor in the absence of CTNNB1, and as activator in its presence. Activates transcription from promoters with several copies of the Tcf motif 5'-CCTTTGATC-3' in the presence of CTNNB1. TLE1, TLE2, TLE3 and TLE4 repress transactivation mediated by TCF7L2/TCF4 and CTNNB1. Expression of dominant-negative mutants results in cell-cycle arrest in G1. Necessary for the maintenance of the epithelial stem-cell compartment of the small intestine PMID 12408868 ↗ · PMID 12727872 ↗ · PMID 19443654 ↗ · PMID 22699938 ↗ · PMID 9727977 ↗ |
| 交互作用 | TCF7L2 與多種蛋白質互動；它透過 armadillo repeat 與 CTNNB1 形成穩定轉錄複合體。CCDC85B 可能經 HMG box 互動並阻止 CTNNB1 結合，MAD2L2 會阻止其與啟動子結合並降低轉錄活性。TCF7L2/CTNNB1 複合體與 PML-4 互動；與 C11orf84/SPINDOC 的互動依賴 SPIN1，與 DAZAP2 的互動會使 DAZAP2 定位至細胞核。另記載其與 TGFB1I1（By similarity）、EP300、NLK、TNIK、ZIPK/DAPK3、XIAP/BIRC4、TLE3、DDIT3/CHOP、SPIN1 及 FERMT2 相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TGFB1I1 (By similarity). Interacts with CTNNB1 (via the armadillo repeat); forms stable transcription complex. Interacts with EP300. Interacts with NLK. Interacts with CCDC85B (probably through the HMG box); prevents interaction with CTNNB1. Interacts with TNIK. Interacts with MAD2L2; prevents TCF7L2/TCF4 binding to promZIPK/DAPK3oters, negatively modulating its transcriptional activity. Interacts with ZIPK/DAPK3. Interacts with XIAP/BIRC4 and TLE3. Interacts with DDIT3/CHOP. The CTNNB1 and TCF7L2/TCF4 complex interacts with PML (isoform PML-4). Identified in a complex with CTNNB1 and FERMT2. Interacts with SPIN1. Interacts with C11orf84/SPINDOC in a SPIN1-dependent manner. Interacts with DAZAP2; the interaction results in localization of DAZAP2 to the nucleus PMID 10080941 ↗ · PMID 11266540 ↗ · PMID 12446687 ↗ · PMID 12556497 ↗ · PMID 12727872 ↗ · PMID 16434966 ↗ · PMID 16714285 ↗ · PMID 17052462 ↗ · PMID 17873903 ↗ · PMID 19304756 ↗ · PMID 19443654 ↗ · PMID 19816403 ↗ · PMID 21454679 ↗ · PMID 22155184 ↗ · PMID 22258766 ↗ · PMID 22304967 ↗ · PMID 22699938 ↗ · PMID 24589551 ↗ · PMID 28829046 ↗ · PMID 29061846 ↗ · PMID 29739711 ↗ · PMID 9065401 ↗ · PMID 9916915 ↗ |
| 細胞定位 | TCF7L2 位於細胞核，呈瀰漫分布或出現在 PML 核體；在部分 PML 核體中，與 SUMO1 及 PIAS4 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus, PML body; Nucleus; Diffuse pattern. Colocalizes with SUMO1 and PIAS4 in a subset of PML (promyelocytic leukemia) nuclear bodies PMID 12727872 ↗ · PMID 22699938 ↗ · PMID 9916915 ↗ · PMID 19304756 ↗ |
| 疾病關聯 | 持續活化及後續標的基因轉錄活化，可能使本應終末分化的細胞維持幹細胞特徵，包括持續增殖與長期存活；來源將此描述為結直腸癌的主要轉化事件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Constitutive activation and subsequent transactivation of target genes may lead to the maintenance of stem-cell characteristics (cycling and longevity) in cells that should normally undergo terminal differentiation and constitute the primary transforming event in colorectal cancer (CRC) |
| 疾病關聯 | 第二型糖尿病是葡萄糖恆定失調的多因子疾病，與胰島素敏感性不足相關，常伴肥胖及代謝症候群表現，包括胰島素阻抗、高血壓和高三酸甘油酯血症，並可能造成眼、腎、神經與血管的長期併發症。影響 TCF7L2 的基因變異與疾病易感性相關，並非來源所述的因果證據。 | 含實驗來源 | 證據與來源Type 2 diabetes mellitus T2D A multifactorial disorder of glucose homeostasis caused by a lack of sensitivity to insulin. Affected individuals usually have an obese body habitus and manifestations of a metabolic syndrome characterized by diabetes, insulin resistance, hypertension and hypertriglyceridemia. The disease results in long-term complications that affect the eyes, kidneys, nerves, and blood vessels. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 125853 PMID 16415884 ↗ · PMID 24390345 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCAATAATCTCCGCTCCCAGACTACTCCGTTCCTCCGGA40TTTCGATCCCCCTTTTTCTATCTGTCAATCAGCGCCGCCT80TTGAACTGAAAAGCTCTCAGTCTAACTTCAACTCACTCAA120ATCCGAGCGGCACGAGCACCTCCTGTATCTTCGGCTTCCC160CCCCCCTTTGCTCTTTATATCTGACTTCTTGTTGTTGTTG200GTGTTTTTTTTTTTTTTACCCCCCTTTTTTATTTATTATT240TTTTTGCACATTGATCGGATCCTTGGGAACGAGAGAAAAA280AGAAACCCAAACTCACGCGTGCAGAAGATCTCCCCCCCCT320TCCCCTCCCCTCCTCCCTCTTTTCCCCTCCCCAGGAGAAA360AAGACCCCCAAGCAGAAAAAAGTTCACCTTGGACTCGTCT400TTTTCTTGCAATATTTTTTGGGGGGGCAAAACTTTTTGGG440GGTGATTTTTTTTGGCTTTTCTTCCTCCTTCATTTTTCTT480CCAAAATTGCTGCTGGTGGGTGAAAAAAAAATGCCGCAGC520TGAACGGCGGTGGAGGGGATGACCTAGGCGCCAACGACGA560ACTGATTTCCTTCAAAGACGAGGGCGAACAGGAGGAGAAG600AGCTCCGAAAACTCCTCGGCAGAGAGGGATTTAGCTGATG640TCAAATCGTCTCTAGTCAATGAATCAGAAACGAATCAAAA680CAGCTCCTCCGATTCCGAGGCGGAAAGACGGCCTCCGCCT720CGCTCCGAAAGTTTCCGAGACAAATCCCGGGAAAGTTTGG760AAGAAGCGGCCAAGAGGCAAGATGGAGGGCTCTTTAAGGG800GCCACCGTATCCCGGCTACCCCTTCATCATGATCCCCGAC840CTGACGAGCCCCTACCTCCCCAACGGATCGCTCTCGCCCA880CCGCCCGAACCCTCCATTTTCAGTCCGGCAGCACACATTA920CTCTGCGTACAAAACGATTGAACACCAGATTGCAGTTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。