基因總覽
TCF7（transcription factor 7）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 TCF/LEF 家族，具有轉錄調控角色。蛋白質含有 HMG box DNA 結合區，以及位於 N 端、可與 CTNNB1 結合的區域；不同異構型可能因是否保有此結合區而有功能差異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342854 ★ | 134,114,681–134,148,210 | 10 |
| ENST00000851078 | 134,114,645–134,148,210 | 10 |
| ENST00000395029 | 134,114,645–134,148,229 | 11 |
| ENST00001037395 | 134,114,645–134,148,229 | 11 |
| ENST00001037396 | 134,114,645–134,148,210 | 11 |
| ENST00001069031 | 134,114,645–134,148,237 | 11 |
| ENST00001135821 | 134,114,645–134,148,229 | 10 |
| ENST00000518887 | 134,115,201–134,142,262 | 5 |
| ENST00000517851 | 134,115,563–134,142,304 | 6 |
| ENST00000521639 | 134,115,563–134,142,752 | 6 |
| ENST00000522375 | 134,115,607–134,148,229 | 10 |
| ENST00000378560 | 134,115,607–134,148,229 | 10 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCF7 是轉錄活化因子，參與 T 細胞淋巴球分化。它對未成熟 CD4(+) CD8(+) 胸腺細胞的存活具有必要性；缺少 N 端 CTNNB1 結合區的異構型無法執行這項作用，顯示該區域與此功能相關。
TCF7 可結合 T 淋巴球特異性增強子序列（5'-WWCAAAG-3'）；此序列位於 CD3E 基因啟動子中，提供其參與基因轉錄調控的具體例子。另一方面，在 αβ T 細胞譜系中，TCF7 會抑制 T 細胞受體 γ 基因的表現；此作用的註記依據相似性推定。
TCF7 也被記載為天然殺手受體陽性淋巴組織誘導 T 細胞發育所必需，這項功能同樣標示為依相似性推定。轉錄活化作用則可受 TLE1、TLE2、TLE3 與 TLE4 抑制；這些因子抑制由 TCF7 與 CTNNB1 介導的轉錄活化。
此外，TCF7 可能作為 CTNNB1 與 TCF7L2 標的基因的回饋性轉錄抑制因子。此處為可能的作用描述，不應視為已確立的普遍機制。
Promoter 與基因調控
>TCF7 ENST00000342854 GRCh38 chr5:134113681-134114781 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGCGCGCCGTGGAGGCCCGCGTGGACGCAGACCCGGGTGCCATACAGATGCGCTGGAATCCAGGCACTT TCCCGCGCTCCGCAAATCTAGATGTTTCAGCCTGGATCGAGCGAGGGTTAGAGGGTTAGTCAGGCCAGGG TCAACTTCAGAGTCATGGGCTCCCTAAATGCGACTTCTAGGGTTGAGTTGCTGTGGACGAGCGACCCATG TCGGAATCCCGCGCCCACGTGGCTGCCCAAAGTTCCGAGTCTCCGGGCTGCAGGTTCTAGTCACGGAACC GAGTTGGGAGAGTCATAGGGGCTGGGACTTGGAGGATCGGCTGAGGTCCGGTGCTCTTGGCTGTGTTCGC GGCTCGGAGCCGTCGCCTGACTGAGGGGCCCGTCACAGATGTGTGATGTATAAGCTCTGCACGCAACAGG AGCTCAATAAATGTGCGAAGGGGGGTATACTTATGTTCGCACTGTATGCAGGCGGCCTAGAAGGAAGTCC CTGATTGGCACAGGGATGGAGGATGGGGCAAGAGCCGCAACAGCGCCGCGGAGTTCCAACGCTGCCGGTT CCCTGGGGTACGAGCACAGCCTCAAGCAGCCTCAAGCCCTAGGAAGCCCCCAGTTCAAAGCACAGGGCGC ATTGGAGCCTGGGCACGATACAGTTCACACCACGGCTGCGATGGTAAGCCACGCCCAAGTCCCAAGGGCC TAGGGGACCCCCGCCCTCCACAGCCGGAGGAGAAACCTGGGCGCAGAAAGCAGGGGGAATATCTGGTTGT AGGTGAGTAAGCGGGGTCAGGAGTTCCCGTTAGAGTCTCTGCGTTTCGGGAGAAGGGTGATCATTCCCAG GCTTGTCCGACGTCTCTCTCAGGGTGCGCTCCGGAAGAGCGAGCCCTTTAAGGCTATGCCGAGTGGGCGC GTCCCGGCCTCTCCCGGGAGAGGAGAGGCGGGGCGGACCTGTGTCCCGCCCCCGGCCCGGCCCGCCCCCA GTGCCCGCCCCGCCCCCGGCACTCGGCCGGCGGCGCCTTTGATGTTCCGACCCGCCAGCTCGCGGAGCCG CTCTGCCCCGCGCCCTAGCCCGCGCCTGCAGCCCGCCCAGGCGGAGTCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCF7_1 ↗ | 5:134,114,681 | 正股 | 134,114,632–134,114,691 |
| TCF7_2 ↗ | 5:134,115,613 | 正股 | 134,115,564–134,115,623 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_93Z886 · enhancer · 134110427–134110871 · regulatory
ENSR5_BZLLS · enhancer · 134111964–134112606 · regulatory
ENSR5_CHBBJ · enhancer · 134113359–134114529 · regulatory
ENSR5_85XGJM · promoter · 134114530–134114722 · regulatory
ENSR5_BZLM9 · promoter · 134115117–134115635 · regulatory
· motif · 134110554–134110562 · motif
· motif · 134110807–134110819 · motif
· motif · 134110809–134110822 · motif
· motif · 134111841–134111853 · motif
· motif · 134111894–134111914 · motif
· motif · 134112642–134112653 · motif
· motif · 134112702–134112717 · motif
· motif · 134112707–134112719 · motif
· motif · 134113794–134113809 · motif
· motif · 134113815–134113827 · motif
· motif · 134113817–134113824 · motif
· motif · 134114018–134114035 · motif
· motif · 134114238–134114251 · motif
· motif · 134114238–134114251 · motif
· motif · 134114331–134114343 · motif
· motif · 134114368–134114381 · motif
· motif · 134114368–134114381 · motif
· motif · 134114461–134114473 · motif
· motif · 134114463–134114470 · motif
· motif · 134114463–134114478 · motif
· motif · 134114494–134114505 · motif
· motif · 134114578–134114591 · motif
· motif · 134114635–134114648 · motif
· motif · 134114669–134114682 · motif
· motif · 134114923–134114936 · motif
· motif · 134115178–134115191 · motif
· motif · 134115562–134115571 · motif
· motif · 134115562–134115573 · motif
· motif · 134115572–134115584 · motif
· motif · 134115694–134115709 · motif
· motif · 134115695–134115708 · motif
· motif · 134115702–134115709 · motif
· motif · 134115894–134115902 · motif
· motif · 134116762–134116774 · motif
· motif · 134116831–134116843 · motif
· motif · 134116909–134116921 · motif
· motif · 134116970–134116982 · motif
· motif · 134116972–134116979 · motif
TCF7 的調控資料指出，TCF7L2 與 CTNNB1 參與其調控；來源未進一步說明此調控的方向、條件或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：384 aa
TCF7 屬於 TCF/LEF 家族，所列蛋白質長度為 384 個胺基酸。其 HMG box 位於第 269–337 位，註解為 DNA 結合區；N 端第 1–59 位為 CTNNB1 結合區。另有數段區域被註解為無序區，第 344–348 位則標示為核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCF7 的定位註記為細胞核；來源未提供不同異構型或條件下定位改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CTNNB1P35222 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MLLT11Q13015 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TCF7 可與 CTNNB1 的 armadillo repeat 結合並形成穩定複合體；也與 TLE5、TLE1、TLE2、TLE3、TLE4、MLLT11 和 DAZAP2 有互作。長異構型透過 N 端與 SOX13 互作，並抑制 WNT 介導的轉錄活性；此項功能關係不等同於來源所述的穩定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCF7 是參與 T 細胞淋巴球分化的轉錄活化因子，且對未成熟 CD4(+) CD8(+) 胸腺細胞存活不可或缺；缺少 N 端 CTNNB1 結合區的異構型無法執行此作用。它結合 CD3E 啟動子中的 T 淋巴球特異性增強子，並在 αβ T 細胞譜系抑制 T 細胞受體 γ 基因表現。天然殺手受體陽性淋巴組織誘導 T 細胞的發育需求，以及對 CTNNB1、TCF7L2 標的基因的回饋性抑制，均分別註記為依相似性推定或可能作用；TLE1 至 TLE4 可抑制 TCF7 與 CTNNB1 介導的轉錄活化。 | 推論支持 | 證據與來源Transcriptional activator involved in T-cell lymphocyte differentiation. Necessary for the survival of CD4(+) CD8(+) immature thymocytes. Isoforms lacking the N-terminal CTNNB1 binding domain cannot fulfill this role. Binds to the T-lymphocyte-specific enhancer element (5'-WWCAAAG-3') found in the promoter of the CD3E gene. Represses expression of the T-cell receptor gamma gene in alpha-beta T-cell lineages (By similarity). Required for the development of natural killer receptor-positive lymphoid tissue inducer T-cells (By similarity). TLE1, TLE2, TLE3 and TLE4 repress transactivation mediated by TCF7 and CTNNB1. May also act as feedback transcriptional repressor of CTNNB1 and TCF7L2 target genes |
| 交互作用 | TCF7 與 CTNNB1 的 armadillo repeat 結合並形成穩定複合體，也與 TLE5、TLE1、TLE2、TLE3、TLE4、MLLT11 及 DAZAP2 互作。長異構型可透過 N 端與 SOX13 互作；來源另指出此互作會抑制 WNT 介導的轉錄活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds the armadillo repeat of CTNNB1 and forms a stable complex. Interacts with TLE5, TLE1, TLE2, TLE3 and TLE4. Interacts with MLLT11. Long isoform interacts (via N-terminus) with SOX13; inhibits WNT-mediated transcriptional activity. Interacts with DAZAP2 PMID 11266540 ↗ · PMID 17218525 ↗ · PMID 19304756 ↗ · PMID 20028982 ↗ · PMID 26079538 ↗ · PMID 9488439 ↗ · PMID 9783587 ↗ |
| 細胞定位 | TCF7 的細胞內定位註記為細胞核；這筆資料未提供定位變化的條件、異構型差異或其他動態資訊。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | TCF7 的調控來源列出 TCF7L2 與 CTNNB1，但沒有進一步交代調控方向、發生條件或作用機制，因此不宜據此判定其上調或下調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGGCCGGCGGCGCCTTTGATGTTCCGACCCGCCAGCT40CGCGGAGCCGCTCTGCCCCGCGCCCTAGCCCGCGCCTGCA80GCCCGCCCAGGCGGAGTCAGCCCGCGCTCCGCCCGCCGCG120ATCCGAGCTCGGAGGTTCGGACTCCGGGCTCGCCGCCCCC160CGGGCCGGCTCCGCGCCCCGCACTCCCGGCGCCCAGCGCC200CCGCGCCCCGGCGGGCGGAGCGCACCATGCCGCAGCTGGA240CTCCGGCGGGGGCGGCGCGGGCGGCGGCGACGACCTCGGC280GCGCCGGACGAGCTGCTGGCCTTCCAGGATGAAGGCGAGG320AGCAGGACGACAAGAGCCGCGACAGCGCCGCCGGTCCCGA360GCGCGACCTGGCCGAGCTCAAGTCGTCGCTCGTGAACGAG400TCCGAGGGCGCGGCCGGCGGCGCAGGGATCCCGGGGGTCC440CGGGGGCCGGCGCCGGGGCCCGCGGCGAGGCCGAGGCTCT480CGGGCGGGAACACGCTGCGCAGAGACTCTTCCCGGACAAA520CTTCCAGAGCCCCTGGAGGACGGCCTGAAGGCCCCGGAGT560GCACCAGCGGCATGTACAAAGAGACCGTCTACTCCGCCTT600CAATCTGCTCATGCATTACCCACCCCCCTCGGGAGCAGGG640CAGCACCCCCAGCCGCAGCCCCCGCTGCACAAGGCCAATC680AGCCCCCCCACGGTGTCCCCCAACTCTCTCTCTACGAACA720TTTCAACAGCCCACATCCCACCCCTGCACCTGCGGACATC760AGCCAGAAGCAAGTTCACAGGCCTCTGCAGACCCCTGACC800TCTCTGGCTTCTACTCCCTGACCTCAGGCAGCATGGGGCA840GCTCCCCCACACTGTGAGCTGGTTCACCCACCCATCCTTG880ATGCTAGGTTCTGGTGTACCTGGTCACCCAGCAGCCATCC920CCCACCCGGCCATTGTGCCCCCCTCAGGGAAGCAGGAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。