基因總覽
TCF21 的正式名稱為 transcription factor 21，屬於蛋白質編碼基因。其產物與腎臟及肺臟的形態發育相關，並可能參與心外膜細胞類型的指定或分化。現有資料指出其作用涉及上皮與間質之間的互動，但未提供更完整的蛋白質家族或結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367882 ★ | 133,889,113–133,892,257 | 2 |
| ENST00000237316 | 133,889,106–133,896,857 | 3 |
| ENST00000903811 | 133,889,106–133,895,536 | 3 |
| ENST00001123154 | 133,889,106–133,892,257 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCF21 參與腎臟與肺臟形態發育過程中的上皮—間質互動。來源將此作用與上皮分化及分支形態發生一併描述，指出 TCF21 涉及的發育互動包括這兩類過程；但未進一步說明其作用方向、調控步驟或具體分子機制。
在心外膜方面，TCF21 可能參與一種或多種心外膜細胞亞群的指定或分化。這項描述採保留語氣，表示其角色仍屬可能，且資料未指出涉及哪些特定亞群，也未提供其作用方式或實驗條件。
Promoter 與基因調控
>TCF21 ENST00000367882 GRCh38 chr6:133888113-133889213 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTCTACCTACTTCCCAGGAGACTTTCTTATTCTCTAGGAAAGGTGGTTCGAGCTGGGGTTAAAGATGGA AAAGAACCTTTCTCAAAAGGATAGTCTTGCTTTGTGTTGTGTAATGTCAGCTTCATGTGAGGAACACTGG CACCTAACAGGCTGGAAGAAGACAAAGACAGCAGCATTGAAAGGGACGGTGCATCACAAAAAGTGCCAGG CAAGGTGATGTCTGAGAGCAACAAAGACTCTCAAGGCAATATTAAATGCATTTCTAGAAAAGAAAAAAAA ACCGAGGGGAAAGTTTCCATTTATTAGGAAAAGATGATCAACTAACATAATGTTTTCCACACACTCATAC TGCCCTCTCATTCCCTACCCACTCCCACTAAGCTGTGTGTGGTTGGGTTTGAGTGTGCAAATCAAGTATG TTTGTGTACACGTAGGCAGTCCTTTGATGTCTTGAAAATGACCAGGTGTAGGTGAAATGTTTTATACTTA CTTTTCCATCACCATAAAGATTCTAGGAAGCACTTGTCTTCATTTATCCCGGGGAAGGTGGAAGATCTCG GTAAAGCCTTGGAGTCTTATGAGGTGTTGGCAGGATGCGGTTGATACTCCCTGTATTTTAATTCGTGTTT TCTTGGGAGGAGAGAGGGCATGGAGTGTAGGTGGAAGGCCCAGAAAGAGCCAAACGATCTAGTCGTTTTT CTAAAGTTCTCAGTAACAACCAGTTGTGACGTCTTAAGAGAGAAAGAAGGCCTTTTACAGATGGACAGAA CATGCTGCTTCTCGGCCCCGGCCACAGTTGGGAGAAGGTGGCTGGTAAGTACATGATGCAGTTGAGTTGA TTTACATTACAAGTTGCAAATCAGGGTCTGTGCATTGAGTTTCCCTCCGGTTGTGAAAGGGGTCTAAGCG CTTTGCTGGGGCCTGGCAGGCCCCTCCCTGGGCTGCAAGGATCCGCCCCTCTATTCCCCAGATAAATTCC TAGTGTCCACCAAATTCCTCAGCGCTCGCTCACCCTCCTCTACGGCCACGACTCTGGGAGTGGGGAAACA GAGAGCCGGTTCCTCTGCTGCAGAAGTCCTCGGGGTTCCTTCTCACAACTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCF21_1 ↗ | 6:133,889,113 | 正股 | 133,889,064–133,889,123 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_93Z5SZ · enhancer · 133888686–133888971 · regulatory
ENSR6_85X9P4 · promoter · 133888972–133889123 · regulatory
ENSR6_85X9P7 · enhancer · 133889124–133889322 · regulatory
ENSR6_536H9P2 · promoter · 133889323–133889345 · regulatory
ENSR6_536H9R5 · CTCF_binding_site · 133889777–133889798 · regulatory
ENSR6_CH9PF · enhancer · 133890763–133891925 · regulatory
ENSR6_93Z5TW · promoter · 133891926–133892198 · regulatory
ENSR6_85X9R7 · enhancer · 133892561–133892791 · regulatory
ENSR6_93Z5W7 · promoter · 133892792–133893292 · regulatory
· motif · 133889779–133889795 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：179 aa
TCF21 蛋白長 179 個胺基酸。其 bHLH 結構域位於第 79 至 131 個胺基酸；另有一段被註記為無序區域，位於第 20 至 87 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCF21 的定位註記為細胞核；來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYOD1P15172 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF12Q99081-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TCF21 與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體，是有效 DNA 結合所需的條件。資料特別指出，TCF21 可與 TCF3 形成異源二聚體，並結合 E box 序列（5'-CANNTG-3'）。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCF21 參與腎臟與肺臟形態發育中的上皮—間質互動，相關過程包括上皮分化與分支形態發生。此外，TCF21 可能參與一種或多種心外膜細胞亞群的指定或分化；此作用以可能性描述，未指明具體細胞亞群。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Involved in epithelial-mesenchymal interactions in kidney and lung morphogenesis that include epithelial differentiation and branching morphogenesis. May play a role in the specification or differentiation of one or more subsets of epicardial cell types |
| 交互作用 | TCF21 要有效結合 DNA，需與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體。具體而言，TCF21 可與 TCF3 形成異源二聚體，並結合 E box 序列 5'-CANNTG-3'。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein. Forms a heterodimer with TCF3 and binds the E box (5'-CANNTG-3') |
| 細胞定位 | TCF21 的細胞定位為細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCGCTCGCTCACCCTCCTCTACGGCCACGACTCTGGGAG40TGGGGAAACAGAGAGCCGGTTCCTCTGCTGCAGAAGTCCT80CGGGGTTCCTTCTCACAACTCTGCGAAGGGGAAAGGGTTG120TGAGACCCAACCAGACCCCAACTCCAGCTCCCAGCAGGAG160GTGGCTGCGCCACACTCGGGAGGCCTCTTGGTTTCAGGGT200CTCTCTGTCTCTCTCTCACCCTCTTCCTCGCTTTCTCTGT240CTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCGTCCACTCCCC280CAAACATGTCCACCGGCTCCCTCAGCGATGTGGAGGACCT320TCAAGAGGTGGAGATGTTGGAATGTGACGGGTTGAAAATG360GATTCGAACAAGGAATTTGTGACTTCCAACGAGAGCACCG400AGGAGAGCTCCAACTGCGAGAATGGGTCTCCCCAGAAGGG440CCGCGGCGGCCTGGGCAAGAGGAGGAAGGCGCCCACCAAG480AAGAGCCCCCTGAGCGGGGTCAGCCAGGAGGGGAAGCAGG520TCCAGCGCAACGCCGCCAACGCGCGAGAGCGGGCCCGCAT560GCGAGTGCTGAGCAAGGCCTTCTCCAGACTCAAGACCACC600CTGCCCTGGGTGCCCCCCGACACCAAGCTCTCCAAGCTGG640ACACGCTCAGGCTGGCGTCCAGCTACATCGCCCACTTGAG680GCAGATCCTGGCTAACGACAAATACGAGAACGGGTACATT720CACCCGGTCAACCTGACGTGGCCCTTTATGGTGGCCGGGA760AACCCGAGAGTGACCTGAAAGAAGTGGTGACCGCGAGCCG800CTTATGTGGAACCACCGCGTCCTGACCTTGGAGGTGCGAG840TCTGGGAAAGGCGCGCTCCCGGGGGGAGCGGGCCCCGGGA880AGGCGACCCCTGCCCTCAGTGCTCTCTGTCTCTGCTTCCC920CCTCGCAATGCTCCTCTCTCTGTCCCACCCCGCGAGAACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。