基因總覽
TCF19 的正式名稱為 transcription factor 19，屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物描述為可能具有轉錄因子作用；不過，來源未提供其家族分類或完整的結構與生化特性，因此無法據此進一步界定。其可能涉及的細胞週期相關調控，詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376257 ★ | 31,158,589–31,164,215 | 4 |
| ENST00000542218 | 31,158,331–31,167,252 | 6 |
| ENST00000706778 | 31,158,331–31,164,311 | 5 |
| ENST00000706780 | 31,158,331–31,164,311 | 5 |
| ENST00000706781 | 31,158,331–31,164,311 | 5 |
| ENST00000706783 | 31,158,331–31,164,311 | 5 |
| ENST00000706786 | 31,158,331–31,164,311 | 5 |
| ENST00000376255 | 31,158,331–31,164,215 | 4 |
| ENST00000706787 | 31,158,331–31,164,311 | 4 |
| ENST00000866485 | 31,158,331–31,164,215 | 4 |
| ENST00000971426 | 31,158,331–31,163,778 | 4 |
| ENST00000971427 | 31,158,331–31,163,778 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCF19 的產物被描述為潛在的轉錄因子，可能參與細胞週期 G1/S 轉換相關基因的調控。這項描述屬於可能的功能，來源並未將其表述為已確定的調控作用。
可能的分子作用方式之一，是與基因的調控元件結合。來源指出，這些目標包括轉錄因子 FOXO1 的啟動子；因此，TCF19 可能藉由與特定基因調控區域接觸，參與相關基因表現的調節。資料未進一步說明這種結合對 FOXO1 表現的影響方向，也未描述調控所需的其他分子或條件。
目前可據此整理的功能範圍，主要是其可能參與 G1/S 轉換相關基因調控，以及可能結合包括 FOXO1 啟動子在內的基因調控元件。來源未提供更詳細的細胞週期機制或其生物學效應，因此不宜據此推定其對細胞週期進程的具體影響。
Promoter 與基因調控
>TCF19 ENST00000376257 GRCh38 chr6:31157589-31158689 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGTGGCCACATGCAGGGCTAGACCCTCCCCAAGACCTTGGGAATCCAGGCCGCCTAGATCCCCAGGCAG AAAAGCCAGCGTCCTGACATCTTATTCAAATCTTTCCTGCGGCTGTTCTCTCAGCTTCTCTCTACTATCC CCTTAGCTTCCATGCCTGCTGCCCGCCTCCTCTTTCTCGAGTCCTAACACATAGTGGGCACTTTAAGATC TTCCTCCCACCCTCCCACCCTCATTAATCTATTTTTTACCCGAATCTGGGATCCCTACTCCCGTCCCTTT TTACAACCTAATCTACCTTTTTCTGAAGGAATTATTCTGGTCCTGACCCTCACCCCCATCTCTCAATAGC CTGCCCTCGCCCCCTGTACGCTAGCCGGCTCTACTCTCCCACCACTGCTCCCCTAGATACCCGAGGCTTC ACCCAGTTAGCCCGTGAGCTCTAAGGCTGTTCTGATCTCTTCATCTGTCCCTTCACCTGGCCCCTGTACC CCCTTCCCCTTTGGACCCCTTGAACCCTCCCAGGACCCCCGCTCAGCCCCTTCCCGCCCCCAACCGACTC TTCCCGAACGTCCCTTACCAACCGCGAGAGCCCCCTACTGCGCTTTGGCCACACCCCCTACGCCTCGCTC CCGGCCCCGCCTCTGCCCCTGACCGCGCCTGCGCAAGGCGGGCGCCCTAAAGTCCTATTTCACTCTGTTG GGAGGAGGGGGAAAGGTGTACGCAGGCGCAGTGGCGTCTAAATTTGGGCCCACTAAATGCGTCGGAGCAT CTCCGCGCCCAGGCGGCTCCTCCTCACTGCGGCAACCCGGGAAAACTTGTGAACTAATCAGAAAAAGTGG AAGGCGGGAGATCTTGGGGCGCTGTCCAATGGCGCGGAAGAGAACACATGAGCTGGCCAATCGGGAACGG CACGGGGGCGGGCTCGCTCGGCGCGAAGTTCGGGCCCGGGAATTCCGAAGGAGGGGTAGGCGCTGCCCGC GCGCAGAGGCCGCGCCCCTCCTGGCCCCGGCTTCTTGGCTGTCAAACAGATGCAGCAACGTCGGCTCCTG CCGAGGAGCCCAAGGGGTCCCGGGATCCGCCGCACAGGCTGGCACTGCTTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCF19_1 ↗ | 6:31,158,589 | 正股 | 31,158,540–31,158,599 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B86XS · promoter · 31157597–31158599 · regulatory
· motif · 31158167–31158184 · motif
· motif · 31158242–31158253 · motif
· motif · 31158242–31158253 · motif
· motif · 31158289–31158299 · motif
· motif · 31158307–31158318 · motif
· motif · 31158307–31158318 · motif
· motif · 31158502–31158512 · motif
· motif · 31158577–31158587 · motif
· motif · 31159339–31159347 · motif
· motif · 31159339–31159354 · motif
· motif · 31159339–31159356 · motif
· motif · 31159691–31159708 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：345 aa
TCF19 蛋白質長 345 個胺基酸。其序列註解包括位於第 31–88 位的 FHA domain、第 293–342 位的 PHD-type zinc finger，以及第 190–227 位的無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- BLZF1Q9H2G9 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- E2F6O75461 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFKBIDQ8NI38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOXA1Q86UR1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDLIM7Q9NR12 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PFDN5Q99471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RHOHQ15669 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIB3Q96RU7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZGPATQ8N5A5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF474Q6S9Z5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCF19 可能是轉錄因子，並可能參與細胞週期 G1/S 轉換相關基因的調控；其可能結合基因調控元件，目標包括轉錄因子 FOXO1 的啟動子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Potential transcription factor that may play a role in the regulation of genes involved in cell cycle G1/S transition. May bind to regulatory elements of genes, including the promoter of the transcription factor FOXO1 PMID 1868030 ↗ · PMID 31141247 ↗ |
| 細胞定位 | TCF19 蛋白質位於細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTGGCCCCGGCTTCTTGGCTGTCAAACAGATGCAGCAACG40TCGGCTCCTGCCGAGGAGCCCAAGGGGTCCCGGGATCCGC80CGCACAGGCTGGCACTGCTTGAAGAGGAGGCTACTCGGAG120ACTGCGCCGCGCGGTGGATTCATTGCCCTCGGAGGTTCAA160CCAGTTATGAGTGAGGGATTGGCCAGAAGATCGGGGCGCA200GGCAAGCAGGAGTGCTCTATTAGGATAAGCAAGTTTGACA240GGAAGAAGCTACTCTTCTCCGAATTACACAGAGGTGATGT280GTTCGTATTGCACGTAGACGTGTGTATAACAGGACCTCCT320TCCCCGCGCCCCGCCACCCCGACACACACAGGAGCTGCCT360AAAGTATCCTTGCCTTGCAGATTGGAGGCTCCCCAAATAT400TTTGCGATCTGAGGATCCAGCTCAAGTGAGGTGCCATAGG440ACGTGTTCCTGAGTTTGCATTGCACGGAGACCTTCCTGGA480ATTTTTCATTTGCAAGTCGGCTTAACCAATTTTGCATTGA520GTCCTAGGCTGCTTGCACTCTGAATTTGGGCTATTCAGGT560AGTGTGCTCAAAGTTGAAACCGCATACAGCACAACTCAAG600TTTGCATCAGACTGGGAAGCGAACTTAAGCCAGCGGTGCG640TGGCCCAGGAGTGGGAAAGGAAATGGATGCCTGAAGTGGA680AGAGGTGGTGCAGAGGGGGCACCGCCCATGCTGCCCTGCT720TCCAACTGCTGCGCATAGGGGGCGGCAGGGGCGGTGATCT760CTACACCTTCCACCCCCCCGCCGGGGCTGGCTGCACCTAT800CGCTTGGGCCACAGGGCCGACCTGTGTGATGTGGCCCTGC840GGCCCCAGCAGGAGCCTGGCCTCATCTCTGGGATCCACGC880CGAACTGCATGCCGAGCCCCGGGGTGATGACTGGAGGGTC920AGCCTGGAAGACCACAGCAGCCAAGGTACTTTGGTCAATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。