基因總覽
TCF15（transcription factor 15）是蛋白質編碼基因，產物屬於 basic helix-loop-helix（bHLH）轉錄因子。其蛋白質長 199 個胺基酸，具有 bHLH 結構域，並含有一段被註記為無序區域的序列。作為早期轉錄因子，TCF15 涉及胚胎發育及幹細胞狀態調控；具體的 DNA 結合與轉錄調節方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000246080 ★ | 604,257–610,309 | 2 |
| ENST00001132999 | 603,801–610,316 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCF15 是早期轉錄因子，參與體節形成、旁軸中胚層發育及幹細胞多能性調控。在體節形成相關的間質轉為上皮轉換過程中，TCF15 是必要因子，也有助於體節形態發生。這些作用與軸骨骼及骨骼肌的模式形成相關；該轉換期間，體節上皮標記的正確定位也需要 TCF15。
在胚胎幹細胞（ESCs）中，TCF15 促進多能性退出，方式是使細胞預備進入分化。對造血幹細胞（HSCs），TCF15 則是自我更新的重要調節因子，透過維持其靜止狀態，支持長期自我更新。這些作用顯示其在不同幹細胞情境中，涉及多能性轉變與自我更新調控。
TCF15 也與心臟內皮細胞中的脂肪酸運輸調控有關；它與 MEOX2 一同調節這些細胞的轉錄，進而調節脂肪酸跨越心臟內皮細胞的運輸。
分子作用上，TCF15 可與另一個 bHLH 蛋白形成異二聚體，例如 TCF3/E12。這種二聚化是有效 DNA 結合所需；形成的複合體可辨識 DNA 上的 E-box 基序（5'-CANNTG-3'），並活化目標基因的轉錄。
Promoter 與基因調控
>TCF15 ENST00000246080 GRCh38 chr20:610209-611309 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGGATTCCAAGAGGTAGTGAAACCGGACAGGCTGGAGCTAGCGCCGCCACTCCCACCTGTACGACTGAA GGCCGGAGCTCTCTGACCTGTAACTCAGGGCTGCCATCCTGCAGCCTCAGCTGGGCGCAATAGAGTATAT AGCACCGAGTCTGGTACACAGTAGTTCCTTAACCAAAACGTCAGTTCCGTGAGGGTGAAGAATTTATTTT GTTAATGGCTGTATCCTCAGACCTAAAACCATGTCTGACACATAGTAGGGACCCAACGAATATTTGTTGA AAAAACGAACGAACTACTGGTGTTTGTGTATTGTGGTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTA AGTTTGTCTTCAGGGACAAGACACTGTCGAATCCTCATTTGGAAAGATTATAGCTTTTCTCCAAGTGTTC TCCACGGACACCACCACTATCACCAATGGCTTGTTACAAAATGTAGGTTCCTGGGCCCGTTCCAGAACTG CTCAATCAGAATGGGAGCAATTTGGGACTCTGTAATAGCAAAAGCCCCTTCCCCAGTTCTTACGCACGTG AAAGCTGCAGAACTACAGGATTAGAATTGGAGGGCAGGCAGACACTAGCTGTTTCTCTGCAATCTGAACG TTCCGAACGAGGAAACTGAGGCCCAGAGAGGAGAAAGGGATCTGCCCGCGTCTCCCAGGTGGTCCAGGCT GGAGACAAAAAGTTCGGATCTGGGCCCACCCCGGCCGACCCTCCCAGACCTCCAGCATCTGCCGGGCTAG CCAGCCGGGAACGGGGGCCTTCGGGGTGGGCCGCCGGCTCCCGGGCCGCTTTCAACCTGGGGGACGGAGG CGGTGGGAGCGTCGCCATTGGCCAGGGCGCGGCGGACGCCTCCCCATTGGCCGGGCGGACGCCTCCCCAT TGGCCGGGCGGAGCCCTCCGCCCCCGGCCGGGGCGGCCTTGCCATTGGCCCCTCCCTCGCCTATAAGGCG GGGGCCGGCGGGGCCGTGGGAGCGCGCGGGAGCGCACGGCGGGGCGCGGCCGACGCTGGGACGCGGCGCA CGGAGGGACGCGGCCGGCGCCCATGGCGTTCGCGCTGCTGCGGCCCGTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCF15_1 ↗ | 20:610,309 | 負股 | 610,299–610,358 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_98JM · promoter · 610299–610644 · regulatory
ENSR20_B59J · enhancer · 611409–612277 · regulatory
· motif · 610342–610352 · motif
· motif · 610375–610385 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：199 aa
TCF15 蛋白長 199 個胺基酸。第 72 至 124 位胺基酸註記為 bHLH 結構域；第 25 至 67 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TCF15 的細胞定位註記為細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TCF15 可與另一個 bHLH 蛋白形成異二聚體，例如 TCF3/E12；與 bHLH 蛋白二聚化是有效 DNA 結合所需。另有資料記載 TCF15 與 MEOX2 互作，但未進一步說明該互作的形式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCF15 是參與體節形成、旁軸中胚層發育及幹細胞多能性調控的早期轉錄因子；它對體節形成相關的間質轉為上皮轉換、體節形態發生及上皮標記正確定位均屬必要，並關聯軸骨骼與骨骼肌模式形成。它促進胚胎幹細胞退出多能性，也透過調節造血幹細胞靜止狀態支持長期自我更新；此外，與 MEOX2 一同調節心臟內皮細胞轉錄及脂肪酸運輸。TCF15 可與其他 bHLH 蛋白形成異二聚體，結合 E-box 並活化目標基因轉錄。 | 推論支持 | 證據與來源Early transcription factor that plays a key role in somitogenesis, paraxial mesoderm development and regulation of stem cell pluripotency. Essential for the mesenchymal to epithelial transition associated with somite formation. Required for somite morphogenesis, thereby regulating patterning of the axial skeleton and skeletal muscles. Required for proper localization of somite epithelium markers during the mesenchymal to epithelial transition. Also plays a key role in regulation of stem cell pluripotency. Promotes pluripotency exit of embryonic stem cells (ESCs) by priming ESCs for differentiation. Acts as a key regulator of self-renewal of hematopoietic stem cells (HSCs) by mediating HSCs quiescence and long-term self-renewal. Together with MEOX2, regulates transcription in heart endothelial cells to regulate fatty acid transport across heart endothelial cells. Acts by forming a heterodimer with another helix-loop-helix (bHLH) protein, such as TCF3/E12, that binds DNA on E-box motifs (5'-CANNTG-3') and activates transcription of target genes |
| 交互作用 | TCF15 與另一個 bHLH 蛋白形成異二聚體，例如 TCF3/E12；與這類蛋白二聚化是有效 DNA 結合所需。資料亦記載 TCF15 與 MEOX2 互作，但未提供互作形式或其條件。 | 推論支持 | 證據與來源Heterodimer; efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein, such as TCF3/E12. Interacts with MEOX2 |
| 細胞定位 | TCF15 的細胞定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCGCGCGGGAGCGCACGGCGGGGCGCGGCCGACGCTGGG40ACGCGGCGCACGGAGGGACGCGGCCGGCGCCCATGGCGTT80CGCGCTGCTGCGGCCCGTCGGCGCGCACGTGCTGTACCCG120GACGTGCGGCTGCTGAGCGAGGACGAGGAGAACCGCAGCG160AGAGCGACGCGTCGGACCAGTCGTTCGGCTGCTGCGAGGG200CCCGGAGGCGGCGCGGCGCGGCCCGGGCCCCGGGGGCGGG240CGGCGGGCGGGCGGCGGCGGCGGCGCGGGCCCCGTGGTGG280TGGTGCGACAGCGGCAGGCGGCCAACGCGCGGGAGCGGGA320CCGCACTCAGAGCGTGAACACGGCCTTCACGGCGCTGCGC360ACGCTCATCCCCACCGAGCCGGTGGACCGCAAGCTGTCCA400AGATCGAGACCGTGCGCCTGGCGTCCAGCTACATCGCGCA440CCTGGCCAACGTGCTGCTGCTGGGCGACTCGGCCGACGAC480GGGCAGCCGTGCTTCCGTGCCGCGGGCAGTGCCAAGGGCG520CCGTCCCCGCCGCCGCCGACGGCGGCCGCCAGCCGCGCTC560CATCTGCACCTTCTGCCTCAGCAACCAGCGCAAGGGGGGT600GGCCGTCGTGACCTGGGGGGCAGCTGCTTGAAGGTGAGGG640GGGTGGCCCCCCTTCGAGGGCCACGGAGATGAGCCTGGAC680CCTGGAGAAGGAGGCCAGGAGCCAGCCACTGGCTGGACAG720GGAAGAAGACCCCAGGAGCCAAGCCCACCCCTTCTTTGTG760TAGGGACCGGGGGACCATGGCCTGTTCCGGGACACTCTGG800GCAGGGCCCTCGGGACATCTCCACCCGATCCTGGAGAGCT840GTGAGGATCCATTCAGCCTGCCCAGCTCTGGCTGGTCAGA880GACAAGGCAGAACTTTTGGAAAAACAAAGACTGTTGGTGA920CAGGGTGTGTGTGTATCTGTGCGTGAGTGTGAGTGTGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。