基因總覽
TCEA2 是蛋白質編碼基因，其產物為 transcription elongation factor A2，屬於參與轉錄延伸的因子。現有資料指出，這個蛋白質與 RNA polymerase II 延伸過程相關；其胺基酸序列長度及結構區域另見蛋白質特徵說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343484 ★ | 64,063,198–64,072,347 | 10 |
| ENST00000361317 | 64,057,293–64,072,346 | 11 |
| ENST00000881796 | 64,063,088–64,072,347 | 11 |
| ENST00000881798 | 64,063,088–64,072,347 | 10 |
| ENST00000881799 | 64,063,088–64,072,352 | 10 |
| ENST00000935688 | 64,063,088–64,072,347 | 9 |
| ENST00000940922 | 64,063,088–64,072,342 | 10 |
| ENST00001006646 | 64,063,088–64,064,143 | 2 |
| ENST00001057011 | 64,063,088–64,072,346 | 10 |
| ENST00001118946 | 64,063,088–64,072,347 | 10 |
| ENST00001118947 | 64,063,088–64,072,346 | 10 |
| ENST00001133282 | 64,063,088–64,072,347 | 10 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TCEA2 產物有助於 RNA polymerase II 有效完成轉錄延伸，尤其是在 DNA 模板含有會使聚合酶停滯的位點時。這些位點可能使部分正在延伸的 RNA polymerase II 被困住，形成無法繼續延伸的鎖定三元複合體，因此轉錄進程會受到阻礙。
來源描述，S-II 可切割新生 RNA 轉錄本，產生新的 3′ 末端；RNA polymerase II 隨後可從這個新末端恢復延伸。TCEA2 因而與協助轉錄機器越過模板編碼的停滯位點有關，並支持 RNA 合成持續進行。資料未進一步說明此作用在特定細胞或生理條件下的差異。
Promoter 與基因調控
>TCEA2 ENST00000343484 GRCh38 chr20:64062198-64063298 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCACACCCTCCCCCAGGATTGTGCCCTCTCCAGGAAACCACCCAGCATCTGCATTACTGGGGAGCTGCC AGGCAGTGGTGGGGATGCTGGCCCTGCACCTGTCCCCGTCCTCAACCCTCCCTAGGCCTGGGCCATCTCT CTGGCTGCCTGCAGTCTGGCCCTACCTAGGGACCTCCAACAACAATGTCAATGAACACTAATTGTCATGC TCCATCCCCTCTCTGTTCTCAGGCATGTGATGTGAATCAGCTGACATCATCTTGACGGGAGCCCTGTGAG GCGGACACTTAACTCCAGTTTCACAGGTGGGGAGACTGAGACACAGTGGTCAACGTGCAGAGCCCAGAAT CTGCTCCCTGGTAGCTGACTTTGCAGGCAGGGGCCTTGCCCACGCAGCCTCGGCAGAGGCCCCCGCACTT CGCGAACCCCAGCAATGGCCCCTTCCAGACGCCACGTCCAGCTACCGCGCGCTCACACCTGCAGGGCCCC ACAAGAGGCCTCCCAGTGTGCGCGGGCCTCTTGAAGAAGTAACTCTACTCAGAAGCCCGAATGACCCAAA CTGGGCTCTGGGAGGCTGGGGACGGCCTTCTAGGCCAAGTGGGGCGCGCGCAGGGCTCAGCGGGGCCCAA GAGAAGGGCTGAGGGCACTGGGTCCTGAGCCACCCACCGAAGGACGCCGCGGGACAGCAAGGCCCGAAGC AGGAGGAGAGAAGGGAGCAGATTCCTGGGCCTCCTGGGGCCCGGTCGCTCCGGGATGTCTGAGCTCTGGG AGGGGCGTGCCCGGGGCGCCTCCCTCGCGGGGTATTGTGGGATCACGAGTCACTGGCGACGGTGGGTCAG GACTACACTTCCCAGGAGGCTGTGCGCGCCGCGTGGCGCCTGGGAGTTGTGGTCCAGAGCGCGGGCGCGG CGGGCGCGGCAGGCGGGCGCGTGGACTACGCATCCTAGGATGCCGCGCGCGGCCGCGGGGCCGAGGGTTT GAACCGGGGGTCTGTCGTCCGCGGCGGGGCTGCGTCGGCTGCGGCGGGTGTGGGAGGTGGCGACGGCCGG GGCCGGGGTCCTGCCCGGCTGCGGAGGCGGGCGCGACGGGCGCGGGGGTCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TCEA2_1 ↗ | 20:64,063,206 | 正股 | 64,063,157–64,063,216 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_C8CLS · enhancer · 64057304–64058897 · regulatory
ENSR20_5K3RZN · CTCF_binding_site · 64058607–64058628 · regulatory
ENSR20_5K3S2T · CTCF_binding_site · 64058865–64058886 · regulatory
ENSR20_BGP9C · promoter · 64062668–64063208 · regulatory
ENSR20_C8CM9 · enhancer · 64063209–64064855 · regulatory
· motif · 64058244–64058256 · motif
· motif · 64058247–64058254 · motif
· motif · 64058258–64058267 · motif
· motif · 64058382–64058389 · motif
· motif · 64058609–64058625 · motif
· motif · 64058621–64058636 · motif
· motif · 64058629–64058636 · motif
· motif · 64058629–64058644 · motif
· motif · 64058664–64058677 · motif
· motif · 64058683–64058695 · motif
· motif · 64058685–64058700 · motif
· motif · 64058867–64058883 · motif
· motif · 64058973–64058985 · motif
· motif · 64058975–64058982 · motif
· motif · 64058975–64058990 · motif
· motif · 64063045–64063058 · motif
· motif · 64063045–64063058 · motif
· motif · 64063254–64063270 · motif
· motif · 64064373–64064386 · motif
· motif · 64064373–64064386 · motif
· motif · 64064388–64064402 · motif
· motif · 64064389–64064402 · motif
· motif · 64064806–64064817 · motif
· motif · 64065235–64065250 · motif
· motif · 64065348–64065358 · motif
· motif · 64065353–64065363 · motif
· motif · 64066196–64066209 · motif
· motif · 64066196–64066209 · motif
· motif · 64066200–64066207 · motif
· motif · 64066352–64066364 · motif
· motif · 64066355–64066362 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：299 aa
transcription elongation factor A2 長 299 個胺基酸，屬於 TFS-II family。其序列包含 TFIIS N-terminal domain（第 6–83 位）、TFIIS central domain（第 138–254 位）及 TFIIS-type zinc finger（第 257–297 位）；第 86–128 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
transcription elongation factor A2 位於細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 113 個夥伴
- ADAMTSL4Q6UY14-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGR2O95994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGTRAPQ6RW13-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ALAS1P13196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AMOTL2Q9Y2J4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARMC10Q8N2F6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AXIN2Q9Y2T1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BACH2Q9BYV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BICD2Q8TD16-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BOLLQ8N9W6-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BTBD6Q96KE9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBY2Q8NA61-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC136Q96JN2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC157Q569K6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP44Q9C0F1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM4Q8IZR5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM6Q9NX76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNTROBQ8N137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COX20Q5RI15 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAB1O75553 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DESP17661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EAF1Q96JC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
transcription elongation factor A2 與基礎轉錄因子 GTF2B 及 REXO1 有交互作用；資料未進一步界定這些關係是否代表同一複合體或特定功能結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TCEA2 對 RNA polymerase II 有效越過 DNA 模板上的停滯位點是必要的。這類位點會困住部分通過其中的延伸中聚合酶，形成鎖定的三元複合體；S-II 切割新生轉錄本後，延伸可從新的 3′ 末端恢復。 | 含實驗來源 | 證據與來源Necessary for efficient RNA polymerase II transcription elongation past template-encoded arresting sites. The arresting sites in DNA have the property of trapping a certain fraction of elongating RNA polymerases that pass through, resulting in locked ternary complexes. Cleavage of the nascent transcript by S-II allows the resumption of elongation from the new 3'-terminus PMID 12034815 ↗ · PMID 41062692 ↗ |
| 交互作用 | TCEA2 與基礎轉錄因子 GTF2B 及 REXO1 有交互作用；這項敘述未提供交互作用的條件或其功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the basal transcription factor GTF2B. Interacts with REXO1 PMID 12943681 ↗ · PMID 8566795 ↗ |
| 細胞定位 | TCEA2 的細胞內定位為細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCGGCGGGGCTGCGTCGGCTGCGGCGGGTGTGGGAGGTGG40CGACGGCCGGGGCCGGGGTCCTGCCCGGCTGCGGAGGCGG80GCGCGACGGGCGCGGGGGTCGCTGCTCCTGAGGCGATGAT120GGGCAAGGAAGAGGAGATTGCGCGGATCGCCCGGAGGCTG160GACAAGATGGTGACCAAGAAGAGCGCGGAGGGAGCCATGG200ATTTGCTGCGGGAGCTGAAGGCCATGCCTATCACGCTGCA240CCTGCTCCAGTCCACCCGAGTCGGGATGTCTGTCAACGCC280CTTCGGAAGCAGAGCTCGGATGAGGAGGTCATTGCACTGG320CCAAGTCTCTCATCAAGTCCTGGAAGAAGCTCCTGGATGC360TTCCGATGCCAAAGCCAGGGAGCGGGGGAGGGGCATGCCT400CTGCCCACGTCCTCGAGGGATGCCTCAGAGGCCCCGGATC440CCAGCCGCAAGAGGCCGGAGCTGCCCAGGGCACCGTCGAC480TCCGAGGATCACCACATTTCCTCCGGTGCCTGTCACCTGT520GATGCCGTGCGCAACAAGTGCCGCGAGATGCTGACCGCTG560CCCTGCAGACGGACCATGACCACGTGGCCATCGGTGCGGA600CTGCGAGCGCCTGTCGGCTCAGATCGAGGAATGCATCTTC640CGGGACGTTGGAAACACAGACATGAAGTATAAGAACCGTG680TACGGAGTCGTATCTCCAACCTGAAGGATGCCAAGAACCC720TGACCTGCGGCGGAATGTGCTGTGTGGGGCCATAACACCC760CAGCAGATCGCTGTGATGACCTCAGAGGAGATGGCCAGTG800ATGAGCTGAAGGAGATCCGTAAGGCCATGACCAAGGAGGC840CATCCGAGAGCACCAGATGGCCCGCACTGGCGGCACGCAG880ACAGACCTGTTCACCTGCGGCAAGTGCAGGAAAAAGAACT920GCACCTACACACAGGTGCAGACCCGCAGCTCTGATGAGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。