演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TCAPT-cap

titin-cap

TCAP 編碼 titin-cap,是肌肉組裝調節因子,參與肌小節 Z-disk 上 titin 分子的反向平行排列。

Homo sapiens17q12UniProt O15273
OFFICIAL SYMBOL
TCAP
CHROMOSOME
17
UNIPROT
O15273
PDB / ALPHAFOLD
2F8V
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TCAP 是蛋白質編碼基因,其產物 titin-cap(亦稱 Telethonin)長 167 個胺基酸。它是與肌肉組裝相關的蛋白質,主要角色與肌小節 Z-disk 上 titin 分子的組裝有關。現有資料支持其參與肌肉結構的建立,但未提供更細的家族分類或完整結構資訊。

Official symbol
TCAP
Gene name
titin-cap
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11610
UniProt
O15273
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
T-capTELEtelethoninCMD1NLGMD2G

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegTCAPpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:39,664,990–39,666,554
Gene span
1,565 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000309889 ★39,665,349–39,666,5542
ENST0000057828339,664,990–39,666,2493
ENST0000110403539,664,990–39,666,5542
ENST0000110403639,664,990–39,666,5532
ENST0000113729939,664,990–39,666,5542

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

titin-cap 是肌肉組裝調節因子,參與肌小節 Z-disk 的組織。它促進兩個 titin(TTN)分子以反向平行方式組裝,作用位置與肌小節的 Z-disk 相連。此排列關係是來源所描述的主要功能,說明 TCAP 產物參與肌肉結構組裝,而非僅作為一般細胞內蛋白質存在。

titin-cap 與兩個 titin 分子的 N 端 Ig-like domains 直接互作,這項結合與其協助 titin 分子反向平行組裝的角色相符。來源沒有進一步描述組裝的分子步驟、是否需要其他因子,或該過程在不同肌肉類型中的差異,因此不宜據此延伸出更詳細的調控機制。

這些資料將 TCAP 的功能定位於肌肉組裝及肌小節 Z-disk 結構安排。其直接連結兩個 titin 分子的方式,提供了理解其參與肌肉結構形成的分子層次線索;不過,來源未說明其對肌肉收縮或其他生理過程的直接影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39665349 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TCAP ENST00000309889 GRCh38 chr17:39664349-39665449 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCACACCCACCACCTGTCTGCCAGCCTCTTGCACCATGAGTTGCTACTCCTGGGGTGCTGGACTGTCCC
CACAGCCATCTGTCTCCCCTGCTCCCCATGAAGAAGAGCCAGTCCCCTCCCAGGTAGCACATCAGAGCGG
GCAGGCTCCAGAGCTCTTCTGGTCCTCTTGCAGTGGCCAGAAAGTGGGGAAAGGGGCCCAGAGAGGGGCA
GGGACTGACCCATGGTCACACAGCCTATTTATGGCTGATCTGGAGCCAGGCCTTCTGACTATCACCCATC
AGAGCCCCTGGATTCCCATTTCACCCAACACAGGTGTTGGGGTAGAACTGGGGGCCCTCCACCCCTACTA
GCCTGACTGTCTCCTGAGACCTGTCTCCTAAGACCACTTACCTGACCACTGGCCATGGGGAAGGAAAACA
CCTGGCCAAGGCTCATGCCCCAGGTTCCCAGGCATGAAGTTGACTGTCTCCGCCCCTGCTGGTGTGGTGA
GGGTGACTGGGGACTAGGCACTAGGCCTTTGGTGCAGGCGCCTGAGGACGTGGTTGCACTCTCCCTTCTG
GGGATATGCCCTTGAGCCCAGGCAGAGGAGAGCACAGCCAGGGCAGGACCTGGCAGCCCTGGTACAGAGC
CCAGAGGGGGCATCAGTTCCTGCTGGTCCTGCTCTGTTTACAGACAAGCTGCTGTCCTCCCTGCAAAGGG
GAGTGGGTGGGGCAGAGGGCAAGTGCCAGGGGGGCACAAGGCTGGGCATGTGGCTGGCATGAGACGGTGT
CTGAGTAATGTCAGGCACCTGGAGGCATTGACCCCAGGACCTTGGACCCCAGACCTCTGACCGGGGGGCA
GCCAGCGTCCAGGTACCCCAACCCCTGCCCTGGGTCCGGCGTCCCCCCATTAGTGAGTCTTGGCTCTACT
TATAGCATCTGACACCAGAGGGGCCGAAAATAGCCCCTGGAGAAGGGGGAGGAGGGGGCTATTTAAAGGG
CCTGGGAGGGGAGAGAGAATGAGGAGTGATCATGGCTACCTCAGAGCTGAGCTGCGAGGTGTCGGAGGAG
AACTGTGAGCGCCGGGAGGCCTTCTGGGCAGAATGGAAGGATCTGACACTG
TCAP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TCAP_2 ↗17:39,664,108正股39,664,059–39,664,118
TCAP_3 ↗17:39,664,255正股39,664,206–39,664,265
TCAP_1 ↗17:39,665,349正股39,665,300–39,665,359

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9KQ33 · enhancer · 39661092–39661530 · regulatory

ENSR17_9KQ46 · promoter · 39664859–39665359 · regulatory

ENSR17_5CBWFT · CTCF_binding_site · 39665988–39666009 · regulatory

ENSR17_B9TK2 · promoter · 39667491–39668473 · regulatory

ENSR17_5CBWTX · CTCF_binding_site · 39668593–39668614 · regulatory

· motif · 39665990–39666006 · motif

· motif · 39666377–39666392 · motif

· motif · 39666471–39666486 · motif

· motif · 39666908–39666915 · motif

· motif · 39666909–39666922 · motif

· motif · 39666912–39666924 · motif

· motif · 39666916–39666929 · motif

· motif · 39667029–39667036 · motif

· motif · 39667044–39667056 · motif

· motif · 39667047–39667054 · motif

· motif · 39667161–39667174 · motif

· motif · 39667421–39667428 · motif

· motif · 39667624–39667630 · motif

· motif · 39668595–39668611 · motif

· motif · 39668702–39668717 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:167 aa

1 aa167 aa功能區域
依 O15273 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

titin-cap 長 167 個胺基酸。序列第 144 至 167 位被註記為無序區域;此特徵由 MobiDB-lite 提供的預測證據支持。來源未列出其他結構域或功能區域。

功能區域Disordered144–167 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2F8V…

PDB · 2F8V

X-ray · 2.75 A · T/Y=1-167

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, myofibril, sarcomere

titin-cap 的註記定位包括細胞質、肌原纖維及肌小節。 資料未提供不同條件下定位改變的資訊,也未指出異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 44 個夥伴 · 最多顯示 50 個
T-capTCAPACTMAPASB6ATN1ATXN1BLZF1CASP6CBX5CDCA4CETN3CHATCRYAACSRP3DNAJB6DYNC1H1F13A1FAM153BFGFR3GFAPGIPC1GRIN2CGSNHIP1HSPA8IKZF3JPH3KLF11KRTAP19-7LAMP2LAMTOR5MYOZ2PAK1PECAM1PLEKHF2PRPF40ARAB5ARANSAPCD1TRAF2TTC19TTNUBE2KUBQLN1VIMQ9Y649
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 44 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

titin-cap 與 MYOZ1、MYOZ2、MYOZ3 及 CSRP3 互作;來源未進一步說明這些互作是否為直接結合。它也直接結合兩個 titin(TTN)分子的 N 端 Ig-like domains,並與 ANKRD2 直接互作。來源未將上述蛋白描述為同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TCAP 變異與家族性肥厚型心肌病 25(CMH25)相關。此遺傳性心臟疾病通常呈不對稱心室肥厚,常涉及心室中隔;症狀包括呼吸困難、暈厥、心悸與胸痛,且可能由運動誘發。嚴重程度可在家族間及家族內不同,從較良性表現到心衰竭及猝死風險較高的形式。另有常染色體隱性肢帶型肌肉失養症 7(LGMDR7)與 TCAP 變異相關,特徵包括肢體近端及遠端肌無力、肌肉萎縮、肌肉切片的失養性變化及缺乏 Telethonin;部分患者也涉及心肌。這些資料描述疾病與基因變異的關聯。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TCAP 產物是肌肉組裝調節因子,能促進 titin(TTN)分子在肌小節 Z-disk 上以反向平行方式組裝;來源將這項組裝功能定位於肌肉結構形成,但未提供更細的分子步驟。資料庫紀錄
證據與來源

Muscle assembly regulating factor. Mediates the antiparallel assembly of titin (TTN) molecules at the sarcomeric Z-disk

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用titin-cap 與 MYOZ1、MYOZ2、MYOZ3 及 CSRP3 互作;並直接結合兩個 titin(TTN)分子的 N 端 Ig-like domains,也直接與 ANKRD2 互作。來源未說明 MYOZ 蛋白及 CSRP3 的互作是否直接。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MYOZ1, MYOZ2 and MYOZ3. Interacts with CSRP3. Interacts directly with the N-terminal Ig-like domains of 2 titin (TTN) molecules. Interacts with ANKRD2; the interaction is direct

PMID 10984498 ↗ · PMID 11842093 ↗ · PMID 15136035 ↗ · PMID 15582318 ↗ · PMID 16407954 ↗ · PMID 16713295 ↗ · PMID 9645487 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位titin-cap 的細胞定位註記包括細胞質、肌原纖維及肌小節;此資料未提供定位變化的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, myofibril, sarcomere

PMID 16713295 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯家族性肥厚型心肌病 25(CMH25)與 TCAP 變異相關,為遺傳性心臟疾病,通常呈不對稱心室肥厚並常涉及心室中隔。症狀包括呼吸困難、暈厥、倒地、心悸及胸痛,且可由運動誘發;表現嚴重度在家族間與家族內均有差異,從良性到心衰竭及猝死高風險形式不等。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 25 CMH25 A hereditary heart disorder characterized by ventricular hypertrophy, which is usually asymmetric and often involves the interventricular septum. The symptoms include dyspnea, syncope, collapse, palpitations, and chest pain. They can be readily provoked by exercise. The disorder has inter- and intrafamilial variability ranging from benign to malignant forms with high risk of cardiac failure and sudden cardiac death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 607487

PMID 15582318 ↗ · PMID 16352453 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯常染色體隱性肢帶型肌肉失養症 7(LGMDR7)與 TCAP 變異相關,為退化性肌病,表現包括肢體近端及遠端肌無力與萎縮、肌肉切片的失養性變化,以及缺乏 Telethonin。部分患者也有心肌受累。含實驗來源
證據與來源

Muscular dystrophy, limb-girdle, autosomal recessive 7 LGMDR7 An autosomal recessive degenerative myopathy characterized by proximal and distal muscle weakness and atrophy in the limbs, dystrophic changes on muscle biopsy, and absence of telethonin. Cardiac muscle is involved in a subset of patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601954

PMID 10655062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000309889 · 960 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GAGGAGTGATCATGGCTACCTCAGAGCTGAGCTGCGAGGT40
41GTCGGAGGAGAACTGTGAGCGCCGGGAGGCCTTCTGGGCA80
81GAATGGAAGGATCTGACACTGTCCACACGGCCCGAGGAGG120
121GCTGCTCCCTGCATGAGGAGGACACCCAGAGACATGAGAC160
161CTACCACCAGCAGGGGCAGTGCCAGGTGCTGGTGCAGCGC200
201TCGCCCTGGCTGATGATGCGGATGGGCATCCTCGGCCGTG240
241GGCTGCAGGAGTACCAGCTGCCCTACCAGCGGGTACTGCC280
281GCTGCCCATCTTCACCCCTGCCAAGATGGGCGCCACCAAG320
321GAGGAGCGTGAGGACACCCCCATCCAGCTTCAGGAGCTGC360
361TGGCGCTGGAGACAGCCCTGGGTGGCCAGTGTGTGGACCG400
401CCAGGAGGTGGCTGAGATCACAAAGCAGCTGCCCCCTGTG440
441GTGCCTGTCAGCAAGCCCGGTGCACTTCGTCGCTCCCTGT480
481CCCGCTCCATGTCCCAGGAAGCACAGAGAGGCTGAGAGGG520
521ACTGTGACTTGGGCTCCGCTGTGCCCGCCCTGGGCTGGGC560
561CCTTCCTGGCTAGGACTGTGGAGGGGAGCTGCTGGCCATG600
601GCTGCTTTGTAGTTTGCCCAGAGTTGGGGGCTAGGGGAGG640
641GGGGAGCCAGAGGCCAGGATGCCTGAGCCCCCTGAGTTCC680
681CAAAGGGAGGGTGGCAGAGACAGTGGGCACTAAGGGTGGA720
721GAGTTGGGGGCCAGCACAGCTGAGGACCCTCAGCCCCAGG760
761AGAAGGGACAAAAGGTACTGGTGAGGGCAAGAGGTGCCTG800
801GGAGGAGTGGCCCTGATCCAGGAAAATGTGAGGGGAATCT840
841GGAACGCTCTAGGCAGAAGAAGCTGGGAGGGAGGGGGAGG880
881TGAAAAGGGCAGAGGCAAGGATGGTGGGGCCCCCAGCACC920
921CTCTGTTAGTGCCGCAATAAATGCTCAATCATGTGCCAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。