演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBXA2R

thromboxane A2 receptor

TBXA2R 編碼 thromboxane A2 receptor,屬 G protein-coupled receptor,能接收 TXA2 訊號並參與血小板聚集調節。

Homo sapiens19p13.3UniProt P21731
OFFICIAL SYMBOL
TBXA2R
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P21731
PDB / ALPHAFOLD
9GG5
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBXA2R 是蛋白質編碼基因,其產物 thromboxane A2 receptor 屬於 G protein-coupled receptor 1 family。此受體為 343 個胺基酸的多次穿膜蛋白,具有七段跨膜螺旋,並以細胞外與細胞質區段交錯排列。其主要角色是作為 thromboxane A2(TXA2)的受體,將此分子的訊號傳入細胞;相關功能包括血小板聚集調節。

Official symbol
TBXA2R
Gene name
thromboxane A2 receptor
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11608
UniProt
P21731
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TBXA2Rpq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:3,594,506–3,606,900
Gene span
12,395 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000375190 ★3,594,507–3,606,8753
ENST000008823063,594,506–3,606,8953
ENST000008823073,594,506–3,606,9004
ENST000011431173,594,507–3,606,9003
ENST000009792143,594,518–3,606,9004
ENST000005899663,594,552–3,600,6692
ENST000004118513,594,780–3,606,9004
ENST000008823083,594,782–3,604,4123

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

thromboxane A2 receptor 是 TXA2 的受體。TXA2 可強烈促進血小板聚集;受體活性由 G protein 介導,並能啟動 phosphatidylinositol-calcium second messenger system,也會活化 phospholipase C。

來源所列的腺苷酸環化酶調節包含活化與抑制兩種作用,但未提供各自發生的條件或差異,因此不能據此指定其調節方向的情境。

在腎臟中,TXA2 與腎小球 TP receptors 結合會造成強烈血管收縮。這項作用描述了受體訊號在腎臟血管反應中的影響;來源未進一步說明其下游機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3606875 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBXA2R ENST00000375190 GRCh38 chr19:3606775-3607875 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGATAGTGGGCGGGGTAGCCGGGGAAGGGGCTTCCGGACTGGGCTGACGAGAGGGCCGGGCCAGGCTGGG
AATACCCCTCACTCACAGCCTGGACTAGCAGCCCTCCCGGGCCCAGGGGACGGGGTGGGGTGCAGTCAGG
GCAAGGTCAGCTTGTCCGGTCCCACTCCAGGTCCCTAACTCAAGGTTCTGTCCGGCTCGGGTGTACAAAC
AAGGCCAAGGAAGCCCAAGGTCCCCCCTCTGCAAAGAGACGGTCCCAGTCCCTGCGTCCGGCACCTTCTC
AGCCATTCCTGTTGGGCTCCATCCCTCCTTCCCCAGCCCGAGCTGGGGGGTGGCCAGGAAAGAGTGCCCA
TCCCCCACTGCAGCCTCCCGGCTCCAGACTGTTCCTCCTCTGGCTCCAAAGCCACCTCCGAGCCTCCTCA
AGAGACCCTCCCATGCGATGCCATCACCCCAGCCCTCCCGGCTCACCTGCTCTGGGACCACCTTTCTCAG
TCTGGCTGTGTCGTCTGGTGCACCCCCCATCCCTCTGTCCTCCCACCCCACCCCTGGAAGGGGCCTCAAA
TATGTCCTGTATGTATTAAGCAGGGCATACTACTACTGTGTGCCGCGTTCCAGCGCACCCAGTGAATTTG
GAGCCCTGGAGTCTGGGCGACCCCCGGGAGCCGATCCGCCTGGACCTGCCCCGCCCCCTCCAGGCCTTGG
GTGCTGCCCAGATGGTGAATAATGCGGGCCTGGCGGCGGGAGCGCCGGGAAGAGGCCTGGCAGGGCGCTG
GGCGGCTGGAGGGGCTGAGGCTCCCGAGGAAGCGCCCCTGCCACCCCTACGCGGGCCATTGCATCCCTGC
CACCGGTGGCCTGGGGGTCCCAAGGGCGCCGCCTTCCCCAGAAGGCTGTAGGGTGTCCCGGCGTGCGGGG
GGCACCCACTGACTCCAAGTCAGCCAGGCCCGGGCCCGAGGGGCGTGGCCAGCGCAGGGTGGGCGGGGCT
GATGAGAGACAGCGGGAGACAGAGACTGGACGGAGAGAGCGAGCCGCGGGCTGCCAGCGGCCCCCACCCG
TCCCAGCTCGGCTTAGCCCCCGCGGACCCCTCCAGGCCGCGACCCCAGGGC
TBXA2R 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBXA2R_2 ↗19:3,600,586負股3,600,576–3,600,635
TBXA2R_1 ↗19:3,606,861負股3,606,851–3,606,910

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BPBC · enhancer · 3603202–3603914 · regulatory

ENSR19_5STXP · CTCF_binding_site · 3603891–3603912 · regulatory

ENSR19_BPBK · enhancer · 3604742–3605696 · regulatory

ENSR19_BPBP · enhancer · 3605870–3606649 · regulatory

ENSR19_BPBS · promoter · 3606650–3607257 · regulatory

ENSR19_CCMZ · enhancer · 3607258–3608589 · regulatory

ENSR19_BPC5 · enhancer · 3608749–3609362 · regulatory

ENSR19_93FNJ · enhancer · 3609728–3610036 · regulatory

· motif · 3603653–3603666 · motif

· motif · 3603893–3603909 · motif

· motif · 3604699–3604714 · motif

· motif · 3605035–3605046 · motif

· motif · 3605184–3605197 · motif

· motif · 3605184–3605197 · motif

· motif · 3607007–3607022 · motif

· motif · 3610163–3610176 · motif

· motif · 3610163–3610176 · motif

· motif · 3610487–3610500 · motif

· motif · 3610487–3610500 · motif

· motif · 3610539–3610552 · motif

· motif · 3610539–3610552 · motif

· motif · 3611000–3611015 · motif

· motif · 3611000–3611015 · motif

· motif · 3611022–3611029 · motif

· motif · 3611072–3611085 · motif

· motif · 3611072–3611085 · motif

· motif · 3611618–3611630 · motif

· motif · 3611620–3611627 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:343 aa

1 aa343 aa跨膜區拓樸區域
依 P21731 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

thromboxane A2 receptor 長 343 個胺基酸,屬 G protein-coupled receptor 1 family。其結構包含七段螺旋型跨膜區,分別位於第 30–52、67–87、107–128、150–172、194–219、247–270 與 290–311 個胺基酸;跨膜區之間及兩端分布有細胞外與細胞質區段。

拓樸區域Extracellular1–29 aa
跨膜區Helical; Name=130–52 aa
拓樸區域Cytoplasmic53–66 aa
跨膜區Helical; Name=267–87 aa
拓樸區域Extracellular88–106 aa
跨膜區Helical; Name=3107–128 aa
拓樸區域Cytoplasmic129–149 aa
跨膜區Helical; Name=4150–172 aa
拓樸區域Extracellular173–193 aa
跨膜區Helical; Name=5194–219 aa
拓樸區域Cytoplasmic220–246 aa
跨膜區Helical; Name=6247–270 aa
拓樸區域Extracellular271–289 aa
跨膜區Helical; Name=7290–311 aa
拓樸區域Cytoplasmic312–343 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9GG5…

PDB · 9GG5

EM · 3.26 A · R=1-343

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

thromboxane A2 receptor 定位於細胞膜,是多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TBXA2RTBXA2RPRDX4KCNMA1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TBXA2R 與 RPGRIP1L、PSMA3 及 RACK1 有互作記錄。來源指出 RACK1 與 TBXA2R 的互作會調節其細胞表面表現;未說明 RPGRIP1L 或 PSMA3 互作的功能,也未將這些互作描述為複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TBXA2R 基因變異與 platelet-type 13 出血症(BDPLT13)的疾病易感性相關。此病症的描述包括血小板聚集降低,以及容易出現輕度皮膚黏膜出血;來源指出的是易感性關聯,並未表述為變異必然造成疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能thromboxane A2 receptor 接收 TXA2;TXA2 是血小板聚集的強效促進因子。受體活性由 G protein 介導,並啟動 phosphatidylinositol-calcium 第二訊使系統及 phospholipase C。在腎臟,TXA2 與腎小球 TP receptors 結合會引起強烈血管收縮。含實驗來源
證據與來源

Receptor for thromboxane A2 (TXA2), a potent stimulator of platelet aggregation. The activity of this receptor is mediated by a G-protein that activates a phosphatidylinositol-calcium second messenger system. In the kidney, the binding of TXA2 to glomerular TP receptors causes intense vasoconstriction. Activates phospholipase C

PMID 8613548 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能此項功能敘述指出 TBXA2R 可活化腺苷酸環化酶;來源未提供其發生條件或相關細胞系統。含實驗來源
證據與來源

Activates adenylyl cyclase

PMID 8613548 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能此項功能敘述指出 TBXA2R 可抑制腺苷酸環化酶;來源未提供其發生條件或相關細胞系統。含實驗來源
證據與來源

Inhibits adenylyl cyclase

PMID 8613548 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TBXA2R 與 RPGRIP1L、PSMA3 及 RACK1 有互作記錄。來源特別指出,RACK1 與 TBXA2R 的互作會調節 TBXA2R 的細胞表面表現;未說明另外兩項互作的功能。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RPGRIP1L. Interacts with PSMA3. Interacts with RACK1; the interaction regulates TBXA2R cell surface expression

PMID 17499743 ↗ · PMID 18088317 ↗ · PMID 19464661 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TBXA2R 是定位於細胞膜的多次穿膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TBXA2R 基因變異與 platelet-type 13 出血症的疾病易感性相關。此病症以血小板聚集降低及容易發生輕度皮膚黏膜出血為特徵;來源描述的是易感性關聯,並未指出變異必然造成疾病。含實驗來源
證據與來源

Bleeding disorder, platelet-type, 13 BDPLT13 A disorder characterized by reduced platelet aggregation and a tendency to mild mucocutaneous bleeding. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614009

PMID 7929844 ↗ · PMID 8613548 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000375190 · 2,642 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGACTGGACGGAGAGAGCGAGCCGCGGGCTGCCAGCGG40
41CCCCCACCCGTCCCAGCTCGGCTTAGCCCCCGCGGACCCC80
81TCCAGGCCGCGACCCCAGGGCGTCCTGTGCCGCCACGCCC120
121TCCATCTGTGTGGGTCCTCTGCTGGGCCCGCCCCTGGTCA160
161CAGCCAGACTGACTCAGTTTCCCTGGGAGGTCCCGCTCGA200
201GCCCGTCCTTCCCCTCCCTCTGCCCGCCCCCAGCCCTCGC240
241CCCACCCTCGGCGCCCGCACATCTGCCTGCTCAGCTCCAG280
281ACGGCGCCCGGACCCCCGGGCGCGGGATCCAGCCAGGTGG320
321GAGCCCCGCAGATGAGGTCTCTGAAGGTGTGCCTGAACCA360
361GTGCCAGCCTGCCCTGTCTGCAGCATCGGCCTGATGGGGT400
401GGTGACTGATCCCTCAGGGCTCCGGAGCCATGTGGCCCAA440
441CGGCAGTTCCCTGGGGCCCTGTTTCCGGCCCACAAACATT480
481ACCCTGGAGGAGAGACGGCTGATCGCCTCGCCCTGGTTCG520
521CCGCCTCCTTCTGCGTGGTGGGCCTGGCCTCCAACCTGCT560
561GGCCCTGAGCGTGCTGGCGGGCGCGCGGCAGGGGGGTTCG600
601CACACGCGCTCCTCCTTCCTCACCTTCCTCTGCGGCCTCG640
641TCCTCACCGACTTCCTGGGGCTGCTGGTGACCGGTACCAT680
681CGTGGTGTCCCAGCACGCCGCGCTCTTCGAGTGGCACGCC720
721GTGGACCCTGGCTGCCGTCTCTGTCGCTTCATGGGCGTCG760
761TCATGATCTTCTTCGGCCTGTCCCCGCTGCTGCTGGGGGC800
801CGCCATGGCCTCAGAGCGCTACCTGGGTATCACCCGGCCC840
841TTCTCGCGCCCGGCGGTCGCCTCGCAGCGCCGCGCCTGGG880
881CCACCGTGGGGCTGGTGTGGGCGGCCGCGCTGGCGCTGGG920
921CCTGCTGCCCCTGCTGGGCGTGGGTCGCTACACCGTGCAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。