演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBX20

T-box transcription factor 20

TBX20 編碼 T-box transcription factor 20,是心臟發育所需的轉錄活化因子與抑制因子,也可能參與維持成人心臟的功能與結構表型。

Homo sapiens7p14.2UniProt Q9UMR3
OFFICIAL SYMBOL
TBX20
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9UMR3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBX20 是蛋白質編碼基因,其產物為 T-box transcription factor 20,屬於含有 T-box DNA 結合區域的轉錄因子。蛋白質長 447 個胺基酸,資料註記其 T-box 區域位於第 109 至 288 個胺基酸。這項結構特色與其轉錄調控角色相符;來源指出,此蛋白質可作為轉錄活化因子或抑制因子,並對心臟發育具有必要性。成人心臟中的功能與結構表型維持,則是來源提出的可能角色。

Official symbol
TBX20
Gene name
T-box transcription factor 20
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11598
UniProt
Q9UMR3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77p14.2
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTBX20pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:35,202,430–35,254,100
Gene span
51,671 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000408931 ★35,202,430–35,254,1008

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TBX20 的產物 T-box transcription factor 20 可促進或抑制轉錄,並且是心臟發育所需的因子。這表示它參與調節基因表現,但現有資料未進一步說明其調控的特定基因、分子機制或各作用情境,因此不宜據此推定更細節的調控路徑。

除了發育期間的必要角色外,來源也指出 TBX20 可能在成人心臟中維持功能與結構表型。此處的描述保留「可能」的限定,支持其與成人心臟狀態維持有關的角色,但沒有界定具體表型、作用方式或作用範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35254100 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBX20 ENST00000408931 GRCh38 chr7:35254000-35255100 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATACAGCTTGAGTGTGTATGTCAGCCTGAGTTTACACGGCTCCAAGCGAAGCGGATTACCCTGCGAATT
CGGAGAATTTGAGTTATTCAGGCTGAGCAGGGCTAACAGGACGCCCTCCAACAAGGCCGTGGGAAGTCCT
CGTCACAGCCGCCTTTGTAAAACCAGAGGGGTCTGTGTCCGCTTAGTCCGGGCGCTACCATAAGGTTCGC
ACTCTCCCACTACGCGTCGCGTGGTTACCGTAGAGCTCCGCGCCCTGACCTTCGCCTTCTCTTCGGCAGC
CGTCCCATTTTCCAGGGTCCCTCTAGGGAAAATAGGAGCCCCAGGCTAGAGACGCACTGGTGAGGAGCAG
AAGCCACGGTTCTGAGAGCAGCATCCTTTGCCAAATGCCCGCAGCTCTCGCTAAGCTTATCTTTTTCAGG
GCTGCATTTGCTCAGCCCCACTGTCAAAGAGATCAAATTTGGGACCATCGAATGAGAGTCCCAGCCCTGG
GATCTGCCCCGAGTATGGACCTGGCCAGTTGGCGCCGGCTCAGAGGCGCCGGATTCTACTGAGCGCTTCC
CTACTTTCTTTTGGAACTTTGAGCGCAGGTAAGAAAAAGAATGGAAAAAGCGAGAACTCCCGAGGCTTCC
ACTGGTCTGGTCATAGCTTCCCCAACTGGGCCATGCCCGGATCTCGGGCGTTAGGCCGCGGTGATGTGTC
CTCTCCCGACAGCGCGCACCGCCCTCCCGCCCGGGGCTGTGAGACCAGGTGGGGATGTCCATGGCTGCTG
CGTCAGCCTAGTGGTGGCACCCTTTTCCCTGAACCTGTGCTGGGGTACCGAACAGCCGGGGCGACAGGCC
ACGCGGGCGCCGCACCCTGGGCGCGCCCTCCGCGCCCGGCCCGCGGCCCCGCCCCCGGCGGCGGAATCAG
GAAGCGGTGACGTGAGACGGCGCTGACTGGCTGCGGGCCTCCGGGATCGCCGCCGCCAGCAAATTAAGGC
GCAGGGCAGCGAGCGCCAGGGCTCACTGTCCGTAGTTCCGCGCCGCGCTCCCCACGCCAGCGTCCTAGCA
GCCGCGCTCGGCTGGTGGCCACCTCAGCCTGGGACATCCCGGCTGTCCCCA
TBX20 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBX20_2 ↗7:35,253,667負股35,253,657–35,253,716
TBX20_1 ↗7:35,254,096負股35,254,086–35,254,145
TBX20_3 ↗7:35,258,306負股35,258,296–35,258,355

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_9HZR6 · enhancer · 35251603–35251978 · regulatory

ENSR7_B8ZWG · promoter · 35254090–35254721 · regulatory

ENSR7_9HZS4 · enhancer · 35254722–35255131 · regulatory

ENSR7_9HZS8 · enhancer · 35255236–35255739 · regulatory

ENSR7_B8ZWR · enhancer · 35256247–35257043 · regulatory

ENSR7_C5HGG · enhancer · 35257147–35258472 · regulatory

· motif · 35251966–35251976 · motif

· motif · 35253922–35253933 · motif

· motif · 35254322–35254336 · motif

· motif · 35254322–35254336 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:447 aa

1 aa447 aaDNA 結合功能區域
依 Q9UMR3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

T-box transcription factor 20 長 447 個胺基酸,含有第 109 至 288 位胺基酸的 DNA 結合 T-box 區域。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 62 至 81 位及第 316 至 340 位胺基酸。

DNA 結合區T-box109–288 aa
功能區域Disordered62–81 aa
功能區域Disordered316–340 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UMR3…

AlphaFold · Q9UMR3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 T-box transcription factor 20 的定位列於細胞核。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TBX20TBX20
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TBX20 相關變異被列為心房中隔缺損 4(ASD4)的致病原因。這種先天性心臟畸形涉及心房間隔未完全閉合,造成血液由左心房流向右心房;患者也可能有其他心臟異常,包括間隔形成、心腔生長及瓣膜形成缺陷。該疾病描述指出,患者沒有心臟傳導系統缺陷,也沒有非心臟異常。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TBX20 具有轉錄活化與抑制作用,是心臟發育所需的因子;此外,它可能在成人心臟中參與維持功能與結構表型。推論支持
證據與來源

Acts as a transcriptional activator and repressor required for cardiac development and may have key roles in the maintenance of functional and structural phenotypes in adult heart

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位T-box transcription factor 20 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TBX20 相關變異被列為心房中隔缺損 4(ASD4)的致病原因。此先天性心臟畸形因心房間隔未完全閉合而使血液由左心房流向右心房;患者可伴有間隔形成、心腔生長及瓣膜形成等其他心臟異常,但不涉及心臟傳導系統缺陷或非心臟異常。含實驗來源
證據與來源

Atrial septal defect 4 ASD4 A congenital heart malformation characterized by incomplete closure of the wall between the atria resulting in blood flow from the left to the right atria. Patients show other heart abnormalities including defects in septation, chamber growth and valvulogenesis. The disease is not associated with defects in the cardiac conduction system or with non-cardiac abnormalities. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611363

PMID 17668378 ↗ · PMID 19762328 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000408931 · 1,824 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCACTGTCCGTAGTTCCGCGCCGCGCTCCCCACGCCAG40
41CGTCCTAGCAGCCGCGCTCGGCTGGTGGCCACCTCAGCCT80
81GGGACATCCCGGCTGTCCCCAGCCCCAGAGGGAGGAAGGA120
121CGCGGAGGGGATGCTCCAGGACCCCAGGACTTTGTGCAGT160
161TGATGCTCGTTTCCGCCTTCGGGCTGTGCAGACTGTCGTC200
201CTGCCGAGCGCCCCGGGGCGTGCGCACCCGCCGTAGTGCT240
241CGGTGGGCCCTCTCCTCTCCGGCTGCCTTCGAAGTCTCTG280
281CGGCTCTGGGGCTTTGCGGTGGGGAATAGAGGCCAGTGTG320
321CAGCTCTGGAGTCGTTGGAGCTGACACTTCTGGAGTCCCT360
361GGCCCCGCTGTGACTGCTCTCGGAAACTTTGAGCTGTGTT400
401TCGGGTCTTTGTCTCCCTTGGGGAATCTGGACGGCAGTTC440
441GGACGACCCCGTCCCTGGCCAGGACCGCGTGCTGGGGACC480
481ATGGAGTTCACGGCGTCCCCCAAGCCCCAACTCTCCTCTC520
521GGGCCAACGCCTTCTCCATTGCCGCGCTCATGTCGAGCGG560
561CGGCTCTAAGGAGAAGGAGGCGACGGAGAACACAATCAAA600
601CCCCTGGAGCAATTTGTGGAGAAGTCGTCCTGTGCCCAGC640
641CCCTGGGTGAGCTGACCAGCCTGGATGCTCATGGGGAGTT680
681TGGTGGAGGCAGTGGCAGCAGCCCGTCCTCCTCCTCTCTG720
721TGCACTGAGCCACTGATCCCCACCACCCCCATCATCCCCA760
761GTGAGGAAATGGCCAAAATTGCCTGCAGCCTGGAGACCAA800
801GGAGCTTTGGGACAAATTCCATGAGCTGGGCACCGAGATG840
841ATCATCACCAAGTCGGGCAGGAGGATGTTTCCAACCATCC880
881GGGTGTCCTTTTCGGGGGTGGATCCTGAGGCCAAGTACAT920
921AGTCCTGATGGACATCGTCCCTGTGGACAACAAGAGGTAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。