基因總覽
TBX10 是蛋白質編碼基因,其產物為 T-box transcription factor 10。來源將此蛋白描述為可能參與發育過程的轉錄調控因子;更具體的功能機制未有資料支持。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335385 ★ | 67,631,303–67,639,763 | 8 |
| ENST00001143439 | 67,631,303–67,639,767 | 8 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
T-box transcription factor 10 可能具有轉錄調控功能,並參與發育過程。現有資料未進一步說明其調控的基因、作用方式或涉及的特定發育階段,因此無法據此描述更具體的分子機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>TBX10 ENST00000335385 GRCh38 chr11:67639663-67640763 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGAATCAAGGCCACTGCCAACCCAGCATCCCCAAGACAGGATTCTGGAGGAGGTATGGGGGGCTCCAGC CAGACGACCCACTCTGTGCCATTCAGCAAGAGTCAAAAGGCCAGCGAGCACTCTCAACCAAGGAACTGGC AGCCTCTCAGGGGGACCTCCAGGTTCTGCCTCCCTGCAGAGTGATCCATGTGTCCCCTGAATGCCCAGCA CAGGCTGTAGACAACCTGGAGAGGGTGCCCGGTCAGGCCAGAGAGAACAGACAGACCCACAGGCAGAGCG GACGCCCACTTCTCACCTGGGCCAGCCTCACCGTTTCCACTCATGTCCAGATGGGGATTCCGTGGACACC ATCAGCCAGGGCAGTGCCCCCAGTTCCAGGCGGGATGGGCTTACCGCTCTCCAGGCTGGGCTAGACCATC ACAGGCGGAAGAGATTATGTGCTTAGGTTAACTGGGGAGGCTGAGGCACGGAGACTGTGGGACCTGCCAG CGTTGCGCAGCTCCCTGAGTTCATCCATGTGTCTGTGCGTGTGGGTTCACGTGCCACAGGACCTGGGCTT CCCGCCATCCAGTCTGGGGCTCTATGCTGACTGCACTCGTTGCTGCTGCCCCCTTGCGTTTCCTGCTCAC ACTGCTCCTGACAATTGCGCATCTGCCGGCCGGCTGGGGCCAGCCTCAGGTCAGGGGTCTGGGTCTTGGT GGGAGGGCACCTCCTCCGCCATTCAGCCCGCAATCTGCTGCTCCCACTGTGCCTCCCAACCCCCGGGGCC CCAGCCCCTCCAGTCAGCCAGGCCTGGACCCCTGCAGATGCCCAGCCGTCCTCAAGAACCACTCTCCCAC CCCCTCACCCCTGCCACGCCTGGGCCCATCGATCAGGAATGGCTGGGGGGCTCTTAGCTGGGGAAGGGAG GAACTTGAAGAGGGAGGACAAGGAGGGAGGAAGGGGGGCTCTGCAACGTCAGAACCTTCCCACCTGCCCT CCTCCCGCACAGCCTTGGACAGCACAGCCCGAGAGTGGCTTGGAGAAGGGCCGCTGCACGCCCCAGAGCC TGCATCTCACCTTCGGAGACCAGGGGTCCAGCTCGAGTAGGAAGACCACGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TBX10_1 ↗ | 11:67,645,168 | 負股 | 67,645,158–67,645,217 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_9ZSTQ · promoter · 67639753–67640253 · regulatory
ENSR11_5KWK4S · CTCF_binding_site · 67640141–67640162 · regulatory
ENSR11_9ZSWZ · enhancer · 67644110–67644408 · regulatory
ENSR11_5KWKRK · CTCF_binding_site · 67644188–67644209 · regulatory
ENSR11_5KWKRP · CTCF_binding_site · 67644219–67644240 · regulatory
ENSR11_5KWKT5 · CTCF_binding_site · 67644524–67644545 · regulatory
· motif · 67637267–67637276 · motif
· motif · 67637267–67637276 · motif
· motif · 67640058–67640069 · motif
· motif · 67640074–67640087 · motif
· motif · 67640077–67640089 · motif
· motif · 67640143–67640159 · motif
· motif · 67644190–67644206 · motif
· motif · 67644221–67644237 · motif
· motif · 67644526–67644542 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:385 aa
T-box transcription factor 10 長 385 個胺基酸。其第 69 至 252 位胺基酸區段註記為 DNA 結合 T-box;第 22 至 61 位胺基酸區段則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
T-box transcription factor 10 的註記定位為細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGCACAGCCCGAGAGTGGCTTGGAGAAGGGCCGCTGCACG40CCCCAGAGCCTGCATCTCACCTTCGGAGACCAGGGGTCCA80GCTCGAGTAGGAAGACCACGACCTCAGGACGTGGACGAAG120GGCGATCGAGGAGGCAAGGACCGTCCTGCCGAGAGACTAC160AGCTTGTGTGAGCACCTGAGGGCTGAGCTGAGGTGCCGAG200TGGACGAGTGGTGACCACCCCTTCCAGCAGGCAGGTTCCC240AGCCCCAGCCAAGCAGTGTTTCTCCAGGAGCCGGACAGCC280TCTCTGTCTCCATGGCAGCCTTCCTATCTGCTGGCCTCGG320CATACTTGCACCCTCAGAGACCTACCCCCTACCTACAACC360AGCTCTGGCTGGGAGCCCCGGCTGGGGTCACCATTCCCAT400CAGGCCCTTGCACCAGCTCTACTGGGGCCCAAGCTGTGGC440CGAGCCCACTGGGCAGGGCCCCAAGAACCCACGTGTGTCC480AGAGTGACAGTTCAGCTGGAGATGAAGCCTCTGTGGGAGG520AATTCAACCAGCTGGGCACTGAGATGATCGTCACCAAGGC560AGGCAGGAGGATGTTCCCCCCCTTCCAGGTGAAGATCCTG600GGCATGGACTCCCTGGCCGACTACGCCCTGCTCATGGACT640TCATCCCCCTGGACGACAAGAGATACAGGTATGCCTTCCA680CAGCTCGGCCTGGCTGGTGGCGGGCAAGGCAGACCCAGCC720ACACCTGGCCGCGTGCACTTCCACCCCGACTCGCCAGCCA760AGGGTGCCCAGTGGATGCGCCAGATTGTGTCCTTTGACAA800GCTCAAGCTGACCAACAACCTGCTGGATGACAATGGCCAC840ATCATTCTCAACTCTATGCACCGCTACCAGCCCCGTTTCC880ACGTGGTCTTCGTGGACCCACGCAAGGACAGTGAGCGCTA920TGCCCAGGAGAACTTCAAGTCCTTCATCTTCACAGAGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。