演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBL2WS-betaTRP

transducin beta like 2

TBL2 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens7q11.23UniProt Q9Y4P3
OFFICIAL SYMBOL
TBL2
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9Y4P3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBL2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 transducin beta like 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 7q11.23。

Official symbol
TBL2
Gene name
transducin beta like 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11586
UniProt
Q9Y4P3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
WS-betaTRPWBSCR13DKFZP43N024

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q11.23
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTBL2pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:73,567,537–73,578,791
Gene span
11,255 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305632 ★73,567,537–73,578,5797
ENST0000043253873,567,537–73,578,3367
ENST0000085733773,567,537–73,578,6486
ENST0000085733973,567,537–73,578,6487
ENST0000091344673,567,537–73,578,6488
ENST0000091344773,567,537–73,578,6488
ENST0000102307773,567,537–73,578,6487
ENST0000102308773,567,537–73,578,6485
ENST0000113797373,567,537–73,578,6487
ENST0000085734073,569,669–73,578,6487
ENST0000047989273,573,343–73,578,7914

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 73578579 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBL2 ENST00000305632 GRCh38 chr7:73578479-73579579 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAACCGTCTCAAAAGTAAATACATAAATAAATAAATAAAATAAGTTTTCTATTAAAAATTCTCCCTTTT
AACTTTCGACTTGCCAGGCCAGCCCCAAATCCAGGCCCTCGTCACCTCCCTCTCGGATCCTTGAAGCCAC
TGCCGGTTTTCTGATTTTGGTCTTTTCACACAAAGGTCCATCCAGGGAATCCTCAGACACAGCTTTTGCC
CCACCTCTCCCTGTAATGAGCAGCTTGTTGGATGGAGCCAGCGCTCAACGTCCCCCAGACCTTTCCGCCC
CTCTAGCCATTTCCCACATCCCAGCTTCTCAGGTCTTTGCGGAGGCTGTTCCACTCCACGCGCCTGGCCT
ACTCTTCCTTAAAAGCCCATCTGAACTTTCGCTGATGCTGAGTTTCCTATCCGTTAAATGGTAATAATAA
TCCCCGCCCCGCTTCCTTGAAAGGATCCAGTGTGGTGATGGCTGGAATAATGCCTTTAATAAACAATTAT
CAGTGAGTTCTTCAGGAGGAGGCGTGAGCAGTGATCGCAAATCCCGCCTTCCTCCGCCCTCCGCAGCCCT
GCAATCTCAACCGCCAGGCGACCCGCCCCTCGAAACGCACCAAGGGTCGAGCCCTGCCCCTCGAGATGTT
CTACTTCCAGGCCCCGCCCCTCGAGACACTCTACCTCCGGGTTCTGCCCCTCGAGACGCTCTAACAACCC
AGCCCCGCCCCTCGAGACGCGCTAACTCCAGACTCTGCCTCTCGAGGCGCTCTAATAACTAGGCTCGGCG
GGTGGAGATGCTCTAACTCCAGGCCCCGCCCCTCGAGCGCCACAACAGCCGGGCCCCACCCCTTGAGGTG
CTTTAACGGCCAGGCCCCGCCCTGAAGGCGTTGTAACAACCAGGCTCCGCCCCCAGGCGCTCTAACGGCC
AGGCCCAGCCGCTTGAGGCTCCCCAACGGCCAGGCCGCGCCCCCGCGTGCGTGCGCGGCCCGGCAGAGCC
GTGCGGGCGCCCGCGTACTCACTAGCTGAGGTGGCAGTGGTTCCACCAACATGGAGCTCTCGCAGATGTC
GGAGCTCATGGGGCTGTCGGTGTTGCTTGGGCTGCTGGCCCTGATGGCGAC
TBL2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBL2_1 ↗7:73,578,579負股73,578,569–73,578,628

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_9347HJ · enhancer · 73576484–73576756 · regulatory

ENSR7_BJL8X · enhancer · 73577431–73578325 · regulatory

ENSR7_BJL93 · promoter · 73578326–73579069 · regulatory

ENSR7_5MB9D3 · CTCF_binding_site · 73578676–73578697 · regulatory

ENSR7_5MB9FT · CTCF_binding_site · 73579062–73579083 · regulatory

ENSR7_9347K5 · enhancer · 73581936–73582380 · regulatory

· motif · 73578230–73578239 · motif

· motif · 73578336–73578351 · motif

· motif · 73578343–73578351 · motif

· motif · 73578343–73578358 · motif

· motif · 73578390–73578403 · motif

· motif · 73578440–73578453 · motif

· motif · 73578456–73578469 · motif

· motif · 73578478–73578488 · motif

· motif · 73578557–73578574 · motif

· motif · 73578583–73578594 · motif

· motif · 73578617–73578628 · motif

· motif · 73578621–73578634 · motif

· motif · 73578626–73578636 · motif

· motif · 73578678–73578694 · motif

· motif · 73578686–73578696 · motif

· motif · 73578747–73578757 · motif

· motif · 73578777–73578787 · motif

· motif · 73578868–73578878 · motif

· motif · 73578907–73578918 · motif

· motif · 73578909–73578918 · motif

· motif · 73578929–73578939 · motif

· motif · 73578959–73578969 · motif

· motif · 73578990–73579000 · motif

· motif · 73579041–73579058 · motif

· motif · 73579064–73579080 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:447 aa

1 aa447 aa功能區域重複區
依 Q9Y4P3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Transducin beta-like protein 2(TBL2)由 447 個胺基酸組成,含有七個 WD 重複序列,分別位於第 88–127、134–174、186–226、228–267、277–316、329–367 與 371–409 個胺基酸。第 38–72 個胺基酸區段被註記為無序區。

重複區WD 188–127 aa
重複區WD 2134–174 aa
重複區WD 3186–226 aa
重複區WD 4228–267 aa
重複區WD 5277–316 aa
重複區WD 6329–367 aa
重複區WD 7371–409 aa
功能區域Disordered38–72 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y4P3…

AlphaFold · Q9Y4P3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WS-betaTRPTBL2PDPK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TBL2 位於 Williams-Beuren syndrome(WBS)的關鍵區域。WBS 與染色體 7q11.23 上多個基因的單套缺失有關;該缺失被認為可能源於缺失區兩側高度同源的低拷貝重複序列發生不等交換。TBL2 劑量不足可能是患者部分心血管及肌肉骨骼異常的成因,但此處僅提出可能性。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
疾病關聯TBL2 位於 Williams-Beuren syndrome(WBS)的關鍵區域。WBS 起因於染色體 7q11.23 上多個基因的單套缺失,該缺失被認為可能由缺失區兩側高度同源的低拷貝重複序列發生不等交換所致。TBL2 劑量不足可能造成此疾病中部分心血管與肌肉骨骼異常。資料庫紀錄
證據與來源

TBL2 is located in the Williams-Beuren syndrome (WBS) critical region. WBS results from a hemizygous deletion of several genes on chromosome 7q11.23, thought to arise as a consequence of unequal crossing over between highly homologous low-copy repeat sequences flanking the deleted region. Haploinsufficiency of TBL2 may be the cause of certain cardiovascular and musculo-skeletal abnormalities observed in the disease

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305632 · 4,344 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTAGCTGAGGTGGCAGTGGTTCCACCAACATGGAGCTCT40
41CGCAGATGTCGGAGCTCATGGGGCTGTCGGTGTTGCTTGG80
81GCTGCTGGCCCTGATGGCGACGGCGGCGGTAGCGCGGGGG120
121TGGCTGCGCGCGGGGGAGGAGAGGAGCGGCCGGCCCGCCT160
161GCCAAAAAGCAAATGGATTTCCACCTGACAAATCTTCGGG200
201ATCCAAGAAGCAGAAACAATATCAGCGGATTCGGAAGGAG240
241AAGCCTCAACAACACAACTTCACCCACCGCCTCCTGGCTG280
281CAGCTCTGAAGAGCCACAGCGGGAACATATCTTGCATGGA320
321CTTTAGCAGCAATGGCAAATACCTGGCTACCTGTGCAGAT360
361GATCGCACCATCCGCATCTGGAGCACCAAGGACTTCCTGC400
401AGCGAGAGCACCGCAGCATGAGAGCCAACGTGGAGCTGGA440
441CCACGCCACCCTGGTGCGCTTCAGCCCTGACTGCAGAGCC480
481TTCATCGTCTGGCTGGCCAACGGGGACACCCTCCGTGTCT520
521TCAAGATGACCAAGCGGGAGGATGGGGGCTACACCTTCAC560
561AGCCACCCCAGAGGACTTCCCTAAAAAGCACAAGGCGCCT600
601GTCATCGACATTGGCATTGCTAACACAGGGAAGTTTATCA640
641TGACTGCCTCCAGTGACACCACTGTCCTCATCTGGAGCCT680
681GAAGGGTCAAGTGCTGTCTACCATCAACACCAACCAGATG720
721AACAACACACACGCTGCTGTATCTCCCTGTGGCAGATTTG760
761TAGCCTCGTGTGGCTTCACCCCAGATGTGAAGGTTTGGGA800
801AGTCTGCTTTGGAAAGAAGGGGGAGTTCCAGGAGGTGGTG840
841CGAGCCTTCGAACTAAAGGGCCACTCCGCGGCTGTGCACT880
881CGTTTGCTTTCTCCAACGACTCACGGAGGATGGCTTCTGT920
921CTCCAAGGATGGTACATGGAAACTGTGGGACACAGATGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。