基因總覽
TBL1X（transducin beta like 1 X-linked）是由蛋白質編碼基因 TBL1X 產生的蛋白質，屬於 WD repeat EBI 家族。其序列包含 LisH 與 F-box-like 結構域，以及多個 WD 重複區；這些是此蛋白質的主要結構特徵。TBL1X 與核受體介導的轉錄調控有關，並參與轉錄活化相關的調節過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000645353 ★ | 9,465,058–9,719,740 | 18 |
| ENST00000407597 | 9,463,258–9,719,740 | 18 |
| ENST00000869543 | 9,463,258–9,719,415 | 17 |
| ENST00000970083 | 9,463,258–9,716,262 | 20 |
| ENST00000380961 | 9,463,329–9,718,862 | 18 |
| ENST00000424279 | 9,463,331–9,719,740 | 17 |
| ENST00000970081 | 9,464,612–9,719,739 | 19 |
| ENST00000970082 | 9,464,612–9,719,739 | 18 |
| ENST00000970084 | 9,464,612–9,717,250 | 17 |
| ENST00000970085 | 9,464,612–9,717,259 | 19 |
| ENST00000970086 | 9,464,612–9,716,262 | 19 |
| ENST00001109732 | 9,464,612–9,658,202 | 5 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TBL1X 是 F-box-like 蛋白質，參與將 ubiquitin／19S proteasome 複合體募集至由核受體調控的轉錄單位。來源指出，TBL1X 對核受體介導的轉錄活化具有重要作用。
TBL1X 可能作為轉錄共抑制複合體的組成部分，協助募集 19S proteasome 複合體。其後，轉錄抑制複合體會經蛋白酶體降解，讓轉錄調控所需的輔因子得以交換。這提供了 TBL1X 參與核受體相關轉錄活化的可能分子途徑；來源以「可能」描述其在共抑制複合體中的角色。
Promoter 與基因調控
>TBL1X ENST00000645353 GRCh38 chrX:9464058-9465158 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGGGGCAAGAATATTTGAAAAATATTCAACGAGGCTGACCCCAGAGGTGCTGGGGAGGGGGAGTGGAGA TCTGTTTAACTGAATTAAGGCTGCGAGTGGTTGGGAGTAGCCTACGTGGAGGGGAGGAAGGAGCGCTGGG GACTTAGGTACACCGGGGCCAGGCCGTGTAAGCCATTGCAACATAAAGCACTTTGCAAGGGCCAGAGGGC TGATGCCTGGGGGGTTGGGGTGGGAGTGATGAGGCCCGAGTGCCCAGGTCCCCCCAACCTCCTCAGCCCC CACACCCGAGTTCCTGGCGCCTATGCCTGTGTGTCTGAGTTTGTCCCTAAGCATTTCTGGCTCTTCTTGG GAGGTGTTTTGCAAAGGTCGAGGCTCCGCCGGAACCCCCACTTTTTGAGCTGGGGTAAAGACTACTGGGG TGTCTTCTAAGACGCCGATTTTGAGGGAGATTCACCATCGGGCAGGTGGCAGGGGGTTCTGTTGGGGCAG CCGGGTGGCTTCCTTTTTGGGGTGGGGGAGGGTAACACTTTAGCAGTGATCGAGGTTCCCCTGCCCCCTA GAAACTGAGGGGGTGGCCGAGGTTCCCGTCCCCTCGAGGCAGTCGTGGAAAGGCTGGGTTTGGGATGTGA TGGGGGTAGCCCTGGGGTCCTCTCAGTCCCACGGAGGCCACGGGGAAGGGACCGGGACCAGAGCAACTAG GGAGAGGCCCGGGTTCCCCTCACCCACCCTAGGCGTGGGGGAGCGGGGCGGGCTTGGTAGGGACGCTGGT CCCCCGACCGTGGGACAGGGGCTGGGTTGGGACGCGGGTCCCCACTAGGAGCCGCGGGGGAGGGGCAGGG CCGGAGTCCCTACCCTCGTAGGGGAGGGGCTGGTTCGGGACGCGGCTCCCCCGGGGCGCAGGGGCGGGGC CGGGTGGTACGCCGGGTCCCCTCCCACGGCCGTGAGGGAGGGGCCGGCGGCGGGGGCGGACCCCTGGCGG TCCTCCTGGCTGGGGTCCGCGCGCTCGCGGCAGCTCCCCGTGGAGGTCACTGTCCGTGCCAGTCCCTCCC GCTGTCCCGCCCTCTCCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCCCGCCTCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TBL1X_2 ↗ | X:9,463,318 | 正股 | 9,463,269–9,463,328 |
| TBL1X_1 ↗ | X:9,465,069 | 正股 | 9,465,020–9,465,079 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_95QF6 · promoter · 9462839–9463339 · regulatory
ENSRX_89HSJ · enhancer · 9463340–9463567 · regulatory
ENSRX_95QFM · promoter · 9464568–9465068 · regulatory
ENSRX_5484WT · CTCF_binding_site · 9464865–9464886 · regulatory
ENSRX_CXCQ · enhancer · 9465069–9467067 · regulatory
ENSRX_5484Z2 · CTCF_binding_site · 9465111–9465132 · regulatory
ENSRX_54854T · CTCF_binding_site · 9465945–9465966 · regulatory
ENSRX_89HX5 · enhancer · 9467853–9468018 · regulatory
· motif · 9462982–9462997 · motif
· motif · 9462989–9462997 · motif
· motif · 9463106–9463116 · motif
· motif · 9463157–9463165 · motif
· motif · 9463192–9463202 · motif
· motif · 9463225–9463234 · motif
· motif · 9463225–9463234 · motif
· motif · 9463225–9463234 · motif
· motif · 9463225–9463234 · motif
· motif · 9463267–9463282 · motif
· motif · 9464867–9464883 · motif
· motif · 9464958–9464971 · motif
· motif · 9465014–9465027 · motif
· motif · 9465113–9465129 · motif
· motif · 9465129–9465142 · motif
· motif · 9465132–9465145 · motif
· motif · 9465135–9465148 · motif
· motif · 9465138–9465151 · motif
· motif · 9465158–9465171 · motif
· motif · 9465195–9465208 · motif
· motif · 9465206–9465219 · motif
· motif · 9465209–9465222 · motif
· motif · 9465280–9465293 · motif
· motif · 9465291–9465304 · motif
· motif · 9465302–9465315 · motif
· motif · 9465947–9465963 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：577 aa
TBL1X 蛋白質長 577 個胺基酸，屬於 WD repeat EBI 家族。其結構包含 LisH 結構域（55–87 位）與 F-box-like 結構域（92–137 位），並具有 8 個 WD 重複區，分布於 230–576 位。來源另註記 177–202 位為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TBL1X 位於細胞核，並與 MECP2 共定位於異染色質聚集區。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- ARL3P36405 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TINF2Q9BSI4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DNAJB1P25685 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPS2Q13227 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCOR2Q9Y618 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
TBL1X 可形成同源四聚體，亦即由二聚體組成的四聚體。它是 N-Cor 轉錄抑制複合體的組成部分，也出現在含 UBE2D1、SIAH1、CACYBP/SIP、SKP1、APC 與 TBL1X 的 E3 ubiquitin ligase 複合體中；來源並指出它可能參與不含 NCOR1、NCOR2 的其他共抑制複合體。TBL1X 與 GPS2（當 GPS2 被 sumoylated 時）、組蛋白 H2B、H3a、H4 及 USP44 有互作紀錄；與 MECP2 的互作則標示為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
TBL1X 相關變異被列為先天性非甲狀腺腫性甲狀腺功能低下症 8（CHNG8）的成因。這是一種中樞性甲狀腺功能低下症，特徵為甲狀腺刺激素對原本正常的甲狀腺刺激不足，造成甲狀腺激素分泌偏低；中樞性病因可涉及先天或後天的腦下垂體或下視丘疾病。CHNG8 為先天性、X 連鎖且相對輕微的形式，部分患者可能伴有聽力損失。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TBL1X 是 F-box-like 蛋白質，參與將 ubiquitin／19S proteasome 複合體募集至核受體調控的轉錄單位，並對核受體介導的轉錄活化具有重要作用。它可能是轉錄共抑制複合體的組成部分，藉由募集 19S proteasome 促使轉錄抑制複合體降解，進而讓輔因子交換。 | 含實驗來源 | 證據與來源F-box-like protein involved in the recruitment of the ubiquitin/19S proteasome complex to nuclear receptor-regulated transcription units. Plays an essential role in transcription activation mediated by nuclear receptors. Probably acts as integral component of corepressor complexes that mediates the recruitment of the 19S proteasome complex, leading to the subsequent proteasomal degradation of transcription repressor complexes, thereby allowing cofactor exchange PMID 14980219 ↗ · PMID 21240272 ↗ |
| 交互作用 | TBL1X 可形成由二聚體組成的同源四聚體，並為 N-Cor 轉錄抑制複合體及一種含多個指定蛋白質的 E3 ubiquitin ligase 複合體成員；它也可能加入不含 NCOR1、NCOR2 的其他共抑制複合體。TBL1X 與 GPS2、組蛋白 H2B、H3a、H4 及 USP44 有互作紀錄，並與 MECP2 互作、被募集至異染色質聚集區；GPS2 被 sumoylated 時，互作可保護 GPS2 免於蛋白酶體降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer; dimer of dimers. Component of the N-Cor repressor complex, at least composed of NCOR1, NCOR2, HDAC3, TBL1X, TBL1R, CORO2A and GPS2. Interacts with GPS2 (when sumoylated); leading to protect GPS2 against degradation by the proteasome. Component of a E3 ubiquitin ligase complex containing UBE2D1, SIAH1, CACYBP/SIP, SKP1, APC and TBL1X. Probably part of other corepressor complexes, that do not contain NCOR1 and NCOR2. Interacts with histones H2B, H3a and H4. Interacts with MECP2; recruits TBL1X to the heterochromatin foci (By similarity). Interacts with USP44 PMID 10809664 ↗ · PMID 11389839 ↗ · PMID 21240272 ↗ · PMID 24943844 ↗ · PMID 27880911 ↗ |
| 細胞定位 | TBL1X 位於細胞核，並與 MECP2 共定位於異染色質聚集區。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 影響 TBL1X 的變異可造成先天性非甲狀腺腫性甲狀腺功能低下症 8。此病屬中樞性甲狀腺功能低下症，因甲狀腺刺激素未能充分刺激原本正常的甲狀腺，使甲狀腺激素分泌偏低；成因可涉及先天或後天的腦下垂體或下視丘疾病。此型為先天、X 連鎖且相對輕微，部分患者可能合併聽力損失。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hypothyroidism, congenital, non-goitrous, 8 CHNG8 A form of central hypothyroidism, a disorder characterized by sub-optimal thyroid hormone secretion, due to insufficient stimulation by the thyroid stimulating hormone of an otherwise normal thyroid gland. It may be caused by congenital or acquired disorders of the pituitary gland or hypothalamus. CHNG8 is a congenital, X-linked, relatively mild form which may be accompanied by hearing loss in some patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 301033 PMID 27603907 ↗ · PMID 30591955 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGCTCGCGGCAGCTCCCCGTGGAGGTCACTGTCCGTGCC40AGTCCCTCCCGCTGTCCCGCCCTCTCCCGCTGCCGCCGCC80GCCGCCGCCGCGCCCGCCTCAGCGCCCCCACTCCGCGCTT120GGGAGCGAGGAGCCGCCAGCGCCCCCGCCCCGCCGCCGCC160GCAGCGCCCTCAGGCCGCCATTCGCCACCGAAACTTTCCA200GCGCCCGCGCTCTCTCCGGGACTCGGCGGCGGCGGGGCGG240GGGCGGCCCGGGGGCGGCGCGCGGCTGCTCCGGGGCGCCG280GGCCCTCTTCGGCCGCCGCACGGCCGGGACTCGGAGGCTG320CCGGCTGGAGGGAGGTTCGGAGCGCGGCCGGGCGCGCGGC360GCCGCCACAAGTTGCGCTGCTCGCGACGAGATTTCCGTGA400GGGTGGAAGAAAATCATACCATATCAGATGCCTCGCAGAG440CACCAGGCCCACCGTGAAAGGCTGGTCCCTGCAGACGGCT480TCCCATTTTTATGACCGGATGCTGGGAAGCCTGCTGGTCC520ACAGGTCCATACATGAAGTCACCATAAGGAGCCCTGGCCT560CCTTGCAGAAACATCGAGGTGACATGTAGCATGACCGAGC600TCGCTGGCGCCTCTTCATCGTGCTGCCACCGCCCTGCAGG640AAGAGGGGCCATGCAGTCAGTCTTGCACCACTTTCAACGT680TTGCGAGGGAGAGAGGGTGGTTCCCACTTCATCAACACCT720CATCGCCGCGAGGTGAGGCTAAGATGAGCATAACCAGTGA760CGAGGTGAACTTTCTGGTGTATCGGTATCTCCAGGAGTCA800GGTTTTTCCCACTCGGCTTTCACGTTTGGGATTGAGAGCC840ACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACGCTAGTGCCACC880GGCCGCCCTCATCTCCATTCTCCAGAAGGGCCTGCAGTAT920GTAGAGGCCGAGATCAGTATCAACGAGGATGGCACAGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。