演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBCCCFC

tubulin folding cofactor C

TBCC 是蛋白質編碼基因,產物 tubulin folding cofactor C 參與 tubulin 折疊途徑的最後階段。

Homo sapiens6p21.1UniProt Q15814
OFFICIAL SYMBOL
TBCC
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q15814
PDB / ALPHAFOLD
9M1M
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBCC 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 tubulin folding cofactor C。其產物屬於 TBCC family,與 tubulin 的折疊過程相關;現有資料指出它參與該折疊途徑的最後階段。

Official symbol
TBCC
Gene name
tubulin folding cofactor C
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11580
UniProt
Q15814
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CFC

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegTBCCpq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:42,744,498–42,746,103
Gene span
1,606 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372876 ★42,744,498–42,746,1031

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TBCC 的產物 tubulin folding cofactor C 參與 tubulin 折疊途徑的最後階段,屬於協助 tubulin 完成折疊的蛋白質。來源未提供該蛋白在此步驟中獨立作用方式的更多細節。

相關資料描述一個由 cofactor A 至 cofactor E 組成的超級複合體。cofactor A 與 cofactor D 可捕捉 tubulin,並使其維持在類天然構形;cofactor E 會與 cofactor D-tubulin 複合體結合。接著,cofactor C 與該複合體的作用會促使 tubulin 多肽釋出,這些多肽已朝向天然狀態前進。此描述將 TBCC 所在的最後階段與 tubulin 由受穩定的構形轉為釋出、承諾形成天然狀態的過程連結起來,但未進一步交代各步驟的分子細節或其生理後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42746103 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBCC ENST00000372876 GRCh38 chr6:42746003-42747103 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAATAATGTACCGCTTCTCCCACCGCTTTCCTAAGACCGACCGCCCCAGAGAGCCACGGAGCCCGGGGCT
AGGGTCTCACCCCAGCGCGGCCGGCGACGCCCAGCTGCGGAGGGAGTGGCCGGGACCGAGCTCGGGGAGG
GCAGGGAAGAAAGAGGAAGGGGGTGTGGATCTCACCTTCCCCCGCCCCCACCCCTCCGACTGCAGCAATT
GGCCAAAAAAATAGTAATCCTTTTATGGACTCCCCCAGGGCCCCTCGAACCAGGTTGCAGTGAGGAACCC
AGTCTCTCCCATCGCAGTGCCCCTTGCCTTCTCCTGCCCTAGTAACTGCCTGCGGGGATCCAGGAGCCCC
CAGGCCGCGCCGAACTGCAGTGGATAGGGGGGAGGGGGGCGGTAAGGATGAGGGCTACGGGGAGGCAGAA
ATGGGTTGGGGGAAGGGGTGGTGGAAGGGAAAAGAAAAAACCGGAGGCATGCAAGCGGCTCCCCAGCCAG
CTGTTCCAGCTGCTGCTTCCTCCGGCGCGGGCCAGGCGGTGCAATATTCCCCCCCGCTCCATCTTTCTCA
CCACTACCTGTCCCCCCAACCCACCACACGCACTCATCCCTCCCACCCACACCCCTAGTAGCGGATCTCC
GGCCTGTAAGGGGGTAGTAGGGAGGAGCTGGGGGGAGGGGGAGGCCTGCGAGTTTCTAACCTTGTTCTTA
TAAACAAACCCACATGTGCAGCTGCCGCTGCTGCAACTCACCCCACAATCCCGGATATAAGTCCTGCCCC
TTTAAGAGGAAAAAAAAGATTCCCCCGCCTGCCTCCCACCCCACCCATCCACAAGAACCTTTGTCTTCCC
ACCCCCATAGTCAGTCGGCCCCGCCCCATCTCCCCGCCCCCTCCGACGCAGAGGAACCAATAGGCGAAGA
AAATAAGGCCGGGGATCTGACATCATCATGTTAGGCCAATCACCGGACGCGTTGGTGGGAGGCCTCACGG
ACAGCGCGCCCGGAGGAAGGAAGACAAGAGAGAGGAAGCTTGAAGCCAATATGGAGTCCGTCAGTTGCTC
CGCTGCTGCTGTCAGGACCGGAGACATGGAGTCCCAGCGGGACCTGAGCCT
TBCC 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBCC_1 ↗6:42,746,110負股42,746,100–42,746,159

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_BBH2S · enhancer · 42742184–42742910 · regulatory

ENSR6_5D3FX8 · CTCF_binding_site · 42742337–42742358 · regulatory

ENSR6_5D3GCF · CTCF_binding_site · 42744752–42744773 · regulatory

ENSR6_9LZ4P · promoter · 42746093–42746593 · regulatory

ENSR6_C68JB · enhancer · 42747594–42749077 · regulatory

· motif · 42742339–42742355 · motif

· motif · 42744754–42744770 · motif

· motif · 42745517–42745525 · motif

· motif · 42745517–42745532 · motif

· motif · 42745517–42745534 · motif

· motif · 42745546–42745557 · motif

· motif · 42745546–42745557 · motif

· motif · 42745918–42745929 · motif

· motif · 42745928–42745941 · motif

· motif · 42745940–42745951 · motif

· motif · 42746132–42746143 · motif

· motif · 42746223–42746233 · motif

· motif · 42746236–42746246 · motif

· motif · 42746256–42746266 · motif

· motif · 42746258–42746268 · motif

· motif · 42746286–42746296 · motif

· motif · 42746345–42746354 · motif

· motif · 42746391–42746401 · motif

· motif · 42746433–42746443 · motif

· motif · 42746488–42746498 · motif

· motif · 42746494–42746504 · motif

· motif · 42746498–42746508 · motif

· motif · 42746643–42746663 · motif

· motif · 42746716–42746726 · motif

· motif · 42746907–42746917 · motif

· motif · 42746909–42746919 · motif

· motif · 42746915–42746925 · motif

· motif · 42746935–42746945 · motif

· motif · 42746943–42746956 · motif

· motif · 42746984–42746994 · motif

· motif · 42747113–42747123 · motif

· motif · 42747127–42747138 · motif

· motif · 42747129–42747138 · motif

· motif · 42747167–42747176 · motif

· motif · 42747724–42747738 · motif

· motif · 42748962–42748973 · motif

· motif · 42749458–42749473 · motif

· motif · 42749458–42749473 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:346 aa

1 aa346 aa結構域功能區域
依 Q15814 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TBCC 蛋白長 346 個胺基酸,屬於 TBCC family。其第 171–323 位胺基酸區段註解為 C-CAP/cofactor C-like domain;第 1–26 位及第 140–171 位區段則註解為無序區。

結構域C-CAP/cofactor C-like171–323 aa
功能區域Disordered1–26 aa
功能區域Disordered140–171 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9M1M…

PDB · 9M1M

EM · 2.21 A · C=1-346

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

TBCC 位於細胞質,並主要在光感受器連接纖毛中檢出。 資料未描述不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CFCTBCCCHATFGFR3GSN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TBCC 所屬的 cofactor C 至 E 超級複合體與 tubulin 折疊相關。cofactor E 結合 cofactor D-tubulin 複合體;之後 cofactor C 與該複合體作用,促使已承諾形成天然狀態的 tubulin 多肽釋出。資料未提供 TBCC 與其他成分直接結合的額外細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TBCC 產物是參與 tubulin 折疊的蛋白質,作用於折疊途徑的最後階段;此描述未進一步說明其在該階段的具體分子作用方式。含實驗來源
證據與來源

Tubulin-folding protein; involved in the final step of the tubulin folding pathway

PMID 11847227 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用cofactor A 至 cofactor E 組成超級複合體;A 與 D 捕捉並穩定類天然構形的 tubulin,E 結合 cofactor D-tubulin 複合體,之後 cofactor C 的作用促使已承諾形成天然狀態的 tubulin 多肽釋出。資料庫紀錄
證據與來源

Supercomplex made of cofactors A to E. Cofactors A and D function by capturing and stabilizing tubulin in a quasi-native conformation. Cofactor E binds to the cofactor D-tubulin complex; interaction with cofactor C then causes the release of tubulin polypeptides that are committed to the native state

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TBCC 位於細胞質,並主要在光感受器連接纖毛中檢出;資料未說明此定位是否會隨條件或異構型而改變。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Detected predominantly in the photoreceptor connecting cilium

PMID 12417528 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372876 · 1,606 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AAGACAAGAGAGAGGAAGCTTGAAGCCAATATGGAGTCCG40
41TCAGTTGCTCCGCTGCTGCTGTCAGGACCGGAGACATGGA80
81GTCCCAGCGGGACCTGAGCCTGGTGCCTGAGCGGCTTCAG120
121AGACGCGAACAAGAACGGCAGCTGGAAGTTGAAAGGCGGA160
161AACAAAAGCGGCAGAACCAGGAGGTAGAGAAGGAGAACAG200
201CCACTTTTTCGTCGCCACCTTTGTTCGGGAGCGAGCGGCC240
241GTGGAAGAGCTTCTGGAGCGCGCGGAGTCGGTCGAGCGGC280
281TGGAGGAGGCGGCCTCTCGGCTCCAGGGGCTGCAGAAACT320
321AATCAACGACTCAGTTTTTTTCCTAGCCGCTTACGACCTG360
361CGGCAGGGACAAGAGGCGCTGGCGCGGCTGCAGGCGGCCT400
401TGGCCGAGCGGCGCCGGGGGCTGCAGCCCAAGAAGCGTTT440
441CGCTTTCAAGACCCGGGGAAAGGATGCTGCTTCGTCTACC480
481AAAGTAGACGCGGCTCCTGGCATCCCCCCGGCAGTTGAAA520
521GCATACAGGACTCCCCGCTGCCCAAGAAGGCGGAAGGAGA560
561CCTCGGCCCCAGCTGGGTCTGCGGTTTCTCCAACCTGGAG600
601TCCCAAGTCTTGGAGAAGAGAGCCAGCGAGTTGCACCAGC640
641GCGACGTTCTTTTGACCGAACTGAGCAACTGCACGGTCAG680
681ACTGTATGGAAATCCCAACACCCTGCGGCTAACCAAGGCC720
721CACAGCTGCAAGCTGCTCTGCGGTCCGGTGTCTACCTCTG760
761TTTTCCTGGAGGACTGCAGTGACTGCGTGCTGGCAGTGGC800
801CTGCCAACAGCTCCGCATACACAGTACGAAAGACACCCGC840
841ATCTTCCTGCAGGTGACCAGCAGGGCCATCGTGGAGGACT880
881GCAGTGGGATCCAGTTCGCCCCTTACACCTGGAGCTACCC920
921GGAGATCGACAAGGACTTCGAGAGCTCTGGTTTAGATAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。