演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBCA

tubulin folding cofactor A

TBCA(tubulin folding cofactor A)是參與 tubulin 摺疊途徑早期階段的蛋白質。

Homo sapiens5q14.1UniProt O75347
OFFICIAL SYMBOL
TBCA
CHROMOSOME
5
UNIPROT
O75347
PDB / ALPHAFOLD
1H7C
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBCA 是由 TBCA 基因編碼的蛋白質,正式名稱為 tubulin folding cofactor A,屬於 TBCA family。現有資料指出,它參與 tubulin 摺疊途徑的早期階段;資料未提供其長度、結構域或其他結構特徵。

Official symbol
TBCA
Gene name
tubulin folding cofactor A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11579
UniProt
O75347
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q14.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegTBCApq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:77,690,172–77,868,780
Gene span
178,609 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000380377 ★77,691,166–77,776,3394
ENST0000051767977,690,172–77,715,3174
ENST0000052036177,690,172–77,776,3723
ENST0000051833877,690,172–77,776,3725
ENST0000052237077,690,172–77,868,7804
ENST0000093272777,690,172–77,776,3724
ENST0000093272977,690,172–77,776,3725
ENST0000106181277,690,172–77,776,3724
ENST0000109456977,690,172–77,776,3723
ENST0000113219477,690,172–77,776,3724
ENST0000093272877,691,217–77,776,3724
ENST0000030638877,691,241–77,776,3723

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TBCA 是 tubulin 摺疊途徑早期階段的參與者。現有資料未進一步說明 TBCA 在此階段的分子作用方式或其對後續摺疊步驟的具體影響。

相關的 tubulin 摺疊輔因子系統由 cofactors A 至 E 組成。資料指出,cofactors A 與 D 可捕捉 tubulin,並使其穩定於類似天然構形的狀態;這描述的是兩種輔因子的作用,並未提供 TBCA 單獨作用的更多細節。

在所述的後續步驟中,cofactor E 與 cofactor D-tubulin 複合體結合;接著,cofactor C 的互作會促使 tubulin 多肽釋出。這些釋出的多肽已被指定進入天然狀態。資料未交代此過程的條件或其對其他細胞活動的影響,因此不宜據此延伸推論 TBCA 的其他功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 77776339 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBCA ENST00000380377 GRCh38 chr5:77776239-77777339 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACGACAG
AGTGAGAATCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGCAATTTTAAAAAGGGCGATTCT
GCCCTGTATTCCTCAGGAGATTCTCTTAGGAAGGGACTGCTAGAGCTCACTGTAGATGTGCCTCATTTTA
TGCAACAAATATATTTTTGAACATATAAAATAGTCAAATGTTGTTCAGCATCTACCATGCGTCAGACAAT
GAGCTAGGTGTTTTAACCCTTATACCTAATCTGTAAAATGGACATTATTATTTCCATTTTGCAGACTGAT
CAGCTGCAAGGCTAAACAGCATACGTATCAGTGTTGTCTAGCTAATAGTCTAGCTATTAAAGGGTGGAAC
CTCGATTGTAAGCCGGTTTGTCTGATTAGGAAGCCCAAGGTTTTGTGTGCGACACACATTCTTGTAAGTT
AAATATTTAGGATACACTATAAGTGATCATCTGAAGAAGTTCTGTTAGTCATTTCCTTTGAAAGGCACGT
TATCTACAAACCTTCTTGCAGGGATTTGAGGTAAAGGGCAAGGATTTTCTTGACTGCGTGCATGATGGCA
GTTTGTTTCACTACACATGCATCACTCTGCCTCATCTGACACCAGATAACGACATCGAAAATACCCTTAA
TACATTTTTTAGGTCACTCCGTCCATTAAGCAGATAATCCCGCAAAGCAACGTCCCAGAGAGACGTTAGT
TTCCCCAAAGGCCCAGGCTGTGGAGACCGGGATAGTGTAACTTGCGCCTGAAGTAAAAAGAGGGGCAGTC
CGAGAGAGAGGAGGAGGGCACGTTTCACTACGGGTAAAGGGGCGCACGAGGGGTAAAGGGACTGGCGGGA
GCAGGGTACCGCCCTCTAGTAAACCCGCCCCGCGGGGCGTGGCGGGGACGACGGGCCGCGCAGCCTGCGC
ATGCGCGCCGGCGACCACGCCTAAATAGCCGCAGCCTCTGCGCGTCGCCCTCCACGGTTACCCCGGCTCT
CCGCCCCTCCTTCTCGCGGCGCTCGAGGGACCATGGCCGATCCTCGCGTGA
TBCA 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBCA_1 ↗5:77,776,310負股77,776,300–77,776,359

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_849PZ5 · enhancer · 77773957–77774166 · regulatory

ENSR5_C9PD5 · enhancer · 77775044–77776250 · regulatory

ENSR5_BKFQD · promoter · 77776251–77776829 · regulatory

ENSR5_5N9X5Z · CTCF_binding_site · 77776404–77776425 · regulatory

ENSR5_849Q38 · enhancer · 77777560–77777798 · regulatory

· motif · 77772299–77772313 · motif

· motif · 77772299–77772313 · motif

· motif · 77772910–77772921 · motif

· motif · 77773321–77773336 · motif

· motif · 77775266–77775288 · motif

· motif · 77775352–77775363 · motif

· motif · 77775542–77775555 · motif

· motif · 77775647–77775658 · motif

· motif · 77775651–77775665 · motif

· motif · 77775651–77775665 · motif

· motif · 77776151–77776161 · motif

· motif · 77776172–77776181 · motif

· motif · 77776353–77776364 · motif

· motif · 77776353–77776364 · motif

· motif · 77776406–77776422 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:108 aa

TBCA 屬於 TBCA family。現有資料未提供其胺基酸序列特徵、結構域或其他功能區域註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1H7C…

PDB · 1H7C

X-ray · 1.80 A · A=1-108

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

TBCA 的定位資料列為細胞質與細胞骨架;來源未描述定位變化的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TBCATBCATERF2IPP0DTC1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料描述由 cofactors A 至 E 組成的超複合體。Cofactors A 與 D 會捕捉並穩定 tubulin,使其處於類似天然構形的狀態;cofactor E 與 cofactor D-tubulin 複合體結合,之後 cofactor C 的互作促使 tubulin 多肽釋出。這些內容描述輔因子間的複合體與功能關係,未提供 TBCA 與其他分子的直接結合細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TBCA 是 tubulin 摺疊蛋白,參與 tubulin 摺疊途徑的早期步驟。資料未進一步說明其在該步驟中的具體作用方式。資料庫紀錄
證據與來源

Tubulin-folding protein; involved in the early step of the tubulin folding pathway

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用由 cofactors A 至 E 組成的超複合體參與 tubulin 摺疊。Cofactors A 與 D 捕捉並穩定類似天然構形的 tubulin;cofactor E 結合 cofactor D-tubulin 複合體,之後 cofactor C 的互作促使已指定進入天然狀態的 tubulin 多肽釋出。資料庫紀錄
證據與來源

Supercomplex made of cofactors A to E. Cofactors A and D function by capturing and stabilizing tubulin in a quasi-native conformation. Cofactor E binds to the cofactor D-tubulin complex; interaction with cofactor C then causes the release of tubulin polypeptides that are committed to the native state

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TBCA 的細胞內定位列為細胞質與細胞骨架;資料未提供定位變化或其發生條件。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000380377 · 661 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTAAATAGCCGCAGCCTCTGCGCGTCGCCCTCCACGGTTA40
41CCCCGGCTCTCCGCCCCTCCTTCTCGCGGCGCTCGAGGGA80
81CCATGGCCGATCCTCGCGTGAGACAGATCAAGATCAAGAC120
121CGGCGTGGTGAAGCGGTTGGTCAAAGAAAAAGTGATGTAT160
161GAAAAAGAGGCAAAACAACAAGAAGAAAAGATTGAAAAAA200
201TGAGAGCTGAAGACGGTGAAAATTATGACATTAAAAAGCA240
241GGCAGAGATCCTACAAGAATCCAGGATGATGATCCCAGAT280
281TGCCAGCGCAGGTTGGAAGCCGCATATTTGGATCTTCAAC320
321GGATACTAGAAAATGAAAAAGACTTGGAAGAAGCTGAGGA360
361ATATAAAGAAGCACGTTTAGTACTGGATTCAGTGAAGTTA400
401GAAGCCTGAAACTTTTCTCGTATGGGGTGGTTTTTGCATT440
441AAATCCTGGGGTCCATTTTACAATCCATTATTTTTGACCA480
481CTGCTATGTGTTCAAGTAGTATGAGAATGTGATTGTTTTT520
521ATCTGGTTACATATATATTTCTTTGTCTAATTTAATATGT560
561CAAATAAATGAGTTCATCTAATAAAATTGTTTATTTTATA600
601CTTTACAAAATTTTTAAATTAACCTTTTATCATTAAACCA640
641CATAGACTTTATGACAGAGAA661

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。