基因總覽
TBCA 是由 TBCA 基因編碼的蛋白質,正式名稱為 tubulin folding cofactor A,屬於 TBCA family。現有資料指出,它參與 tubulin 摺疊途徑的早期階段;資料未提供其長度、結構域或其他結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380377 ★ | 77,691,166–77,776,339 | 4 |
| ENST00000517679 | 77,690,172–77,715,317 | 4 |
| ENST00000520361 | 77,690,172–77,776,372 | 3 |
| ENST00000518338 | 77,690,172–77,776,372 | 5 |
| ENST00000522370 | 77,690,172–77,868,780 | 4 |
| ENST00000932727 | 77,690,172–77,776,372 | 4 |
| ENST00000932729 | 77,690,172–77,776,372 | 5 |
| ENST00001061812 | 77,690,172–77,776,372 | 4 |
| ENST00001094569 | 77,690,172–77,776,372 | 3 |
| ENST00001132194 | 77,690,172–77,776,372 | 4 |
| ENST00000932728 | 77,691,217–77,776,372 | 4 |
| ENST00000306388 | 77,691,241–77,776,372 | 3 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TBCA 是 tubulin 摺疊途徑早期階段的參與者。現有資料未進一步說明 TBCA 在此階段的分子作用方式或其對後續摺疊步驟的具體影響。
相關的 tubulin 摺疊輔因子系統由 cofactors A 至 E 組成。資料指出,cofactors A 與 D 可捕捉 tubulin,並使其穩定於類似天然構形的狀態;這描述的是兩種輔因子的作用,並未提供 TBCA 單獨作用的更多細節。
在所述的後續步驟中,cofactor E 與 cofactor D-tubulin 複合體結合;接著,cofactor C 的互作會促使 tubulin 多肽釋出。這些釋出的多肽已被指定進入天然狀態。資料未交代此過程的條件或其對其他細胞活動的影響,因此不宜據此延伸推論 TBCA 的其他功能。
Promoter 與基因調控
>TBCA ENST00000380377 GRCh38 chr5:77776239-77777339 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACGACAG AGTGAGAATCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGCAATTTTAAAAAGGGCGATTCT GCCCTGTATTCCTCAGGAGATTCTCTTAGGAAGGGACTGCTAGAGCTCACTGTAGATGTGCCTCATTTTA TGCAACAAATATATTTTTGAACATATAAAATAGTCAAATGTTGTTCAGCATCTACCATGCGTCAGACAAT GAGCTAGGTGTTTTAACCCTTATACCTAATCTGTAAAATGGACATTATTATTTCCATTTTGCAGACTGAT CAGCTGCAAGGCTAAACAGCATACGTATCAGTGTTGTCTAGCTAATAGTCTAGCTATTAAAGGGTGGAAC CTCGATTGTAAGCCGGTTTGTCTGATTAGGAAGCCCAAGGTTTTGTGTGCGACACACATTCTTGTAAGTT AAATATTTAGGATACACTATAAGTGATCATCTGAAGAAGTTCTGTTAGTCATTTCCTTTGAAAGGCACGT TATCTACAAACCTTCTTGCAGGGATTTGAGGTAAAGGGCAAGGATTTTCTTGACTGCGTGCATGATGGCA GTTTGTTTCACTACACATGCATCACTCTGCCTCATCTGACACCAGATAACGACATCGAAAATACCCTTAA TACATTTTTTAGGTCACTCCGTCCATTAAGCAGATAATCCCGCAAAGCAACGTCCCAGAGAGACGTTAGT TTCCCCAAAGGCCCAGGCTGTGGAGACCGGGATAGTGTAACTTGCGCCTGAAGTAAAAAGAGGGGCAGTC CGAGAGAGAGGAGGAGGGCACGTTTCACTACGGGTAAAGGGGCGCACGAGGGGTAAAGGGACTGGCGGGA GCAGGGTACCGCCCTCTAGTAAACCCGCCCCGCGGGGCGTGGCGGGGACGACGGGCCGCGCAGCCTGCGC ATGCGCGCCGGCGACCACGCCTAAATAGCCGCAGCCTCTGCGCGTCGCCCTCCACGGTTACCCCGGCTCT CCGCCCCTCCTTCTCGCGGCGCTCGAGGGACCATGGCCGATCCTCGCGTGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TBCA_1 ↗ | 5:77,776,310 | 負股 | 77,776,300–77,776,359 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_849PZ5 · enhancer · 77773957–77774166 · regulatory
ENSR5_C9PD5 · enhancer · 77775044–77776250 · regulatory
ENSR5_BKFQD · promoter · 77776251–77776829 · regulatory
ENSR5_5N9X5Z · CTCF_binding_site · 77776404–77776425 · regulatory
ENSR5_849Q38 · enhancer · 77777560–77777798 · regulatory
· motif · 77772299–77772313 · motif
· motif · 77772299–77772313 · motif
· motif · 77772910–77772921 · motif
· motif · 77773321–77773336 · motif
· motif · 77775266–77775288 · motif
· motif · 77775352–77775363 · motif
· motif · 77775542–77775555 · motif
· motif · 77775647–77775658 · motif
· motif · 77775651–77775665 · motif
· motif · 77775651–77775665 · motif
· motif · 77776151–77776161 · motif
· motif · 77776172–77776181 · motif
· motif · 77776353–77776364 · motif
· motif · 77776353–77776364 · motif
· motif · 77776406–77776422 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
TBCA 的定位資料列為細胞質與細胞骨架;來源未描述定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- TERF2IPQ9NYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- P0DTC1P0DTC1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
資料描述由 cofactors A 至 E 組成的超複合體。Cofactors A 與 D 會捕捉並穩定 tubulin,使其處於類似天然構形的狀態;cofactor E 與 cofactor D-tubulin 複合體結合,之後 cofactor C 的互作促使 tubulin 多肽釋出。這些內容描述輔因子間的複合體與功能關係,未提供 TBCA 與其他分子的直接結合細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TBCA 是 tubulin 摺疊蛋白,參與 tubulin 摺疊途徑的早期步驟。資料未進一步說明其在該步驟中的具體作用方式。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 由 cofactors A 至 E 組成的超複合體參與 tubulin 摺疊。Cofactors A 與 D 捕捉並穩定類似天然構形的 tubulin;cofactor E 結合 cofactor D-tubulin 複合體,之後 cofactor C 的互作促使已指定進入天然狀態的 tubulin 多肽釋出。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Supercomplex made of cofactors A to E. Cofactors A and D function by capturing and stabilizing tubulin in a quasi-native conformation. Cofactor E binds to the cofactor D-tubulin complex; interaction with cofactor C then causes the release of tubulin polypeptides that are committed to the native state |
| 細胞定位 | TBCA 的細胞內定位列為細胞質與細胞骨架;資料未提供定位變化或其發生條件。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTAAATAGCCGCAGCCTCTGCGCGTCGCCCTCCACGGTTA40CCCCGGCTCTCCGCCCCTCCTTCTCGCGGCGCTCGAGGGA80CCATGGCCGATCCTCGCGTGAGACAGATCAAGATCAAGAC120CGGCGTGGTGAAGCGGTTGGTCAAAGAAAAAGTGATGTAT160GAAAAAGAGGCAAAACAACAAGAAGAAAAGATTGAAAAAA200TGAGAGCTGAAGACGGTGAAAATTATGACATTAAAAAGCA240GGCAGAGATCCTACAAGAATCCAGGATGATGATCCCAGAT280TGCCAGCGCAGGTTGGAAGCCGCATATTTGGATCTTCAAC320GGATACTAGAAAATGAAAAAGACTTGGAAGAAGCTGAGGA360ATATAAAGAAGCACGTTTAGTACTGGATTCAGTGAAGTTA400GAAGCCTGAAACTTTTCTCGTATGGGGTGGTTTTTGCATT440AAATCCTGGGGTCCATTTTACAATCCATTATTTTTGACCA480CTGCTATGTGTTCAAGTAGTATGAGAATGTGATTGTTTTT520ATCTGGTTACATATATATTTCTTTGTCTAATTTAATATGT560CAAATAAATGAGTTCATCTAATAAAATTGTTTATTTTATA600CTTTACAAAATTTTTAAATTAACCTTTTATCATTAAACCA640CATAGACTTTATGACAGAGAA661cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。