演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TBC1D22AC22orf4

TBC1 domain family member 22A

TBC1D22A 是一種含有 Rab-GAP TBC 結構域的蛋白質,可能作為 Rab 家族蛋白的 GTPase 活化蛋白。

Homo sapiens22q13.31UniProt Q8WUA7
OFFICIAL SYMBOL
TBC1D22A
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q8WUA7
PDB / ALPHAFOLD
2QFZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TBC1D22A(TBC1 domain family member 22A)是由蛋白質編碼基因 TBC1D22A 產生的蛋白質,屬於 TBC1 domain family。其序列含有 Rab-GAP TBC 結構域,並具有一段預測為無序的區域。這些特徵提供了辨識其家族與蛋白質組成的基本線索;其可能的酵素調節角色則見功能說明。

Official symbol
TBC1D22A
Gene name
TBC1 domain family member 22A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1309
UniProt
Q8WUA7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C22orf4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.31
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegTBC1D22Apq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:46,762,617–47,175,699
Gene span
413,083 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000337137 ★46,762,650–47,175,69313
ENST0000038099546,762,617–47,175,69914
ENST0000040738146,762,617–47,175,69912
ENST0000035570446,762,617–47,175,69911
ENST0000085978946,762,617–47,175,69911
ENST0000085979046,762,617–47,175,69911
ENST0000085979146,762,617–47,175,69914
ENST0000085979246,762,617–47,175,69913
ENST0000085979346,762,617–47,175,6999
ENST0000085979446,762,617–47,175,69914
ENST0000091811246,762,617–47,175,6999
ENST0000095401546,762,617–47,175,69912

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TBC1D22A 可能作為 Rab 家族蛋白的 GTPase 活化蛋白(GAP)。GAP 一般涉及調節 GTPase 的活性狀態;不過,現有資料僅指出 TBC1D22A「可能」具有此作用,未指明受調節的 Rab 蛋白種類,也未提供足以確認其作用方式或效應的細節。因此,這項功能應視為尚未確定的可能角色,而非已明確界定的特定 Rab 調控機制。

由於來源沒有列出具體的 Rab 靶蛋白、實驗系統、作用條件或細胞過程,目前無法進一步說明 TBC1D22A 是否影響特定囊泡運輸路徑、細胞器功能或其他生物學結果。其序列中的 Rab-GAP TBC 結構域與可能參與 Rab 蛋白調控的註解相符,但單憑這些資料不能推定其底物選擇性或細胞內效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 46762650 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TBC1D22A ENST00000337137 GRCh38 chr22:46761650-46762750 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATGCAAACCAGACACGGTTTTTTTAGTGATTTTCTGCACACACACACACACACACACACACACACAGTA
AAAAGATCTAGTCATAACGTGTGCACCTGCAGTTCCAACTACTGGGGAGGGTGAGGCAGGAGGATCACTA
GAGGGCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGGCAACATAGCAAGACACCCACCCCCAGTCCCCCCCGGAAAAAA
AGAATAAAAAAGGTAAAAATAATTTTAAAAAGAGTAAAAGGAATGTAAAAATAATTTTAATGCATTTTAT
TTAATCCAATACATTAAAAATGTTACCTAACATGCAAACAATATACAAATTATTTTATACGACGTCTTTG
GAATCCTGTATTTTACACGTAAAGCGCATCTCACTCCGGACTAGCCAGGTTTCAAGCACGTGATAGCCGC
ACAAGGCTGGAACCCAGGCCTGGGGAATTAATTCTTGTCCTCGGTGCTCAAACCATTCTTCCCTTCAAGC
CTGGCCTAATCCCCAGTCTCTCTCATCTCTTCGAATACGCTCCGCGGTTATGCCCCTCACCTCACTGCAC
TGCAAATATTTCGTCCACTGAGTATTTGCTGATCGTCACTCAGTGCCGGGTGACCCAGCTTGACCAGCAC
CCGCAGCCGCCCTGCCACTGTTGGGCCGGGTATGGTGTGTCTGGCTTCCCTCTGTTCTGGGCCGGCTCCG
AAACGCGCTCAAGAGAAATCGGAATCAGACACGGGGCAGTTCAGCTTTGGAAATGAGGAGCTCGAGGCTC
CTGGGAGTCCGTTGCGGGCAGGTGGGCGCCGCTGTTGTGTCGGGAGAGCCAGGAGCGACAGACTCAAACT
CAGAAACCCAACCACCTCCGCTCCCTCCGCGATGCGTGTAACGTGCGTTGCGCGGCGTCGCCCTTTAATA
ACGACGGGCGCTCGGAGTGCTGCGTCACTCGCCACCAGGGACTTAGGCGGGACTTCCGGGCGCGCGTAGG
CACAACTTCCGGAAGGAGGCGGAAGAGCTTCTCGGCTCTAGGCTCTGGAGTCCCGGGAGCAGTGAGGGGC
CACCCGGGGCACAGGAAAGGGCCGCTAGGGGAGGGCCGGGTGCACTCGGGG
TBC1D22A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TBC1D22A_1 ↗22:46,762,660正股46,762,611–46,762,670

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_83D577 · enhancer · 46758224–46758381 · regulatory

ENSR22_BC9JW · enhancer · 46758708–46759287 · regulatory

ENSR22_5DZXMR · CTCF_binding_site · 46758977–46758998 · regulatory

ENSR22_5DZZ5Q · CTCF_binding_site · 46761780–46761801 · regulatory

ENSR22_BC9KD · enhancer · 46761977–46762602 · regulatory

ENSR22_74Q8KF · promoter · 46762603–46762691 · regulatory

ENSR22_5DZZ9P · CTCF_binding_site · 46762634–46762655 · regulatory

ENSR22_BC9KH · enhancer · 46762692–46763609 · regulatory

· motif · 46758741–46758753 · motif

· motif · 46758979–46758995 · motif

· motif · 46759030–46759045 · motif

· motif · 46759037–46759052 · motif

· motif · 46759038–46759053 · motif

· motif · 46759043–46759055 · motif

· motif · 46759046–46759053 · motif

· motif · 46759230–46759240 · motif

· motif · 46761782–46761798 · motif

· motif · 46761790–46761805 · motif

· motif · 46762174–46762189 · motif

· motif · 46762231–46762242 · motif

· motif · 46762500–46762513 · motif

· motif · 46762610–46762619 · motif

· motif · 46762610–46762621 · motif

· motif · 46762633–46762642 · motif

· motif · 46762633–46762644 · motif

· motif · 46762633–46762644 · motif

· motif · 46762636–46762652 · motif

· motif · 46762645–46762656 · motif

· motif · 46762819–46762836 · motif

· motif · 46762873–46762885 · motif

· motif · 46762875–46762882 · motif

· motif · 46762875–46762888 · motif

· motif · 46762880–46762892 · motif

· motif · 46762881–46762896 · motif

· motif · 46762882–46762889 · motif

· motif · 46762882–46762895 · motif

· motif · 46762887–46762899 · motif

· motif · 46762889–46762896 · motif

· motif · 46763016–46763031 · motif

· motif · 46763181–46763192 · motif

· motif · 46763281–46763296 · motif

· motif · 46763522–46763535 · motif

· motif · 46763522–46763535 · motif

· motif · 46764636–46764649 · motif

· motif · 46764636–46764649 · motif

· motif · 46767434–46767445 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:517 aa

1 aa517 aa結構域功能區域
依 Q8WUA7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TBC1D22A 蛋白長 517 個胺基酸。其第 222–446 位胺基酸為 Rab-GAP TBC 結構域;第 103–191 位胺基酸則註解為無序區域。

結構域Rab-GAP TBC222–446 aa
功能區域Disordered103–191 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2QFZ…

PDB · 2QFZ

X-ray · 2.10 A · A/B=191-517

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C22orf4TBC1D22AACBD3NDUFV1PEX1TTRWFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TBC1D22A 可形成同源二聚體,並與 ACBD3、ARFGEF1 及 YWHAB、YWHAE、YWHAG、YWHAH、YWHAQ、YWHAZ 互作。來源未進一步說明這些互作是否為直接結合,或是否構成特定複合體;因此不宜將其與可能的 Rab-GAP 功能混為一談。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TBC1D22A 可能作為 Rab 家族蛋白的 GTPase 活化蛋白;來源以可能性描述此功能,未指出具體的 Rab 蛋白種類或其作用所涉及的條件。推論支持
證據與來源

May act as a GTPase-activating protein for Rab family protein(s)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TBC1D22A 可形成同源二聚體,並與 ACBD3、ARFGEF1、YWHAB、YWHAE、YWHAG、YWHah、YWHAQ 及 YWHAZ 互作;來源未進一步提供這些互作的機制或功能意義。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with ACBD3 and ARFGEF1. Interacts with YWHAB, YWHAE, YWHAG, YWHAH, YWHAQ and YWHAZ

PMID 18186464 ↗ · PMID 23572552 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000337137 · 3,758 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAAGAGCTTCTCGGCTCTAGGCTCTGGAGTCCCGGGAGC40
41AGTGAGGGGCCACCCGGGGCACAGGAAAGGGCCGCTAGGG80
81GAGGGCCGGGTGCACTCGGGGTGTCTGGGCCGCGGGTCTG120
121AGGGATGAGGAGGGGCCATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAA160
161GCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGC200
201ATCCAGCACGTGTATGGTGCCCAGCACCCCCCCTTTGATC240
241CACTGTTACATGGCACTTTGCTCAGGTCCACGGCCAAGAT280
281GCCGACCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTC320
321CAGGAGTTTGAGAGCAATACCAGCGATGCCTGGGACGCTG360
361GGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAG400
401CCTGAACTCCGAGGTGGTCATGGAGACGGCCAACCGTGTG440
441CTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGC480
481AGGAGGGGCCAGGGCTTCAGCAGAAGCCCAGGCCCGAGGC520
521AGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTG560
561AAGTCGGTCAGTGAGAGCCACACGTCCTGTCCTGCAGAAA600
601GTGCCAGCGATGCCGCCCCTCTGCAGAGGTCCCAGTCTCT640
641CCCACACTCGGCCACCGTCACGCTGGGTGGCACATCTGAC680
681CCCAGCACTCTCAGCAGCTCAGCGCTGAGCGAAAGAGAGG720
721CCTCCCGGCTCGACAAGTTCAAGCAGCTGCTTGCCGGCCC760
761CAACACGGACCTTGAGGAATTACGGAGGTTGAGCTGGTCC800
801GGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCC840
841TCTCAGGTTACCTTCCCGCCAATGTAGACCGGAGACCAGC880
881CACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATT920
921GAGCACTATTACGATTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。