演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TAX1BP1TXBP151

Tax1 binding protein 1

TAX1BP1 編碼 Tax1 binding protein 1,是參與免疫訊號調節與選擇性自噬的泛素結合接頭蛋白。

Homo sapiens7p15.2UniProt Q86VP1
OFFICIAL SYMBOL
TAX1BP1
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q86VP1
PDB / ALPHAFOLD
4NLH
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TAX1BP1 是蛋白質編碼基因,其產物 Tax1 binding protein 1 為泛素結合接頭蛋白。來源資料描述它參與發炎、抗病毒與先天免疫相關過程,也具有選擇性自噬受體的角色。蛋白質全長 789 個胺基酸,包含兩個 UBZ1-type 鋅指,並有一段與寡聚化相關的區域;另有數段被註記為無序區。這些特徵提供了其分子組成的基本概況,具體的訊號調節與自噬作用見功能說明。

Official symbol
TAX1BP1
Gene name
Tax1 binding protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11575
UniProt
Q86VP1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TXBP151CALCOCO3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77p15.2
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTAX1BP1pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:27,739,331–27,844,565
Gene span
105,235 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396319 ★27,740,162–27,829,76717
ENST0000041869127,739,331–27,765,9824
ENST0000054311727,739,373–27,829,76517
ENST0000042280027,739,602–27,765,8644
ENST0000026539327,740,084–27,828,88117
ENST0000040998027,740,084–27,828,88118
ENST0000087170227,740,084–27,829,76417
ENST0000087170327,740,084–27,829,75018
ENST0000087170427,740,084–27,829,67417
ENST0000087170527,740,084–27,829,67417
ENST0000087170627,740,084–27,829,25917
ENST0000087170727,740,084–27,829,26118

顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TAX1BP1 透過泛素結合參與免疫訊號調節,並在發炎、抗病毒及先天免疫過程中發揮作用。它可作為接頭蛋白,協助泛素編輯酶 A20/TNFAIP3 接觸並失活其受質,因而負向調節 NF-κB 與 IRF3 訊號。對 IL-1 或 TNF 誘發的 NF-κB 路徑,TAX1BP1 也會將 A20/TNFAIP3 帶至帶有泛素標記的 TRAF6 與 RIPK1,促進這些訊號蛋白去泛素化,從而抑制相關訊號傳遞。

在另一條抗病毒訊號調節路徑中,TAX1BP1 會干擾 E3 泛素連接酶 TRAF3 與 TBK1/IKBKE 的交互作用,減少 TBK1 的 Lys63 連結多聚泛素化,並因此降低 IFN-β 生成。它亦可招募 E3 泛素連接酶 ITCH,促進 MAVS 的 Lys48 連結多聚泛素化及降解,減弱 MAVS 介導的細胞凋亡訊號,抑制病毒誘發的細胞凋亡。

作為巨自噬受體,TAX1BP1 可協助選擇性自噬清除病原菌,包括 Salmonella typhimurium 與 Mycobacterium tuberculosis。當 NBR1 被招募至 SQSTM1-泛素凝集體後,TAX1BP1 是促使 RB1CC1 到達這些凝集體的主要招募者,進而促進凝集體的自噬降解。TAX1BP1 也介導其他受質(包括 TICAM1)的自噬降解。

此外,資料指出 TAX1BP1 在壞死性凋亡期間可招募 TNKS/PARP5A 與 RNF146 至 RIPK1,促使 RIPK1 泛素化並降解,因而負向調節壞死性凋亡;此項功能標註為相似性推定。這些不同作用使 TAX1BP1 能參與免疫訊號的抑制,以及特定蛋白質或病原體的選擇性清除。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 27740162 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TAX1BP1 ENST00000396319 GRCh38 chr7:27739162-27740262 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAAAAATGTCAATACACAGGAAACAAATCAGTCTGTAAATATTGAGAACCTATGTTATCAAAGCTAATG
TCTTCTGAAATAACTGGAAGTAAAGATGAAAGTATATGAAAGATAATTTTGAATGTTCTGTATTTAGAAT
GTGCTTCAACATTTAATGCGATCTAATTTACATATCCTTTCTGGTGCTATTGCAAGGTTTGTCAGGGTTT
TACGGCAACAGAAGACTATGATGAATTCGAATGGGACACATTTGCTTCTGTGGAGTTACGATTCAAACTG
AATGTCCAATATAGGAAGGCAACATATACAACAAGCAAAAGTGATTTTAGAAATAACAGAACGCGGGAGA
AAATTCACACACGGAAAATGATACGGATAACAAAAGCAGGTAACTCACAGAAATGCGGCTAGAAAAGAGG
CCTCTGCTGGAGCGAGAGCAAATAGAATCAGAGGGCATTAGAACTGAAAAGCTCCTAGGAGCTTTCAGTG
AACAAAACTTCATAGCCAAAAAAGCACACGACTGGGCCAGGAGTTCAGAGACAGTCTTGGTGCTCAGGGG
TTTGCAGCCCTAGCCGTGTGGTCACTCCCTTGCTTCTCTGGCTATTTCCTTATCTATAAAATGAGTGGGC
TAGTTTAGGCCGACTGAGACGCAGACAGGGATACGGTACTGTCCATGGACCTCTGAGCTGCCCTTTCCAC
ATCGCTGGTGAGTTACTTAAACCTCCTGTGTGTTTCCCCCTTTCGTATGTCAAAATAATAACATAAAATC
AGAATGTAAATCCAGACGCATTGTTTTGCTGCGATTAAGTTGAACGAAAATAGCAAGGACGAAGTAAGGA
GAGAGCCAGCCTACCCGCGGGATGAGGCGTCCCGCGGCGGAGTGGGCTGGGGGCGTGTCGTCGCGGAGGG
GAGCGGCGAACCAGGCAGGAGGCGGAAGAGACCGCCCCGTGGGCGGAAGTGACGCAAGGCCTACTGTCGG
CTGGGAGGGGAGGTGTAGCCGGTCTTTGGGGGTAGGCGGTAGTGGCGGAAGAGGTTCGGCGGCTGATGGC
GGATCAGGATCGGAAGCCTGCGTAACTTTCTCCCTTGATCCGGGAGTCTTT
TAX1BP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TAX1BP1_1 ↗7:27,740,182正股27,740,133–27,740,192

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_8S2GK · enhancer · 27735268–27735471 · regulatory

ENSR7_9F29D · promoter · 27738948–27739383 · regulatory

ENSR7_B7HM9 · promoter · 27739605–27740172 · regulatory

ENSR7_8S2KD · enhancer · 27740173–27740384 · regulatory

ENSR7_9F29R · promoter · 27740385–27740885 · regulatory

ENSR7_58J6MP · CTCF_binding_site · 27740806–27740827 · regulatory

ENSR7_B7HMM · enhancer · 27741926–27742514 · regulatory

ENSR7_B7HN3 · enhancer · 27744878–27745448 · regulatory

· motif · 27735283–27735298 · motif

· motif · 27735356–27735368 · motif

· motif · 27735406–27735419 · motif

· motif · 27737379–27737390 · motif

· motif · 27740090–27740101 · motif

· motif · 27740111–27740122 · motif

· motif · 27740113–27740122 · motif

· motif · 27740205–27740215 · motif

· motif · 27740389–27740406 · motif

· motif · 27740663–27740680 · motif

· motif · 27740808–27740824 · motif

· motif · 27741027–27741042 · motif

· motif · 27741027–27741042 · motif

· motif · 27741082–27741104 · motif

· motif · 27741082–27741104 · motif

· motif · 27741150–27741161 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:789 aa

1 aa789 aa功能區域鋅指
依 Q86VP1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Tax1 binding protein 1 長 789 個胺基酸。其第 727–753 與 754–780 位胺基酸區段各註記一個 UBZ1-type 鋅指;第 320–420 位胺基酸區段與寡聚化相關。另有三段無序區,分別位於第 481–508、第 639–660 與第 678–712 位胺基酸。

鋅指UBZ1-type 1727–753 aa
鋅指UBZ1-type 2754–780 aa
功能區域Oligomerization320–420 aa
功能區域Disordered481–508 aa
功能區域Disordered639–660 aa
功能區域Disordered678–712 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4NLH…

PDB · 4NLH

X-ray · 1.90 A · A/B=15-147

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Mitochondrion;Preautophagosomal structure;Cytoplasmic vesicle, autophagosome

資料將 TAX1BP1 註記於細胞質、粒線體、前自噬體結構及細胞質囊泡中的自噬體。 此定位資訊未提供各位置間轉換的條件或動態,也未區分異構型。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Preautophagosomal structure。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TXBP151TAX1BP1ARK2NCBX8CHUKCOG7CWF19L2CXXC1DAXXDAZAP2DSTNEMILIN1FAM161AFAM168AFAM90A1FOXC2GABARAPL1GABARAPL2GRNHEL-S-61IGFN1KANK2KAT5L3MBTL2LGALS8LITAFLMO3LNX1LRATD2MAP1LC3CMRPL11MRPL53NMRK1NTAQ1PIBF1PLEKHB2PLEKHN1POLR1CRAB18RAD18RAD23BRALBP1RNF11SCNM1SSX2BSTARD13TBC1D15TCAF1TCEA2TCL1ATNFAIP3TNIP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 66 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TAX1BP1 可形成同源寡聚體,並與 TNFAIP3、NBR1、RB1CC1、SQSTM1、MAVS、RIPK1、TRAF6、TBK1、TICAM1 等蛋白質交互作用。與 TOM1 的交互作用為間接作用,由 MYO6 作為橋接者;TICAM1 與 TRIM32 的交互作用則與 TICAM1 的選擇性自噬降解相關。感染情境下,TAX1BP1 也與 HTLV-1 的 Tax、呼吸道融合病毒 N 蛋白、Lassa virus Z 蛋白及 Mopeia virus Z 蛋白交互作用;呼吸道融合病毒 N 蛋白的交互作用可能藉由抑制先天免疫反應促進病毒生長。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TAX1BP1 是泛素結合接頭蛋白,參與發炎、抗病毒、先天免疫與選擇性自噬。它協助 A20/TNFAIP3 調節 NF-κB、IRF3 及 IL-1/TNF 訊號,並透過影響 TBK1 泛素化降低 IFN-β 生成;也促進 MAVS 降解以減弱病毒誘發的細胞凋亡。作為自噬受體,它參與病原菌及其他受質的自噬清除;壞死性凋亡中的 RIPK1 調節則為相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Ubiquitin-binding adapter that participates in inflammatory, antiviral and innate immune processes as well as selective autophagy regulation. Plays a key role in the negative regulation of NF-kappa-B and IRF3 signalings by acting as an adapter for the ubiquitin-editing enzyme A20/TNFAIP3 to bind and inactivate its substrates. Disrupts the interactions between the E3 ubiquitin ligase TRAF3 and TBK1/IKBKE to attenuate 'Lys63'-linked polyubiquitination of TBK1 and thereby IFN-beta production. Also recruits A20/TNFAIP3 to ubiquitinated signaling proteins TRAF6 and RIPK1, leading to their deubiquitination and disruption of IL-1 and TNF-induced NF-kappa-B signaling pathways. Inhibits virus-induced apoptosis by inducing the 'Lys-48'-linked polyubiquitination and degradation of MAVS via recruitment of the E3 ligase ITCH, thereby attenuating MAVS-mediated apoptosis signaling. As a macroautophagy/autophagy receptor, facilitates the xenophagic clearance of pathogenic bacteria such as Salmonella typhimurium and Mycobacterium tuberculosis. Upon NBR1 recruitment to the SQSTM1-ubiquitin condensates, acts as the major recruiter of RB1CC1 to these ubiquitin condensates to promote their autophagic degradation. Mediates the autophagic degradation of other substrates including TICAM1. Acts as a negative regulator of necroptosis by recruiting TNKS/PARP5A and RNF146 to RIPK1 during necroptosis, leading to RIPK1 ubiquitination and degradation (By similarity)

PMID 10435631 ↗ · PMID 10920205 ↗ · PMID 17703191 ↗ · PMID 21885437 ↗ · PMID 26451915 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 28898289 ↗ · PMID 29940186 ↗ · PMID 30459273 ↗ · PMID 30909570 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TAX1BP1 可形成同源寡聚體,並與多種蛋白質交互作用,包括 TNFAIP3、MAVS、TRAF6、RIPK1、NBR1、TBK1、RB1CC1、SQSTM1、AZI2、TICAM1 與 TRIM32。它與 TOM1 的交互作用由 MYO6 間接橋接;另有多項互作與受質去泛素化、訊號抑制或選擇性自噬降解相關。含實驗來源
證據與來源

Homooligomer. Interacts with TNFAIP3. Interacts with STARD13. Interacts with MYO6. Interacts with TOM1; the interaction is indirect and is mediated by MYO6, which acts as a bridge between TOM1 and TAX1BP1. Interacts with MAVS; this interaction induces MAVS polyubiquitination. Interacts with TNIP1. Interacts with TRAF6; this interaction mediates deubiquitination of TRAF6 and inhibition of NF-kappa-B activation. Interacts with RIPK1; this interaction negatively regulates RIPK1 ubiquitination. Interacts with NBR1. Interacts with TBK1. Interacts with RB1CC1. Interacts with SQSTM1. Interacts with AZI2. Interacts with TICAM1 and TRIM32; these interactions target TICAM1 to TAX1BP1-mediated selective autophagic degradation

PMID 10435631 ↗ · PMID 10920205 ↗ · PMID 14697242 ↗ · PMID 17703191 ↗ · PMID 21885437 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 28898289 ↗ · PMID 30459273 ↗ · PMID 31371777 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,TAX1BP1 與人類 T 細胞白血病病毒 1 型(HTLV-1)的 Tax 蛋白交互作用;此項資料未說明該交互作用的功能結果。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with the HTLV-1 protein Tax

PMID 10435631 ↗ · PMID 14530271 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,TAX1BP1 與呼吸道融合病毒的 N 蛋白交互作用。此交互作用可能透過抑制先天免疫反應促進病毒生長,來源對其促進作用保留可能性表述。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Respiratory syncytial virus protein N; this interaction may promote viral growth by inhibiting the innate immune response

PMID 34431698 ↗

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交互作用在微生物感染情境下,TAX1BP1 與 Lassa virus 的 Z 蛋白交互作用;資料未指出這項交互作用的功能或對感染的影響。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Lassa virus protein Z

PMID 30909570 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,TAX1BP1 與 Mopeia virus 的 Z 蛋白交互作用;資料未指出這項交互作用的功能或對感染的影響。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Mopeia virus protein Z

PMID 30909570 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TAX1BP1 的細胞內定位註記包括細胞質、粒線體、前自噬體結構,以及細胞質囊泡中的自噬體;資料未提供這些定位的條件差異或動態。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Mitochondrion; Preautophagosomal structure; Cytoplasmic vesicle, autophagosome

PMID 30909570 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗ · PMID 26451915 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396319 · 3,423 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTCTTTGGGGGTAGGCGGTAGTGGCGGAAGAGGTTCGGC40
41GGCTGATGGCGGATCAGGATCGGAAGCCTGCGTAACTTTC80
81TCCCTTGATCCGGGAGTCTTTCCACTGGATTCACAATGAC120
121ATCCTTTCAAGAAGTCCCATTGCAGACTTCCAACTTTGCC160
161CATGTCATCTTTCAAAATGTGGCCAAGAGTTACCTTCCTA200
201ATGCACACCTGGAATGTCATTACACCTTAACTCCATATAT240
241TCATCCACATCCAAAAGATTGGGTTGGTATATTCAAGGTT280
281GGATGGAGTACTGCTCGTGATTATTACACGTTTTTATGGT320
321CCCCTATGCCTGAACATTATGTGGAAGGATCAACAGTCAA360
361TTGTGTACTAGCATTCCAAGGATATTACCTTCCAAATGAT400
401GATGGAGAATTTTATCAGTTCTGTTACGTTACCCATAAGG440
441GTGAAATTCGTGGAGCAAGTACACCTTTCCAGTTTCGAGC480
481TTCTTCTCCAGTTGAAGAGCTGCTTACTATGGAAGATGAA520
521GGAAATTCTGACATGTTAGTGGTGACCACAAAAGCAGGCC560
561TTCTTGAGTTGAAAATTGAGAAAACCATGAAAGAAAAAGA600
601AGAACTGTTAAAGTTAATTGCCGTTCTGGAAAAAGAAACA640
641GCACAACTTCGAGAACAAGTTGGGAGAATGGAAAGAGAAC680
681TTAACCATGAGAAAGAAAGATGTGACCAACTGCAAGCAGA720
721ACAAAAGGGTCTTACTGAAGTAACACAAAGCTTAAAAATG760
761GAAAATGAAGAGTTTAAGAAGAGGTTCAGTGATGCTACAT800
801CCAAAGCCCATCAGCTTGAGGAAGATATTGTGTCAGTAAC840
841ACATAAAGCAATTGAAAAAGAAACCGAATTAGACAGTTTA880
881AAGGACAAACTCAAGAAGGCACAACATGAAAGAGAACAAC920
921TTGAATGTCAGTTGAAGACAGAGAAGGATGAAAAGGAACT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。