基因總覽
TAX1BP1 是蛋白質編碼基因,其產物 Tax1 binding protein 1 為泛素結合接頭蛋白。來源資料描述它參與發炎、抗病毒與先天免疫相關過程,也具有選擇性自噬受體的角色。蛋白質全長 789 個胺基酸,包含兩個 UBZ1-type 鋅指,並有一段與寡聚化相關的區域;另有數段被註記為無序區。這些特徵提供了其分子組成的基本概況,具體的訊號調節與自噬作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396319 ★ | 27,740,162–27,829,767 | 17 |
| ENST00000418691 | 27,739,331–27,765,982 | 4 |
| ENST00000543117 | 27,739,373–27,829,765 | 17 |
| ENST00000422800 | 27,739,602–27,765,864 | 4 |
| ENST00000265393 | 27,740,084–27,828,881 | 17 |
| ENST00000409980 | 27,740,084–27,828,881 | 18 |
| ENST00000871702 | 27,740,084–27,829,764 | 17 |
| ENST00000871703 | 27,740,084–27,829,750 | 18 |
| ENST00000871704 | 27,740,084–27,829,674 | 17 |
| ENST00000871705 | 27,740,084–27,829,674 | 17 |
| ENST00000871706 | 27,740,084–27,829,259 | 17 |
| ENST00000871707 | 27,740,084–27,829,261 | 18 |
顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAX1BP1 透過泛素結合參與免疫訊號調節,並在發炎、抗病毒及先天免疫過程中發揮作用。它可作為接頭蛋白,協助泛素編輯酶 A20/TNFAIP3 接觸並失活其受質,因而負向調節 NF-κB 與 IRF3 訊號。對 IL-1 或 TNF 誘發的 NF-κB 路徑,TAX1BP1 也會將 A20/TNFAIP3 帶至帶有泛素標記的 TRAF6 與 RIPK1,促進這些訊號蛋白去泛素化,從而抑制相關訊號傳遞。
在另一條抗病毒訊號調節路徑中,TAX1BP1 會干擾 E3 泛素連接酶 TRAF3 與 TBK1/IKBKE 的交互作用,減少 TBK1 的 Lys63 連結多聚泛素化,並因此降低 IFN-β 生成。它亦可招募 E3 泛素連接酶 ITCH,促進 MAVS 的 Lys48 連結多聚泛素化及降解,減弱 MAVS 介導的細胞凋亡訊號,抑制病毒誘發的細胞凋亡。
作為巨自噬受體,TAX1BP1 可協助選擇性自噬清除病原菌,包括 Salmonella typhimurium 與 Mycobacterium tuberculosis。當 NBR1 被招募至 SQSTM1-泛素凝集體後,TAX1BP1 是促使 RB1CC1 到達這些凝集體的主要招募者,進而促進凝集體的自噬降解。TAX1BP1 也介導其他受質(包括 TICAM1)的自噬降解。
此外,資料指出 TAX1BP1 在壞死性凋亡期間可招募 TNKS/PARP5A 與 RNF146 至 RIPK1,促使 RIPK1 泛素化並降解,因而負向調節壞死性凋亡;此項功能標註為相似性推定。這些不同作用使 TAX1BP1 能參與免疫訊號的抑制,以及特定蛋白質或病原體的選擇性清除。
Promoter 與基因調控
>TAX1BP1 ENST00000396319 GRCh38 chr7:27739162-27740262 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAAAATGTCAATACACAGGAAACAAATCAGTCTGTAAATATTGAGAACCTATGTTATCAAAGCTAATG TCTTCTGAAATAACTGGAAGTAAAGATGAAAGTATATGAAAGATAATTTTGAATGTTCTGTATTTAGAAT GTGCTTCAACATTTAATGCGATCTAATTTACATATCCTTTCTGGTGCTATTGCAAGGTTTGTCAGGGTTT TACGGCAACAGAAGACTATGATGAATTCGAATGGGACACATTTGCTTCTGTGGAGTTACGATTCAAACTG AATGTCCAATATAGGAAGGCAACATATACAACAAGCAAAAGTGATTTTAGAAATAACAGAACGCGGGAGA AAATTCACACACGGAAAATGATACGGATAACAAAAGCAGGTAACTCACAGAAATGCGGCTAGAAAAGAGG CCTCTGCTGGAGCGAGAGCAAATAGAATCAGAGGGCATTAGAACTGAAAAGCTCCTAGGAGCTTTCAGTG AACAAAACTTCATAGCCAAAAAAGCACACGACTGGGCCAGGAGTTCAGAGACAGTCTTGGTGCTCAGGGG TTTGCAGCCCTAGCCGTGTGGTCACTCCCTTGCTTCTCTGGCTATTTCCTTATCTATAAAATGAGTGGGC TAGTTTAGGCCGACTGAGACGCAGACAGGGATACGGTACTGTCCATGGACCTCTGAGCTGCCCTTTCCAC ATCGCTGGTGAGTTACTTAAACCTCCTGTGTGTTTCCCCCTTTCGTATGTCAAAATAATAACATAAAATC AGAATGTAAATCCAGACGCATTGTTTTGCTGCGATTAAGTTGAACGAAAATAGCAAGGACGAAGTAAGGA GAGAGCCAGCCTACCCGCGGGATGAGGCGTCCCGCGGCGGAGTGGGCTGGGGGCGTGTCGTCGCGGAGGG GAGCGGCGAACCAGGCAGGAGGCGGAAGAGACCGCCCCGTGGGCGGAAGTGACGCAAGGCCTACTGTCGG CTGGGAGGGGAGGTGTAGCCGGTCTTTGGGGGTAGGCGGTAGTGGCGGAAGAGGTTCGGCGGCTGATGGC GGATCAGGATCGGAAGCCTGCGTAACTTTCTCCCTTGATCCGGGAGTCTTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAX1BP1_1 ↗ | 7:27,740,182 | 正股 | 27,740,133–27,740,192 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_8S2GK · enhancer · 27735268–27735471 · regulatory
ENSR7_9F29D · promoter · 27738948–27739383 · regulatory
ENSR7_B7HM9 · promoter · 27739605–27740172 · regulatory
ENSR7_8S2KD · enhancer · 27740173–27740384 · regulatory
ENSR7_9F29R · promoter · 27740385–27740885 · regulatory
ENSR7_58J6MP · CTCF_binding_site · 27740806–27740827 · regulatory
ENSR7_B7HMM · enhancer · 27741926–27742514 · regulatory
ENSR7_B7HN3 · enhancer · 27744878–27745448 · regulatory
· motif · 27735283–27735298 · motif
· motif · 27735356–27735368 · motif
· motif · 27735406–27735419 · motif
· motif · 27737379–27737390 · motif
· motif · 27740090–27740101 · motif
· motif · 27740111–27740122 · motif
· motif · 27740113–27740122 · motif
· motif · 27740205–27740215 · motif
· motif · 27740389–27740406 · motif
· motif · 27740663–27740680 · motif
· motif · 27740808–27740824 · motif
· motif · 27741027–27741042 · motif
· motif · 27741027–27741042 · motif
· motif · 27741082–27741104 · motif
· motif · 27741082–27741104 · motif
· motif · 27741150–27741161 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:789 aa
Tax1 binding protein 1 長 789 個胺基酸。其第 727–753 與 754–780 位胺基酸區段各註記一個 UBZ1-type 鋅指;第 320–420 位胺基酸區段與寡聚化相關。另有三段無序區,分別位於第 481–508、第 639–660 與第 678–712 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 TAX1BP1 註記於細胞質、粒線體、前自噬體結構及細胞質囊泡中的自噬體。 此定位資訊未提供各位置間轉換的條件或動態,也未區分異構型。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Preautophagosomal structure。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 66 個夥伴
- ARK2NQ96B23 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBX8Q9HC52 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHUKO15111 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- COG7P83436 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- CWF19L2Q2TBE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXXC1Q9P0U4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- DAXXQ9UER7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- DSTNP60981 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- EMILIN1Q9Y6C2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM161AQ3B820 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM168AQ92567 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXC2Q99958 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL1Q9H0R8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL2P60520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HEL-S-61V9HW29 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFN1Q86VF2-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KANK2Q63ZY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- L3MBTL2Q969R5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LGALS8O00214 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TAX1BP1 可形成同源寡聚體,並與 TNFAIP3、NBR1、RB1CC1、SQSTM1、MAVS、RIPK1、TRAF6、TBK1、TICAM1 等蛋白質交互作用。與 TOM1 的交互作用為間接作用,由 MYO6 作為橋接者;TICAM1 與 TRIM32 的交互作用則與 TICAM1 的選擇性自噬降解相關。感染情境下,TAX1BP1 也與 HTLV-1 的 Tax、呼吸道融合病毒 N 蛋白、Lassa virus Z 蛋白及 Mopeia virus Z 蛋白交互作用;呼吸道融合病毒 N 蛋白的交互作用可能藉由抑制先天免疫反應促進病毒生長。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TAX1BP1 是泛素結合接頭蛋白,參與發炎、抗病毒、先天免疫與選擇性自噬。它協助 A20/TNFAIP3 調節 NF-κB、IRF3 及 IL-1/TNF 訊號,並透過影響 TBK1 泛素化降低 IFN-β 生成;也促進 MAVS 降解以減弱病毒誘發的細胞凋亡。作為自噬受體,它參與病原菌及其他受質的自噬清除;壞死性凋亡中的 RIPK1 調節則為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ubiquitin-binding adapter that participates in inflammatory, antiviral and innate immune processes as well as selective autophagy regulation. Plays a key role in the negative regulation of NF-kappa-B and IRF3 signalings by acting as an adapter for the ubiquitin-editing enzyme A20/TNFAIP3 to bind and inactivate its substrates. Disrupts the interactions between the E3 ubiquitin ligase TRAF3 and TBK1/IKBKE to attenuate 'Lys63'-linked polyubiquitination of TBK1 and thereby IFN-beta production. Also recruits A20/TNFAIP3 to ubiquitinated signaling proteins TRAF6 and RIPK1, leading to their deubiquitination and disruption of IL-1 and TNF-induced NF-kappa-B signaling pathways. Inhibits virus-induced apoptosis by inducing the 'Lys-48'-linked polyubiquitination and degradation of MAVS via recruitment of the E3 ligase ITCH, thereby attenuating MAVS-mediated apoptosis signaling. As a macroautophagy/autophagy receptor, facilitates the xenophagic clearance of pathogenic bacteria such as Salmonella typhimurium and Mycobacterium tuberculosis. Upon NBR1 recruitment to the SQSTM1-ubiquitin condensates, acts as the major recruiter of RB1CC1 to these ubiquitin condensates to promote their autophagic degradation. Mediates the autophagic degradation of other substrates including TICAM1. Acts as a negative regulator of necroptosis by recruiting TNKS/PARP5A and RNF146 to RIPK1 during necroptosis, leading to RIPK1 ubiquitination and degradation (By similarity) PMID 10435631 ↗ · PMID 10920205 ↗ · PMID 17703191 ↗ · PMID 21885437 ↗ · PMID 26451915 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 28898289 ↗ · PMID 29940186 ↗ · PMID 30459273 ↗ · PMID 30909570 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗ |
| 交互作用 | TAX1BP1 可形成同源寡聚體,並與多種蛋白質交互作用,包括 TNFAIP3、MAVS、TRAF6、RIPK1、NBR1、TBK1、RB1CC1、SQSTM1、AZI2、TICAM1 與 TRIM32。它與 TOM1 的交互作用由 MYO6 間接橋接;另有多項互作與受質去泛素化、訊號抑制或選擇性自噬降解相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer. Interacts with TNFAIP3. Interacts with STARD13. Interacts with MYO6. Interacts with TOM1; the interaction is indirect and is mediated by MYO6, which acts as a bridge between TOM1 and TAX1BP1. Interacts with MAVS; this interaction induces MAVS polyubiquitination. Interacts with TNIP1. Interacts with TRAF6; this interaction mediates deubiquitination of TRAF6 and inhibition of NF-kappa-B activation. Interacts with RIPK1; this interaction negatively regulates RIPK1 ubiquitination. Interacts with NBR1. Interacts with TBK1. Interacts with RB1CC1. Interacts with SQSTM1. Interacts with AZI2. Interacts with TICAM1 and TRIM32; these interactions target TICAM1 to TAX1BP1-mediated selective autophagic degradation PMID 10435631 ↗ · PMID 10920205 ↗ · PMID 14697242 ↗ · PMID 17703191 ↗ · PMID 21885437 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 28898289 ↗ · PMID 30459273 ↗ · PMID 31371777 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TAX1BP1 與人類 T 細胞白血病病毒 1 型(HTLV-1)的 Tax 蛋白交互作用;此項資料未說明該交互作用的功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TAX1BP1 與呼吸道融合病毒的 N 蛋白交互作用。此交互作用可能透過抑制先天免疫反應促進病毒生長,來源對其促進作用保留可能性表述。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Respiratory syncytial virus protein N; this interaction may promote viral growth by inhibiting the innate immune response PMID 34431698 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TAX1BP1 與 Lassa virus 的 Z 蛋白交互作用;資料未指出這項交互作用的功能或對感染的影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,TAX1BP1 與 Mopeia virus 的 Z 蛋白交互作用;資料未指出這項交互作用的功能或對感染的影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TAX1BP1 的細胞內定位註記包括細胞質、粒線體、前自噬體結構,以及細胞質囊泡中的自噬體;資料未提供這些定位的條件差異或動態。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Mitochondrion; Preautophagosomal structure; Cytoplasmic vesicle, autophagosome PMID 30909570 ↗ · PMID 27736772 ↗ · PMID 33226137 ↗ · PMID 34471133 ↗ · PMID 26451915 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGTCTTTGGGGGTAGGCGGTAGTGGCGGAAGAGGTTCGGC40GGCTGATGGCGGATCAGGATCGGAAGCCTGCGTAACTTTC80TCCCTTGATCCGGGAGTCTTTCCACTGGATTCACAATGAC120ATCCTTTCAAGAAGTCCCATTGCAGACTTCCAACTTTGCC160CATGTCATCTTTCAAAATGTGGCCAAGAGTTACCTTCCTA200ATGCACACCTGGAATGTCATTACACCTTAACTCCATATAT240TCATCCACATCCAAAAGATTGGGTTGGTATATTCAAGGTT280GGATGGAGTACTGCTCGTGATTATTACACGTTTTTATGGT320CCCCTATGCCTGAACATTATGTGGAAGGATCAACAGTCAA360TTGTGTACTAGCATTCCAAGGATATTACCTTCCAAATGAT400GATGGAGAATTTTATCAGTTCTGTTACGTTACCCATAAGG440GTGAAATTCGTGGAGCAAGTACACCTTTCCAGTTTCGAGC480TTCTTCTCCAGTTGAAGAGCTGCTTACTATGGAAGATGAA520GGAAATTCTGACATGTTAGTGGTGACCACAAAAGCAGGCC560TTCTTGAGTTGAAAATTGAGAAAACCATGAAAGAAAAAGA600AGAACTGTTAAAGTTAATTGCCGTTCTGGAAAAAGAAACA640GCACAACTTCGAGAACAAGTTGGGAGAATGGAAAGAGAAC680TTAACCATGAGAAAGAAAGATGTGACCAACTGCAAGCAGA720ACAAAAGGGTCTTACTGAAGTAACACAAAGCTTAAAAATG760GAAAATGAAGAGTTTAAGAAGAGGTTCAGTGATGCTACAT800CCAAAGCCCATCAGCTTGAGGAAGATATTGTGTCAGTAAC840ACATAAAGCAATTGAAAAAGAAACCGAATTAGACAGTTTA880AAGGACAAACTCAAGAAGGCACAACATGAAAGAGAACAAC920TTGAATGTCAGTTGAAGACAGAGAAGGATGAAAAGGAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。