基因總覽
TAS1R1(taste 1 receptor member 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 G protein-coupled receptor 3 family 的 TAS1R subfamily。這是一種推定的味覺受體;來源將其與另一受體成員 TAS1R3 描述為共同形成異源二聚體。其序列特徵與受體家族歸屬,構成理解其味覺相關角色的基本背景;具體的刺激反應及序列差異可能造成的影響見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000333172 ★ | 6,555,307–6,579,755 | 6 |
| ENST00000351136 | 6,555,303–6,579,755 | 5 |
| ENST00001144450 | 6,555,303–6,579,755 | 6 |
| ENST00000411823 | 6,570,941–6,579,426 | 3 |
| ENST00000415267 | 6,570,941–6,579,426 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAS1R1 被描述為推定的味覺受體。來源指出,TAS1R1 與 TAS1R3 形成的受體組合會對鮮味刺激產生反應;此處所指的鮮味刺激以麩胺酸鈉的味道為例。這項資料支持 TAS1R1 參與鮮味感知,但將其功能定位為推定性質,並未提供更細部的分子傳訊步驟或其他生理作用細節。
味覺反應的選擇性與專一性可能受到 TAS1R1 序列差異影響。來源特別指出,這些差異可存在於同一物種之內,也可出現在不同物種之間,且可能顯著改變味覺反應的特性。因此,對鮮味刺激的反應並非必然在不同序列背景下完全相同;不過,資料並未進一步列出哪些序列變化對應特定刺激或反應,也未界定影響的方向。
整體來看,現有描述將 TAS1R1 的主要生物學角色連結至鮮味受體反應,並指出其序列變異可能影響味覺辨識的選擇性與專一性。這些資訊界定了其功能相關範圍,但不足以推論具體的受體活化機制、其他味覺類別或下游細胞反應。
Promoter 與基因調控
>TAS1R1 ENST00000333172 GRCh38 chr1:6554307-6555407 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCCCTCCCTCCAGTCCACGCCGGACGCCTGGGCTTGCAGTAACCGCCACCGTAGGCGCCGCCGACCGCA CCAGCGCAGGCTCCCGAGCCGGCGGCGGGGCCGGCGGCTGAGGATGAGCTGGGGCCGGGCCTTGCGGACC CGCAGCCAAGTGGAACGGCAGGAACCCCGCTTTAGCAGCAGTCCCGAGTCCGCCATGCTGGGTCCTCAGG GCCTACCGCGCGAGAATCTCGCGAGATCCCGTCGGTCCGCCCCGCTGCCCTCCCAGCTGCCGAAAAGAGG GGCCTCCGAGCCGCCGGCGCCCTCTGCCGGCAACCTCCGGAAGCACACTAGGAGGTTCCAGCCGATCTGG TCGAGGGGCTCCACGGAGGACTCCATTTACGTTACGCAAATTCCCTACCCCAGCCGGCCGGAGAGAGAAA GCCAGAAACCTCGCGACCAGCCATGGGCCACCTCTCCGGAAAAACACCGGGATATTTTTTTTCTCCTGCA GAAAAAGCTTTAGGATTGGCAGTTTAAACAAAACATGTCTATTTGCATACCTTCGGTTTGCATGCATTTG TTTCGAAGTGAGCAACCCTGGGTAACAAGGCGAAAGTATATGACAATTTGCTCAGAATCTTAATGTCAGA AAACTGGAGACTGGGGCAGGGGGGTGTCGACTCAAAGCTGTGTCTCATTTAGTAAACTGAGGCCCAGGTA AAAAGTTCTGAAACCTCGCAACACCCGGAGAAATTGTGTTCCAGCCTCCCACCTCGCCCCAAAATGCCAG AGCTCCTTTTCTAAGCCAGGTGAAGTCACAGAGCGTGGACAGAACCCACAACCGTCCAGAGGAAGGGTCA CTGGGTGCCACCTGGTTTGCATCTGTGCCTTCGTCCTGCCCAGTTCCTGAGTGGGACCGCAGGCCCGGAA TGTCAAGGCAAACAGTCCTGCTTCAGCCACTGGGCTCCAGTCCCACCCCTTTTGGGGGCCTGAAGTTAGG AAGCATCCGGCAGCTGCCTTCTATTTAAGCAACTGGCCTCCTTAGAGGCCACTCCTTGGCCATGCCAGGC GCGGGCATCTGGCCAGCATGCTGCTCTGCACGGCTCGCCTGGTCGGCCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_53JLSZ · CTCF_binding_site · 6554289–6554310 · regulatory
ENSR1_B3B5C · promoter · 6554503–6555319 · regulatory
ENSR1_53JLWF · CTCF_binding_site · 6554600–6554621 · regulatory
ENSR1_53JLZX · CTCF_binding_site · 6555148–6555169 · regulatory
· motif · 6554193–6554213 · motif
· motif · 6554252–6554267 · motif
· motif · 6554291–6554307 · motif
· motif · 6554494–6554504 · motif
· motif · 6554602–6554618 · motif
· motif · 6554622–6554631 · motif
· motif · 6555150–6555166 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:841 aa
TAS1R1 蛋白質長 841 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 3 family 的 TAS1R subfamily。序列註解包含一段 20 個胺基酸的訊號區,以及七段螺旋型跨膜區。跨膜區之間的拓撲註解顯示,蛋白質具有胞外與細胞質區段;其中較長的胞外區位於 N 端。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAS1R1 被註解為多次跨膜蛋白,定位於細胞膜。 來源未提供定位隨條件改變、異構型差異或動態變化的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TAS1R1 與 TAS1R3 形成異源二聚體,這是來源明確記載的複合體關係;資料未另外描述其他實體結合夥伴或互作方式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TAS1R1 是推定的味覺受體,與 TAS1R3 共同對鮮味刺激產生反應,所舉例子是麩胺酸鈉的味道。同一物種內或不同物種間的序列差異,都可能顯著影響味覺反應的選擇性與專一性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Putative taste receptor. TAS1R1/TAS1R3 responds to the umami taste stimulus (the taste of monosodium glutamate). Sequence differences within and between species can significantly influence the selectivity and specificity of taste responses PMID 11917125 ↗ |
| 交互作用 | TAS1R1 與 TAS1R3 形成異源二聚體。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TAS1R1 定位於細胞膜,並被註解為多次跨膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTATTTAAGCAACTGGCCTCCTTAGAGGCCACTCCTTGGC40CATGCCAGGCGCGGGCATCTGGCCAGCATGCTGCTCTGCA80CGGCTCGCCTGGTCGGCCTGCAGCTTCTCATTTCCTGCTG120CTGGGCCTTTGCCTGCCATAGCACGGAGTCTTCTCCTGAC160TTCACCCTCCCCGGAGATTACCTCCTGGCAGGCCTGTTCC200CTCTCCATTCTGGCTGTCTGCAGGTGAGGCACAGACCCGA240GGTGACCCTGTGTGACAGGTCTTGTAGCTTCAATGAGCAT280GGCTACCACCTCTTCCAGGCTATGCGGCTTGGGGTTGAGG320AGATAAACAACTCCACGGCCCTGCTGCCCAACATCACCCT360GGGGTACCAGCTGTATGATGTGTGTTCTGACTCTGCCAAT400GTGTATGCCACGCTGAGAGTGCTCTCCCTGCCAGGGCAAC440ACCACATAGAGCTCCAAGGAGACCTTCTCCACTATTCCCC480TACGGTGCTGGCAGTGATTGGGCCTGACAGCACCAACCGT520GCTGCCACCACAGCCGCCCTGCTGAGCCCTTTCCTGGTGC560CCATGATTAGCTATGCGGCCAGCAGCGAGACGCTCAGCGT600GAAGCGGCAGTATCCCTCTTTCCTGCGCACCATCCCCAAT640GACAAGTACCAGGTGGAGACCATGGTGCTGCTGCTGCAGA680AGTTCGGGTGGACCTGGATCTCTCTGGTTGGCAGCAGTGA720CGACTATGGGCAGCTAGGGGTGCAGGCACTGGAGAACCAG760GCCACTGGTCAGGGGATCTGCATTGCTTTCAAGGACATCA800TGCCCTTCTCTGCCCAGGTGGGCGATGAGAGGATGCAGTG840CCTCATGCGCCACCTGGCCCAGGCCGGGGCCACCGTCGTG880GTTGTTTTTTCCAGCCGGCAGTTGGCCAGGGTGTTTTTCG920AGTCCGTGGTGCTGACCAACCTGACTGGCAAGGTGTGGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。