基因總覽
TAL2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 TAL bHLH transcription factor 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q31.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000334077 ★ | 105,662,457–105,663,124 | 1 |
| ENST00001099655 | 105,656,229–105,665,420 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TAL2 ENST00000334077 GRCh38 chr9:105661457-105662557 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTGCGAGACTAAATACCCCCACTTCTGTTCTTCATACACCAGGGTTTCAAGACCCTTCATCATTCTGTT CCTGCTCCTCTAAATATAGTCCAGTCTGGATATTTTAGTTCTTACAGAGAGGGGCTGAATCCTCCAGGTG AGGTCTGCCAGCTAACAAGAGAGCTGTATTGTCTTCTCTATTCCAAATTTTATTTTATTAACGAAACCTA CAATCATTTTCTTTTTTTACTTCATTCTGATAATACATTGTTGATTCATATTCAACTCTCTGTTGGTGGC CGGGCATCGTGACTCACGCTTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGATCA GGAGTTTAAGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATATAAAAACTAGCCAGGC GTGGTGGCAGGCGCCTATAGTCCCAGCTACTCCGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTCAAACCCGGGAGC TGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGTGCCATGGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCA AAAAAAGAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAACTTTCTATTGGCCAAACATATGTTGCATTTATACATAA ACTCAATCAATATTGTACCTGATTCTGAACAATTAGGAAGAGTTGGTTATAAAGGAAGAAACAGGAGTAT TGGGACAAAGCAATCTTTCAACTGGAGGCTTCAAAACAGCCAGAGAGAAAAAGCTGAAGGGTGTTGTTCT TACCTTCCCCTGTTGTTTTTAAGTTAAAAAAAGAAATTATGCATAATTCATAGCGTCACTGATGCCTCGA AAGGTGAGAGGCATATGTTTGTGTCCCTGTGGGGTTGTTTTCTTTTTTAAAAACCTGAAAATGAGGAAAT GAATCTCGTAAGCTCTGAGTCGAGAAAATCTAACATCTCAGGTTCTTGGCAGGACATGTGATACCAATCA GGCCTCTTATAAGATATTGGCCCTGAGGGCCCTTTCTCTTTCCATCTCAGGAACTCAAACATGACCAGGA AGATCTTCACAAATACCAGGGAGCGGTGGAGGCAGCAGAATGTCAACAGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_854TP7 · promoter · 105662310–105662467 · regulatory
· motif · 105662204–105662217 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:108 aa
TAL2 蛋白質長 108 個胺基酸。其第 2–54 位為 bHLH 結構域;第 89–108 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
涉及 TAL2 的染色體異常可能是部分 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL)的成因之一。來源指出的異常為 t(7;9)(q34;q32) 易位,涉及 TCRB;此資料支持可能的疾病成因關聯,並未將其描述為所有 T-ALL 的原因。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 疾病關聯 | 涉及 TAL2 的染色體異常可能是部分 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL)的成因之一;所述異常為涉及 TCRB 的 t(7;9)(q34;q32) 易位。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving TAL2 may be a cause of some T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Translocation t(7;9)(q34;q32) with TCRB PMID 1763056 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCCTGAGGGCCCTTTCTCTTTCCATCTCAGGAACTCAAAC40ATGACCAGGAAGATCTTCACAAATACCAGGGAGCGGTGGA80GGCAGCAGAATGTCAACAGCGCCTTTGCCAAGCTGAGGAA120GCTCATCCCCACTCACCCTCCAGACAAAAAGCTGAGCAAA160AATGAAACGCTTCGCCTGGCAATGAGGTATATCAACTTCT200TGGTCAAGGTCTTGGGGGAGCAAAGCCTGCAACAAACGGG240AGTGGCTGCTCAGGGGAACATTCTGGGGCTCTTCCCTCAA280GGACCCCACCTGCCAGGCCTGGAGGACAGAACTCTGCTTG320AGAACTACCAGGTTCCTTCACCTGGTCCAAGCCACCACAT360TCCTTAGTGTGGCTCTGGCTGTCATCTCCCAGGGCAGCAC400TTGCCCAGAAATCACTGCCTGTGGACAGACTTTTGCATGT440TCCAGAGTTGACCTGATGATAACTCGTGAAGCATGAATTC480TAGCTTCCTGGGAGGTGGCTCAGAGACAGCTGCAGGGAGC520TGAAAGAAGCCATGAGGAATGTCACTTGTGGGCCGCCACC560CCCCAGGGATGTCAGGTAGAGCGGCCTACCTCTGCCTATT600TTAAATCCAGGTTCTGCATAAGACTTTTGGAGAAAAAATT640CTAAATAAAAAAAAAAAAAGGCTGAAAA668cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。