演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TAL2bHLHa19

TAL bHLH transcription factor 2

TAL2 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens9q31.2UniProt Q16559
OFFICIAL SYMBOL
TAL2
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q16559
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TAL2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 TAL bHLH transcription factor 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q31.2。

Official symbol
TAL2
Gene name
TAL bHLH transcription factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11557
UniProt
Q16559
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
bHLHa19

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q31.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTAL2pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:105,656,229–105,665,420
Gene span
9,192 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334077 ★105,662,457–105,663,1241
ENST00001099655105,656,229–105,665,4202

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 105662457 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TAL2 ENST00000334077 GRCh38 chr9:105661457-105662557 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTGCGAGACTAAATACCCCCACTTCTGTTCTTCATACACCAGGGTTTCAAGACCCTTCATCATTCTGTT
CCTGCTCCTCTAAATATAGTCCAGTCTGGATATTTTAGTTCTTACAGAGAGGGGCTGAATCCTCCAGGTG
AGGTCTGCCAGCTAACAAGAGAGCTGTATTGTCTTCTCTATTCCAAATTTTATTTTATTAACGAAACCTA
CAATCATTTTCTTTTTTTACTTCATTCTGATAATACATTGTTGATTCATATTCAACTCTCTGTTGGTGGC
CGGGCATCGTGACTCACGCTTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGATCA
GGAGTTTAAGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATATAAAAACTAGCCAGGC
GTGGTGGCAGGCGCCTATAGTCCCAGCTACTCCGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTCAAACCCGGGAGC
TGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGTGCCATGGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCA
AAAAAAGAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAACTTTCTATTGGCCAAACATATGTTGCATTTATACATAA
ACTCAATCAATATTGTACCTGATTCTGAACAATTAGGAAGAGTTGGTTATAAAGGAAGAAACAGGAGTAT
TGGGACAAAGCAATCTTTCAACTGGAGGCTTCAAAACAGCCAGAGAGAAAAAGCTGAAGGGTGTTGTTCT
TACCTTCCCCTGTTGTTTTTAAGTTAAAAAAAGAAATTATGCATAATTCATAGCGTCACTGATGCCTCGA
AAGGTGAGAGGCATATGTTTGTGTCCCTGTGGGGTTGTTTTCTTTTTTAAAAACCTGAAAATGAGGAAAT
GAATCTCGTAAGCTCTGAGTCGAGAAAATCTAACATCTCAGGTTCTTGGCAGGACATGTGATACCAATCA
GGCCTCTTATAAGATATTGGCCCTGAGGGCCCTTTCTCTTTCCATCTCAGGAACTCAAACATGACCAGGA
AGATCTTCACAAATACCAGGGAGCGGTGGAGGCAGCAGAATGTCAACAGCG
TAL2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_854TP7 · promoter · 105662310–105662467 · regulatory

· motif · 105662204–105662217 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:108 aa

1 aa108 aa結構域功能區域
依 Q16559 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TAL2 蛋白質長 108 個胺基酸。其第 2–54 位為 bHLH 結構域;第 89–108 位則被註記為無序區域。

結構域bHLH2–54 aa
功能區域Disordered89–108 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q16559…

AlphaFold · Q16559

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
bHLHa19TAL2TCF4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

涉及 TAL2 的染色體異常可能是部分 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL)的成因之一。來源指出的異常為 t(7;9)(q34;q32) 易位,涉及 TCRB;此資料支持可能的疾病成因關聯,並未將其描述為所有 T-ALL 的原因。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
疾病關聯涉及 TAL2 的染色體異常可能是部分 T 細胞急性淋巴性白血病(T-ALL)的成因之一;所述異常為涉及 TCRB 的 t(7;9)(q34;q32) 易位。含實驗來源
證據與來源

A chromosomal aberration involving TAL2 may be a cause of some T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Translocation t(7;9)(q34;q32) with TCRB

PMID 1763056 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334077 · 668 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCTGAGGGCCCTTTCTCTTTCCATCTCAGGAACTCAAAC40
41ATGACCAGGAAGATCTTCACAAATACCAGGGAGCGGTGGA80
81GGCAGCAGAATGTCAACAGCGCCTTTGCCAAGCTGAGGAA120
121GCTCATCCCCACTCACCCTCCAGACAAAAAGCTGAGCAAA160
161AATGAAACGCTTCGCCTGGCAATGAGGTATATCAACTTCT200
201TGGTCAAGGTCTTGGGGGAGCAAAGCCTGCAACAAACGGG240
241AGTGGCTGCTCAGGGGAACATTCTGGGGCTCTTCCCTCAA280
281GGACCCCACCTGCCAGGCCTGGAGGACAGAACTCTGCTTG320
321AGAACTACCAGGTTCCTTCACCTGGTCCAAGCCACCACAT360
361TCCTTAGTGTGGCTCTGGCTGTCATCTCCCAGGGCAGCAC400
401TTGCCCAGAAATCACTGCCTGTGGACAGACTTTTGCATGT440
441TCCAGAGTTGACCTGATGATAACTCGTGAAGCATGAATTC480
481TAGCTTCCTGGGAGGTGGCTCAGAGACAGCTGCAGGGAGC520
521TGAAAGAAGCCATGAGGAATGTCACTTGTGGGCCGCCACC560
561CCCCAGGGATGTCAGGTAGAGCGGCCTACCTCTGCCTATT600
601TTAAATCCAGGTTCTGCATAAGACTTTTGGAGAAAAAATT640
641CTAAATAAAAAAAAAAAAAGGCTGAAAA668

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。