基因總覽
TAGLN2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 transgelin 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q23.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368097 ★ | 159,918,111–159,925,507 | 5 |
| ENST00000368096 | 159,918,106–159,923,747 | 5 |
| ENST00000320307 | 159,918,106–159,924,551 | 5 |
| ENST00000854582 | 159,918,106–159,925,525 | 5 |
| ENST00000854583 | 159,918,106–159,925,525 | 5 |
| ENST00000854584 | 159,918,106–159,925,512 | 5 |
| ENST00000854585 | 159,918,106–159,925,510 | 5 |
| ENST00000854586 | 159,918,106–159,925,478 | 5 |
| ENST00000854587 | 159,918,106–159,925,012 | 5 |
| ENST00000854588 | 159,918,106–159,924,658 | 5 |
| ENST00000854589 | 159,918,106–159,924,606 | 5 |
| ENST00000854590 | 159,918,106–159,923,365 | 5 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TAGLN2 ENST00000368097 GRCh38 chr1:159925407-159926507 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCATAGAATGCACAACAGTCACACAGCAGGTAAAGGGTAGAGCAGGTGGGGAGCCAGTCAAGGAAGGGAA ACTGTCCTAGGCAGAGGAATAGCCTTTGTAAAGGCACAGAAGAGTGAGAATGCTTGACAATCAGTGGGAC TGGAATATAGGGCTGTGTAGGACTCGGGGAGGGAACAGAGAATAATAGAAAGGTTGGACAGGACTGGATA TTGACATCCTGGAATCTCAGGTTCAAGGGAGGACTCTATCATGTGTGCAGAACTCCACCCCGGGGGACTC TATTCAACTGAAGCCTGAAAGGATGGGGGGCTCTTTCTCCACCCCTGAACTGTGCTGTCCTCCACCCTCA GAGACAAAAGAACCCCAGCCAGCCTCCTCGCGCTGAGGTCTCCCCCTCTGATCCCTCCAGGATTTAGGAA GAGATACCAGGTCATAGAAAAGGAGATGAAAGGCAGGGAGAAGACAGGTCTGAGCCCTGGGTCCCAACAC CGAAAACACCCCTAGGGCCCTGGGCAGAGTGACCTCACTGTTAGTCCCTGCCCAGGCTTGAAGTAAGAGG TGAGCAAGATCACGTGGGGGTGCTGTCCCGGCCTGCAAGTCCCAGTCCTGTCACACACTAGTCAGTTGGG GTCGGGGGAAGGCCTTCCTGTGCCTCCTTTTACCTTGCCAGCCTCTAAACTAGGAGGCTTCTTCCTACAT AAACACGCCCACAGTGTTTAGCTAACTTTCTAGGCAGAAAGTTTCCTACTGGGGCACAAGTCTACGGGCT CTCGGTGGAGGCTGAGGTACTCACGGGTGGAGACCACTGCAGCCGCCTTTGTAGATTCAGACTCCCCGAA CCTTTAACCCTTGCTCTGGTCTACTGTCCCTCTGTCTCAAGCAGTCCTCCCTCCTTCTGCGCTGCGGCGC CTTTAAACCTTCTTGGCCCTTGCCCCGCCCCGGGTCCGCCCCGTCTGAGGCGGGACCCTCCTGAAAATCC CCGGCTGGGCAGGGCGCACCACTTGCAGCTGCAGCCCTTGCCTTGAGTCAGTGCGCCGCTCTCCAGCCCG CTTGAACGGTGAGCAGGTCGGGGGTACGGGGGTCGGGGACATGTGCGTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAGLN2_2 ↗ | 1:159,923,336 | 負股 | 159,923,326–159,923,385 |
| TAGLN2_1 ↗ | 1:159,923,734 | 負股 | 159,923,724–159,923,783 |
| TAGLN2_3 ↗ | 1:159,925,754 | 負股 | 159,925,744–159,925,803 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_94CGT9 · promoter · 159923707–159924207 · regulatory
ENSR1_94CGTJ · promoter · 159924541–159925041 · regulatory
ENSR1_53DLLX9 · CTCF_binding_site · 159924722–159924743 · regulatory
ENSR1_94CGTR · promoter · 159925497–159925997 · regulatory
· motif · 159921510–159921519 · motif
· motif · 159921800–159921817 · motif
· motif · 159922293–159922304 · motif
· motif · 159922319–159922330 · motif
· motif · 159922328–159922345 · motif
· motif · 159922529–159922542 · motif
· motif · 159922629–159922642 · motif
· motif · 159922641–159922654 · motif
· motif · 159922641–159922654 · motif
· motif · 159922917–159922930 · motif
· motif · 159922917–159922930 · motif
· motif · 159923117–159923130 · motif
· motif · 159923117–159923130 · motif
· motif · 159923128–159923141 · motif
· motif · 159923128–159923141 · motif
· motif · 159923222–159923231 · motif
· motif · 159923367–159923378 · motif
· motif · 159923751–159923764 · motif
· motif · 159923771–159923784 · motif
· motif · 159923947–159923956 · motif
· motif · 159924072–159924085 · motif
· motif · 159924072–159924085 · motif
· motif · 159924215–159924223 · motif
· motif · 159924560–159924569 · motif
· motif · 159924600–159924613 · motif
· motif · 159924637–159924645 · motif
· motif · 159924724–159924740 · motif
· motif · 159924783–159924796 · motif
· motif · 159924846–159924858 · motif
· motif · 159924848–159924855 · motif
· motif · 159924929–159924941 · motif
· motif · 159924932–159924947 · motif
· motif · 159925016–159925025 · motif
· motif · 159925016–159925025 · motif
· motif · 159925016–159925025 · motif
· motif · 159925016–159925025 · motif
· motif · 159925031–159925042 · motif
· motif · 159925031–159925042 · motif
· motif · 159925033–159925042 · motif
· motif · 159925037–159925050 · motif
· motif · 159925088–159925101 · motif
· motif · 159925099–159925111 · motif
· motif · 159925101–159925108 · motif
· motif · 159925157–159925171 · motif
· motif · 159925157–159925171 · motif
· motif · 159925246–159925258 · motif
· motif · 159925249–159925256 · motif
· motif · 159925285–159925298 · motif
· motif · 159925571–159925584 · motif
· motif · 159925571–159925586 · motif
· motif · 159925657–159925670 · motif
· motif · 159925657–159925672 · motif
· motif · 159925690–159925707 · motif
· motif · 159925930–159925939 · motif
· motif · 159927832–159927845 · motif
· motif · 159927832–159927845 · motif
· motif · 159928097–159928110 · motif
· motif · 159928450–159928463 · motif
· motif · 159928450–159928463 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：199 aa
Transgelin-2 長 199 個胺基酸，屬於 calponin 家族。其第 24–136 位胺基酸區段註記為 Calponin-homology (CH) 結構域；第 174–199 位則標註為 Calponin-like 重複區。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- ACTBP60709 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GDAP1Q8TB36 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMN2Q16637 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAGLN3Q9UI15 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTGCAGCTGCAGCCCTTGCCTTGAGTCAGTGCGCCGCT40CTCCAGCCCGCTTGAACGCTCCCCGCAGCCACCGCCACCC80ATTGGAATGGCCAACAGGGGACCTGCATATGGCCTGAGCC120GGGAGGTGCAGCAGAAGATTGAGAAACAATATGATGCAGA160TCTGGAGCAGATCCTGATCCAGTGGATCACCACCCAGTGC200CGAAAGGATGTGGGCCGGCCCCAGCCTGGACGCGAGAACT240TCCAGAACTGGCTCAAGGATGGCACGGTGCTATGTGAGCT280CATTAATGCACTGTACCCCGAGGGGCAGGCCCCAGTAAAG320AAGATCCAGGCCTCCACCATGGCCTTCAAGCAGATGGAGC360AGATCTCTCAGTTCCTGCAAGCAGCTGAGCGCTATGGCAT400TAACACCACTGACATCTTCCAAACTGTGGACCTCTGGGAA440GGAAAGAACATGGCCTGTGTGCAGCGGACGCTGATGAATC480TGGGTGGGCTGGCAGTAGCCCGAGATGATGGGCTCTTCTC520TGGGGATCCCAACTGGTTCCCTAAGAAATCCAAGGAGAAT560CCTCGGAACTTCTCGGATAACCAGCTGCAAGAGGGCAAGA600ACGTGATCGGGTTACAGATGGGCACCAACCGCGGGGCGTC640TCAGGCAGGCATGACTGGCTACGGGATGCCACGCCAGATC680CTCTGATCCCACCCCAGGCCTTGCCCCTGCCCTCCCACGA720ATGGTTAATATATATGTAGATATATATTTTAGCAGTGACA760TTCCCAGAGAGCCCCAGAGCTCTCAAGCTCCTTTCTGTCA800GGGTGGGGGGTTCAGCCTGTCCTGTCACCTCTGAGGTGCC840TGCTGGCATCCTCTCCCCCATGCTTACTAATACATTCCCT880TCCCCATAGCCATCAAAACTGGACCAACTGGCCTCTTCCT920TTCCCCTGGGACCAAAATTTAGGGGCCTCAGTCCCTCACC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。