基因總覽
TAF7（TATA-box binding protein associated factor 7）是人類的蛋白質編碼基因，產物屬於 TAF7 family，也是 TATA-box binding protein associated factor（TAF）家族成員。其蛋白質是 TFIID 基礎轉錄因子複合體的一部分；TFIID 由 TBP 與多種 TAF 組成，TAF7 是其中一個亞基。此複合體可參與 RNA polymerase II 依賴的轉錄起始。TAF7 也出現在含有 TAF10 的 TFIID alpha，以及不含 TAF10 的 TFIID beta 兩種複合體中。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000313368 ★ | 141,318,490–141,320,784 | 1 |
| ENST00000624761 | 141,318,995–141,320,781 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAF7 的主要功能脈絡是參與 TFIID 在 RNA polymerase II 依賴性轉錄起始中的作用。TFIID 透過其亞基 TBP 辨識並結合啟動子；此結合不要求啟動子一定具有 TATA box，並有助於組裝轉錄前起始複合體（PIC）。因此，TAF7 所在的 TFIID 複合體連結了啟動子辨識與轉錄起始所需複合體的形成。
在 TFIID 中，TAF7 與 TAF1、TAF2 共同形成可結合啟動子 DNA 的次複合體。這項組成關係指出，TAF7 位於與啟動子 DNA 結合相關的 TFIID 模組中；來源未進一步說明 TAF7 單獨辨識 DNA，或其對整體結合能力的具體貢獻。TFIID 的啟動子結合與促進 PIC 組裝，則是來源描述的複合體層級功能。
TAF7 可出現在兩種組成不同的 TFIID 複合體：含有 TAF10 的 TFIID alpha，以及缺少 TAF10 的 TFIID beta。這表示 TAF7 並非只見於含 TAF10 的版本；但現有資料未指出這兩種複合體在功能或條件上的差異，也不支持將其解讀為 TAF7 本身具有不同作用。
Promoter 與基因調控
>TAF7 ENST00000313368 GRCh38 chr5:141320684-141321784 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGGAAACAATACTTCAATTATATCTACTTTAACCAGATGCTCAGTCTATCAGACAATTCTGTCCAAAA GAACACTTCCTTCTCTGTTTACATTTACATCTAAATCAAGCACATAAAAAGGAATCACCCTTGTTTCCCC AGAAGTATTATAGAACACAAGTAAAACCAGAGGCACAATTCCCCTACAGGGAATTATATTTAAAAATACA GACTTTGGGCCATGCGCGCTGGCTCACACCTATAATCCTAGTACTTTGGGAGGCCAAGACAGGCAGATCA CCTCAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAC TTAGGTGGGGTAGTGGAACGTGCCTGTAATCCCAACTACTTAAGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCTTGAA CCCCAGAGGTGGAGGTTGCAGTCAGCCAATATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGTGACAGCCTGAGAC TCCATCTCCAAAACAAACAAACAAACATATATATAGAGAGAGACTTATATAGTAAGCTGCATGTCCTCCT CACTCCATTGATTTGGGTACTTTGAAATCCATTGTATAGTAGCTACACATTCTTGTATTGGCACCAGATA GGCTAGACTCTAGGGAACATCCGAGATGTTTCCAGAAGCAAAGACGCTTACTGCAAGGCGTCCCCCATCT CCCGGAATCACCCGGAAGTCTAGAAGCCATCCGGCCCCACAGCGATCCCGTAAAAGTGCTGGCTTAGCGG GGGACGAATCTGTGTCTTTCTTGGAACTTCCAAGCTCTAAATAGTTTGAAACCAACAGCTCTTCCGAAAC ACTGTCATTTCCATCCCGGAAAAACAAGTTCTCGCGAAAAGATGAGTTTCACGCTGGGCAGCGTAATTGC GCTATTGCGCCTGCGCTAGCTGGGGCTCCGCCCTTCCGCCCGGAGGGGCTGTCACTCACAGCCGCCTCCC GCCCCGCGTCGCGACGTAGCACTTCCGTTTTTGCTGGGTAGGCGACCCGGACGGAGGGCCGGCGAGGTGC GGGGTCTGGTGATGCGAGCTGCGCCTCTCGGCAAGATTTCGCGCTGCCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAF7_1 ↗ | 5:141,320,784 | 負股 | 141,320,774–141,320,833 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_5388GTQ · CTCF_binding_site · 141320317–141320338 · regulatory
ENSR5_8666ZW · promoter · 141320771–141320990 · regulatory
ENSR5_9444HJ · enhancer · 141320991–141321401 · regulatory
· motif · 141317167–141317178 · motif
· motif · 141317444–141317458 · motif
· motif · 141318456–141318467 · motif
· motif · 141320319–141320335 · motif
· motif · 141320385–141320395 · motif
· motif · 141320772–141320785 · motif
· motif · 141320774–141320785 · motif
· motif · 141320774–141320785 · motif
· motif · 141320776–141320785 · motif
· motif · 141320858–141320869 · motif
· motif · 141320858–141320869 · motif
· motif · 141320906–141320917 · motif
· motif · 141320921–141320932 · motif
· motif · 141321065–141321074 · motif
· motif · 141321065–141321076 · motif
· motif · 141321065–141321076 · motif
· motif · 141321543–141321555 · motif
· motif · 141322379–141322387 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：349 aa
TAF7 蛋白質長 349 個胺基酸，屬於 TAF7 family。序列註解指出，105–126、186–212、227–247 與 328–349 位為無序區；第 3–5 位則標註有 [KR]-[STA]-K motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAF7 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位變化、特定條件或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- PABIR3Q6P4D5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFF2Q03403 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UNGP13051-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Taf1Q80UV9-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TAF7 是 TFIID 的組成亞基，也被列為含 TFIID 的 RNA polymerase II 轉錄前起始複合體成員；另見於部分 MLL1/MLL 複合體。互作資料指出，TAF7 與 TAF1 有直接互作，並與 TAF1、TAF5、TAF11、TAF12、TAF13 互作；同一資料列未記錄其與 TAF10 或 TBP 互作。TAF7 也與 CIITA 及 TAF1 互作，並抑制兩者的乙醯轉移酶活性，對 CIITA 與 TAF1 調控的啟動子呈抑制作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFIID 是 RNA polymerase II 依賴性轉錄起始的重要基礎轉錄因子複合體。它透過亞基 TBP 辨識並結合有或沒有 TATA box 的啟動子，促進轉錄前起始複合體組裝。TFIID 由 TBP 與多種 TAF 組成；TAF7 與 TAF1、TAF2 形成可結合啟動子 DNA 的次複合體。TAF7 也存在於含 TAF10 的 TFIID alpha 及不含 TAF10 的 TFIID beta。 | 含實驗來源 | 證據與來源The TFIID basal transcription factor complex plays a major role in the initiation of RNA polymerase II (Pol II)-dependent transcription. TFIID recognizes and binds promoters with or without a TATA box via its subunit TBP, a TATA-box-binding protein, and promotes assembly of the pre-initiation complex (PIC). The TFIID complex consists of TBP and TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. TAF7 forms a promoter DNA binding subcomplex of TFIID, together with TAF1 and TAF2. Part of a TFIID complex containing TAF10 (TFIID alpha) and a TFIID complex lacking TAF10 (TFIID beta) PMID 10438527 ↗ · PMID 33795473 ↗ |
| 交互作用 | TAF7 是由 TBP 與多種 TAF 組成的 TFIID 成員，也屬於含 TFIID 的 RNA polymerase II 轉錄前起始複合體，並見於部分 MLL1/MLL 複合體。TAF7 與 TAF1 有直接互作，亦與 TAF5、TAF11、TAF12、TAF13 互作；資料未記錄其與 TAF10 或 TBP 互作。TAF7 與 CIITA、TAF1 互作並抑制其乙醯轉移酶活性，且作為 CIITA 與 TAF1 調控啟動子的抑制因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the TFIID basal transcription factor complex, composed of TATA-box-binding protein TBP, and a number of TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. Part of a TFIID-containing RNA polymerase II pre-initiation complex that is composed of TBP and at least GTF2A1, GTF2A2, GTF2E1, GTF2E2, GTF2F1, GTF2H2, GTF2H3, GTF2H4, GTF2H5, GTF2B, TCEA1, ERCC2, ERCC3, TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. Interacts with TAF1; the interaction is direct. Interacts with TAF1, TAF5, TAF11, TAF12, and TAF13, but not with TAF10 or TBP. Component of some MLL1/MLL complex, at least composed of the core components KMT2A/MLL1, ASH2L, HCFC1/HCF1, WDR5 and RBBP5, as well as the facultative components BACC1, CHD8, E2F6, HSP70, INO80C, KANSL1, LAS1L, MAX, MCRS1, MGA, MYST1/MOF, PELP1, PHF20, PRP31, RING2, RUVB1/TIP49A, RUVB2/TIP49B, SENP3, TAF1, TAF4, TAF6, TAF7, TAF9 and TEX10. Interacts with CIITA and TAF1 and inhibits their acetyltransferase activity, and behaving as a repressor of CIITA- and TAF1-regulated promoters PMID 10438527 ↗ · PMID 11592977 ↗ · PMID 15960975 ↗ · PMID 20937824 ↗ · PMID 25412659 ↗ · PMID 27007846 ↗ · PMID 33795473 ↗ · PMID 8702684 ↗ |
| 細胞定位 | TAF7 的定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTTCCGTTTTTGCTGGGTAGGCGACCCGGACGGAGGGCC40GGCGAGGTGCGGGGTCTGGTGATGCGAGCTGCGCCTCTCG80GCAAGATTTCGCGCTGCCCATCCCGGGCCCTTTCATCAGT120AATCGGTAGTGGATCACTCTGCCAAGCGGCAGGAAGAATT160AAGGAAACGACAAGGAGACGCTCGGCTCTCTCCCGCTTGG200CTCCTTGCGGCCTCCTCTTCCCTTCGCTCCGGCCCGGTGA240AACTGAACTTATAATCGTCACTGGATTGTAAGTACCCGAG280GCGAAGAGAGCTCGCTGAGCCCTGATTTTTTGAGTGTCTT320TGTTCCGGGAGAGTTTGTGAGTTGAAAGTATCTCTGCTGG360GCTTTCTGGGCCGAAAACCGTTCCGGGGGAGCCGCCATTT400GCTTTCCTGTTCCCTAGCTAGCTAGCTAGCTCTCTCCGCG440TTGTCCGGCAGCGGCACCTAGAGGTTGGGACTTGGCATTG480CATCTGATTTAATGAACTTAAGTCTGTGAATAAGCCTTTG520TGTTAACGACTGGTATTCGGTCACAGCATATTTAGAGAAA560AGACTTGGAGCTTAAATAAAAACTAAGGCAAAATAGACGC600TTAGCTGCTGATCTACAGAGAACTTCTTGTAATTAAAAGA640TTTCAATTCATAGCAAACTGGTGTTTTAAACTATTGCAGT680AGCTGGAACTTTTTAGTGTAACCAGCATTTATTGGAGAAG720TGAATCACAAGGAAATAAAGATGAGTAAAAGCAAAGATGA760TGCTCCTCACGAACTGGAGAGCCAGTTTATCTTACGTCTG800CCTCCAGAATATGCCTCTACTGTGAGAAGGGCAGTACAGT840CTGGTCATGTCAACCTCAAGGACAGACTGACAATTGAGTT880ACATCCTGATGGGCGTCATGGAATCGTCAGAGTGGACCGT920GTTCCATTGGCCTCAAAATTAGTAGACCTGCCCTGTGTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。