基因總覽
TAF1B 的正式名稱為 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B，屬於蛋白質編碼基因，其產物屬於 RRN7/TAF1B family。此蛋白是 RNA polymerase I core factor complex 的組成因子，並參與 RNA polymerase I 轉錄起始相關工作。來源指出它具有類似 GTF2B/TFIIB 的因子特性；其主要角色與轉錄起始中的複合體組裝及 RNA polymerase I 招募有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263663 ★ | 9,843,474–9,934,416 | 15 |
| ENST00000944452 | 9,843,340–9,934,994 | 16 |
| ENST00001109610 | 9,843,340–9,877,159 | 7 |
| ENST00001112398 | 9,843,340–9,920,717 | 14 |
| ENST00001126841 | 9,843,340–9,934,142 | 15 |
| ENST00001140775 | 9,843,340–9,934,994 | 15 |
| ENST00000625239 | 9,843,443–9,846,113 | 3 |
| ENST00000492648 | 9,875,998–9,913,709 | 6 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAF1B 是 RNA polymerase I（Pol I）轉錄起始過程中的因子，屬於 RNA polymerase I core factor complex，並具有類似 GTF2B/TFIIB 的作用特性。來源指出，它在轉錄起始的多個步驟中扮演重要角色，包含前起始複合體（PIC）的組裝，以及 Pol I 招募後續事件。
在啟動子層次，TAF1B 可結合 rDNA 啟動子，並作為 SL1/TIF-IB 複合體的一部分參與 Pol I 招募。來源也指出，TAF1B 可能透過與 RRN3 的交互作用直接參與 Pol I 招募；此處的直接途徑帶有可能性限定，不能視為唯一或已確定的招募方式。
這些作用將啟動子辨識、起始複合體組裝與 Pol I 招募連結起來，支持 Pol I 轉錄起始的多個環節。來源所述範圍聚焦於轉錄起始及其後的招募事件，未進一步說明其他生物學過程或功能結果。
Promoter 與基因調控
>TAF1B ENST00000263663 GRCh38 chr2:9842474-9843574 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTTGGGATGTACGATTATATCAAAAATCCTCTTCTCAATGAGATCTCTCTTGAACATCACATTTCAGAC TGAAATCACCTTGTTGTTCCCATTCTCCTCTCCTCTTTATTTTTCTCCTTGGAACTCACCACCACTTAAC ATACCACATATTTTCCTTATTTATTTTTGTCTCTCCCCATCAGAATACAATCTCCATGAAGGCAAGGACT TTTGTTTACTTTGTTCACTGCTGAATCCCCAGGACACAAACCAGTTCCTGTTTAATAAATAAAACAAGGA ATGAATGTGTTAGATGAAGAAACAATAAGAGCTAAATTTATTGAGCACTTACTGAGACTCAATTATATTC ACTCATGCATTTATTTATTCAGTTATTTACTTATGCAGAGAAGGGGTCTCGCTTTGTTGCCCCGGCTGGT CTCCAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCTCCCGACTCAGCCTCCCCAGGATTACAGGCGTGAACCAGCACGC CCGGTGGAGACTCAATTATAAGGGGCTCACAGATAACATCTAATTCTTACAGAGGAGTAAACTGAGGCAC AAGTAAGCAGGAGAGCCGTGATTAGAAACCTAGGTCTAACTCACAGCCCGTGAGCTTTCCTCCAAGCCCC GAGGCTTCCCCTTAAAAAAGCCAGCAAGGGGCGAGACTCGGAGGGCAGAACCCACGGAGGGCGGAACCCA CAGAGGACAGAGCCCGCGCTCGCGAGCACGGCCTTGTCCGACCCCCCGTGCCGCCGGAGGAGCAAGTCTG TCTTGGAATGAATGATCGTCGGAACGGAGCTTGATCAAACCACTCAGCAGTAGGCGTCGCCCACTTTCTT ATTGGTTGGTTTTGGTTCTCAAGAGTAGGAAAGTTAGGTAGTCCGCGAGGGGTCTGCGAGCTTTGCGGAG CCTCGCCCCCGAGCGCGCGGTTTCCCTGCCGCGCAGGCGCACGGAATCCTAGGCGCGGATCTCGCGTTTC CGGCCGGAAGCTTCTCCAGCCTTTCCCGGAAGCTGCGCTCGCTACCCGGGTAACGGGTCCCGGCTGTGGA AGCTCCCGCGGCGCCGCGATGGACCTCGAGGAGGCGGTAAGGAGGCGGTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAF1B_1 ↗ | 2:9,843,505 | 正股 | 9,843,456–9,843,515 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_B3XQ4 · promoter · 9842953–9843484 · regulatory
ENSR2_54BHRS · CTCF_binding_site · 9843286–9843307 · regulatory
ENSR2_89RZH · enhancer · 9843485–9843674 · regulatory
ENSR2_54BHT2 · CTCF_binding_site · 9843543–9843564 · regulatory
ENSR2_54BHTJ · CTCF_binding_site · 9843654–9843675 · regulatory
ENSR2_95WHC · promoter · 9843675–9844175 · regulatory
ENSR2_54BHWW · CTCF_binding_site · 9843950–9843971 · regulatory
ENSR2_95WJ6 · enhancer · 9846465–9846933 · regulatory
ENSR2_89S3M · enhancer · 9847173–9847400 · regulatory
· motif · 9843288–9843304 · motif
· motif · 9843413–9843424 · motif
· motif · 9843413–9843424 · motif
· motif · 9843448–9843457 · motif
· motif · 9843456–9843465 · motif
· motif · 9843476–9843487 · motif
· motif · 9843478–9843487 · motif
· motif · 9843545–9843561 · motif
· motif · 9843572–9843581 · motif
· motif · 9843656–9843672 · motif
· motif · 9843722–9843733 · motif
· motif · 9843722–9843733 · motif
· motif · 9843792–9843809 · motif
· motif · 9843831–9843848 · motif
· motif · 9843952–9843968 · motif
· motif · 9844067–9844082 · motif
· motif · 9844263–9844285 · motif
· motif · 9844263–9844285 · motif
· motif · 9844832–9844847 · motif
· motif · 9847314–9847323 · motif
· motif · 9847314–9847323 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：588 aa
TAF1B 蛋白長 588 個胺基酸，屬於 RRN7/TAF1B family。其 N 端包含 RRN7-type zinc finger（第 4–39 位），接續 B-reader（第 40–68 位）與 B-linker（第 69–73 位）；另有 N-terminal cyclin fold（第 74–261 位）及 C-terminal cyclin fold（第 262–372 位）。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAF1B 的定位記錄為細胞核與核仁。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- ACADVLP49748 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CALRP27797 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETQ01105 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAF1AQ15573 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TAF1CQ15572 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TBPP20226 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
TAF1B 是 SL1/TIF-IB 複合體的組成部分；此複合體包含 TBP、TAF1A、TAF1B 與 TAF1C，並至少還有 TAF1D。TAF1B 在複合體中直接與 TBP、TAF1A 和 TAF1C 互作，也與 RRN3 互作。SL1/TIF-IB 各次單元與 TBP 的互作會排除 TBP 與 TFIID 次單元互作。TAF1B 亦屬於 Pol I 前起始複合體，其中 Pol I core 與 RRN3、啟動子結合的 UTBF 及 SL1/TIF-IB 複合體組裝。另有與 FLNA 經 N 端互作的相似性註記。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TAF1B 是 RNA polymerase I core factor complex 的組成因子，具有類似 GTF2B/TFIIB 的作用特性，參與 Pol I 轉錄起始中的多個步驟，包括前起始複合體組裝及 Pol I 招募後續事件。它可結合 rDNA 啟動子，並透過 SL1/TIF-IB 複合體參與 Pol I 招募；也可能藉由與 RRN3 互作直接參與招募。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of RNA polymerase I core factor complex that acts as a GTF2B/TFIIB-like factor and plays a key role in multiple steps during transcription initiation such as pre-initiation complex (PIC) assembly and postpolymerase recruitment events in polymerase I (Pol I) transcription. Binds rDNA promoters and plays a role in Pol I recruitment as a component of the SL1/TIF-IB complex and, possibly, directly through its interaction with RRN3 PMID 11250903 ↗ · PMID 11283244 ↗ · PMID 15970593 ↗ · PMID 21921198 ↗ · PMID 21921199 ↗ · PMID 7491500 ↗ · PMID 7801123 ↗ · PMID 7801130 ↗ |
| 交互作用 | TAF1B 經 N 端與 FLNA 互作的記載屬於相似性推論。TAF1B 是 SL1/TIF-IB 複合體成員，並在其中直接與 TBP、TAF1A、TAF1C 互作；該複合體次單元與 TBP 的互作會排除 TBP 與 TFIID 次單元互作。TAF1B 也與 RRN3 互作，並參與由 Pol I core、RRN3、啟動子結合的 UTBF 及 SL1/TIF-IB 組成的 Pol I 前起始複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with FLNA (via N-terminus) (By similarity). Component of the transcription factor SL1/TIF-IB complex, composed of TBP and at least TAF1A, TAF1B, TAF1C and TAF1D. In the complex interacts directly with TBP, TAF1A and TAF1C. Interaction of the SL1/TIF-IB subunits with TBP excludes interaction of TBP with the transcription factor IID (TFIID) subunits. Interacts with TBP and RRN3. Part of Pol I pre-initiation complex (PIC), in which Pol I core assembles with RRN3 and promoter-bound UTBF and SL1/TIF-IB complex PMID 11250903 ↗ · PMID 11283244 ↗ · PMID 7801123 ↗ |
| 細胞定位 | TAF1B 的細胞內定位記錄為細胞核與核仁；此筆資料未提供定位變化條件或其他細節。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCCCGGAAGCTGCGCTCGCTACCCGGGTAACGGGTCC40CGGCTGTGGAAGCTCCCGCGGCGCCGCGATGGACCTCGAG80GAGGCGGAAGAGTTTAAAGAACGCTGTACTCAGTGTGCTG120CTGTCTCATGGGGTCTTACTGATGAAGGCAAATATTATTG160CACTTCTTGCCACAATGTTACAGAGAGATATCAGGAAGTT200ACAAACACTGATCTTATTCCTAATACCCAAATAAAAGCCC240TCAACCGGGGGCTTAAAAAAAAAAACAATACTGAAAAAGG280CTGGGATTGGTATGTGTGTGAAGGTTTCCAGTATATTCTT320TATCAACAAGCAGAAGCCTTAAAGAACCTTGGAGTAGGCC360CAGAGTTAAAGAACGATGTTTTACATAATTTTTGGAAGCG400CTACCTTCAGAAGAGCAAGCAGGCATATTGTAAGAACCCA440GTTTATACCACTGGAAGGAAACCTACGGTATTAGAAGATA480ATCTAAGTCATTCAGACTGGGCTAGTGAGCCTGAGCTGCT520AAGTGATGTCAGCTGTCCTCCTTTTCTTGAAAGTGGAGCG560GAGTCTCAGTCTGACATCCACACTCGAAAACCTTTCCCCG600TCAGCAAAGCATCACAATCAGAAACGTCTGTCTGCTCTGG640ATCTCTGGATGGAGTTGAATACTCACAACGAAAGGAGAAG680GGAATCGTGAAGATGACCATGCCACAGACACTTGCCTTCT720GTTATCTGTCCTTACTTTGGCAGAGAGAAGCAATAACACT760TTCAGATCTTTTGAGGTTTGTTGAAGAGGACCATATTCCT800TACATAAATGCTTTTCAGCATTTTCCAGAACAGATGAAAT840TATATGGACGTGACAGAGGAATCTTTGGTATAGAGTCTTG880GCCTGACTACGAGGACATCTACAAAAAAACAGTAGAAGTT920GGAACATTTTTAGATTTGCCTCGTTTTCCAGACATAACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。