基因總覽
TAF15（TATA-box binding protein associated factor 15）是人類的蛋白質編碼基因，位於第 17 號染色體。其蛋白質屬於 RRM TET family，具有 RNA 與單股 DNA 結合能力；來源描述其可能在不同啟動子上的轉錄起始階段扮演特定角色。蛋白質序列包含 RRM、RanBP2-type zinc finger，以及多段重複序列與無序區域，呈現多種結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000605844 ★ | 35,809,484–35,847,242 | 16 |
| ENST00000604841 | 35,809,475–35,847,356 | 16 |
| ENST00000852321 | 35,809,475–35,847,356 | 16 |
| ENST00000852322 | 35,809,475–35,847,356 | 14 |
| ENST00000852323 | 35,809,475–35,847,356 | 15 |
| ENST00000852324 | 35,809,475–35,847,356 | 15 |
| ENST00000852325 | 35,809,475–35,847,356 | 16 |
| ENST00000852326 | 35,809,475–35,847,356 | 16 |
| ENST00000919937 | 35,809,475–35,847,356 | 9 |
| ENST00000919938 | 35,809,475–35,847,356 | 16 |
| ENST00000919939 | 35,809,475–35,847,356 | 14 |
| ENST00000947553 | 35,809,475–35,847,356 | 17 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAF15 是 RNA 與單股 DNA 結合蛋白，來源指出它可能在不同啟動子上的轉錄起始過程中發揮特定作用；此描述限定於轉錄起始，並未進一步指定哪些啟動子或細胞情境。
TAF15 可結合帶有共識序列 5'-AGGUAA-3' 的單股 RNA。這項結合特性提供其辨識特定 RNA 序列的依據，但現有資料未說明該序列在細胞中的分布，也未交代結合後引發的下游變化。
在 RNA polymerase II（Pol II）轉錄起始相關過程中，TAF15 能與 Pol II 一同進入轉錄前起始複合體。這表示它可在複合體組裝階段進入相關分子機器；來源未進一步界定其進入的條件、對複合體其他成員的影響，或對轉錄量的具體效應。
Promoter 與基因調控
>TAF15 ENST00000605844 GRCh38 chr17:35808484-35809584 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAGTACTTTGCTCACTTCTTTACTCGGTCAACTTCTGCACAACACCTAGGGTTTGGCTCAGATACCATG CCTTCCCGGAAAACGTCTTTGCTGGCTCTCTGAGCTTTTCCAGCCCGTTTCCTGCTGCAGAGCCCAAGCG GCCTTGGGCCCACCCCGCTGGGCCGTGCAGCATTTTGGTTAAACTCATATGCAATATATCGTTGGGTTAC CAGGCTTCAAATTCCACCTTGGCCGTTTACTAGCTGTACGACCTAGGTCAAATGAATTCTGTCTTCTCAT CTGCAACATGGGGAAAATATTTCATCAGTCTGTTGTGAGAATTAAATGAGATGATGTAAGGTGCCTGACA ATTAAGAGTCAGCTATTATTATAGTGCTGAAAATTAAAGCTCGATCCCTCCGCCCCGCCACATTCTCAGG GTCAGATTCGTGTACGATTTCGTTTTAATGTACCCTTTTCTTCCAGCATCCTTGTTTGCTACTCGGCGAG ACAGTTACAACAAACCGGGAAGCGATCAGGTACGCGAGCTGGTCACGACTCACAGTCCCAGAGCTCGCCG ACTCCGAACGCCCCCAGGTGGCCCAAGCACTCTGCAGCAAAAGCCGCCAGCTAGGACGTACCATTCGAAA TTGTAGGGAAAGAAAGGCTTTGCATAACCAAATACTCTGTGTTTATAAGGTCCCTCCTCTTTCGTTTCCT AACCGCAAATTCCATCACACCCAATAAAGTGAGAAATAGGATTGTAAATAAGACGGAGCAAGTAGGTTCC ACTTCCTCCCCGATCGTGATCGTGGCATTGGTACTTTCTCTTCTCAATTCCCTCTCAATAATGGTACGGC TAGCGGAGGGGGGAATAGAGGGCCCTGGGAAGGCCTCAGGGCTCGGCGGCTAGTACCAGTGCAGAAACAT CCCTCCTGCCGCAGCTTTGTGGTACCACCCGCTGCCCGCTGATTGGCTGCCGGGGTCCCGCAGTCCGCCT CAGCCCGCCGCGCCGCCCTCAGTACAGCTCCGGCCGCCGCGCCGCCTGGCTTTCGTATTCGTTGTTCTCG GCGGGCTGTGGGGCCTCCGCGCCGCGGCCGTTAGTCATGTCGGGTAGGTGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAF15_1 ↗ | 17:35,809,484 | 正股 | 35,809,435–35,809,494 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B94T5 · enhancer · 35804565–35805394 · regulatory
ENSR17_5BFDD9 · CTCF_binding_site · 35804860–35804881 · regulatory
ENSR17_5BFDDN · CTCF_binding_site · 35804947–35804968 · regulatory
ENSR17_9J7PZ · enhancer · 35807437–35807701 · regulatory
ENSR17_B94TM · enhancer · 35808325–35808886 · regulatory
ENSR17_B94TP · promoter · 35808887–35809499 · regulatory
ENSR17_5BFF4N · CTCF_binding_site · 35809048–35809069 · regulatory
ENSR17_5BFF6Q · CTCF_binding_site · 35809499–35809520 · regulatory
ENSR17_C5JXF · enhancer · 35809500–35810790 · regulatory
· motif · 35804719–35804728 · motif
· motif · 35804862–35804878 · motif
· motif · 35804949–35804965 · motif
· motif · 35804996–35805011 · motif
· motif · 35804996–35805011 · motif
· motif · 35805449–35805462 · motif
· motif · 35805449–35805462 · motif
· motif · 35808466–35808475 · motif
· motif · 35808841–35808852 · motif
· motif · 35809050–35809066 · motif
· motif · 35809183–35809191 · motif
· motif · 35809183–35809198 · motif
· motif · 35809183–35809200 · motif
· motif · 35809209–35809221 · motif
· motif · 35809501–35809517 · motif
· motif · 35809511–35809531 · motif
· motif · 35809563–35809571 · motif
· motif · 35809714–35809724 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：592 aa
TAF15 蛋白質長 592 個胺基酸，屬於 RRM TET family。其第 234–320 位包含 RRM，第 354–385 位有 RanBP2-type zinc finger；第 407–575 位則標註約 21 個串聯重複。另有多段區域被註記為無序區，包括第 1–237、324–356 與 373–592 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAF15 位於細胞核與細胞質之中，並可由細胞核穿梭至細胞質；資料未進一步描述此移動的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- FUSP35637 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TAF15 是 RNA polymerase II（Pol II）轉錄多蛋白複合體的成員；此複合體也包含 TATA-binding protein（TBP）及其他 TAF(II)s。來源另指出 TAF15 會結合 SF1，但未提供結合情境或功能後果。
疾病與遺傳關聯
一種涉及 TAF15/TAF2N 的染色體異常見於某型骨外黏液樣軟骨肉瘤（EMC）：t(9;17)(q22;q11) 染色體易位，涉及 NR4A3。資料呈現的是疾病中的染色體異常關聯，未據此證明 TAF15 對疾病具有因果作用。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TAF15 可結合 RNA 與單股 DNA，可能在不同啟動子上的轉錄起始過程中發揮特定作用。它能辨識含有共識序列 5'-AGGUAA-3' 的單股 RNA，也能與 RNA polymerase II 一同進入轉錄前起始複合體；資料未說明這些作用的具體條件或下游效應。 | 含實驗來源 | 證據與來源RNA and ssDNA-binding protein that may play specific roles during transcription initiation at distinct promoters. Binds to ssRNA containing the consensus sequence 5'-AGGUAA-3'. Can enter the pre-initiation complex together with the RNA polymerase II (Pol II) PMID 19124016 ↗ · PMID 21256132 ↗ |
| 交互作用 | TAF15 是 RNA polymerase II（Pol II）轉錄多蛋白複合體的成員，該複合體包含 TATA-binding protein（TBP）與其他 TBP-associated factors（TAF(II)s）。此外，TAF15 會結合 SF1；來源未交代這項結合的條件或功能結果。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Belongs to the RNA polymerase II (Pol II) transcriptional multiprotein complex, together with the TATA-binding protein (TBP) and other TBP-associated factors (TAF(II)s). Binds SF1 |
| 細胞定位 | TAF15 位於細胞核與細胞質，並可在兩者之間移動，具體描述為由細胞核穿梭至細胞質。來源未提供此穿梭發生的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 涉及 TAF15/TAF2N 的染色體異常見於一種骨外黏液樣軟骨肉瘤（EMC），異常為與 NR4A3 相關的 t(9;17)(q22;q11) 易位。此資料說明染色體異常與疾病的關聯，沒有證明 TAF15 對疾病具有因果作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving TAF15/TAF2N is found in a form of extraskeletal myxoid chondrosarcomas (EMC). Translocation t(9;17)(q22;q11) with NR4A3 PMID 10602519 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTACAGCTCCGGCCGCCGCGCCGCCTGGCTTTCGTATTC40GTTGTTCTCGGCGGGCTGTGGGGCCTCCGCGCCGCGGCCG80TTAGTCATGTCGGATTCTGGAAGTTACGGTCAGTCTGGGG120GTGAGCAGCAAAGTTATTCTACCTATGGAAATCCAGGCAG160CCAAGGCTATGGACAAGCATCACAAAGCTATTCTGGCTAT200GGGCAAACGACTGATTCCTCTTATGGACAGAACTACAGCG240GTTACTCCAGTTATGGACAAAGTCAGTCAGGTTATTCACA280GTCCTATGGTGGTTATGAGAATCAAAAGCAGAGCTCATAT320AGCCAGCAACCATATAATAACCAGGGACAGCAGCAAAACA360TGGAATCATCAGGAAGCCAAGGTGGAAGAGCACCTTCCTA400TGACCAGCCAGACTATGGTCAACAAGATTCATATGACCAG440CAGTCAGGCTATGATCAACATCAAGGCTCATATGATGAGC480AGTCAAATTATGATCAGCAGCATGATTCCTATAGTCAAAA520CCAGCAGTCCTATCATTCACAAAGGGAAAACTACAGCCAC560CACACACAAGATGACCGTCGTGATGTGAGTAGGTATGGAG600AAGATAATAGAGGATATGGCGGGTCACAGGGAGGAGGTAG640AGGGCGTGGGGGATATGACAAGGATGGAAGAGGTCCTATG680ACAGGATCAAGTGGTGGTGACCGCGGTGGCTTCAAAAATT720TTGGTGGTCACAGGGATTATGGACCCAGAACAGATGCTGA760TTCAGAATCTGATAATTCAGATAACAACACAATCTTTGTG800CAAGGACTTGGGGAGGGTGTGTCTACAGATCAAGTTGGGG840AGTTCTTTAAACAAATAGGAATTATCAAGACAAATAAGAA880GACCGGAAAACCAATGATAAATCTTTATACAGACAAGGAC920ACAGGAAAGCCAAAGGGGGAGGCAACAGTGTCATTTGATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。