基因總覽
TAF11（TATA-box binding protein associated factor 11）是由蛋白質編碼基因 TAF11 產生的蛋白質，屬於 TAF11 family。它是 TBP-associated factors（TAFs）之一，為 TFIID 基礎轉錄因子複合體的組成成員。現有資料將其描述為參與轉錄起始相關複合體的一部分；蛋白質序列註解另指出，其第 1 至 81 個胺基酸區段為無序區。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361288 ★ | 34,877,462–34,888,042 | 5 |
| ENST00001115262 | 34,829,083–34,888,071 | 5 |
| ENST00001115263 | 34,867,117–34,888,071 | 5 |
| ENST00000650109 | 34,877,462–34,888,071 | 6 |
| ENST00001140393 | 34,877,462–34,888,071 | 5 |
| ENST00000912391 | 34,877,553–34,888,071 | 5 |
| ENST00000420584 | 34,877,778–34,888,071 | 4 |
| ENST00001084315 | 34,877,778–34,888,071 | 3 |
| ENST00000950462 | 34,877,779–34,888,071 | 5 |
| ENST00000950463 | 34,877,780–34,888,071 | 4 |
| ENST00000912392 | 34,877,785–34,888,071 | 4 |
| ENST00000686190 | 34,878,129–34,887,957 | 3 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFIID 基礎轉錄因子複合體在 RNA polymerase II（Pol II）依賴性轉錄的起始中扮演重要角色。此複合體由 TATA-box-binding protein（TBP）及多種 TBP-associated factors（TAFs）組成，TAF11 是其中一員。TFIID 可辨識並結合帶有或不帶有 TATA box 的啟動子；這項啟動子辨識與結合是轉錄起始過程中的關鍵環節。
TFIID 對啟動子的結合是透過其亞基 TBP 進行。結合啟動子後，TFIID 會促進 pre-initiation complex（PIC）的組裝，將轉錄起始所需的複合體組成與啟動子辨識連結起來。資料指出，TAF11 與 TAF13、TBP 一同參與 TFIID 及 TFIIA 轉錄因子複合體結合啟動子的過程，顯示 TAF11 的功能與這些複合體在啟動子上的作用相關。
因此，來源所支持的 TAF11 主要角色，是作為 TFIID 的組成成員，參與轉錄起始期間的啟動子結合相關步驟。資料未進一步說明 TAF11 在這些步驟中的具體分子機制或對個別基因轉錄的影響。
Promoter 與基因調控
>TAF11 ENST00000361288 GRCh38 chr6:34887942-34889042 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCAAAGGTTTTGGGAGCTCCTGGGACAGGAAATACGGTAATTCGTCCAGGCAGCGTAGAAACAAAGAGA TAAATGTAACGCGCACCTACATTTCCAAGTCCATTCTTTCAGCACGCATAAATTAAATATGTAATAGGTG CGGGGACCTAGTCATACCCAGGTGAATAAAACGCCCTCCCCCTCGTATCTCAATGAGGGAAGAGAAGAAA ATTTTAAAACAGAAATATCCTCACCACTTCATCCTCCCAGTACGTGAACTAGTTCATTAAAGTGAAACGT TCAAAGGAGACACCTTCCTCTCTTTAGGCTTTCCTCTTAGTTTTAATGAGATTAACCAAACTGATAGAAA AGTGTCAGACTTGTAAAAACAAACCTCAATCTTCAGTACTGGCGAACTGAAAAAAATCATTTAATTGGGT AGAAACTATGTGTGTTTTGTTCCCTGGTACTAGCACTGTTTCTAAATCGAAGTAGGCAGTCAATAGTTGT GGATGAATAAATGAATTGGATAAATTCTGCTCGAGCTATATGACTTTTTGTTGTTAAGGTGCTTGCGGAA TGGAGGGGAAATGCTAGCAATTCTATGTACACACAGGCCCGCGGTTTCGGGCCAGTTGAAATATACAAGG TTGAGTCCTTGCCTGAAAGTTTACCAGTCCCGGGGAGCCTCATTCCACGACACCGCCATACAACGGAACT GAGTTTTCTCCCAGTCCCCCAACTTTACTCTGAGGGGTTAACGAAGGGATTAACTGACATTGCATTTTTA GACAGGCGAAAAGGAAAAAGTTATTTAGTAAACAAAACTGCGCTCCTTCACAAGTGCTGGTTTCCTAGCG AGGAGGATCCATAGTCTGAGCTCTTTACGTCCAATTTTCCCGCTTCCCACTGTCGCCAAACCAAAGTTAA AATGAGTCCTCTAGTCCTCTACGCGCGCCTCAAAATGACCCCTCAGGAGAGCGGTAGGGGTGATGTCATC GCTGCGCGACGACAGGAAGTAAGATCCTGGCCTGTGCAGCTCGGGTTTCCGAGCTTCTGCCTCAGGCATC TCCGCGATCTCCTCTCCCCTCCAATCCTATCCGTGATGGACGATGCCCACG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAF11_1 ↗ | 6:34,888,041 | 負股 | 34,888,031–34,888,090 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B8WXH · promoter · 34887947–34888561 · regulatory
ENSR6_9HSW7 · promoter · 34888765–34889275 · regulatory
ENSR6_5B7KD5 · CTCF_binding_site · 34889198–34889219 · regulatory
ENSR6_5B7KDX · CTCF_binding_site · 34889377–34889398 · regulatory
· motif · 34883446–34883460 · motif
· motif · 34887051–34887073 · motif
· motif · 34887051–34887073 · motif
· motif · 34888042–34888051 · motif
· motif · 34888062–34888075 · motif
· motif · 34888062–34888075 · motif
· motif · 34888323–34888333 · motif
· motif · 34888472–34888483 · motif
· motif · 34889200–34889216 · motif
· motif · 34889226–34889242 · motif
· motif · 34889247–34889258 · motif
· motif · 34889247–34889258 · motif
· motif · 34889249–34889258 · motif
· motif · 34889379–34889395 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：211 aa
TAF11 蛋白質長 211 個胺基酸，屬於 TAF11 family。序列註解指出，第 1 至 81 個胺基酸構成一段無序區；來源未提供其他功能區或結構域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAF11 的定位記錄為細胞核。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TAF13Q15543 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TAF11 是 TFIID 基礎轉錄因子複合體的組成成員；該複合體包含 TBP 與多種 TAFs。TAF11 與 TAF13 在體外及細胞內均有互作記錄，也被記載為可直接與 TBP 互作。這些資料描述的是複合體組成及互作關係，未提供其結合效應或其他功能結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFIID 基礎轉錄因子複合體在 RNA polymerase II（Pol II）依賴性轉錄起始中扮演重要角色。它透過亞基 TBP 辨識並結合有或沒有 TATA box 的啟動子，並促進 pre-initiation complex（PIC）組裝。TAF11 與 TAF13、TBP 一同參與 TFIID 及 TFIIA 複合體的啟動子結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源The TFIID basal transcription factor complex plays a major role in the initiation of RNA polymerase II (Pol II)-dependent transcription. TFIID recognizes and binds promoters with or without a TATA box via its subunit TBP, a TATA-box-binding protein, and promotes assembly of the pre-initiation complex (PIC). The TFIID complex consists of TBP and TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. TAF11, together with TAF13 and TBP, play key roles during promoter binding by the TFIID and TFIIA transcription factor complexes PMID 33795473 ↗ |
| 交互作用 | TAF11 是 TFIID 基礎轉錄因子複合體的組成成員；該複合體由 TBP 與多種 TAFs 組成。TAF11 與 TAF13 在體外及細胞內均有互作記錄，並且可直接與 TBP 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the TFIID basal transcription factor complex, composed of TATA-box-binding protein TBP, and a number of TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. Interacts with TAF13 both in vitro and intracellularly; also interacts directly with TBP PMID 33795473 ↗ · PMID 9695952 ↗ |
| 細胞定位 | TAF11 的細胞內定位記錄為細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AAGATCCTGGCCTGTGCAGCTCGGGTTTCCGAGCTTCTGC40CTCAGGCATCTCCGCGATCTCCTCTCCCCTCCAATCCTAT80CCGTGATGGACGATGCCCACGAGTCGCCCTCCGACAAAGG120TGGAGAGACAGGGGAGTCGGATGAGACGGCCGCTGTGCCC160GGGGACCCGGGGGCTACCGACACCGATGGAATCCCAGAGG200AAACTGACGGAGACGCAGATGTGGACTTGAAAGAAGCTGC240AGCGGAGGAAGGCGAGCTCGAGAGTCAGGATGTCTCAGAT280TTAACAACAGTTGAAAGGGAAGACTCATCATTACTTAATC320CTGCAGCCAAAAAACTGAAAATAGATACCAAAGAAAAGAA360AGAGAAAAAGCAGAAAGTAGATGAAGATGAGATTCAGAAG400ATGCAAATCCTGGTTTCTTCTTTTTCTGAGGAGCAGCTGA440ACCGTTATGAAATGTATCGCCGCTCAGCTTTCCCTAAGGC480AGCCATCAAAAGGCTGATCCAGTCCATCACTGGCACCTCT520GTGTCTCAGAATGTTGTTATTGCTATGTCTGGTATTTCCA560AGGTTTTCGTCGGGGAGGTGGTAGAAGAAGCACTGGATGT600GTGTGAGAAGTGGGGAGAAATGCCACCACTACAACCCAAA640CATATGAGGGAAGCCGTTAGAAGGTTAAAGTCAAAAGGAC680AGATCCCTAACTCGAAGCACAAAAAAATCATCTTCTTCTA720GACCAAAGTCTAGAAAGGCCTATGTTACTGACGGAAGAAG760TATTGGTTCCAGACTTCCTATAAGACTGTCTGCATTGGTG800CTTTAGTATCTCAGGCCTCCAAGGATTCCATGATGATTTT840AATGTCTTTCTCAAAACTCTGATATTTGTCACACCTAGAA880AGTATGTAGCCTGATTGATACTTGCCTTGACTAAATTTTG920GGACCTCTTGGGGCATTTTGAAGTATTTAACTGTCTTGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。