基因總覽
TAF10 的正式名稱為 TATA-box binding protein associated factor 10，是一種蛋白質編碼基因，產物屬於 TAF10 family。此蛋白質是多種轉錄相關複合體的組成成員，包括 TFIID，以及數種含有組蛋白乙醯轉移酶活性的複合體。其蛋白質長度為 218 個胺基酸；序列註解指出，N 端第 1 至 85 個胺基酸屬於無序區域。這些資訊描繪其基本分子性質與複合體成員身分，具體轉錄作用則見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000299424 ★ | 6,606,294–6,612,216 | 5 |
| ENST00001047493 | 6,606,294–6,612,231 | 5 |
| ENST00001144187 | 6,606,294–6,612,231 | 5 |
| ENST00000527248 | 6,610,845–6,612,189 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TAF10 的功能與轉錄調控複合體的組成密切相關。它是 TFIID 基礎轉錄因子複合體的成員；TFIID 在 RNA polymerase II（Pol II）依賴的轉錄起始中扮演重要角色。TFIID 可透過其中的 TBP 辨識並結合啟動子，這種結合不要求啟動子一定具有 TATA box，之後並促進轉錄前起始複合體（PIC）的組裝。TAF10 是 TFIID 中多個 TBP-associated factors（TAFs）之一。
除了 TFIID，TAF10 也出現在 PCAF 組蛋白乙醯轉移酶複合體、TATA-binding protein-free TAF complex（TFTC）及 STAGA transcription coactivator-HAT complex。這些複合體的組成並不相同，但均包含 TAF10；因此，TAF10 與不同的轉錄相關複合體相連，而不是只屬於單一複合體。現有資料指出其複合體成員身分，未進一步界定 TAF10 在各複合體中的個別作用方式。
資料另以相似性推論指出，TAF10 可能調節 cyclin E 表現。此項描述屬於 By similarity 的推論，不能視為已確立的調控結果；來源也未提供調控方向、條件或作用機制。整體來說，直接支持的功能重點是 TAF10 作為多種轉錄相關複合體的組成部分，而其與 cyclin E 表現的關聯仍應保留推論性質。
Promoter 與基因調控
>TAF10 ENST00000299424 GRCh38 chr11:6612116-6613216 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGAGGCTACTTTATTTTGGTATGGCTGAAAAATCCTAGATTTTCTAAACAAAACCTGTTTGAATCTTGGT TCTGATATGGACTAGGAGAGAGACTGGGTCAAGTAAGCTTATCTCCCTGAGGCTGTTTCCTCGTCTGTTA AGTGTGAATATCAATACCTGCCTTTCATAATCACCAGGGAATAAAGTGGAATAATGTTGATAACAGTGCT TGGCACCTGGAAGTAGGTGGCAGATGTTAACGCCCTTCCTCCCTTGCACTGCGCCCCCTGTGCCTACCTC TAGCATTGTAACGACCACGTAGTATTGAAATGGCCAGTTTACTTGTCTGCCTTCCTTTCCAAGACCGTTG GTGCCTAGAGGACTAGAATCGTGTCCTATTTAACTTTGTGTTCCCAGGTCCTAGCTCAGGAGTTGGCAAA TAAGAATTAAATGTCTGCTACACCGAAAACCTCACGCCTCTCATTCGTTGTGATTTTTGCATATGTTGTT GACTCAGGCTGAAACTCCTCCTCCTCCTACAGCAGCACTGTGTGCCGCCCCACTGCTGCCCCCACCTCTC GGGGCAGCTGGCGGAGAAGAGAGGGGGCTTTCCAAATCCACTATGAATCCTTAAAAGGCTGAATAAGGGA ACTTGAAACGATGCAGACAGGCAGGCAACCCGTAGTCGAGGGACATAGGGCCATAAACGTCGAAGCCAGG TCTTGAGCGTCAGACAGAATGAGGTGTCCCAGAGCGGCGGAGGAGAGCCAGACGCACGCTGGTTCCGGTC TGGACGGAATCGCCGCGGAGCACGGCAGAGGCTAGGGCGGAATGGCTACGGCAGCGCAGTTCGCCAAGGC TCGGTCTCCGCCCTGCAGCCTATTTCCTCTAACCCGCAGATCCACTATGGGAGGAGGCGGGGAGCGGGCT GGAGAGCACTAACAGAGACAGGCGGGGCGAGTCGTGGGCGCGTGACGTCACCCCGGGGTGTGCGCGGCGC GAGCGGAAGCGGAAGCGGCTCTGTTCGCCGCCTCTCCCACCGGCCCGATGAGCTGCAGCGGCTCCGGCGC GGACCCCGAGGCGGCGCCGGCCTCCGCCGCCTCGGCCCCGGGCCCCGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAF10_1 ↗ | 11:6,612,214 | 負股 | 6,612,204–6,612,263 |
| TAF10_2 ↗ | 11:6,612,574 | 負股 | 6,612,564–6,612,623 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_CMNX · enhancer · 6606122–6607921 · regulatory
ENSR11_53JZP7 · CTCF_binding_site · 6611794–6611815 · regulatory
ENSR11_7DHG3 · promoter · 6612179–6612298 · regulatory
ENSR11_CMPC · enhancer · 6612299–6613368 · regulatory
ENSR11_53JZWN · CTCF_binding_site · 6612981–6613002 · regulatory
· motif · 6608541–6608552 · motif
· motif · 6608968–6608976 · motif
· motif · 6611647–6611658 · motif
· motif · 6611796–6611812 · motif
· motif · 6612220–6612231 · motif
· motif · 6612253–6612268 · motif
· motif · 6612253–6612268 · motif
· motif · 6612254–6612267 · motif
· motif · 6612254–6612267 · motif
· motif · 6612448–6612457 · motif
· motif · 6612533–6612548 · motif
· motif · 6612583–6612596 · motif
· motif · 6612762–6612777 · motif
· motif · 6612983–6612999 · motif
· motif · 6613035–6613048 · motif
· motif · 6613066–6613078 · motif
· motif · 6615923–6615930 · motif
· motif · 6616134–6616147 · motif
· motif · 6616163–6616170 · motif
· motif · 6616163–6616176 · motif
· motif · 6616170–6616183 · motif
· motif · 6616177–6616184 · motif
· motif · 6616203–6616216 · motif
· motif · 6616299–6616314 · motif
· motif · 6616300–6616313 · motif
· motif · 6616305–6616317 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：218 aa
TAF10 蛋白質長 218 個胺基酸，屬於 TAF10 family。序列註解將第 1 至 85 位胺基酸標示為無序區域；第 187 至 189 位則有一段 [KR]-[STA]-K motif。來源未提供這些區域的具體分子作用說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TAF10 的細胞定位資料標示為細胞核；來源未提供定位改變的條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ATXN7O15265 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SETD7Q8WTS6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TAF8Q7Z7C8-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TAF10 是 TFIID、TFTC、PCAF 與 STAGA 等複合體的組成成員。另有資料指出，TAF10 與 TAF3、LOXL2 互作，並與 TAF12 的 TAFII20 異構型直接互作；這些互作關係與複合體成員身分應加以區分。來源未說明 TAF3 或 LOXL2 互作是否代表其同屬上述複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFIID 在 RNA polymerase II（Pol II）依賴的轉錄起始中扮演重要角色，透過 TBP 辨識並結合有或沒有 TATA box 的啟動子，促進轉錄前起始複合體（PIC）組裝。TAF10 是 TFIID 的 TAF 成員，也存在於 PCAF、TFTC 與 STAGA 複合體。另有相似性推論指出，TAF10 可能調節 cyclin E 表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源The TFIID basal transcription factor complex plays a major role in the initiation of RNA polymerase II (Pol II)-dependent transcription. TFIID recognizes and binds promoters with or without a TATA box via its subunit TBP, a TATA-box-binding protein, and promotes assembly of the pre-initiation complex (PIC). The TFIID complex consists of TBP and TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. TAF10 is also component of the PCAF histone acetylase complex, the TATA-binding protein-free TAF complex (TFTC) and the STAGA transcription coactivator-HAT complex. May regulate cyclin E expression (By similarity) PMID 10373431 ↗ · PMID 11564863 ↗ · PMID 12601814 ↗ · PMID 18206972 ↗ · PMID 33795473 ↗ · PMID 9885574 ↗ |
| 交互作用 | TAF10 是由 TBP 與多種 TAF 組成的 TFIID 成員，也屬於 TFTC、PCAF 與 STAGA 複合體；來源列出各複合體至少包含的部分組成。STAGA core complex 另與由 ATXN7L3、ENY2、USP22 組成、參與組蛋白去泛素化的亞複合體相關。TAF10 另與 TAF3、LOXL2 互作，並與 TAF12 的 TAFII20 異構型直接互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the TFIID basal transcription factor complex, composed of TATA-box-binding protein TBP, and a number of TBP-associated factors (TAFs), including TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 and TAF13. Component of the TATA-binding protein-free TAF complex (TFTC), the PCAF histone acetylase complex and the STAGA transcription coactivator-HAT complex. The PCAF complex consists at least of TADA2L/ADA2, TADA3L/ADA3, SUPT3H, TAF5L TAF6L, TAF9, TAF10, TAF12 and TRRAP. The TFTC-HAT complex consists at least of TAF5L, TAF6L, TADA3L, SUPT3H, TAF2, TAF4, TAF5, GCN5L2/GCN5, TAF10 and TRRAP. The STAGA transcription coactivator-HAT complex consists at least of SUPT3H, GCN5L2, TAF5L, TAF6L, SUPT7L, TADA3L, TAD1L, TAF10, TAF12, TRRAP and TAF9. The STAGA core complex is associated with a subcomplex required for histone deubiquitination composed of ATXN7L3, ENY2 and USP22. Interacts with TAF3. Interacts with LOXL2. Interacts with TAF12 isoform TAFII20; the interaction is direct PMID 10373431 ↗ · PMID 11438666 ↗ · PMID 11564863 ↗ · PMID 12601814 ↗ · PMID 18206972 ↗ · PMID 25959397 ↗ · PMID 33795473 ↗ · PMID 7729427 ↗ · PMID 9885574 ↗ |
| 細胞定位 | TAF10 的細胞定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTGTTCGCCGCCTCTCCCACCGGCCCGATGAGCTGCAGCG40GCTCCGGCGCGGACCCCGAGGCGGCGCCGGCCTCCGCCGC80CTCGGCCCCGGGCCCCGCGCCCCCGGTCTCGGCTCCCGCC120GCGCTGCCCTCCAGCACCGCCGCGGAGAACAAGGCCAGCC160CCGCGGGGACAGCGGGGGGACCTGGGGCTGGAGCAGCTGC200TGGGGGCACGGGACCCTTGGCGGCGCGGGCCGGGGAGCCA240GCTGAGCGGCGTGGGGCGGCTCCGGTGTCGGCGGGTGGCG280CGGCGCCCCCGGAGGGGGCCATATCTAACGGGGTTTACGT320ACTGCCGAGCGCGGCCAACGGAGACGTGAAGCCCGTGGTG360TCCAGCACGCCTTTGGTGGACTTCTTGATGCAGCTGGAAG400ATTACACGCCTACGATCCCAGATGCAGTGACTGGTTACTA440CCTGAACCGTGCTGGCTTTGAGGCCTCAGACCCACGCATA480ATTCGGCTCATCTCCTTAGCTGCCCAGAAATTCATCTCAG520ATATTGCCAATGATGCCCTACAGCACTGCAAAATGAAGGG560CACGGCCTCCGGCAGCTCCCGGAGCAAGAGCAAGGACCGC600AAGTACACTCTAACCATGGAGGACTTGACCCCTGCCCTCA640GCGAGTATGGCATCAATGTGAAGAAGCCGCACTACTTCAC680CTGAGCCACCCAACCTAAATGTACTTATCTGTCCCCATGT720CCCCACACCAGCCTGTTTTCATAATAAACTTTATTGTGAC760AGGCGGGGCTGATCCCTCCCATGTTGGGAGACACCATGTG800GCAAGTGACAAAGCTCTGAGCCCGCCCCTCTTGGGGCCAC840AGTGGTAGGGATGGGGGAAGGGGATGGACCCCATGGCTGG880GGTAGTACCATGACTGGAGGCGGGGGAGGCAACCAGAGGC920CTGCTGCTTTGGGGAGGTGCATTCCCCCAACCATGTCCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。