基因總覽
TADA2A（transcriptional adaptor 2A）是人類的蛋白質編碼基因，產物為 443 個胺基酸的蛋白質。其蛋白質具有 ZZ-type 鋅指、SANT 與 SWIRM 結構域，並包含一段註記為無序的區域。TADA2A 是 ATAC 複合體的組成成員，也與 P/CAF 複合體相關；這些複合體將它置於染色質調節與轉錄相關蛋白質的組成網絡中。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000615182 ★ | 37,406,886–37,479,725 | 16 |
| ENST00000620367 | 37,406,884–37,465,653 | 11 |
| ENST00000853616 | 37,406,884–37,479,807 | 14 |
| ENST00000853617 | 37,406,884–37,479,807 | 17 |
| ENST00000853618 | 37,406,884–37,479,807 | 16 |
| ENST00000936106 | 37,406,884–37,479,807 | 15 |
| ENST00000963847 | 37,406,884–37,479,807 | 15 |
| ENST00001134543 | 37,406,884–37,479,807 | 16 |
| ENST00000614112 | 37,406,886–37,442,617 | 6 |
| ENST00000612272 | 37,407,215–37,479,807 | 16 |
| ENST00000621780 | 37,407,248–37,440,579 | 5 |
| ENST00000615328 | 37,407,314–37,465,541 | 9 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TADA2A 是 ATAC 複合體的組成成員；此複合體具有對組蛋白 H3 與 H4 的組蛋白乙醯轉移酶活性。TADA2A 也與部分酸性活化結構域的功能有關，這些結構域可從遠端位置活化轉錄；此項功能依序列相似性推定（By similarity），不應視為已確立的實驗結論。
在染色質層次，TADA2A 可結合雙股 DNA，也可結合雙核小體，且可能位於相鄰核小體之間的連接區域。這些結合特性與其參與染色質重塑的角色相符；來源指出它在此過程中具有作用，但未進一步界定其具體重塑步驟或方向。
TADA2A 可能促進 TP53/p53 的 Lys-321 乙醯化，並使 TP53 穩定性與轉錄活性降低。它也可能促進 XRCC6 乙醯化，進而協助細胞在 DNA 損傷後發生凋亡。這些作用均以可能性表述，來源未提供足以將其概括為所有情境下必然結果的資訊。
Promoter 與基因調控
>TADA2A ENST00000615182 GRCh38 chr17:37405886-37406986 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTATTATGCATATACCAAAAAAGAATGAAAGGGTTCACACAGGCATAAAGTGTAAGTGAATTCTAAAAA AAGGTTGGGCAAATTTATCAAAGGCAGACTTCTAAATAGATGTAACAGTTATATAGTTCAGATAAACCAT GGTTTGAATTCCCTTCCCCAGTACTTCCTAGCAGTGTGATCCCAAGTTATTTATGTCAGTGCCTAGATTT CTTCACCTGGAAAATAGGGATAACAACAGGTGCCTACCTCACAAGTTTTAAATGAGACCGTATGTGTAAC CTGCTTTGTGCAATGTCTGGCATGCAATAAGTACTCGACAAATGGTAGCTATTAGAATCATCATTAACAG CAGTAATAAGAGATCTTGGGACATACCTAGCCCTCAAGATTGACATCAGAGTAGACCACCACATCCTCTC ATCATTGCGCCTCAATTTGGGCCTCTGAAGCCCAAAGAGGGGATGGTTCTTTCCAAAGAAGACAATTTCG ACGTTCCAGGAGCATCTGATTGAAACGCACCCTCTTCACCCCTTAAAATCAGTCTGGTTCATCCACGAGC AGCCCTTCGGGGCCCGGACTGGAGAGGCGCCACGGCTCGCCGTCCCTGGGCCCAGTTCCCTCAGCCTCAA TTTCCCTTGCTGCAACAGGGGTGGAGATGGGAACGTTATCCCCAAACCCAGGCAGTCCCGGCTCGGCCCG CCTCACCGCACTCCGGAGGGGACCAAACAGCCCCACGCGCCAGGAAGCCTCAGGCAACGGGCCACGCGCC ACACGGGCAAAGTGATTACTGGTCGGATCAAAAGTCAGGCAAGCGGCTCAGCCCCATCCTCCCAGTCCTC GGGCACGGGGACAGCAGCAGGCGCGCGGCGGGGACCGGGAAAAGGCCAAGAGGGCGGTGGCGGGCGCTCA GCACCCGGCGGGGGCCTCCACGGCCGAGGGGCGGAGGCGGCGGGCGCGCGGCACGCGGCGCGCTCGCCAC TGCGCCGCCCGGGGGCGCGCACGCAAAGCCCGGAGGCGCGCGCGACCGGCGGCTCTTTGGCGCGGATTAG GGGGTCTCGGCGAGGTGAGGCGCCAGGCAGCGCTGGGCGGGCGGGCGGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B9FFR · enhancer · 37405963–37406825 · regulatory
ENSR17_9JSTR · promoter · 37406826–37407234 · regulatory
ENSR17_5BRK3Z · CTCF_binding_site · 37406866–37406887 · regulatory
ENSR17_B9FFZ · enhancer · 37407235–37407995 · regulatory
· motif · 37403137–37403159 · motif
· motif · 37403137–37403159 · motif
· motif · 37406588–37406603 · motif
· motif · 37406767–37406782 · motif
· motif · 37406823–37406836 · motif
· motif · 37406868–37406884 · motif
· motif · 37407043–37407056 · motif
· motif · 37407168–37407175 · motif
· motif · 37407217–37407227 · motif
· motif · 37407547–37407558 · motif
· motif · 37407720–37407736 · motif
· motif · 37407720–37407736 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：443 aa
TADA2A 蛋白質長 443 個胺基酸，具有位於第 12–69 位的 ZZ-type 鋅指、第 70–122 位的 SANT 結構域，以及第 356–443 位的 SWIRM 結構域。第 348–372 位另註記為無序區域；第 426–435 位有 DNA 結合註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TADA2A 的定位註記為細胞核與染色體。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 42 個夥伴
- AATFQ9NY61 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCDC116Q8IYX3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CCDC134Q9H6E4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCHCR1Q8TD31-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDCA7LQ96GN5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EIF4E2O60573 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FANCGA0A0S2Z3R2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FANCGA0A0S2Z4A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FARS2O95363 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBF1Q8TES7-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPSM3Q9Y4H4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- KAT2AQ92830 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KLC4Q9NSK0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLHL38Q2WGJ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPNA2P52292 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGOHP61326 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGOHBQ96A72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFAP1P55081 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MKRN3Q13064 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTX2O75431 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFE2L2Q16236 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PPP1R16BQ96T49 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TADA2A 與 GCN5、NR3C1 及 CCDC134 有互作註記，並與 P/CAF 蛋白相關。它是 P/CAF 複合體及含 ADA2A 的 ATAC 複合體成員；這些複合體包含多種列載的蛋白質組成分子，複合體成員關係不等同於各成員皆與 TADA2A 直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TADA2A 是具有組蛋白 H3、H4 乙醯轉移酶活性的 ATAC 複合體成員，並依序列相似性推定參與部分酸性活化結構域的功能，協助遠端位置的轉錄活化。它可結合雙股 DNA 與雙核小體，可能接觸相鄰核小體間的連接區，並參與染色質重塑。TADA2A 可能促進 TP53/p53 Lys-321 乙醯化，降低 TP53 穩定性及轉錄活性；也可能促進 XRCC6 乙醯化，協助 DNA 損傷後的細胞凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ATAC complex, a complex with histone acetyltransferase activity on histones H3 and H4. Required for the function of some acidic activation domains, which activate transcription from a distant site (By similarity). Binds double-stranded DNA. Binds dinucleosomes, probably at the linker region between neighboring nucleosomes. Plays a role in chromatin remodeling. May promote TP53/p53 'Lys-321' acetylation, leading to reduced TP53 stability and transcriptional activity. May also promote XRCC6 acetylation thus facilitating cell apoptosis in response to DNA damage PMID 19103755 ↗ · PMID 22644376 ↗ |
| 交互作用 | TADA2A 與 GCN5、NR3C1 及 CCDC134 有互作註記，並與 P/CAF 蛋白相關。它是 P/CAF 複合體成員，該複合體至少包含 TADA2L/ADA2、TADA3L/ADA3、TAF5L/PAF65-beta、TAF6L/PAF65-alpha、TAF10/TAFII30、TAF12/TAFII20、TAF9/TAFII31 與 TRRAP。TADA2A 也是含 ADA2A 的 ATAC 複合體成員，該複合體由 KAT14、KAT2A、TADA2L、TADA3L、ZZ3、MBIP、WDR5、YEATS2、CCDC101 與 DR1 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with GCN5 and NR3C1. Associated with the P/CAF protein in the PCAF complex. Component of the PCAF complex, at least composed of TADA2L/ADA2, TADA3L/ADA3, TAF5L/PAF65-beta, TAF6L/PAF65-alpha, TAF10/TAFII30, TAF12/TAFII20, TAF9/TAFII31 and TRRAP. Component of the ADA2A-containing complex (ATAC), composed of KAT14, KAT2A, TADA2L, TADA3L, ZZ3, MBIP, WDR5, YEATS2, CCDC101 and DR1. Interacts with CCDC134 PMID 19103755 ↗ · PMID 22644376 ↗ · PMID 9154805 ↗ · PMID 9885574 ↗ |
| 細胞定位 | TADA2A 的細胞定位註記包括細胞核與染色體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACGCAAAGCCCGGAGGCGCGCGCGACCGGCGGCTCTTTGG40CGCGGATTAGGGGGTCTCGGCGAGGGAGTCATCAAGCTTT80GGTGTATGTGTTGGCCGGTTCTGAAGTCTTGAAGAAGCTC120TGCTGAGGAAGACCAAAGCAGCACTCGTTGCCAATTAGGG160AATGGACCGTTTGGGTTCCTTTAGCAATGATCCCTCTGAT200AAGCCACCTTGCCGAGGCTGCTCCTCCTACCTCATGGAGC240CTTATATCAAGTGTGCTGAATGTGGGCCACCTCCTTTTTT280CCTCTGCTTGCAGTGTTTCACTCGAGGCTTTGAGTACAAG320AAACATCAAAGCGATCATACTTATGAAATAATGACTTCAG360ATTTTCCTGTCCTTGATCCCAGCTGGACTGCTCAAGAAGA400AATGGCCCTTTTAGAAGCTGTGATGGACTGTGGCTTTGGA440AATTGGCAGGATGTAGCCAATCAAATGTGCACCAAGACCA480AGGAGGAGTGTGAGAAGCACTATATGAAGCATTTCATCAA520TAACCCTCTGTTTGCATCTACCCTGCTGAACCTGAAACAA560GCAGAGGAAGCAAAAACTGCTGACACAGCCATTCCATTTC600ACTCTACAGATGACCCTCCCCGACCTACCTTTGACTCCTT640GCTTTCTCGGGACATGGCCGGGTACATGCCAGCTCGAGCA680GATTTCATTGAGGAATTTGACAATTATGCAGAATGGGACT720TGAGAGACATTGATTTTGTTGAAGATGACTCGGACATTTT760ACATGCTCTGAAGATGGCTGTGGTAGATATCTATCATTCC800AGGTTAAAGGAGAGACAAAGACGAAAAAAAATTATAAGAG840ACCATGGATTAATCAACCTTAGAAAGTTTCAATTAATGGA880ACGGCGGTATCCCAAGGAGGTCCAGGACCTGTATGAAACA920ATGAGGCGATTTGCAAGAATTGTGGGGCCAGTGGAACATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。