演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TACR2SKR

tachykinin receptor 2

TACR2 編碼 tachykinin receptor 2,是細胞膜上的 tachykinin 神經肽受體,可辨識 substance K,並傳遞受體訊號。

Homo sapiens10q22.1UniProt P21452
OFFICIAL SYMBOL
TACR2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P21452
PDB / ALPHAFOLD
9W1J
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TACR2 是蛋白質編碼基因,產物 tachykinin receptor 2 屬於 G protein-coupled receptor 1 family。這種受體可辨識 tachykinin 神經肽,其中 substance K(neurokinin A)是其受體配體;來源也指出它能結合並回應 substance P 與 neurokinin B/neuromedin-K,但此部分依序列相似性推定。受體對不同 tachykinin 的親和力排序為 substance K 高於 neuromedin-K,再高於 substance P。其蛋白質具有多段跨膜區域,構成受體的膜內結構。

Official symbol
TACR2
Gene name
tachykinin receptor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11527
UniProt
P21452
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SKRNK2RTAC2RNKNAR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q22.1
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegTACR2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:69,402,885–69,416,923
Gene span
14,039 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000373306 ★69,403,903–69,416,9185
ENST0000037330769,402,885–69,409,2823
ENST0000111898169,402,885–69,416,8825
ENST0000114253469,402,885–69,416,9235

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tachykinin receptor 2 的主要功能是辨識 tachykinin 神經肽並將配體結合轉換為細胞內訊號。已報告它是 substance K(亦稱 neurokinin A)的受體;此外,依序列相似性資料推定,該受體也能結合並回應 substance P 及 neurokinin B(neuromedin-K)。對這些 tachykinin 的親和力具有排序差異:substance K 最高,其次是 neuromedin-K,substance P 最低。這項排序描述受體對配體的相對親和力,並不表示三者的訊號效果相同。

substance K 與受體結合後,可引發 G protein-coupled receptor 訊號,涉及 G(q) 活化以及 phospholipase C 催化的 phosphatidylinositol 水解。這些事件將細胞外的配體辨識連結到細胞內訊號傳遞;來源明確指出 G(q) 活化與磷脂水解是該受體訊號的一部分,但未提供更下游反應的細節。

substance K 結合也會促進 adenylate cyclase 活性,並使細胞內 cyclic AMP(cAMP)濃度上升。此路徑同樣是受體配體辨識後引發的訊號反應,但資料將其標示為依序列相似性推定。現有資訊支持 tachykinin receptor 2 可透過不同訊號途徑回應 substance K;對其他配體的具體訊號方式與生理效應,則未提供足以進一步說明的內容。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 69416918 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TACR2 ENST00000373306 GRCh38 chr10:69416818-69417918 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGGGAGACAAGGGCTGGGTGTCAGGAAAGTGACACACAGGGAGAAGCAGAAAATGGACTGGGAGTGTGGG
GGCCGAGGCCCAGCCACGAGAAACCCAGGCGGTGCAAGGCAGAGCCCTGGGAGCACAGAGGCTGCTGTGC
CGTGGGTTGCTGGTGAATGAGAAGCCTCCTCTGCTTTAATGAAGAACATGCCCCCCCGACTCCCGCTAAT
CCTGCCCTGCCTTCATGGTCCACACACCACAGGTGTGCACAGGTTCATGCGTGTGTGTGAGCTTAACACG
TCAGCCGCACATACAGTTGCTCAGAAACATCTTCACTGCTTCACACACGTGCACACAGTCAATGACCAGG
AGCAGGGATCTTGGGGCAAACCTAGAGCAGCTTCTCAGGAGTTAAAACTCCAGCTTTGCTGTGGTTCCCG
GAAGAGCCCTGACTTTGTCCTAAGACAGTGGTTCTCAAAGTGAAGTGCTGGCTCCAGCAGCATCAGTATC
ACCTGGGAACTCGCTGGAAACGCTCCGGGTTCTGGCTTCTCCTCCTAGAGCGCCCAGAGCTGTGGGGTCC
TCCCTTCGGGCCAGAAACTCCAATCATAGTTTTTATGTACCAACCCCTGTGCTAAGTAGACTTTGTGCAC
ATTATCTCCATTTAAAATTCACAAATGTACTGTAAGATGCACACCATTTTTCTATATTTTTCAGATGGGG
TAGACAGAGCTCAGAAAGGTTAAGAGACTTGCCTGGAGTCACCAAACCAGGCTCGAACTCCTTCTGTATT
CAGAATCACTCTTCAGACGTAGCTCCTGTCCTGGGCTGAAAGTCAACATCCGCCGAGAGCTGGGCCCTCT
GTACCAGCCCCATCTCCCCCAAGTCTCTCCCTGCCTCTGCAGCCAGTCCTAAATCTTTCAAGAGACAAGG
CCAAGCAGGGGGTGGGACCAGGGGCGGGAGCCAAAGCCCCCCCTCGTGAGCAGGCAGCACCTCTGCCAAG
GCCCCCACTGGCCCTGCCCCAGAGAACGGCAGGGAAGCTGCAGCGAGGGCTGGCAGCTGGCAGAGCCCTG
AGCACCCAGCACCCAGCCCGGCTTGCAGCCCAAAGCCTGGAGAGAGGCTGC
TACR2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TACR2_1 ↗10:69,416,918負股69,416,908–69,416,967

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_5LBS56 · CTCF_binding_site · 69413134–69413155 · regulatory

ENSR10_BHQXG · enhancer · 69413140–69413903 · regulatory

ENSR10_5LBS6J · CTCF_binding_site · 69413431–69413452 · regulatory

ENSR10_5LBS72 · CTCF_binding_site · 69413539–69413560 · regulatory

ENSR10_932JZD · promoter · 69421877–69422134 · regulatory

· motif · 69413136–69413152 · motif

· motif · 69413433–69413449 · motif

· motif · 69413502–69413517 · motif

· motif · 69413502–69413517 · motif

· motif · 69413541–69413557 · motif

· motif · 69418268–69418283 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:398 aa

1 aa398 aa跨膜區拓樸區域
依 P21452 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tachykinin receptor 2 長 398 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解指出其具有七段螺旋型跨膜區域,並由胞外與胞質拓撲區段交替連接;蛋白質的 N 端區段位於胞外,C 端區段位於胞質側。

拓樸區域Extracellular1–32 aa
跨膜區Helical; Name=133–56 aa
拓樸區域Cytoplasmic57–69 aa
跨膜區Helical; Name=270–90 aa
拓樸區域Extracellular91–107 aa
跨膜區Helical; Name=3108–129 aa
拓樸區域Cytoplasmic130–149 aa
跨膜區Helical; Name=4150–170 aa
拓樸區域Extracellular171–196 aa
跨膜區Helical; Name=5197–218 aa
拓樸區域Cytoplasmic219–251 aa
跨膜區Helical; Name=6252–272 aa
拓樸區域Extracellular273–290 aa
跨膜區Helical; Name=7291–310 aa
拓樸區域Cytoplasmic311–398 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9W1J…

PDB · 9W1J

EM · 2.97 A · R=1-398

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

tachykinin receptor 2 位於細胞膜,並被註記為多次跨膜蛋白。 現有資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SKRTACR2TAC1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tachykinin receptor 2 可辨識 substance K(neurokinin A),也依序列相似性推定能結合並回應 substance P 與 neurokinin B(neuromedin-K)。其對 tachykinin 的親和力由高至低為 substance K、neuromedin-K、substance P。substance K 結合後可透過 G(q) 活化及 phospholipase C 促進 phosphatidylinositol 水解傳遞訊號;另依序列相似性推定會促進 adenylate cyclase 活性,使細胞內 cAMP 增加。含實驗來源
證據與來源

This is a receptor for the tachykinin neuropeptide substance K (neurokinin A). Is also able to bind and respond to tachynins substance P and neurokinin B/neuromedin-K (By similarity). The rank order of affinity of this receptor to tachykinins is: substance K > neuromedin-K > substance P (By similarity). Substance K binding to its receptor triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of G(q) and phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Substance K binding also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) (By similarity)

PMID 1659297 ↗ · PMID 1848773 ↗ · PMID 35882833 ↗ · PMID 7957923 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tachykinin receptor 2 位於細胞膜,屬於多次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 37968728 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000373306 · 2,715 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGAACGGCAGGGAAGCTGCAGCGAGGGCTGGCAGCTGG40
41CAGAGCCCTGAGCACCCAGCACCCAGCCCGGCTTGCAGCC80
81CAAAGCCTGGAGAGAGGCTGCTGCGCCATTGACCTGTGGA120
121CTCCAGAGACTCCCGCTGTGCATTCCTCTGATCTGGAAGG160
161TTTCCTGAATTACGTGACGAGAAACCTGGGTTCGAGTCCT200
201AACTTGTCACCAACTTCCTGAGTGACCTGGGCTGGTCCCG240
241TCCCCTCTTGGAATCTCTGTCTTCCATCTCTTCAGCGAAG280
281GGGTTGATTTATAAGGGTGTTTTCTGCTCTGACACTGTGA320
321TTTGAATTCTGTGTTTCCACATGATATTCGAGAAGTCTGG360
361CCGGAAGGATGGAATCTGAAATGACAATGGTTCTGGACTG400
401GGCTTTGTGCTCAGCCCAGCTCATCTTTGCCTGAGACCTA440
441GGAGTGGCCCCAGGCTCTCCTGATGTGCCACCACGCTTGG480
481CATCTGCTCCTCTCCCTGCCCCCATATTCCCATGCTCTGA520
521AGGGGAGTTCTCTTTCATAGCAAATCCGAGAGGAGCCGAG560
561GAGCCAGGTCCTTTGTTCCAGACCCAGAAGCAGCCATGGG600
601GACCTGTGACATTGTGACTGAAGCCAATATCTCATCTGGC640
641CCTGAGAGCAACACCACGGGCATCACAGCCTTCTCCATGC680
681CCAGCTGGCAACTGGCACTGTGGGCCACAGCCTACCTGGC720
721CCTGGTGCTGGTGGCCGTGACGGGTAATGCCATCGTCATC760
761TGGATCATCCTGGCCCATCGGAGGATGCGCACAGTCACCA800
801ACTACTTCATCGTCAATCTGGCGCTGGCTGACCTCTGCAT840
841GGCTGCCTTCAATGCCGCCTTCAACTTTGTCTATGCCAGC880
881CACAACATCTGGTACTTTGGCCGTGCCTTCTGCTACTTCC920
921AGAACCTCTTCCCCATCACAGCCATGTTTGTCAGCATCTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。