基因總覽
TACR1 是蛋白質編碼基因,產物 tachykinin receptor 1 為 G protein-coupled receptor 家族成員。此受體可辨識 tachykinin 類訊號分子,作為細胞接收並轉換這類訊號的膜蛋白。其蛋白質具有多段跨膜螺旋,並包含細胞外與細胞質區段;這種構造提供受體與細胞外訊號接觸、並連結細胞內反應的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305249 ★ | 75,046,463–75,199,520 | 5 |
| ENST00001140780 | 75,046,463–75,199,526 | 5 |
| ENST00000409848 | 75,051,036–75,199,526 | 4 |
| ENST00001113254 | 75,118,628–75,199,526 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
tachykinin receptor 1 是 Substance P 的受體,也能結合並回應 neurokinin A(substance K)與 neurokinin B(neuromedin-K)。對這三種 tachykinin 的親和力排序為 Substance P 高於 neurokinin A,再高於 neurokinin B;因此,受體對不同配體的辨識程度並不相同。
Substance P 與受體結合後,可引發 G protein-coupled receptor 訊號傳遞,其中一條路徑是活化 phospholipase C,促進 phosphatidylinositol 水解。這表示受體能將細胞外配體結合事件轉換為細胞內的脂質訊號變化。
此外,Substance P 結合也會促進 adenylate cyclase 活性,進而提高細胞內 cyclic AMP(cAMP)濃度。此路徑與 phosphatidylinositol 水解並列,說明受體活化可連結不同的細胞內訊號反應。adenylate cyclase 相關效應標示為依相似性推定;來源未提供其適用的具體實驗條件,因此不宜視為與其他敘述具有相同證據性質。
Promoter 與基因調控
>TACR1 ENST00000305249 GRCh38 chr2:75199420-75200520 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCAGGATGGAGGCGGGCAGAGAAGGCTGGCTGACCTGTCCTCCAGCCCCTATGCAAACCTGGAAGGGGA ACAGGGAGAAGGACCACCGATGCCACCCCGAGCCCGGCTCTGGCCTGCAGGCTTGGCAGGCGCGGAGGCG GAGGCTGCCAGGTCCCCGGGAGGCAAACGCAGCGCCGCAGTGATTGCTGGCGGAGAGCCCAGAGCCGCGC GTCTGAGCGACAAGCTGCCTATGAGTGTGGCTCCTGCGCTCACCAAGATTCGCAGGGAGCTCAGCCCTGT CCCCAGTGATTGAGCAGAGGCTCATCCAGAGGGGTCAGGTGGAGGGCTCAAATGGAGCTTCTCCTGGAAC GAGGGGCCAAGTCACCAGGGTGGCTGAGGAAAGTGTCCTCAAAGCTTAGAGACTGTCACTTCCCAGGTGA ATCAGCTAGCCAGGTAACTGAGCTAGATATTTTGTGGGGGTGTTTCCTAAACACAGCCTCAGGAAAGTTG TTTTCGGGACACCTGGACCAGGGAGTCGTCGCCTCTGGCTTCTCGGTAGCTGGAGCGCGGCCCGGAGCGC GGCGCTGGCACATCGCCCCCACACATGACCGTTTCCCATTGCCACAGGCAAGCCGCCTCTGCAGAGCTGT CTCAGGGCTCTGGGCTTCATTCCCTGGAAGTTGATTGTCCTCCACTCCAGCTGTTTCCCAAATCCTTCCT TCCTCCCAGCACCCCTCGTGCAACGACGATTCCAGCTGCGGACCGCATCTGTGTCAGTTACTTCCAAGCC ACCTACTGCCCCCTCGCGGAGTGCGTGGGGCTCCCGGCTCGCAGACTCCCACGGCAAGTAGCAAGCAGCA AAAGGCGTGGTAGCTGCGGCGGTGGAATGAGACAGTTGTCAACAGCTGGCGCAGCTGCCGCGCTGCGCAC CGGGACTGGCGAGTACGCAGCCCAGGTACTGCCCCTTCCCAGTGACGTCTCTGCAGGGGGTTATAAAAGC CTCGTGCGCAGCTAACTCGCGAGCTGAGCAACCCGAACCGAGAGGTGCCCGCGAAACTGCAGGCGGCGGC AGCGGCAGCAAAAGAGAAGGAAAAATCTCCAGCTGGATACGAAGCTCCAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TACR1_1 ↗ | 2:75,199,519 | 負股 | 75,199,509–75,199,568 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_BJWXK · promoter · 75199047–75200010 · regulatory
ENSR2_5MNKBX · CTCF_binding_site · 75199728–75199749 · regulatory
ENSR2_5MNKHN · CTCF_binding_site · 75200752–75200773 · regulatory
ENSR2_847NS6 · enhancer · 75201011–75201209 · regulatory
· motif · 75199639–75199652 · motif
· motif · 75199659–75199676 · motif
· motif · 75199730–75199746 · motif
· motif · 75200754–75200770 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:407 aa
tachykinin receptor 1 長 407 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。蛋白質含七段跨膜螺旋,並交錯排列細胞外與細胞質區段;C 端位於細胞質側,末端區域另標註為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tachykinin receptor 1 位於細胞膜,並可在訊號級聯啟動後因 Substance P 結合而內化至早期胞內體;之後受體會再循環回到細胞表面。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CCDC167Q9P0B6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAC1P20366 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TMEM147Q9BVK8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
來源記載 tachykinin receptor 1 與 ARRB1 互作,但未進一步說明此互作是否屬於特定複合體,或其功能性結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tachykinin receptor 1 可辨識 Substance P,也能結合並回應 neurokinin A(substance K)及 neurokinin B(neuromedin-K);對三者的親和力依序為 Substance P、neurokinin A、neurokinin B。Substance P 結合可透過 phospholipase C 活化 phosphatidylinositol 水解,也可促進 adenylate cyclase 活性並提高細胞內 cAMP;後一訊號敘述依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for the tachykinin substance P, also able to bind and respond to tachynins neurokinin A/substance K and neurokinin B/neuromedin-K. The rank order of affinity of this receptor to tachykinins is: substance P > neurokinin A/substance K > neurokinin B/neuromedin-K. Substance P binding to its receptor triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Substance P binding also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) (By similarity) PMID 15452552 ↗ · PMID 1718267 ↗ |
| 交互作用 | tachykinin receptor 1 與 ARRB1 互作;此敘述未提供互作發生的條件或其功能後果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | tachykinin receptor 1 是多次跨膜蛋白,位於細胞膜。訊號級聯啟動後,Substance P 結合會使受體內化並定位至早期胞內體,隨後受體再循環回到細胞表面。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Early endosome; After signaling cascade initiation, substance P binding results in receptor internalization and localization to early endosomes, followed by receptor recycling to the cell surface PMID 37968728 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGCTGAGCAACCCGAACCGAGAGGTGCCCGCGAAACTGC40AGGCGGCGGCAGCGGCAGCAAAAGAGAAGGAAAAATCTCC80AGCTGGATACGAAGCTCCAGAATCCTGGCCATAGGCTCAG120AACTTTTACAGGTCGCGCTGCAATGGGCCCCCACTTCGCT160CCTAAGTCCTCACGCAGCACAGGGCTTTGCCTTTCCCTGC200GGAGGAAGGAGAAATAGGAGTTGCAGGCAGCAGCAGGTGC240ATAAATGCGGGGGATCTCTTGCTTCCTAGAACTGTGACCG280GTGGAATTTCTTTCCCTTTTTCAGTTTACCGCAAGAGAGA320TGCTGTCTCCAGACTTCTGAACTCAAACGTCTCCTGAAGC360TTGAAAGTGGAGGAATTCAGAGCCACCGCGGGCAGGCGGG400CAGTGCATCCAGAAGCGTTTATATTCTGAGCGCCAGTTCA440GCTTTCAAAAAGAGTGCTGCCCAGAAAAAGCCTTCCACCC480TCCTGTCTGGCTTTAGAAGGACCCTGAGCCCCAGGCGCCA520GCCACAGGACTCTGCTGCAGAGGGGGGTTGTGTACAGATA560GTAGGGCTTTACCGCCTAGCTTCGAAATGGATAACGTCCT600CCCGGTGGACTCAGACCTCTCCCCAAACATCTCCACTAAC640ACCTCGGAACCCAATCAGTTCGTGCAACCAGCCTGGCAAA680TTGTCCTTTGGGCAGCTGCCTACACGGTCATTGTGGTGAC720CTCTGTGGTGGGCAACGTGGTAGTGATGTGGATCATCTTA760GCCCACAAAAGAATGAGGACAGTGACGAACTATTTTCTGG800TGAACCTGGCCTTCGCGGAGGCCTCCATGGCTGCATTCAA840TACAGTGGTGAACTTCACCTATGCTGTCCACAACGAATGG880TACTACGGCCTGTTCTACTGCAAGTTCCACAACTTCTTTC920CCATCGCCGCTGTCTTCGCCAGTATCTACTCCATGACGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。