演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TACR1SPR

tachykinin receptor 1

TACR1 編碼 tachykinin receptor 1,屬於 G protein-coupled receptor 家族,可辨識多種 tachykinin,並引發細胞內訊號傳遞。

Homo sapiens2p12UniProt P25103
OFFICIAL SYMBOL
TACR1
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P25103
PDB / ALPHAFOLD
7RMG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TACR1 是蛋白質編碼基因,產物 tachykinin receptor 1 為 G protein-coupled receptor 家族成員。此受體可辨識 tachykinin 類訊號分子,作為細胞接收並轉換這類訊號的膜蛋白。其蛋白質具有多段跨膜螺旋,並包含細胞外與細胞質區段;這種構造提供受體與細胞外訊號接觸、並連結細胞內反應的基本架構。

Official symbol
TACR1
Gene name
tachykinin receptor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11526
UniProt
P25103
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SPRNK1RNKIRTAC1R

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p12
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegTACR1pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:75,046,463–75,199,526
Gene span
153,064 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305249 ★75,046,463–75,199,5205
ENST0000114078075,046,463–75,199,5265
ENST0000040984875,051,036–75,199,5264
ENST0000111325475,118,628–75,199,5262

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tachykinin receptor 1 是 Substance P 的受體,也能結合並回應 neurokinin A(substance K)與 neurokinin B(neuromedin-K)。對這三種 tachykinin 的親和力排序為 Substance P 高於 neurokinin A,再高於 neurokinin B;因此,受體對不同配體的辨識程度並不相同。

Substance P 與受體結合後,可引發 G protein-coupled receptor 訊號傳遞,其中一條路徑是活化 phospholipase C,促進 phosphatidylinositol 水解。這表示受體能將細胞外配體結合事件轉換為細胞內的脂質訊號變化。

此外,Substance P 結合也會促進 adenylate cyclase 活性,進而提高細胞內 cyclic AMP(cAMP)濃度。此路徑與 phosphatidylinositol 水解並列,說明受體活化可連結不同的細胞內訊號反應。adenylate cyclase 相關效應標示為依相似性推定;來源未提供其適用的具體實驗條件,因此不宜視為與其他敘述具有相同證據性質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 75199520 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TACR1 ENST00000305249 GRCh38 chr2:75199420-75200520 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCAGGATGGAGGCGGGCAGAGAAGGCTGGCTGACCTGTCCTCCAGCCCCTATGCAAACCTGGAAGGGGA
ACAGGGAGAAGGACCACCGATGCCACCCCGAGCCCGGCTCTGGCCTGCAGGCTTGGCAGGCGCGGAGGCG
GAGGCTGCCAGGTCCCCGGGAGGCAAACGCAGCGCCGCAGTGATTGCTGGCGGAGAGCCCAGAGCCGCGC
GTCTGAGCGACAAGCTGCCTATGAGTGTGGCTCCTGCGCTCACCAAGATTCGCAGGGAGCTCAGCCCTGT
CCCCAGTGATTGAGCAGAGGCTCATCCAGAGGGGTCAGGTGGAGGGCTCAAATGGAGCTTCTCCTGGAAC
GAGGGGCCAAGTCACCAGGGTGGCTGAGGAAAGTGTCCTCAAAGCTTAGAGACTGTCACTTCCCAGGTGA
ATCAGCTAGCCAGGTAACTGAGCTAGATATTTTGTGGGGGTGTTTCCTAAACACAGCCTCAGGAAAGTTG
TTTTCGGGACACCTGGACCAGGGAGTCGTCGCCTCTGGCTTCTCGGTAGCTGGAGCGCGGCCCGGAGCGC
GGCGCTGGCACATCGCCCCCACACATGACCGTTTCCCATTGCCACAGGCAAGCCGCCTCTGCAGAGCTGT
CTCAGGGCTCTGGGCTTCATTCCCTGGAAGTTGATTGTCCTCCACTCCAGCTGTTTCCCAAATCCTTCCT
TCCTCCCAGCACCCCTCGTGCAACGACGATTCCAGCTGCGGACCGCATCTGTGTCAGTTACTTCCAAGCC
ACCTACTGCCCCCTCGCGGAGTGCGTGGGGCTCCCGGCTCGCAGACTCCCACGGCAAGTAGCAAGCAGCA
AAAGGCGTGGTAGCTGCGGCGGTGGAATGAGACAGTTGTCAACAGCTGGCGCAGCTGCCGCGCTGCGCAC
CGGGACTGGCGAGTACGCAGCCCAGGTACTGCCCCTTCCCAGTGACGTCTCTGCAGGGGGTTATAAAAGC
CTCGTGCGCAGCTAACTCGCGAGCTGAGCAACCCGAACCGAGAGGTGCCCGCGAAACTGCAGGCGGCGGC
AGCGGCAGCAAAAGAGAAGGAAAAATCTCCAGCTGGATACGAAGCTCCAGA
TACR1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TACR1_1 ↗2:75,199,519負股75,199,509–75,199,568

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_BJWXK · promoter · 75199047–75200010 · regulatory

ENSR2_5MNKBX · CTCF_binding_site · 75199728–75199749 · regulatory

ENSR2_5MNKHN · CTCF_binding_site · 75200752–75200773 · regulatory

ENSR2_847NS6 · enhancer · 75201011–75201209 · regulatory

· motif · 75199639–75199652 · motif

· motif · 75199659–75199676 · motif

· motif · 75199730–75199746 · motif

· motif · 75200754–75200770 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:407 aa

1 aa407 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 P25103 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tachykinin receptor 1 長 407 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。蛋白質含七段跨膜螺旋,並交錯排列細胞外與細胞質區段;C 端位於細胞質側,末端區域另標註為無序區。

拓樸區域Extracellular1–31 aa
跨膜區Helical; Name=132–54 aa
拓樸區域Cytoplasmic55–64 aa
跨膜區Helical; Name=265–86 aa
拓樸區域Extracellular87–106 aa
跨膜區Helical; Name=3107–128 aa
拓樸區域Cytoplasmic129–148 aa
跨膜區Helical; Name=4149–169 aa
拓樸區域Extracellular170–194 aa
跨膜區Helical; Name=5195–219 aa
拓樸區域Cytoplasmic220–248 aa
跨膜區Helical; Name=6249–270 aa
拓樸區域Extracellular271–283 aa
跨膜區Helical; Name=7284–308 aa
拓樸區域Cytoplasmic309–407 aa
功能區域Disordered364–407 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7RMG…

PDB · 7RMG

EM · 3.00 A · R=1-407

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Early endosome

tachykinin receptor 1 位於細胞膜,並可在訊號級聯啟動後因 Substance P 結合而內化至早期胞內體;之後受體會再循環回到細胞表面。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPRTACR1CCDC167TAC1TMEM147
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 tachykinin receptor 1 與 ARRB1 互作,但未進一步說明此互作是否屬於特定複合體,或其功能性結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tachykinin receptor 1 可辨識 Substance P,也能結合並回應 neurokinin A(substance K)及 neurokinin B(neuromedin-K);對三者的親和力依序為 Substance P、neurokinin A、neurokinin B。Substance P 結合可透過 phospholipase C 活化 phosphatidylinositol 水解,也可促進 adenylate cyclase 活性並提高細胞內 cAMP;後一訊號敘述依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Receptor for the tachykinin substance P, also able to bind and respond to tachynins neurokinin A/substance K and neurokinin B/neuromedin-K. The rank order of affinity of this receptor to tachykinins is: substance P > neurokinin A/substance K > neurokinin B/neuromedin-K. Substance P binding to its receptor triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Substance P binding also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) (By similarity)

PMID 15452552 ↗ · PMID 1718267 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tachykinin receptor 1 與 ARRB1 互作;此敘述未提供互作發生的條件或其功能後果。推論支持
證據與來源

Interacts with ARRB1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tachykinin receptor 1 是多次跨膜蛋白,位於細胞膜。訊號級聯啟動後,Substance P 結合會使受體內化並定位至早期胞內體,隨後受體再循環回到細胞表面。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Early endosome; After signaling cascade initiation, substance P binding results in receptor internalization and localization to early endosomes, followed by receptor recycling to the cell surface

PMID 37968728 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305249 · 4,779 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGCTGAGCAACCCGAACCGAGAGGTGCCCGCGAAACTGC40
41AGGCGGCGGCAGCGGCAGCAAAAGAGAAGGAAAAATCTCC80
81AGCTGGATACGAAGCTCCAGAATCCTGGCCATAGGCTCAG120
121AACTTTTACAGGTCGCGCTGCAATGGGCCCCCACTTCGCT160
161CCTAAGTCCTCACGCAGCACAGGGCTTTGCCTTTCCCTGC200
201GGAGGAAGGAGAAATAGGAGTTGCAGGCAGCAGCAGGTGC240
241ATAAATGCGGGGGATCTCTTGCTTCCTAGAACTGTGACCG280
281GTGGAATTTCTTTCCCTTTTTCAGTTTACCGCAAGAGAGA320
321TGCTGTCTCCAGACTTCTGAACTCAAACGTCTCCTGAAGC360
361TTGAAAGTGGAGGAATTCAGAGCCACCGCGGGCAGGCGGG400
401CAGTGCATCCAGAAGCGTTTATATTCTGAGCGCCAGTTCA440
441GCTTTCAAAAAGAGTGCTGCCCAGAAAAAGCCTTCCACCC480
481TCCTGTCTGGCTTTAGAAGGACCCTGAGCCCCAGGCGCCA520
521GCCACAGGACTCTGCTGCAGAGGGGGGTTGTGTACAGATA560
561GTAGGGCTTTACCGCCTAGCTTCGAAATGGATAACGTCCT600
601CCCGGTGGACTCAGACCTCTCCCCAAACATCTCCACTAAC640
641ACCTCGGAACCCAATCAGTTCGTGCAACCAGCCTGGCAAA680
681TTGTCCTTTGGGCAGCTGCCTACACGGTCATTGTGGTGAC720
721CTCTGTGGTGGGCAACGTGGTAGTGATGTGGATCATCTTA760
761GCCCACAAAAGAATGAGGACAGTGACGAACTATTTTCTGG800
801TGAACCTGGCCTTCGCGGAGGCCTCCATGGCTGCATTCAA840
841TACAGTGGTGAACTTCACCTATGCTGTCCACAACGAATGG880
881TACTACGGCCTGTTCTACTGCAAGTTCCACAACTTCTTTC920
921CCATCGCCGCTGTCTTCGCCAGTATCTACTCCATGACGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。