基因總覽
TACC3（transforming acidic coiled-coil containing protein 3）是蛋白質編碼基因，產生屬於 TACC 家族的蛋白質。其蛋白質長 838 個胺基酸，帶有 coiled-coil C-terminal region，並包含多段預測為無序的區域；部分區域與紡錘體定位有關，但單獨並不足以促成定位。TACC3 參與微管相關的細胞活動，也可與其他蛋白質組成複合體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000313288 ★ | 1,721,521–1,745,171 | 16 |
| ENST00000458173 | 1,712,891–1,728,219 | 4 |
| ENST00000954273 | 1,720,581–1,745,178 | 16 |
| ENST00000612220 | 1,720,596–1,745,178 | 15 |
| ENST00000874198 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000874199 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000874200 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000918507 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000918508 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000918509 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
| ENST00000918510 | 1,720,596–1,745,178 | 15 |
| ENST00000918511 | 1,720,596–1,745,178 | 16 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TACC3 參與微管依賴的細胞核與中心體耦合，並涉及調節神經前驅細胞的中心體介導性核間移行（interkinetic nuclear migration, INM）。這項神經前驅細胞功能的描述依據相似性推定，應視為類推資訊，而非此處明確限定於人類細胞的直接證據。
在有絲分裂期間，TACC3 是 TACC3/ch-TOG/clathrin 複合體的一員。此複合體被認為可作為微管間橋，協助穩定有絲分裂紡錘體的動粒纖維；來源指出，該複合體對維持動粒纖維張力是必要的。這些敘述將 TACC3 的作用置於紡錘體微管結構的穩定與張力維持之中，但未將複合體的整體功能等同於 TACC3 單獨作用。
TACC3 也可能參與細胞生長與分化的控制，並可能與癌症有關；來源以「可能」描述這些角色，未提供足以將其解讀為確定因果關係的資訊。因此，這些面向應與上述紡錘體複合體功能區分，保留其推測性質。
Promoter 與基因調控
>TACC3 ENST00000313288 GRCh38 chr4:1720521-1721621 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCTGCGCCCAGGCGCTTTCGGGGCCTCGGGGAGCTGGCGGAGGCCTCCTCCTGACCTCCCAGCAAGCCC TGCGCAGGAGAGGATGCGGCCGGCCGGCCCGAGCAGCCTCACCGAGCGGCAGCAGCGAGTGGCACAACAG CGTGGCGGCCGTGCGGCGCAAGTGGAAGGGCACGAAGGCGGCGTCCTCGCTGCCCAGCCAGCCCGACAGC AGGTTCTGCACCGTGAGCCCCGCCGCGTGGAACTCGTTGGGCGTGAACACGAAGCACACGGCGAACACCA GATAGGCGAGAGTGAAGGTCACCTCGGGGCTGTCCATCGCGCAGCCGCCGGGAAGCTGTCGAGCTAGGCC CCCGCCCCGGCGCGCGGACGAGGCCGCAGCGCCCAGTCCCGGACCTGTCGGTTGCGGCGGCCGCCGCCCG GCCGCCCGCGGGGCACTCTAGGACATGGAGTCCCGCCGCCCGGCCGCCCGCGGGGCACTCTAGGACATGG AGTCCCGCCGCCCGGCCGCCCGCGGGGCACTCTAGGACATGGAGTCCCGCCGCCCGGCCGCCCGCGGGGC ACTCTAGGGCATGGAGTCCCGCCGCTCGGCCGCTCGCGGGGCGCTCTGGGAGATGCAGTCCCCGTGCGGG TGCGGCCTCTCTTCTCGGCCGGCCCTGGAGGCGGCACCGCACCTGTGCATTGAGCACAGGTGGGGAAACT TAGGCCTGAGCGAGGCCCTGGCCATGAAGCCCCGCCCAGTAGCGTCAGTTGCGGAACTCGAAATTCATGG GGCGACTGCGAGCCCGGGGTCTCAGCTTCAGACACCCTGGCGTGCCCTCCACTCCGGAAACGGAACCGTC GGCGCCCGAGCGGGGGGTGGGGGGGGAGGGAGGGCGGAGCCGGCGAGGCACAGCTTCCCATTGGACGCCC GCCCTCCTGCGGTCCTGCCCCCGGCCGCGCGCTGATTGGCCGCGCGAAGGCAACCGTCGGCGTTTGAAAC TCCGGCGCGCCGGCGGCCATCAAGGGCTAGAAGCGCGACGGCGGTAGCAGCTAGGCTTGGCCCCCGGCGT GGAGCAGACGCGGACCCCTCCTTCCTGGCGGCGGCGGCGCGGGCTCAGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TACC3_2 ↗ | 4:1,720,631 | 正股 | 1,720,582–1,720,641 |
| TACC3_1 ↗ | 4:1,721,522 | 正股 | 1,721,473–1,721,532 |
| TACC3_3 ↗ | 4:1,723,416 | 正股 | 1,723,367–1,723,426 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_67GH6 · CTCF_binding_site · 1720268–1720319 · regulatory
ENSR4_9NFX · promoter · 1720588–1721088 · regulatory
ENSR4_83CW3 · enhancer · 1721089–1721312 · regulatory
ENSR4_83CW7 · promoter · 1721313–1721531 · regulatory
ENSR4_5DX6L · CTCF_binding_site · 1721426–1721447 · regulatory
ENSR4_9NG8 · promoter · 1721734–1722234 · regulatory
ENSR4_5DXFP · CTCF_binding_site · 1722965–1722986 · regulatory
ENSR4_BC8Q · enhancer · 1725981–1726788 · regulatory
ENSR4_5DZ25 · CTCF_binding_site · 1726291–1726312 · regulatory
ENSR4_5DZ2P · CTCF_binding_site · 1726418–1726439 · regulatory
· motif · 1716647–1716658 · motif
· motif · 1718524–1718537 · motif
· motif · 1718692–1718707 · motif
· motif · 1718929–1718942 · motif
· motif · 1719328–1719343 · motif
· motif · 1719336–1719343 · motif
· motif · 1719529–1719540 · motif
· motif · 1719585–1719596 · motif
· motif · 1719639–1719648 · motif
· motif · 1719837–1719846 · motif
· motif · 1720033–1720042 · motif
· motif · 1720087–1720096 · motif
· motif · 1720133–1720142 · motif
· motif · 1720270–1720286 · motif
· motif · 1720300–1720316 · motif
· motif · 1720348–1720363 · motif
· motif · 1720366–1720375 · motif
· motif · 1720366–1720375 · motif
· motif · 1720569–1720581 · motif
· motif · 1720572–1720579 · motif
· motif · 1721188–1721197 · motif
· motif · 1721205–1721214 · motif
· motif · 1721249–1721259 · motif
· motif · 1721428–1721444 · motif
· motif · 1722012–1722021 · motif
· motif · 1722087–1722096 · motif
· motif · 1722463–1722471 · motif
· motif · 1722967–1722983 · motif
· motif · 1723128–1723143 · motif
· motif · 1723275–1723284 · motif
· motif · 1723275–1723284 · motif
· motif · 1723277–1723293 · motif
· motif · 1723277–1723293 · motif
· motif · 1723284–1723293 · motif
· motif · 1723286–1723298 · motif
· motif · 1723311–1723320 · motif
· motif · 1723342–1723355 · motif
· motif · 1723404–1723417 · motif
· motif · 1723482–1723491 · motif
· motif · 1723482–1723493 · motif
· motif · 1723482–1723495 · motif
· motif · 1723509–1723518 · motif
· motif · 1724285–1724296 · motif
· motif · 1726293–1726309 · motif
· motif · 1726420–1726436 · motif
TACC3 在多種癌細胞株中呈現上調；來源未進一步說明造成此變化的條件或調控機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：838 aa
TACC3 蛋白質長 838 個胺基酸，屬於 TACC 家族。蛋白質註解標示數段無序區域，包括胺基酸 123–227、311–527 及 569–594。胺基酸 522–577 與 594–838 的區域各自對紡錘體定位不可或缺，但單獨均不足以促成定位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TACC3 位於細胞質，亦見於中心體、紡錘體及紡錘體極。 與 CKAP5 結合時，TACC3 在有絲分裂與間期定位於微管正端；與 CKAP5 和 clathrin 組成複合體時，則定位於有絲分裂紡錘體的微管間橋。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- ARHGDIGQ99819 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASPSCR1Q9BZE9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEX2Q9BXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEX3Q00994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C2CD6Q53TS8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCHCR1Q8TD31-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC20BQ86Y33-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP55Q53EZ4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CIB3Q96Q77 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- CKAP5Q14008 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- CLTAP09496 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GDF15Q99988 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQCDQ96DY2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIZQ2M2Z5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KLC1Q07866-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLHL38Q2WGJ6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NDEL1Q9GZM8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP54Q7Z3B4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF20Q5VTR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNX20Q7Z614 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPATA18Q8TC71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBC1D22BQ9NU19 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- VPS37CA5D8V6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TACC3 可與微管及 CKAP5 互作，且與 CKAP5 的互作不依賴 clathrin；與 CKAP5、clathrin 共同形成 TACC3/ch-TOG/clathrin 複合體。TACC3 在 Ser-558 經 AURKA 磷酸化後，與 CLTC 被認為可構成複合的微管互作表面。另有資料指出 TACC3 與 CCDC100/CEP120、GCN5L2、PCAF 互作；其 coiled coil C-terminal region 與 ARNT、ARNT2 的互作則依據相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TACC3 參與微管依賴的細胞核與中心體耦合，也涉及調節神經前驅細胞的中心體介導性核間移行；此神經前驅細胞相關敘述依據相似性推定。TACC3 是 TACC3/ch-TOG/clathrin 複合體的一員，該複合體被認為可作為微管間橋，協助穩定有絲分裂紡錘體的動粒纖維，且對維持其張力是必要的。此外，TACC3 可能參與細胞生長與分化控制，也可能與癌症有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in the microtubule-dependent coupling of the nucleus and the centrosome. Involved in the processes that regulate centrosome-mediated interkinetic nuclear migration (INM) of neural progenitors (By similarity). Acts as a component of the TACC3/ch-TOG/clathrin complex proposed to contribute to stabilization of kinetochore fibers of the mitotic spindle by acting as inter-microtubule bridge. The TACC3/ch-TOG/clathrin complex is required for the maintenance of kinetochore fiber tension. May be involved in the control of cell growth and differentiation. May contribute to cancer PMID 14767476 ↗ · PMID 21297582 ↗ · PMID 23532825 ↗ |
| 交互作用 | TACC3 與微管互作，也可不依賴 clathrin 與 CKAP5 互作；與 CKAP5 及 clathrin 共同形成位於紡錘體微管間橋的 TACC3/ch-TOG/clathrin 複合體。TACC3 經 AURKA 在 Ser-558 磷酸化後，與 CLTC 被認為可形成複合的微管互作表面。TACC3 也與 CCDC100/CEP120、GCN5L2 及 PCAF 互作；其 coiled coil C-terminal region 與 ARNT、ARNT2 的互作依據相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with microtubules. Interacts with CKAP5 independently of clathrin. Interacts with CKAP5 and clathrin forming the TACC3/ch-TOG/clathrin complex located at spindle inter-microtubules bridges; TACC3 (phosphorylated at Ser-558 by AURKA) and CLTC are proposed to form a composite microtubule interaction surface. Interacts with CCDC100/CEP120. The coiled coil C-terminal region interacts with AH receptor nuclear translocator protein (ARNT) and ARNT2 (By similarity). Interacts with GCN5L2 and PCAF PMID 14767476 ↗ · PMID 21297582 ↗ · PMID 23918938 ↗ · PMID 25596274 ↗ |
| 細胞定位 | TACC3 位於細胞質、中心體、紡錘體及紡錘體極。與 CKAP5 結合時，TACC3 在有絲分裂與間期定位於微管正端；與 CKAP5 和 clathrin 組成複合體時，則位於有絲分裂紡錘體的微管間橋。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole; In complex with CKAP5 localized to microtubule plus-ends in mitosis and interphase. In complex with CKAP5 and clathrin localized to inter-microtubule bridges in mitotic spindles PMID 17545617 ↗ · PMID 21297582 ↗ · PMID 23918938 ↗ |
| 調控 | TACC3 在多種癌細胞株中呈現上調；來源未提供造成上調的條件或調控機制。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CAAGGGCTAGAAGCGCGACGGCGGTAGCAGCTAGGCTTGG40CCCCCGGCGTGGAGCAGACGCGGACCCCTCCTTCCTGGCG80GCGGCGGCGCGGGCTCAGAGCCCGGCAACGGGCGGGCGGG120CAGAATGAGTCTGCAGGTCTTAAACGACAAAAATGTCAGC160AATGAAAAAAATACAGAAAATTGCGACTTCCTGTTTTCGC200CACCAGAAGTTACCGGAAGATCGTCTGTTCTTCGTGTGTC240ACAGAAAGAAAATGTGCCACCCAAGAACCTGGCCAAAGCT280ATGAAGGTGACTTTTCAGACACCTCTGCGGGATCCACAGA320CGCACAGGATTCTAAGTCCTAGCATGGCCAGCAAACTTGA360GGCTCCTTTCACTCAGGATGACACCCTTGGACTGGAAAAC400TCACACCCGGTCTGGACACAGAAAGAGAACCAACAGCTCA440TCAAGGAAGTGGATGCCAAAACTACTCATGGAATTCTACA480GAAACCAGTGGAGGCTGACACCGACCTCCTGGGGGATGCA520AGCCCAGCCTTTGGGAGTGGCAGCTCCAGCGAGTCTGGCC560CAGGTGCCCTGGCTGACCTGGACTGCTCAAGCTCTTCCCA600GAGCCCAGGAAGTTCTGAGAACCAAATGGTGTCTCCAGGA640AAAGTGTCTGGCAGCCCTGAGCAAGCCGTGGAGGAAAACC680TTAGTTCCTATTCCTTAGACAGAAGAGTGACACCCGCCTC720TGAGACCCTAGAAGACCCTTGCAGGACAGAGTCCCAGCAC760AAAGCGGAGACTCCGCACGGAGCCGAGGAAGAATGCAAAG800CGGAGACTCCGCACGGAGCCGAGGAGGAATGCCGGCACGG840TGGGGTCTGTGCTCCCGCAGCAGTGGCCACTTCGCCTCCT880GGTGCAATCCCTAAGGAAGCCTGCGGAGGAGCACCCCTGC920AGGGTCTGCCTGGCGAAGCCCTGGGCTGCCCTGCGGGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。