演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TACC2AZU-1

transforming acidic coiled-coil containing protein 2

TACC2 是 TACC family 的蛋白質,參與微管依賴的細胞核與中心體耦聯,並可能協助組織中心體微管;其腫瘤相關作用仍以可能性描述。

Homo sapiens10q26.13UniProt O95359
OFFICIAL SYMBOL
TACC2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
O95359
PDB / ALPHAFOLD
無模型
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TACC2(transforming acidic coiled-coil containing protein 2)是由蛋白質編碼基因產生的 TACC family 成員。其蛋白質全長為 2,948 個胺基酸,包含一個 SPAZ 結構域;序列註解亦指出多處區域預測為無序區。現有資料將 TACC2 與微管、中心體及細胞核的關聯列為其主要特性,並指出它可能參與腫瘤抑制或成為腫瘤進展標記,但這些描述保留「可能」的限定,不能視為已確立的作用。

Official symbol
TACC2
Gene name
transforming acidic coiled-coil containing protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11523
UniProt
O95359
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
AZU-1ECTACC

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.13
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegTACC2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:121,989,163–122,254,560
Gene span
265,398 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000369005 ★121,989,163–122,254,54223
ENST00000513429121,989,163–122,254,56020
ENST00000515273121,989,163–122,254,56020
ENST00000515603121,989,163–122,254,56020
ENST00001129730121,989,163–122,022,7353
ENST00001140150121,989,163–122,254,56023
ENST00000866908121,994,584–122,254,56020
ENST00000866909121,994,584–122,254,56020
ENST00000866910121,994,584–122,254,56020
ENST00001099338121,994,584–122,079,1454
ENST00001129729121,994,584–122,050,8043
ENST00000866911122,019,255–122,254,56020

顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TACC2 參與微管依賴的細胞核與中心體耦聯,將細胞核和中心體的空間關係連結到微管相關過程。來源亦指出,TACC2 可能參與組織中心體微管;此項作用以可能性表述,並未提供更具體的分子步驟或調控方式。

在神經祖細胞中,TACC2 與中心體介導的細胞間期核遷移(interkinetic nuclear migration,INM)調控過程有關。此敘述依據相似性推定(By similarity),指出 TACC2 涉及調節該核遷移過程的機制,但並未界定它在其中的直接作用,也未描述其影響方向或條件。因此,不能據此將 TACC2 說成直接驅動核移動的因子。

TACC2 也被提出可能具有腫瘤抑制蛋白作用,並可能作為腫瘤進展標記。這些是帶有限定的功能與標記性描述,來源沒有提供足以確認其因果作用、適用腫瘤類型或判定方式的細節。整體而言,現有資料支持 TACC2 與微管、中心體及神經祖細胞核遷移調控的關聯,另列出可能的腫瘤相關角色;各項推論仍應依其證據限定解讀。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 121989163 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TACC2 ENST00000369005 GRCh38 chr10:121988163-121989263 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAATAAAGAAAAGAAAAAAAAAGGATTTGGTCATTGTAAGTGCTATGAAGAATTTAAATAGGCTAAAGGG
ATAGGTGGAGAATAGAAGTTGCATTTTTTCTTTCCCTCCAGATAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG
AGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCTGGGTTCAGGCAGTTCTCCTGCCTTAGCC
TCCTAAATAGCTGGGATAGCAGGCACCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGAGGG
GGTTTTACCATGTTCGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAAGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCA
AAGTGCTGGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCCGACCTGAAAGTTGCTATTTTAGGTGTGATGAGCAG
CACAACATCTTTCCTGAGGAGGTGACATTTGAGATGTGACTTGAATTGTGAGGAGTAATGTGTCATGCAA
AAATACAGGGAAGTCATATTGTAGTCAAAGGCAATAGCAAAAAAAAGTCTTTGGGGTTAAAATAAGTCTG
ACACATTCAAGAAAGTTCAGAAAGGCATACATACCTGTGTTAGAGTAGGTAGCTAGGGGAACATGAGAAG
GGCAGCAGAGGGCATTCCACCCCCACCCCCAACCAGGAATGTCAGGCGACCATCATGTGATGGTCAGGTG
GTTGTTACACTGTTTCTCTAAAATCATCATTGGTTGCAGCCAGCACCAGGGAAAGGCCGGCTCCCAATAG
ATAGAAAACACCTGAAGCTAGTGTCAGCCGCTTCCTGATAAGATCTCAGGAGTTGGGCAAGTGGGCTCAA
GCATGGGCCCTAAGGGGCAAAATGTCAGAGTTTAACTAATATATGACCTTCCTCTAGGAATTCTCGACTG
GCAAGGGAAAAATGCCTCAAATGAGCACGCGCACAACTTCAGTAAACACACTGTGAGTGCGGCCACTCCC
AAGTGCTGGCAGACCACTGCATAAGTGGACAGCCTGCTCCAAGGGAAGGATCAGGAGAGAAGAAACGCAA
ATCCCAGAACCGTGCCAACATATAAAACCCCACATTAAGGGTTGTACAGTG
TACC2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TACC2_1 ↗10:121,989,163正股121,989,114–121,989,173
TACC2_2 ↗10:121,994,632正股121,994,583–121,994,642
TACC2_4 ↗10:122,163,496正股122,163,447–122,163,506
TACC2_3 ↗10:122,163,680正股122,163,631–122,163,690

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_93RFBD · enhancer · 121987693–121987965 · regulatory

· motif · 121990497–121990510 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2948 aa

1 aa2948 aa結構域功能區域
依 O95359 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TACC2 蛋白質長 2,948 個胺基酸,屬於 TACC family,含有 SPAZ 結構域(第 2,315–2,403 位)。序列註解在多個區段標示無序區,包括 N 端及蛋白質中後段;這些區域是序列特徵註解,來源未進一步說明其特定功能。

結構域SPAZ2315–2403 aa
功能區域Disordered1–304 aa
功能區域Disordered314–333 aa
功能區域Disordered392–453 aa
功能區域Disordered465–785 aa
功能區域Disordered825–964 aa
功能區域Disordered985–1050 aa
功能區域Disordered1062–1154 aa
功能區域Disordered1243–1274 aa
功能區域Disordered1296–1400 aa
功能區域Disordered1427–1463 aa
功能區域Disordered1493–1661 aa
功能區域Disordered1675–1705 aa
功能區域Disordered1741–1878 aa
功能區域Disordered1907–2035 aa
功能區域Disordered2052–2460 aa
功能區域Disordered2555–2577 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
目前沒有可用的 PDB 或 AlphaFold DB 模型。
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome

TACC2 被記錄於細胞質與細胞核,也定位於細胞質中的細胞骨架、微管組織中心及中心體。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
AZU-1TACC2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TACC2 與微管有交互作用,並與 YEATS4、GCN5L2 及 PCAF 交互作用;來源未進一步界定這些關係是否代表同一複合體或其功能後果。TACC2 也被記載與 CCDC100/CEP120 交互作用,但此項關係標註為依相似性推定(By similarity)。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TACC2 參與微管依賴的細胞核與中心體耦聯,並涉及調節神經祖細胞中心體介導之細胞間期核遷移(INM)的過程;此項 INM 關聯依相似性推定。TACC2 可能協助組織中心體微管,也可能具有腫瘤抑制蛋白作用或成為腫瘤進展標記。含實驗來源
證據與來源

Plays a role in the microtubule-dependent coupling of the nucleus and the centrosome. Involved in the processes that regulate centrosome-mediated interkinetic nuclear migration (INM) of neural progenitors (By similarity). May play a role in organizing centrosomal microtubules. May act as a tumor suppressor protein. May represent a tumor progression marker

PMID 10749935 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TACC2 與 CCDC100/CEP120 交互作用,此關係依相似性推定;另有資料記載 TACC2 與微管、YEATS4、GCN5L2 及 PCAF 交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CCDC100/CEP120 (By similarity). Interacts with microtubules. Interacts with YEATS4, GCN5L2 and PCAF

PMID 12620397 ↗ · PMID 14767476 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TACC2 的定位記錄包括細胞質、細胞核,以及細胞質中的細胞骨架、微管組織中心與中心體。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome

PMID 10749935 ↗ · PMID 14767476 ↗ · PMID 15304323 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000369005 · 9,704 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATAAGTGGACAGCCTGCTCCAAGGGAAGGATCAGGAGAGA40
41AGAAACGCAAATCCCAGAACCGTGCCAACATATAAAACCC80
81CACATTAAGGGTTGTACAGTGCACTGGGATTTCTCAAGTC120
121ACCCGCTTGGTCCTCTTCCAAGTATACTTTACTTCCTTTC160
161ATTCCTCTCTAAAACTTTTTTAAAAACTTTCACTCCTGCT200
201CTAAAAGTTATCTTGGTTTCTTACTCTACCTTATGCCCCT240
241TGGGCGAATTTTTTCCTCTGAGGAGGGAAGAATAGAGTTG280
281CTGCTGCAGACACATCAGATTCCCTACTGGTAACAGCTGG320
321AGTGCGTCACCTCTGACAAAATTCTGGGGACGCTGGGAAC360
361ACTGAATCAACATGGGCAATGAGAACAGCACCTCGGACAA400
401CCAGAGGACTTTATCAGCTCAGACTCCAAGGTCCGCGCAG440
441CCACCCGGGAACAGTCAGAATATAAAAAGGAAGCAGCAGG480
481ACACGCCCGGAAGCCCTGACCACAGAGACGCGTCCAGCAT520
521TGGCAGCGTTGGGCTTGGAGGCTTCTGCACCGCTTCTGAG560
561AGTTCTGCCAGCCTGGATCCATGCCTTGTGTCCCCAGAGG600
601TGACTGAGCCAAGGAAGGACCCACAGGGAGCCAGGGGGCC640
641AGAAGGTTCTTTGCTGCCCAGCCCACCACCGTCCCAGGAG680
681CGAGAGCACCCCTCGTCCTCCATGCCCTTTGCCGAGTGTC720
721CCCCGGAAGGTTGCTTGGCAAGTCCAGCAGCGGCACCTGA760
761AGATGGTCCTCAGACTCAGTCTCCCAGGAGGGAACCTGCC800
801CCAAATGCCCCAGGAGACATCGCGGCGGCATTTCCCGCTG840
841AGAGGGACAGCTCTACTCCATACCAAGAGATTGCTGCCGT880
881CCCCAGTGCTGGAAGAGAGAGACAGCCGAAGGAAGAAGGA920
921CAGAAGTCCTCCTTCTCCTTCTCCAGTGGCATCGACCAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。