演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TACC1

transforming acidic coiled-coil containing protein 1

TACC1 是 TACC 家族的蛋白質,與核受體調控的轉錄、細胞分裂相關過程及多種蛋白質互作有關。

Homo sapiens8p11.22UniProt O75410
OFFICIAL SYMBOL
TACC1
CHROMOSOME
8
UNIPROT
O75410
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TACC1(transforming acidic coiled-coil containing protein 1)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 TACC 家族。其來源資料指出,TACC1 與核受體誘導的轉錄調控有關,也可能參與分化組織形成前、促進細胞分裂的過程。蛋白質序列註解包含兩個 SPAZ 結構域,以及多段無序區域;另標示有兩個雙部分核定位訊號。這些特徵描述了 TACC1 的家族歸屬與序列組成,來源未進一步說明各結構特徵的作用機制。

Official symbol
TACC1
Gene name
transforming acidic coiled-coil containing protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11522
UniProt
O75410
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p11.22
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegTACC1pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:38,728,157–38,853,028
Gene span
124,872 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000317827 ★38,787,236–38,853,02813
ENST0000052034038,728,157–38,839,44910
ENST0000099061938,728,157–38,853,02814
ENST0000088531938,728,166–38,853,02812
ENST0000051941638,728,186–38,853,02813
ENST0000052061538,728,190–38,853,02813
ENST0000088532138,728,213–38,853,02814
ENST0000094362638,728,292–38,853,02813
ENST0000088532538,728,302–38,853,02815
ENST0000088532038,728,314–38,853,02812
ENST0000101616338,728,420–38,853,02815
ENST0000088532638,728,490–38,853,02815

顯示 12/55 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TACC1 與核受體所誘導的轉錄調控有關,來源列出的訊號途徑包括甲狀腺素 T3 與 all-trans retinoic acid。資料也指出,TACC1 可能促進核受體進入細胞核;此項描述帶有可能性,並未將它表述為已確立的作用機制。

此外,TACC1 可能參與促進細胞分裂的過程,時間上是在分化組織形成之前。來源未進一步說明這項作用涉及哪些細胞分裂步驟,也未交代它與核受體相關轉錄調控之間是否存在直接因果關係。因此,TACC1 的功能資料涵蓋核受體相關的轉錄調控,以及分化組織形成前的細胞分裂相關過程,但後者同樣以可能參與的方式描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 38787236 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TACC1 ENST00000317827 GRCh38 chr8:38786236-38787336 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGGTTTTGAGAGGAACAATCCCTACATGAAATCCCTCCATGGGAAATGGAGAACATCAGCTATTTCCCA
TTGCCTTCAAACCTAAAGATGTCGCCAGGCCTCTTGGCTTGTTACTGAAGCAGCGAAATAAGTCAGAAAT
CAAAGACTTAGAAGTTACGAAAAGAAAATCTCAAAAAGGAGAATGGGGTCAGGCGCGGTGTCAGGCCTGG
AATCCTAGCATTTTGGGAGGCAGAGGCGGGAGGATCGCTTGTGGCCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCA
ACATATCGAGACGCCTGTCTGTATTTTAAATAAATAAATATGGAGAATGGGAAACCCATCAGGCTGTAAT
CTCACAGGGAATTTAGTACCCTTTACCTAAGACAAGACCTGGGCACTTGGGAAGCCTCCCCGAGTGCGGT
TTGGGGAGGGGGAGGGCATCTTAAATTCCAGTCCTCGGTCACTCTTGTGGCTTTGCCAAGGGATTTTCAA
ATCCCGGGAATGCCAGGGATGGAGATGAACAGGCTGAAATCCCCCACGCTGCCAGGGTTAGGGAGGGGAA
AACAACAGTCCACAGCGGCCGCGAAGGTTTGTATTTTTTTTTTTTTGGTAACAAGGGGCTTGTGTGCAGT
CCAATATCACCATCGCCGTGAAGTCACAGTGGCAAGATGAAAATGTTTAAAAAAATTTTAAAAAGGAATA
AGGAAAGAGGAAGAGGACAGCGTGCCCCGGCTCAGAAAACGGTCCTCCTCTGCCCCGGACGCCGGCGGAC
CTGTGGGGTATGACCGAATCTCCCCGCGCAGCCGGCAAGCCCCGGCCCTCAGTCGGGCCGCGACCAGCGT
GACGCCGCGGTAGGGGGATCCGGCGGGCGCGCGGCCGTCTTCAAAGCCCCGGCGCCGCCGCCGCCCCCGC
GCGCGCGCGCGAGTAGTACGGTCCGAGGGGGCGGCTTCTGGGGCGCGGCTCCGGCGGCAGCTGATGCGCG
CCCCGCCGGCCGGGAGGCGGGAGTCCGCGAGCCGGGAGCGGGAGCAGCAGAGGTCTAGCAGCCGGGCGCC
GCGGGCCGGGGGCCTGAGGAGGCCACAGGACGGGCGTCTTCCCGGCTAGTG
TACC1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TACC1_3 ↗8:38,728,582正股38,728,533–38,728,592
TACC1_2 ↗8:38,757,277正股38,757,228–38,757,287
TACC1_1 ↗8:38,787,237正股38,787,188–38,787,247

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_C5SWN · enhancer · 38784737–38786370 · regulatory

ENSR8_5C5BF2 · CTCF_binding_site · 38785172–38785193 · regulatory

ENSR8_5C5BLB · CTCF_binding_site · 38786313–38786334 · regulatory

ENSR8_B9NSJ · promoter · 38786746–38787273 · regulatory

ENSR8_9KDNC · promoter · 38787616–38788116 · regulatory

ENSR8_5C5C84 · CTCF_binding_site · 38789941–38789962 · regulatory

· motif · 38784303–38784315 · motif

· motif · 38784667–38784680 · motif

· motif · 38784667–38784680 · motif

· motif · 38784668–38784681 · motif

· motif · 38784668–38784681 · motif

· motif · 38785131–38785141 · motif

· motif · 38785143–38785153 · motif

· motif · 38785149–38785159 · motif

· motif · 38785174–38785190 · motif

· motif · 38785595–38785601 · motif

· motif · 38785772–38785784 · motif

· motif · 38785774–38785789 · motif

· motif · 38785776–38785791 · motif

· motif · 38785964–38785970 · motif

· motif · 38786315–38786331 · motif

· motif · 38786649–38786657 · motif

· motif · 38786649–38786664 · motif

· motif · 38786880–38786895 · motif

· motif · 38786898–38786912 · motif

· motif · 38786930–38786950 · motif

· motif · 38786937–38786950 · motif

· motif · 38787129–38787142 · motif

· motif · 38787135–38787148 · motif

· motif · 38787167–38787180 · motif

· motif · 38787226–38787240 · motif

· motif · 38787247–38787261 · motif

· motif · 38787581–38787591 · motif

· motif · 38787634–38787649 · motif

· motif · 38788203–38788213 · motif

· motif · 38788244–38788257 · motif

· motif · 38788544–38788561 · motif

· motif · 38788591–38788606 · motif

· motif · 38789943–38789959 · motif

· motif · 38791639–38791650 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:805 aa

1 aa805 aa結構域功能區域基序
依 O75410 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TACC1 蛋白質長 805 個胺基酸,屬於 TACC 家族,序列中註記有 SPAZ 1 與 SPAZ 2 兩個結構域。另有數段無序區域,以及與不同互作對象相關的區域;序列註解也標示兩個雙部分核定位訊號。

結構域SPAZ 1215–297 aa
結構域SPAZ 2359–507 aa
功能區域Interaction with LSM7 and SNRPG2–55 aa
功能區域Disordered23–140 aa
功能區域Interaction with TDRD7152–259 aa
功能區域Interaction with YEATS4206–427 aa
功能區域Disordered215–457 aa
功能區域Disordered493–526 aa
功能區域Interaction with CH-TOG701–805 aa
基序Bipartite nuclear localization signal 1226–241 aa
基序Bipartite nuclear localization signal 2455–471 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75410…

AlphaFold · O75410

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome;Midbody;Membrane

TACC1 在間期位於細胞核;有絲分裂期間則弱度集中於中心體,並於細胞質分裂時在中體與 AURKC 共定位。 不同異構型的定位註記有所差異:Isoform 5 標示為膜/脂質錨定,Isoform 10 則位於細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Midbody;Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 20 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TACC1TACC1BTRCCKAP5HTTMEMO1SH2D4ASTX5TDRD7THAP12YEATS4LSM7SNRPGAURKBBTRCBTRCERCC4FAM50BTHRAZFHX3ZNF48Thra
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TACC1 與 CH-TOG、YEATS4、AURKA、AURKB、AURKC、LSM7、TDRD7、SNRPG、GCN5L2 及 PCAF 有互作紀錄。它也與 THRA、THRB 及其他核受體互作;與 THRA isoform alpha-2 的互作較突出。T3 存在時,TACC1 與 THRA isoform alpha-1、THRB 的互作減少;與 ESR1、NR3C1、PPARG、RARA、RXRA 的互作則較偏向發生於缺乏相應荷爾蒙配體時。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TACC1 與核受體誘導的轉錄調控有關,涵蓋甲狀腺素 T3 與 all-trans retinoic acid 路徑;它可能促進核受體定位至細胞核。此外,TACC1 可能參與分化組織形成前促進細胞分裂的過程。含實驗來源
證據與來源

Involved in transcription regulation induced by nuclear receptors, including in T3 thyroid hormone and all-trans retinoic acid pathways. Might promote the nuclear localization of the receptors. Likely involved in the processes that promote cell division prior to the formation of differentiated tissues

PMID 20078863 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TACC1 與 CH-TOG、YEATS4、AURKA、AURKB、AURKC、LSM7、TDRD7、SNRPG、GCN5L2 及 PCAF 互作,也與 THRA、THRB 等核受體互作,且較常與 THRA isoform alpha-2 互作。T3 存在時,與 THRA isoform alpha-1、THRB 的互作減少;與 ESR1、NR3C1、PPARG、RARA、RXRA 的互作則較偏向缺少荷爾蒙配體時發生。含實驗來源
證據與來源

Interacts with KIAA0097/CH-TOG and with the oncogenic transcription factor YEATS4. Interacts with AURKA, AURKB and AURKC. Interacts with LSM7, TDRD7 and SNRPG. Interacts with GCN5L2 and PCAF. Interacts with the thyroid hormone receptors THRB and THRA, predominantly with isoform alpha-2. The interaction with THRA isoform alpha-1 and THRB is decreased in the presence of thyroid hormone T3. Also interacts with other nuclear receptors, including ESR1, NR3C1, PPARG, RARA and RXRA, preferentially in the absence of their hormonal ligands

PMID 11903063 ↗ · PMID 12165861 ↗ · PMID 14603251 ↗ · PMID 14767476 ↗ · PMID 15064709 ↗ · PMID 20078863 ↗ · PMID 21531210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TACC1 位於細胞質與細胞核;間期時位於細胞核,有絲分裂期間則弱度集中於中心體。細胞分裂時,TACC1 也會在中體與 AURKC 共定位。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Midbody; Nucleus during interphase. Weakly concentrated at centrosomes during mitosis and colocalizes with AURKC at the midbody during cytokinesis

PMID 14767476 ↗ · PMID 21531210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 5; Membrane / Lipid-anchor推論支持
證據與來源

Isoform 5; Membrane / Lipid-anchor

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TACC1 的 Isoform 10 定位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Isoform 10; Cytoplasm

PMID 20078863 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000317827 · 7,770 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGTCCGCGAGCCGGGAGCGGGAGCAGCAGAGGTCTAGCA40
41GCCGGGCGCCGCGGGCCGGGGGCCTGAGGAGGCCACAGGA80
81CGGGCGTCTTCCCGGCTAGTGGAGCCCGGCGCGGGGCCCG120
121CTGCGGCCGCACCGTGAGGGGAGGAGGCCGAGGAGGACGC160
161AGCGCCGGCTGCCGGCGGGAGGAAGCGCTCCACCAGGGCC200
201CCCGACGGCACTCGTTTAACCACATCCGCGCCTCTGCTGG240
241AAACGCTTGCTGGCGCCTGTCACCGGTTCCCTCCATTTTG280
281AAAGGGAAAAAGGCTCTCCCCACCCATTCCCCTGCCCCTA320
321GGAGCTGGAGCCGGAGGAGCCGCGCTCATGGCGTTCAGCC360
361CGTGGCAGATCCTGTCCCCCGTGCAGTGGGCGAAATGGAC400
401GTGGTCTGCGGTACGCGGCGGGGCCGCCGGCGAGGACGAG440
441GCTGGCGGGCCCGAGGGCGACCCCGAGGAGGAGGATTCGC480
481AAGCCGAGACCAAATCCTTGAGTTTCAGCTCGGATTCTGA520
521AGGTAATTTTGAGACTCCTGAAGCTGAAACCCCGATCCGA560
561TCACCTTTCAAGGAGTCCTGTGATCCATCACTCGGATTGG600
601CAGGACCTGGGGCCAAAAGCCAAGAATCACAAGAAGCTGA640
641TGAACAGCTTGTAGCAGAAGTGGTTGAAAAATGTTCATCT680
681AAGACTTGTTCTAAACCTTCAGAAAATGAAGTGCCACAGC720
721AGGCCATTGACTCTCACTCAGTCAAGAATTTCAGAGAAGA760
761ACCTGAACATGATTTTAGCAAAATTTCCATCGTGAGGCCA800
801TTTTCAATAGAAACGAAGGATTCCACGGATATCTCGGCAG840
841TCCTCGGAACAAAAGCAGCTCATGGCTGTGTAACTGCAGT880
881CTCAGGCAAGGCTCTGCCTTCCAGCCCGCCAGACGCCCTC920
921CAGGACGAGGCGATGACAGAAGGCAGCATGGGGGTCACCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。