演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TAC3ZNEUROK1

tachykinin precursor 3

TAC3 編碼 tachykinin precursor 3,屬於 tachykinin 家族;其產物可作為 TACR3 的配體,並與性腺功能調節有關。

Homo sapiens12q13.3UniProt Q9UHF0
OFFICIAL SYMBOL
TAC3
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q9UHF0
PDB / ALPHAFOLD
1P9F
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TAC3 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 tachykinin precursor 3,所產生的蛋白質屬於 tachykinin 家族。來源將 tachykinins 描述為具有生物活性的胜肽,可作用於神經活動、行為反應、血管與分泌功能,以及平滑肌收縮。TAC3 產物亦可作為 TACR3 的配體,與性腺功能調節相關。蛋白質序列長 121 個胺基酸,N 端註有訊號區,C 端部分則被註解為無序區。這些資訊概述其家族歸屬、基本分子性質與主要生物學角色;具體的受體訊號作用另於功能段落說明。

Official symbol
TAC3
Gene name
tachykinin precursor 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11521
UniProt
Q9UHF0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNEUROK1NKBNK3LncZBTB39-1:2LncZBTB39NKNB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.3
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegTAC3pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:57,010,000–57,028,883
Gene span
18,884 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000458521 ★57,010,000–57,016,5297
ENST0000044188157,010,000–57,016,5596
ENST0000041523157,010,000–57,028,8837
ENST0000087242357,010,000–57,016,5596
ENST0000092210857,010,000–57,016,5597
ENST0000110191457,010,000–57,022,4398
ENST0000114332757,010,000–57,016,5597

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TAC3 產物是 TACR3 的配體。配體與 TACR3 結合後,可啟動 G 蛋白偶聯受體訊號:其中一條路徑涉及 G(q) 活化,並由 phospholipase C 引發 phosphatidylinositol 水解。來源另指出,TACR3 結合也會促進 adenylate cyclase 活性,使細胞內 cyclic AMP(cAMP)增加;此訊號描述標示為依相似性推定,應與有明確實驗文獻支持的 G(q) 路徑區分。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57016529 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TAC3 ENST00000458521 GRCh38 chr12:57016429-57017529 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACGAAGAAATAAGTAGCCCTGTATAGTAGTAATACTTTGTTGTGAATAACTGTCATAAGTCATCTCTAA
AACTGTATTTTTTATCTAGTTATTATATATGACTAGCTATATGTCTAGTTTTTTAAATAATACAAAGTAA
TTTATTTTTGGCATCCTCAAAAACCAAAGAGATTAGGTAATGTAGTGTAGAAGAGAGCAGAGCTTTAGAC
CTGAGAAGAATCTGCCCATGACTCGTGAAACTCCACAACGAAAGTAGGAGACCCCAAAAAAGGGGTGAGT
GTCATCTTTTCTGAATTTTTTTTTTTTTTTAGATGGAGTCTTGCTCTGCCACCAGGCTGGAGTGCAGTGG
TGCAATCTCGGCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCACGCGCCACCATGACCAGCTAATTTTTG
TATTTTTAGTAGAGACAGCGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCGTGATCCGC
CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGCACTCGGCCGGTCAGATAATTTTT
TTGGCCAGTTTTTACATAGAGTAATTTTAGGTTTTATGGCTGGCTTTGGGGCAAAGGGGTTCTGGTTTTT
ATAGCTGGTCTTGGGGGAGAATGGAACCGAGTGACAAGAGGACAAGAGAGGGTCAGAGAAAAACTTCTGC
TTCTGAGGCGGCTATTGAGGCCTTCATTTTGGAGTATTGTCCTCTAAGCCCCAGCAGTGTCAAACTGTAC
ACAAACCATACACAGCAGCCAGCTCGGGTGCTGTTAGGAAATGGTCTCACTGCTGGGTCTGTGGGGTATG
TGTGTGTCTGGGTGTGTGGCTACTGTCTGCATCCTCCTCCCCCCTACAGCCTCCCCGCCTCCCCTCCAGC
CACCCTGGGATTGGTGACTCTCAGCCCCTCCCCTCAGCTCCCCTAGACCCTCCCAGAGCCTTTATCAGGG
AGCTGGGACTGAGTGACTGCAGCCTTCCTAGATCCCCTCCACTCGGTTTCTCTCTTTGCAGGAGCACCGG
CAGCACCAGTGTGTGAGGGGAGCAGGCAGCGGTCCTAGCCAGTTCCTTGAT
TAC3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TAC3_1 ↗12:57,016,529負股57,016,519–57,016,578

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_5HF3WR · CTCF_binding_site · 57013143–57013164 · regulatory

ENSR12_83N93L · enhancer · 57016294–57016509 · regulatory

ENSR12_83N93P · promoter · 57016510–57016762 · regulatory

· motif · 57011684–57011692 · motif

· motif · 57013145–57013161 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:121 aa

1 aa121 aa功能區域訊號胜肽
依 Q9UHF0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tachykinin precursor 3 長 121 個胺基酸,屬於 tachykinin 家族。其第 1 至 16 個胺基酸為訊號區;第 93 至 121 個胺基酸區段則註解為無序區。

訊號胜肽1–16 aa
功能區域Disordered93–121 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1P9F…

PDB · 1P9F

NMR · - · A=81-90

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

TAC3 產物被註記為分泌型;來源未提供進一步的定位條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNEUROK1TAC3JPH3PRB1A0A087WZY1TACR3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TAC3 與下丘腦性性腺功能低下症 10(可伴或不伴嗅覺缺失)相關。此病症的描述包括 18 歲時性成熟缺失或不完全,並伴隨循環促性腺激素與睪固酮偏低,且下視丘—腦下垂體軸沒有其他異常;部分病例也有嗅覺缺失、腭裂或感音神經性聽力損失。資料指出,影響 TAC3 的變異可導致此病,但未在此列出特定變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Tachykinins 是具有生物活性的胜肽,可促使神經元興奮並引發行為反應,也具有強效血管舒張與促分泌作用;此外,它們能直接或間接使多種平滑肌收縮。資料庫紀錄
證據與來源

Tachykinins are active peptides which excite neurons, evoke behavioral responses, are potent vasodilators and secretagogues, and contract (directly or indirectly) many smooth muscles

開啟資料庫紀錄 ↗

功能TAC3 產物是 TACR3 的配體,可藉由活化 G(q) 並促使 phospholipase C 水解 phosphatidylinositol,啟動 G 蛋白偶聯受體訊號。依相似性推定,與 TACR3 結合也會活化 adenylate cyclase,使細胞內 cyclic AMP(cAMP)增加。資料亦指出該產物是性腺功能的重要中樞調節因子,其中部分證據標示為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Is a ligand for TACR3, and triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of G(q) and phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Binding to TACR3 also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) (By similarity). Is a critical central regulator of gonadal function (By similarity)

PMID 19079066 ↗ · PMID 37391393 ↗

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細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯下丘腦性性腺功能低下症 10 可伴或不伴嗅覺缺失,患者在 18 歲時性成熟可能缺失或不完全,並有循環促性腺激素與睪固酮偏低,且下視丘—腦下垂體軸沒有其他異常。部分病例伴隨嗅覺缺失、腭裂或感音神經性聽力損失;嗅覺缺失或減退與嗅球及嗅束缺失或發育不全有關。性腺功能低下歸因於 gonadotropin-releasing hormone 不足,可能源自胚胎期合成該激素的神經元遷移失敗。有嗅覺缺失時稱為 Kallmann syndrome;嗅覺正常時稱為 normosmic idiopathic hypogonadotropic hypogonadism(nIHH)。資料指出,影響 TAC3 的變異可導致此病。含實驗來源
證據與來源

Hypogonadotropic hypogonadism 10 with or without anosmia HH10 A disorder characterized by absent or incomplete sexual maturation by the age of 18 years, in conjunction with low levels of circulating gonadotropins and testosterone and no other abnormalities of the hypothalamic-pituitary axis. In some cases, it is associated with non-reproductive phenotypes, such as anosmia, cleft palate, and sensorineural hearing loss. Anosmia or hyposmia is related to the absence or hypoplasia of the olfactory bulbs and tracts. Hypogonadism is due to deficiency in gonadotropin-releasing hormone and probably results from a failure of embryonic migration of gonadotropin-releasing hormone-synthesizing neurons. In the presence of anosmia, idiopathic hypogonadotropic hypogonadism is referred to as Kallmann syndrome, whereas in the presence of a normal sense of smell, it has been termed normosmic idiopathic hypogonadotropic hypogonadism (nIHH). The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614839

PMID 19079066 ↗ · PMID 23643382 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000458521 · 804 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCTTCCTAGATCCCCTCCACTCGGTTTCTCTCTTTGCA40
41GGAGCACCGGCAGCACCAGTGTGTGAGGGGAGCAGGCAGC80
81GGTCCTAGCCAGTTCCTTGATCCTGCCAGACCACCCAGCC120
121CCCGGCACAGAGCTGCTCCACAGGCACCATGAGGATCATG160
161CTGCTATTCACAGCCATCCTGGCCTTCAGCCTAGCTCAGA200
201GCTTTGGGGCTGTCTGTAAGGAGCCACAGGAGGAGGTGGT240
241TCCTGGCGGGGGCCGCAGCAAGAGGGATCCAGATCTCTAC280
281CAGCTGCTCCAGAGACTCTTCAAAAGCCACTCATCTCTGG320
321AGGGATTGCTCAAAGCCCTGAGCCAGGCTAGCACAGATCC360
361TAAGGAATCAACATCTCCCGAGAAACGTGACATGCATGAC400
401TTCTTTGTGGGACTTATGGGCAAGAGGAGCGTCCAGCCAG440
441ACTCTCCTACGGATGTGAATCAAGAGAACGTCCCCAGCTT480
481TGGCATCCTCAAGTATCCCCCGAGAGCAGAATAGGTACTC520
521CACTTCCGGACTCCTGGACTGCATTAGGAAGACCTCTTTC560
561CCTGTCCCAATCCCCAGGTGCGCACGCTCCTGTTACCCTT600
601TCTCTTCCCTGTTCTTGTAACATTCTTGTGCTTTGACTCC640
641TTCTCCATCTTTTCTACCTGACCCTGGTGTGGAAACTGCA680
681TAGTGAATATCCCCAACCCCAATGGGCATTGACTGTAGAA720
721TACCCTAGAGTTCCTGTAGTGTCCTACATTAAAAATATAA760
761TGTCTCTCTCTATTCCTCAACAATAAAGGATTTTTGCATA800
801TGAA804

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。