基因總覽
TAC1(tachykinin precursor 1)是蛋白質編碼基因,其產物 Protachykinin-1 屬於 tachykinin family。這個前驅蛋白長 129 個胺基酸,序列 N 端第 1 至 19 位標註為訊號胜肽;來源將其細胞定位記為分泌。Tachykinins 是具有活性的胜肽,能影響神經元及多種生理反應。TAC1 產物所涉及的胜肽訊號,與神經活動、血管舒張、分泌反應和平滑肌收縮等作用相關;具體受體與訊號方式則見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000319273 ★ | 97,732,086–97,740,472 | 7 |
| ENST00000350485 | 97,731,907–97,740,472 | 6 |
| ENST00000346867 | 97,731,907–97,740,472 | 6 |
| ENST00000864055 | 97,731,907–97,740,472 | 5 |
| ENST00001141070 | 97,731,907–97,740,472 | 7 |
| ENST00000962701 | 97,732,181–97,740,472 | 7 |
| ENST00000926836 | 97,732,346–97,740,472 | 7 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Tachykinins 是活性胜肽,可興奮神經元並引發行為反應,也能促進血管舒張與分泌,並直接或間接使多種平滑肌收縮。這些作用顯示 TAC1 相關胜肽可影響神經及周邊組織反應;來源未進一步限定各項作用的組織或生理情境。
Substance P 可作為 TACR1 的配體,啟動 G 蛋白偶聯受體訊號。其作用包括經 phospholipase C 促進 phosphatidylinositol 水解;與 TACR1 結合也可活化 adenylate cyclase,使細胞內 cyclic AMP(cAMP)增加。這些受體訊號的部分描述標示為依相似性推定。Substance P 也能活化 TACR3,但對該受體的親和力較低。
Substance P 是由特定感覺神經末梢釋出的鹼性分泌素神經胜肽,也可與肥大細胞上的 MRGPRX2 結合。此作用會啟動與神經源性發炎及疼痛相關的訊號。神經源性發炎涉及肥大細胞活化、免疫細胞募集,以及細胞激素和趨化因子等發炎介質釋放;這些反應之後可能活化或使傷害感受器敏化,進而促進疼痛。上述發炎後續反應亦有依相似性推定的部分。
此外,TAC1 相關胜肽可作為 TACR2 配體,透過 G(q) 活化及 phospholipase C 促進 phosphatidylinositol 水解;與 TACR2 結合也會活化 adenylate cyclase,增加細胞內 cAMP。這些受體途徑呈現 TAC1 相關胜肽如何連結細胞表面受體與細胞內訊號,但來源未提供其在特定生理情境中的相對貢獻。
Promoter 與基因調控
>TAC1 ENST00000319273 GRCh38 chr7:97731086-97732186 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAAGGGCTCATGGAAAGGTGTGGTTTCTGTACAAATGCTATTTGTCTAATATTTTGTGCTGTTAATGACT GTCCCATTAGCATCTTCACTACACTTACTTTCATAGAAAGGAGAAACATGATTTATAGAGCCCTTTAGTG ACAAGGGTGAGGATCCTACACACTATGTTGCTGGTTTCCTAGTCTTCAGCAAGAAAGTGTAGGAGAGAAG CAAAAAACGTCCTGTTCAACCCCTGCTCCTGGATGTGGCAAGGAAGAGGAGTTACCCGGCTTGAAACAAA AGAAATCCTAAGTCTGACACACAATGTCATGTTTAAATTCCCCTTTCTCCAAAATGTAAAATAAATCTGC TTCCATCTTCTAAAATACTATGGGACTAAACATCCTTTTGTTATGCTAAGGAAAAGCCAGTATTCGCGTT GATTTAGAAGAGGGATGTTCTGGTTATAGAACGATGCTGTGTCTCAGAAACACTTAAATACTATTAAGCT AGAAATAGAAGGGAAAATAATGCTTCCCCGCATCTCCCCTCAAGTGTAGTCCTCTTTTTTTAGCCTGATT TCCGACGAAATGTCTGAATGCCTACAGTTATTTGGCCATCCTGAAAAGTGCAACTTATCCTGACGTCTCG AGGGACGGAAAAGTTACCGAAGTCCAAGGAATGAGTCACTTTGCTCAAATTTGATGAGTAATATCAGGTG TCATGAAACCCAGTTTCGAAGGAGAGGGGAGGGGGCGTCAGATCTGCAGACGGAAGCAGGCCGCTCCGGA TTGGATGGCGAGACCTCGATTTTCCTAAAATTGCGTCATTTAGAACCCAATTGGGTCCAGATGTTATGGG CATCGACGAGTTACCGTCTCGGAAACTCTCAATCACGCAAGCGAAAGGAGAGGAGGCGGCTAATTAAATA TTGAGCAGAAAGTCGCGTGGGGAGAATGTCACGTGGGTCTGGAGGCTCAAGGAGGCTGGGATAAATACCG CAAGGCACTGAGCAGGCGAAAGAGCGCGCTCGGACCTCCTTCCCGGCGGCAGCTACCGAGAGTGCGGAGC GACCAGCGTGCGCTCGGAGGAACCAGAGAAACTCAGCACCCCGCGGGACTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TAC1_2 ↗ | 7:97,731,908 | 正股 | 97,731,859–97,731,918 |
| TAC1_1 ↗ | 7:97,732,086 | 正股 | 97,732,037–97,732,096 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:129 aa
Protachykinin-1 長 129 個胺基酸,屬於 tachykinin family。其序列第 1 至 19 位註解為訊號胜肽;來源未提供其他結構域或功能區域的資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將此蛋白質記為分泌;另有 Substance P 分泌的定位註記。 資料未描述定位隨條件改變的情形或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- TACR1P25103 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TACR2P21452 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Tachykinins 是具有活性的胜肽,可興奮神經元、引發行為反應、強力促進血管舒張與分泌,並直接或間接使多種平滑肌收縮。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Tachykinins are active peptides which excite neurons, evoke behavioral responses, are potent vasodilators and secretagogues, and contract (directly or indirectly) many smooth muscles |
| 功能 | Substance P 是 TACR1 的配體,可透過 phospholipase C 促進 phosphatidylinositol 水解,並可活化 adenylate cyclase、提高細胞內 cAMP;後述部分訊號為依相似性推定。它也是親和力較低的 TACR3 致效劑,並由特定感覺神經末梢釋出。Substance P 與肥大細胞 MRGPRX2 結合後,可啟動涉及神經源性發炎與疼痛的訊號;相關發炎反應包括肥大細胞活化、免疫細胞募集及發炎介質釋放,之後可能活化或使傷害感受器敏化,促進疼痛,其中部分描述為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Is a ligand for TACR1, and triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Substance P binding to TACR1 also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) (By similarity). Is also a TACR3 agonist with low receptor affinity. Basic secretagogue neuropeptide released from the terminals of specific sensory nerves. Acts as a ligand for MRGPRX2 receptor in mast cells, initiating a signaling that mediates neurogenic inflammation and pain. Neurogenic inflammation includes mast cell activation, recruitment of immune cells and release of inflammatory mediators, such as cytokines and chemokines (By similarity). The inflammatory response can then activate or sensitize nociceptors, promoting pain (By similarity) PMID 30686732 ↗ · PMID 34789875 ↗ · PMID 37391393 ↗ |
| 功能 | TAC1 相關胜肽是 TACR2 的配體,可經由 G(q) 活化及 phospholipase C 促進 phosphatidylinositol 水解;與 TACR2 結合也會活化 adenylate cyclase,使細胞內 cAMP 增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Is a ligand for TACR2, and triggers G protein-coupled receptor signaling via activation of G(q) and phosphatidylinositol hydrolysis by phospholipase C. Binding to TACR2 also triggers signaling via activation of adenylate cyclase activity which results in increased intracellular levels of cyclic AMP (cAMP) PMID 35882833 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Substance P; Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCGCGCTCGGACCTCCTTCCCGGCGGCAGCTACCGAG40AGTGCGGAGCGACCAGCGTGCGCTCGGAGGAACCAGAGAA80ACTCAGCACCCCGCGGGACTGTCCGTCGCAAAATCCAACA120TGAAAATCCTCGTGGCCTTGGCAGTCTTTTTTCTTGTCTC160CACTCAGCTGTTTGCAGAAGAAATAGGAGCCAATGATGAT200CTGAATTACTGGTCCGACTGGTACGACAGCGACCAGATCA240AGGAGGAACTGCCGGAGCCCTTTGAGCATCTTCTGCAGAG280AATCGCCCGGAGACCCAAGCCTCAGCAGTTCTTTGGATTA320ATGGGCAAACGGGATGCTGATTCCTCAATTGAAAAACAAG360TGGCCCTGTTAAAGGCTCTTTATGGACATGGCCAGATCTC400TCACAAAAGACATAAAACAGATTCCTTTGTTGGACTAATG440GGCAAAAGAGCTTTAAATTCTGTGGCTTATGAAAGGAGTG480CAATGCAGAATTATGAAAGAAGACGTTAATAAACTACCTA520ACATTATTTATTCAGCTTCATTTGTGTCAATGGGCAATGA560CAGGTAAATTAAGACATGCACTATGAGGAATAATTATTTA600TTTAATAACAATTGTTTGGGGTTGAAAATTCAAAAAGTGT640TTATTTTTCATATTGTGCCAATATGTATTGTAAACATGTG680TTTTAATTCCAATATGATGACTCCCTTAAAATAGAAATAA720GTGGTTATTTCTCAACAAAGCACAGTGTTAAATGAAATTG760TAAAACCTGTCAATGATACAGTCCCTAAAGAAAAAAAATC800ATTGCTTTGAAGCAGTTGTGTCAGCTACTGCGGAAAAGGA840AGGAAACTCCTGACAGTCTTGTGCTTTTCCTATTTGTTTT880CATGGTGAAAATGTACTGAGATTTTGGTATTACACTGTAT920TTGTATCTCTGAAGCATGTTTCATGTTTTGTGACTATATA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。