基因總覽
SYNGR4 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 synaptogyrin 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19q13.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344846 ★ | 48,364,367–48,376,377 | 5 |
| ENST00001098040 | 48,364,260–48,376,377 | 5 |
| ENST00001098041 | 48,364,360–48,376,377 | 5 |
| ENST00001098042 | 48,364,367–48,376,377 | 5 |
| ENST00001098043 | 48,364,367–48,376,377 | 4 |
| ENST00000600863 | 48,373,043–48,375,701 | 3 |
| ENST00000601610 | 48,373,103–48,376,376 | 4 |
| ENST00000595322 | 48,373,108–48,376,377 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SYNGR4 ENST00000344846 GRCh38 chr19:48363367-48364467 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCTCCCTGGGGTTCCACATCTTGCGATACTCCCCCATTTTGGCTGCCAGCGATGAGAGGGCCCGGGGGG GCCCGAGGAGCGCGGGCAACAGTGGCCATACTCGGACCCTGGACCCCCAGACCCCCCGGGTCACATGCAG CATGGCTAGACCCTTTCCCCGGAGCCTAAACAGAGGAAAATGGGCAGGGGTCAAAGGCCATCTAGAGGAA AAGCGCCCTCTCCACCTCCACGTCCCACCCTCCAGAAGCCGTCTCTACCCCAGGCAGGGCGCAGAGCCCA TCCGCTCGCCTCAAAGCCCCTGTTGCCTGTCCCCTTCCCACACTGCTCAGTTGGCCTGGGTCCCAGACAG GGGTCAGAGGTCTTAGGTTCTGGGGCGTTTTTCAGGCCCAGAGACCCTGTAGTGGTACAACGTTTCTTTG GGGTCTAGACAGCGAGGTAGATCTTAGGAGAGCAGGAAATGCTCGTAAAGGTTACCTAGGGGGTGCAGGG CCGCCCTCCCTGGCCATGCAATCCCCCGATTTCTCCCTCACCTTAGCCAAAGCTCGACTGTCATTGAGCC TCCTGCGCATGTGCAGGAGGGCGTCCTGGGCTCCCGAGGTTCGGCTTCACCCAGCAGTAAAACGCATGCG CAAAGCTTCGGTCAATGCGGGCTGTCCATTTCTCACCGCCGACTCCCTACATCAACTACGCATGCGTTGC CTGCCTTTCTCCACCGCCGGCCTCGTTTGGGCGCGACGCATGCGCCGCAGGAGTGTCTCCTTGTCAGCTT GCTACAAAGGGAAGGGGCGGTGTGGACGCGAGACTCCCTAGAGGGATGGGGCGGGGTAGGGCTCCCGCGC GCAGTCCGCCAACGGCGCGCAGTCCAACGTTCGCCGAGGCCACGCCCCGGCTCGTGTCAGCTCCTGAGTA GGCGGAAAGAGGGAGGGGGCGGGACTTGGGCGCAGCCAATCAGCTGTGGAGGAGCGAAAAGGCGGGAAAA AGCGGAACCAAAAGAAGGCTGAGGTGGCGCTAGGGACCAGGAGGGGTGGGGGTGGCGAAAGGAAGGGCGG GCCCTCAGGTGACGCAGATTGGCCCTCCAGAGAAGGGGCGGCCCCTTCTCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SYNGR4_1 ↗ | 19:48,364,367 | 正股 | 48,364,318–48,364,377 |
| SYNGR4_2 ↗ | 19:48,364,490 | 正股 | 48,364,441–48,364,500 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_9P7B8 · promoter · 48363928–48364377 · regulatory
ENSR19_BCL67 · enhancer · 48364378–48365184 · regulatory
· motif · 48362863–48362877 · motif
· motif · 48362863–48362877 · motif
· motif · 48363094–48363108 · motif
· motif · 48363094–48363108 · motif
· motif · 48363126–48363135 · motif
· motif · 48363551–48363563 · motif
· motif · 48363553–48363560 · motif
· motif · 48363553–48363566 · motif
· motif · 48363714–48363726 · motif
· motif · 48363716–48363723 · motif
· motif · 48363716–48363729 · motif
· motif · 48363930–48363941 · motif
· motif · 48363930–48363941 · motif
· motif · 48363987–48363998 · motif
· motif · 48363987–48363998 · motif
· motif · 48364002–48364019 · motif
· motif · 48364053–48364064 · motif
· motif · 48364053–48364064 · motif
· motif · 48364101–48364112 · motif
· motif · 48364101–48364112 · motif
· motif · 48364245–48364255 · motif
· motif · 48364291–48364301 · motif
· motif · 48364342–48364362 · motif
· motif · 48364388–48364398 · motif
· motif · 48364392–48364402 · motif
· motif · 48364467–48364480 · motif
· motif · 48364467–48364480 · motif
· motif · 48364476–48364491 · motif
· motif · 48364550–48364560 · motif
· motif · 48364616–48364627 · motif
· motif · 48364616–48364627 · motif
· motif · 48364629–48364649 · motif
· motif · 48364728–48364743 · motif
· motif · 48364758–48364778 · motif
· motif · 48364767–48364789 · motif
· motif · 48364767–48364789 · motif
· motif · 48366060–48366071 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：234 aa
synaptogyrin 4 是長 234 個胺基酸的蛋白質，屬於 synaptogyrin family。其第 18–169 個胺基酸區段含有 MARVEL domain；序列註解預測有四段螺旋型跨膜區，分別位於第 25–45、66–86、104–124 與 145–165 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
synaptogyrin 4 被註解為膜蛋白，具有多次跨膜特性；來源未提供其定位改變條件或不同異構型的定位差異。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | synaptogyrin 4 被註解為膜蛋白，並具有多次跨膜特性；此項資料未進一步說明其具體細胞膜位置、定位條件或實驗證據。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GAGGTGGCGCTAGGGACCAGGAGGGGTGGGGGTGGCGAAA40GGAAGGGCGGGCCCTCAGGTGACGCAGATTGGCCCTCCAG80AGAAGGGGCGGCCCCTTCTCAGGTGCCGTCACCCCCAAAC120CTCAGCACTGCCATTCCAGGTCCTTAAAGGGGAGACCGCG160ATTCTAAGAAGCAGCCAAGCCCAGGGCTGGCCTGAAGCCC200CCGGACGGCAGTGCCCAGCAGGCAGCGCCCAGCACCCTGG240CTCCCACCTCCCAGTGGCCCCAAAGGAAAACAGCTGCCAT280GCACATCCCCAAAAGCCTCCAGGAGCTGGCCAACAGCGAA320GCCGTGCAGTTTCTGAGAAGGCCCAAGACCATCACGCGGG360TCTTCGAAGGGGTCTTCTCCCTGATCGTCTTCTCCTCCCT400GCTGACCGACGGCTACCAGAACAAGATGGAGTCTCCGCAG440CTCCACTGCATTCTCAACAGCAACAGCGTGGCCTGCAGCT480TTGCCGTGGGAGCCGGCTTCCTGGCCTTCCTCAGCTGCCT520GGCCTTCCTCGTCCTGGACACACAGGAGACCCGCATTGCC560GGCACCCGCTTCAAGACAGCCTTCCAGCTCCTGGACTTCA600TCCTGGCTGTTCTCTGGGCAGTTGTCTGGTTCATGGGTTT640CTGCTTCCTGGCCAACCAATGGCAGCATTCGCCGCCCAAA680GAGTTCCTCCTGGGGAGCAGCAGTGCCCAGGCAGCCATCG720CCTTCACCTTCTTCTCCATCCTTGTCTGGATATTCCAGGC760CTACCTGGCATTCCAGGACCTCCGAAATGATGCTCCAGTC800CCTTACAAGCGCTTCCTGGATGAGGGTGGCATGGTGCTGA840CCACCCTCCCCTTGCCCTCTGCCAACAGCCCTGTGAACAT880GCCCACCACTGGCCCCAACAGCCTGAGTTATGCTAGCTCT920GCCCTGTCCCCCTGTCTGACCGCTCCAAAGTCCCCCCGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。