基因總覽
SYNGR2 是蛋白質編碼基因，產物 synaptogyrin 2 屬於 synaptogyrin 家族。此蛋白長 224 個胺基酸，具有四個螺旋跨膜區段，並含有 MARVEL 結構域。來源描述其與細胞內囊泡相關；在神經細胞中，可能參與囊泡相關過程，也被描述為可能與 GLUT4 的儲存及運送有關。SYNGR2 的來源資料亦記載其在 SFTS phlebovirus 感染情境中的作用與定位。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000225777 ★ | 78,168,581–78,172,720 | 4 |
| ENST00000968423 | 78,168,545–78,172,719 | 2 |
| ENST00001002534 | 78,168,545–78,176,005 | 4 |
| ENST00001002535 | 78,168,545–78,172,727 | 3 |
| ENST00000585591 | 78,168,566–78,173,335 | 5 |
| ENST00000589711 | 78,168,566–78,176,005 | 3 |
| ENST00000588282 | 78,168,566–78,172,719 | 3 |
| ENST00000862683 | 78,168,566–78,172,727 | 4 |
| ENST00000862684 | 78,168,566–78,176,005 | 4 |
| ENST00000862685 | 78,168,566–78,172,723 | 2 |
| ENST00000862686 | 78,168,566–78,176,005 | 4 |
| ENST00001054790 | 78,168,566–78,172,720 | 4 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
synaptogyrin 2 可能參與受調控的胞吐作用。於神經細胞中，它會調節 synaptophysin（SYP）在類突觸微囊泡中的定位；因此，可能進一步參與這些囊泡的形成或成熟。來源未將此作用描述為已確立的因果機制，形成與成熟兩者也保留為可能的功能方向。
此外，synaptogyrin 2 可能參與 GLUT4 的儲存，以及 GLUT4 向質膜的運送。來源並未進一步說明此作用的細胞條件或分子步驟。
在 SFTS phlebovirus 感染期間，synaptogyrin 2 可能參與細胞質包涵體的組裝，而這些包涵體是病毒複製所需。此描述指出可能的參與關係，並未表示 synaptogyrin 2 單獨即可促成病毒複製。
Promoter 與基因調控
>SYNGR2 ENST00000225777 GRCh38 chr17:78167581-78168681 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTTGTTGTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACC TCAGGTGATCCAACCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTT GCACACCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG AGTGCAATGGCACAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCAGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG GGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCAACCGCCTCGGCCTCCC AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCTCCCGGCCTTGCACACCATCTTAAGTGTGACGCCACAC TGCCCTTCACAGCCTTGGGGCTCTGCCCAGACCAGGAGGAATGGGGAGGGGGTCTTTGACCCTACCCCAG GCTTAGCCCCAGAGAGGAGGAAAGAGTGGCAGGCCAGGCAGGGAGGGGCTCCAGGGTGTGGCCTGGGTTT TTCAGTGGGATGGGGGAGGGGTTGCTTATGAGCCTGGGTGGGTTCTTGGTAGGTGGTGGGCTTCCTAGAG GAGGCGGTGGGAGGGCAGGGGCAAAGAGGGTGAGCGGTCCTCAGTTCGTCCGTCTTCCCGGGGGACTCTC TGACCCTTTCTGGTCCGTGCTGCGGCCGGCGTGGCCCGGAGACTAGCCCCTCAACCCCGAGGTGGGGTGG ACCCGGGTGCTCCGCGGCCACAGCCCCTCCCCGCCTCTAGAAGCGCAGTCCCGCGGCTCGCCCGCCGCTC GCGAGGGCCGCACTTTGCCCTCGGTCCCTAGCGGCGCCTGGCCACGCCCCCGGCGGGTGGAGTCGGGCGG GGCGCCGGGCAGGTTCCTCTGCGTTCCGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGACGGCGACATGGAGAGCGGGGC CTACGGCGCGGCCAAGGCGGGCGGCTCCTTCGACCTGCGGCGCTTCCTGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SYNGR2_1 ↗ | 17:78,168,581 | 正股 | 78,168,532–78,168,591 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9362NM · enhancer · 78166458–78166775 · regulatory
ENSR17_5NDF4M · CTCF_binding_site · 78166860–78166881 · regulatory
ENSR17_BKHT4 · promoter · 78168091–78168621 · regulatory
ENSR17_9362PB · promoter · 78168668–78169168 · regulatory
ENSR17_5NDG3B · CTCF_binding_site · 78172405–78172426 · regulatory
· motif · 78166862–78166878 · motif
· motif · 78167912–78167923 · motif
· motif · 78167959–78167974 · motif
· motif · 78167964–78167976 · motif
· motif · 78167967–78167974 · motif
· motif · 78168056–78168071 · motif
· motif · 78168126–78168133 · motif
· motif · 78168334–78168347 · motif
· motif · 78168334–78168347 · motif
· motif · 78168347–78168359 · motif
· motif · 78168499–78168512 · motif
· motif · 78168687–78168696 · motif
· motif · 78168792–78168808 · motif
· motif · 78168792–78168808 · motif
· motif · 78169038–78169053 · motif
· motif · 78170481–78170493 · motif
· motif · 78170483–78170490 · motif
· motif · 78170483–78170498 · motif
· motif · 78170990–78171001 · motif
· motif · 78171407–78171420 · motif
· motif · 78171407–78171420 · motif
· motif · 78171524–78171532 · motif
· motif · 78171524–78171539 · motif
· motif · 78171672–78171684 · motif
· motif · 78171674–78171687 · motif
· motif · 78171806–78171813 · motif
· motif · 78171877–78171890 · motif
· motif · 78171938–78171955 · motif
· motif · 78172338–78172350 · motif
· motif · 78172407–78172423 · motif
· motif · 78172501–78172512 · motif
· motif · 78172501–78172512 · motif
· motif · 78172501–78172514 · motif
· motif · 78172561–78172574 · motif
· motif · 78172707–78172727 · motif
· motif · 78173089–78173102 · motif
· motif · 78173089–78173102 · motif
· motif · 78173169–78173181 · motif
· motif · 78173171–78173178 · motif
· motif · 78173171–78173184 · motif
· motif · 78173171–78173184 · motif
· motif · 78173221–78173234 · motif
· motif · 78173361–78173374 · motif
· motif · 78173504–78173511 · motif
SFTS phlebovirus 感染時，synaptogyrin 2 的蛋白質量上調；此調控描述限於蛋白質層級。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：224 aa
synaptogyrin 2 長 224 個胺基酸，具有四個螺旋跨膜區段，分別位於第 26–46、73–93、105–125 與 147–167 個胺基酸位置。MARVEL 結構域位於第 20–171 個胺基酸。此蛋白屬於 synaptogyrin 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
synaptogyrin 2 位於細胞質囊泡膜，包括分泌囊泡與突觸囊泡膜，也見於與回收型胞內體相關的細胞質囊泡。 SFTS phlebovirus 感染時，蛋白質定位於脂滴及包涵體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Lipid droplet。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SCARA3Q6AZY7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SFTS phlebovirus 感染期間，synaptogyrin 2 與病毒蛋白 NSs 互作；來源另指出它可能參與病毒複製，但未將此功能關係等同於直接的複製機制。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | synaptogyrin 2 可能參與受調控的胞吐作用。在神經細胞中，它會調節 synaptophysin（SYP）於類突觸微囊泡中的定位，因此可能參與這些囊泡的形成或成熟；此外，也可能與 GLUT4 的儲存及運送至質膜有關。 | 推論支持 | 證據與來源May play a role in regulated exocytosis. In neuronal cells, modulates the localization of synaptophysin/SYP into synaptic-like microvesicles and may therefore play a role in the formation and/or the maturation of this vesicles. May also play a role in GLUT4 storage and transport to the plasma membrane |
| 功能 | 在 SFTS phlebovirus 感染情境中，synaptogyrin 2 可能參與細胞質包涵體的組裝；這些包涵體為病毒複製所需。來源以可能參與描述此作用，未表示該蛋白單獨足以促成複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) May play a role in the assembly of cytoplasmic inclusion bodies required for SFTS phlebovirus replication PMID 27226560 ↗ |
| 交互作用 | SFTS phlebovirus 感染期間，synaptogyrin 2 與病毒蛋白 NSs 互作；來源並指出 synaptogyrin 2 可能參與病毒複製，但未提供更具體的機制描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with SFTS phlebovirus protein NSs; may be involved in virus replication PMID 27226560 ↗ |
| 細胞定位 | synaptogyrin 2 是多次跨膜膜蛋白，定位於細胞質囊泡膜，也見於分泌囊泡膜及突觸囊泡膜；此外，它位於與回收型胞內體相關的細胞質囊泡。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Localizes to cytoplasmic vesicles associated with the recycling endosomes |
| 細胞定位 | synaptogyrin 2 可定位於脂滴；在 SFTS phlebovirus 感染時，該蛋白定位於脂滴及包涵體。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Lipid droplet; (Microbial infection) Upon SFTS phlebovirus infection, the protein localizes in lipid droplets and inclusion bodies |
| 調控 | SFTS phlebovirus 感染時，synaptogyrin 2 的表現上調；此變化記載於蛋白質層級。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Up-regulated upon SFTS phlebovirus infection (at protein level) PMID 27226560 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGTTCCGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGACGGCGACATGG40AGAGCGGGGCCTACGGCGCGGCCAAGGCGGGCGGCTCCTT80CGACCTGCGGCGCTTCCTGACGCAGCCGCAGGTGGTGGCG120CGCGCCGTGTGCTTGGTCTTCGCCTTGATCGTGTTCTCCT160GCATCTATGGTGAGGGCTACAGCAATGCCCACGAGTCTAA200GCAGATGTACTGCGTGTTCAACCGCAACGAGGATGCCTGC240CGCTATGGCAGTGCCATCGGGGTGCTGGCCTTCCTGGCCT280CGGCCTTCTTCTTGGTGGTCGACGCGTATTTCCCCCAGAT320CAGCAACGCCACTGACCGCAAGTACCTGGTCATTGGTGAC360CTGCTCTTCTCAGCTCTCTGGACCTTCCTGTGGTTTGTTG400GTTTCTGCTTCCTCACCAACCAGTGGGCAGTCACCAACCC440GAAGGACGTGCTGGTGGGGGCCGACTCTGTGAGGGCAGCC480ATCACCTTCAGCTTCTTTTCCATCTTCTCCTGGGGTGTGC520TGGCCTCCCTGGCCTACCAGCGCTACAAGGCTGGCGTGGA560CGACTTCATCCAGAATTACGTTGACCCCACTCCGGACCCC600AACACTGCCTACGCCTCCTACCCAGGTGCATCTGTGGACA640ACTACCAACAGCCACCCTTCACCCAGAACGCGGAGACCAC680CGAGGGCTACCAGCCGCCCCCTGTGTACTGAGCGGCGGTT720AGCGTGGGAAGGGGGACAGAGAGGGCCCTCCCCTCTGCCC760TGGACTTTCCCATGAGCCTCCTGGAACTGCCAGCCCCTCT800CTTTCACCTGTTCCATCCTGTGCAGCTGACACACAGCTAA840GGAGCCTCATAGCCTGGCGGGGGCTGGCAGAGCCACACCC880CAAGTGCCTGTGCCCAGAGGGCTTCAGTCAGCCGCTCACT920CCTCCAGGGCACTTTTAGGAAAGGGTTTTTAGCTAGTGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。