演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SYN3

synapsin III

SYN3 編碼 synapsin III,屬於 synapsin family;可能參與神經傳導物質釋放的調節與突觸生成。

Homo sapiens22q12.3UniProt O14994
OFFICIAL SYMBOL
SYN3
CHROMOSOME
22
UNIPROT
O14994
PDB / ALPHAFOLD
2P0A
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SYN3 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 synapsin III,產物 Synapsin-3 長 580 個胺基酸,屬於 synapsin family。其蛋白質由多個區域組成,包括 N 端的 A 區與 B 區、中段的 C 區,以及較後段的富含脯胺酸連接區 J 和末端 E 區;部分區域被註記為無序區。這些序列區域構成 Synapsin-3 的基本結構輪廓,C 區則帶有與 actin 和突觸囊泡結合相關的註記。

Official symbol
SYN3
Gene name
synapsin III
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11496
UniProt
O14994
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q12.3
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegSYN3pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:32,507,820–33,058,388
Gene span
550,569 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358763 ★32,507,820–33,058,38114
ENST0000113270232,507,820–33,058,38814
ENST0000044182132,980,645–33,057,8583
ENST0000041257532,980,673–33,014,5293

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Synapsin III 可能參與神經傳導物質釋放的調節,也可能參與突觸生成。來源以「可能」描述這些作用,未進一步說明其調節方向、分子步驟或作用條件,因此目前只能將其視為可能涉及的生物學角色,不能據此判定它如何改變釋放量或突觸形成過程。

在神經傳導物質釋放方面,Synapsin III 被指可能參與調節;但現有資料沒有指出這種調節是促進或抑制,也沒有提供特定刺激、細胞或實驗系統的資訊。因此,這項功能應保留為概括性的可能關聯,而非已確立的作用機制。

在突觸生成方面,資料同樣僅指出 Synapsin III 可能參與此過程,未描述其影響突觸形成的具體方式,也未說明與神經傳導物質釋放調節之間的關係。這些資訊支持將它列為可能涉及突觸生成與神經傳遞相關過程的蛋白質,但不足以推導更細節的功能或因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 33058381 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SYN3 ENST00000358763 GRCh38 chr22:33058281-33059381 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCTGGCTGTAACCCACTCTCCCCTTGCTCACCTCACTCAGCCACCCTGGGGGCCAGTTCCAGCTTCAGA
ACCATGCATCGGCCGACCCCTCTGTCAGCAATGCTCTTGCTTCAGCCCTGGAATCGTTTTTGTCCTCCAA
GTATCCAATATCACAAGCGGCCCGGAGACCACCCTAGGTATAGCAGTCCTAGACCCCTTTCTTTTTCTTT
TCTTTTTTTTGGAGACGGCATCTAGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCTAACTCGGCTTACT
GTAACTTCCACCTCCCGGGTCCAAGCAATTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGTGAGGG
CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTATCATCTTGGCCAGGCTGGTCTT
GAACTCCCGACCTCGTGATTCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACAGG
CACCCAGCCGACATTCTCTTGTTTTTTTCGTTTGTTGTATATAACCTACCCCCACCTCCACCCCATGCAA
AGTCCACGAGGACGATAGACTTTGTCTTGTTCCCTGTTGCATCCTGGCCCTAGGGCCTAGCCCACAACCT
GGGACATTTCCTGACAAGGGGCCCTGGTTTCTCTGAGGTGCCACCTGAGGTCCGGGAGGTCAGCTGACTT
TCCCAAAGGTGGATTCCAAGGACACTGCATTCTTCGCACTCCCCGAGGGGCGTCTAGACACTCCTGGGAC
CCAGAATTATTAGCTAACTGGGCTCCTGAGTCCGGTGAGAGCTCAGAGTCTAGAAGCAACTTTCCCTGCC
TGGAGAGGTGAACCCAGCAAGGCGTTGGGGAGAGGCGTGGGCGAGGGAGTGGGCGCGGGTGGGCGGGGCC
GTCCGGGGGCCTCGTTGCCCGAGCCAATGGGGCGCCGCGGCGCGGGGAGGCCGGGCCGCCGGGCGGGGGC
GCTCGCGCGCGTTGAGGGGCAGAGGCTGAGCTCCCGGGACCCGGAGCGGATCGACTGGCGGGCGCCGCGC
CGAGGCACCACCGGGCGCCGAGTTCCTGGCGGCTCGCACGGTAAGCGGCGC
SYN3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SYN3_1 ↗22:33,058,381負股33,058,371–33,058,430

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_59QXBJ · CTCF_binding_site · 33057611–33057632 · regulatory

ENSR22_B8K5P · enhancer · 33057769–33058370 · regulatory

ENSR22_59QXF6 · CTCF_binding_site · 33058175–33058196 · regulatory

ENSR22_9H59K · promoter · 33058371–33058766 · regulatory

ENSR22_59QXG6 · CTCF_binding_site · 33058397–33058418 · regulatory

· motif · 33056155–33056168 · motif

· motif · 33056399–33056412 · motif

· motif · 33057613–33057629 · motif

· motif · 33058177–33058193 · motif

· motif · 33058399–33058415 · motif

· motif · 33058793–33058808 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:580 aa

1 aa580 aa功能區域
依 O14994 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Synapsin-3 長 580 個胺基酸,屬於 synapsin family。其區域包括 A 區(1–28)、B 區連接段(28–90)、C 區(91–399)、富含脯胺酸的 J 區連接段(400–531)及 E 區(532–580);19–56 與 395–567 另標註為無序區。C 區具有 actin 結合及突觸囊泡結合註記。

功能區域A1–28 aa
功能區域Disordered19–56 aa
功能區域B; linker28–90 aa
功能區域C; actin-binding and synaptic-vesicle binding91–399 aa
功能區域Disordered395–567 aa
功能區域J; Pro-rich linker400–531 aa
功能區域E532–580 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2P0A…

PDB · 2P0A

X-ray · 1.90 A · A/B=76-417

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane

Synapsin III 被註記為位於細胞質囊泡與分泌囊泡,並可作為突觸囊泡膜的周邊膜蛋白,定位於囊泡的細胞質表面。 資料未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SYN3SYN3SYN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Synapsin III 與 CAPON 有交互作用註記;資料未進一步說明這是何種結合形式、是否屬於特定複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Synapsin III 可能參與神經傳導物質釋放的調節及突觸生成。資料未說明其作用方向、具體機制或發生條件,因此這些功能仍應視為可能涉及的角色。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in the regulation of neurotransmitter release and synaptogenesis

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Synapsin III 與 CAPON 有交互作用,但資料未指出交互作用的具體形式、發生條件或功能意義。推論支持
證據與來源

Interacts with CAPON

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Synapsin III 位於細胞質囊泡及分泌囊泡,並作為周邊膜蛋白定位於突觸囊泡膜的細胞質側,也就是囊泡的細胞質表面。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Peripheral membrane protein localized to the cytoplasmic surface of synaptic vesicles

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358763 · 7,867 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGGCTGAGCTCCCGGGACCCGGAGCGGATCGACTGGCG40
41GGCGCCGCGCCGAGGCACCACCGGGCGCCGAGTTCCTGGC80
81GGCTCGCACGCAGGTAAATAAAGGCAGCTAAAGCTGACTG120
121CTGGTTGCGCAAAATCCCCCTGGCTCTTCTGGCTAAAGTC160
161CTACCACTCCCTGTACCTGGCAGCAGCCTGTCTTCTGGGC200
201CTCACCTACACACGTCTGGGTAGGAGCCAGTCATCTCCAT240
241CCATCCACAGCCATGAATTTCCTCCGGCGACGTCTCTCTG280
281ACAGCAGCTTCATGGCCAACCTGCCTAATGGCTATATGAC320
321GGACCTGCAACGCCCAGATAGCTCCACCAGCTCACCTGCT360
361TCCCCCGCCATGGAGAGGAGGCACCCCCAGCCCCTGGCTG400
401CCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCCAGCCTTTTTAGCTCCCT440
441CTCCAGTGCCATGAAGCAGGCCCCTCAGGCCACCTCAGGA480
481CTGATGGAGCCTCCAGGTCCCTCCACGCCCATTGTTCAAA520
521GACCCAGGATCCTGTTGGTGATCGATGATGCCCATACAGA560
561CTGGTCGAAGTATTTCCATGGGAAGAAGGTGAATGGAGAG600
601ATTGAGATCCGAGTGGAGCAGGCTGAATTCTCAGAGTTGA640
641ACCTAGCTGCCTATGTGACCGGGGGCTGCATGGTGGACAT680
681GCAGGTCGTGAGAAATGGGACCAAAGTGGTGAGCAGATCC720
721TTCAAGCCAGACTTCATCCTGGTCCGCCAGCATGCCTACA760
761GCATGGCCCTGGGGGAAGACTACCGCAGCCTGGTCATCGG800
801CCTGCAGTATGGAGGGCTGCCTGCTGTCAACTCTCTCTAC840
841TCCGTCTACAACTTCTGCAGCAAGCCCTGGGTGTTCTCTC880
881AGCTCATTAAGATCTTCCATTCCCTGGGTCCTGAGAAGTT920
921CCCGCTTGTGGAGCAAACATTTTTCCCCAACCATAAGCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。