演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SYN2SYNII

synapsin II

SYN2 編碼神經元磷蛋白 synapsin II,與突觸囊泡及細胞骨架相關,並被認為參與神經傳遞物質釋放的調節。

Homo sapiens3p25.2UniProt Q92777
OFFICIAL SYMBOL
SYN2
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q92777
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SYN2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 synapsin II。其產物是神經元磷蛋白,屬於 synapsin 家族;來源描述它與突觸囊泡及細胞骨架有關。關於其可能參與的神經傳遞功能,現有資料指出的是推定角色,詳情見功能說明。

Official symbol
SYN2
Gene name
synapsin II
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11495
UniProt
Q92777
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SYNIISYNIIaSYNIIb

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p25.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegSYN2pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:12,004,325–12,192,032
Gene span
187,708 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000621198 ★12,004,388–12,192,03213
ENST0000062017512,004,325–12,185,72811
ENST0000112568912,004,325–12,185,72810
ENST0000114048612,004,325–12,192,03213

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

synapsin II 是神經元磷蛋白,會附著於突觸囊泡,並與細胞骨架結合。來源將這些特性與神經傳遞物質釋放的調節連結,但明確指出其調節角色仍屬相信或推定,不能據此視為已確立的作用機制。

此外,資料指出 synapsin II 可能參與交感神經元的 noradrenaline 分泌;這項描述標示為依相似性推定,因此應理解為可能的功能,而非已證實的特定分泌作用。現有來源未提供更細節的分子步驟或其他生物學過程,故其功能說明限於突觸囊泡、細胞骨架、神經傳遞物質釋放調節,以及交感神經元 noradrenaline 分泌的可能關聯。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 12004388 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SYN2 ENST00000621198 GRCh38 chr3:12003388-12004488 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGAAATGTCTTCACAGAGGTCAAGGCAACGAATAAAATGGAAAAAACAAGTAGAAAGATCTTGAAGAGA
TGTCCTTCTTGGTATAGCACTGGATGCATCAATGCATGCTAGGAAAGAAACACGGTGGGGTTGGGGGATC
CTTAGATATCCCTCTTGGGGTGGAGACCATGTCTCCAGTCTTCTCTTGGTTTTCTCTCACTGGTCAGTGA
GGAGGGGGAGAGAAGTACATACTGTTGTTGTCCCTAGAAGTGCAGGAGTGAAAACACACCCCACCCCTCC
TTCCATGACAGAGTAGAGAGGATCTGTTTCTCCCCTTTCCTCTCCCTCGCCTTGGAGTAAGGAGGCTGCC
TTCCTCCCTAGAAGAGGTATTTCTTTTTTGTCTCACCATAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTAACAGCGGATTATTCCCTTCCC
CCTCTTCTGGGGGCTGGGGAGATGACATCTTTCTCCCCAGCGTTGGGAAAGGAGGTGGTTCTTTTCCTCC
TCACTACAGGGTGTTCGTGCTTGTGTGCGTGTGTGCGCGCGTGATTGGGATGACTCCTTTCGTTCTCACC
TCCGCATAGGGAGGCTGACACCTCTTATCCTTCCAAAAGGAGTGGGGTCGGTTTCCTTCGCCTCCATTTC
AGCTGGGACACGGCTCTTTTTCTCTCCAACCAAAAAGATGGTGGGGCCTCTGGTTCCTTTTCCTTCCCCT
GGGGAGAAGGCCTGGCTCCCACGCCCTCCCCGCATAGTCACGCTCAGGTTGCTGGAGGCCTGGGTCGCCC
CCTCCTGCAAGCCCCGAGAGTCGCCAGACGCGCGGCTAGGTGCCCTCCGTGAGCGGGGCGGGGCCGCCTC
TGCGGCGCGGGGCGGGGGCTATCTCTGGCCCCGCCCCTGCCCCGCCCGCTCCCTCTCCGCGAGCCTCGCG
CCGCGCGGGTTGCCTGGCCCAGACCGCCGCTGCTGTCTGCGGGGTCTGGTGCCGGGGCCTGAGTCTCTGC
TGGCTAAGCCGCCGCCTCAGCCGCCTCAGTCGCCTCAATCTCGCCTTCCGC
SYN2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SYN2_1 ↗3:12,004,388正股12,004,339–12,004,398

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_B4DBP · promoter · 12003898–12004416 · regulatory

ENSR3_54S8C5 · CTCF_binding_site · 12004219–12004240 · regulatory

· motif · 12004221–12004237 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:582 aa

1 aa582 aa功能區域
依 Q92777 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

synapsin II 屬於 synapsin 家族,長度為 582 個胺基酸。其區域包括 C 區(胺基酸 113–420),標註具有 actin 結合與突觸囊泡結合功能;另有 B 區 linker、富含 Pro 的 G 區 linker,以及富含 Pro/Ser 的 H 區 linker。胺基酸 16–84 與 420–545 被註記為無序區。

功能區域A1–29 aa
功能區域Disordered16–84 aa
功能區域B; linker33–112 aa
功能區域C; actin-binding and synaptic-vesicle binding113–420 aa
功能區域Disordered420–545 aa
功能區域G; Pro-rich linker421–457 aa
功能區域H; Pro/Ser-rich linker458–533 aa
功能區域E534–582 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q92777…

AlphaFold · Q92777

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Synapse

synapsin II 的定位資料記載為突觸;來源未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。

未繪示構造:Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SYNIISYN2SYN3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

synapsin II 可與 SYN1 形成寡聚體,並與 CAPON 互作。來源未進一步說明 synapsin II 與 CAPON 互作的形式或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SYN2 所代表基因的變異可能與 schizophrenia 的疾病易感性相關。資料將此描述為易感性關聯,並未指出變異必然導致疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能synapsin II 是神經元磷蛋白,會附著於突觸囊泡並結合細胞骨架;它被認為可能參與神經傳遞物質釋放的調節。依相似性推定,它也可能參與交感神經元的 noradrenaline 分泌。推論支持
證據與來源

Neuronal phosphoprotein that coats synaptic vesicles, binds to the cytoskeleton, and is believed to function in the regulation of neurotransmitter release. May play a role in noradrenaline secretion by sympathetic neurons (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用synapsin II 可與 SYN1 形成寡聚體,並與 CAPON 互作;來源未提供 CAPON 互作的形式或功能後果。含實驗來源
證據與來源

Can form oligomers with SYN1. Interacts with CAPON

PMID 23406870 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Synapse資料庫紀錄
證據與來源

Synapse

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Schizophrenia 是複雜且多因子的精神病性疾病或疾病群,可能涉及思考內容與形式、情緒、自我感、與外界的關係及行為等方面的改變,也可能伴有輕微認知功能受損;部分患者同時有 schizophrenia 與 bipolar disorder 症狀,可能被診斷為 schizoaffective disorder。SYN2 所代表基因的變異可能與疾病易感性相關,但此為關聯描述,並不表示變異必然造成疾病。含實驗來源
證據與來源

Schizophrenia SCZD A complex, multifactorial psychotic disorder or group of disorders characterized by disturbances in the form and content of thought (e.g. delusions, hallucinations), in mood (e.g. inappropriate affect), in sense of self and relationship to the external world (e.g. loss of ego boundaries, withdrawal), and in behavior (e.g bizarre or apparently purposeless behavior). Although it affects emotions, it is distinguished from mood disorders in which such disturbances are primary. Similarly, there may be mild impairment of cognitive function, and it is distinguished from the dementias in which disturbed cognitive function is considered primary. Some patients manifest schizophrenic as well as bipolar disorder symptoms and are often given the diagnosis of schizoaffective disorder. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 181500

PMID 15449241 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000621198 · 3,320 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACCGCCGCTGCTGTCTGCGGGGTCTGGTGCCGGGGCCT40
41GAGTCTCTGCTGGCTAAGCCGCCGCCTCAGCCGCCTCAGT80
81CGCCTCAATCTCGCCTTCCGCCCTCGCTCTCCCTCCGCGC120
121CACCAGACCCCGTAGCCCCGCGCGCCCCCAGCCCTTTAAG160
161CCAGATGATGAACTTCCTGCGGCGCCGGCTGTCGGACAGC200
201AGCTTCATCGCCAACCTGCCCAACGGCTACATGACCGACC240
241TGCAGCGGCCCGAGCCCCAGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCC280
281CCCCGGTCCGGGCGCCGCCTCGGCCTCGGCGGCGCCCCCG320
321ACCGCCTCGCCGGGCCCGGAGCGGAGGCCGCCGCCCGCCT360
361CGGCGCCCGCGCCGCAGCCCGCGCCGACGCCGTCGGTGGG400
401CAGCAGCTTCTTCAGCTCGCTGTCCCAAGCCGTGAAGCAG440
441ACGGCCGCCTCGGCTGGCCTGGTGGACGCGCCCGCTCCCG480
481CGCCCGCAGCCGCCAGGAAGGCCAAGGTGCTGCTGGTGGT520
521CGACGAGCCGCACGCCGACTGGGCCAAGTGCTTTCGGGGC560
561AAAAAAGTCCTTGGAGATTATGATATCAAGGTGGAACAGG600
601CAGAATTTTCAGAGCTCAACCTGGTGGCCCATGCAGATGG640
641CACCTATGCTGTGGATATGCAGGTTCTCCGGAATGGCACA680
681AAGGTTGTCCGGTCCTTCCGGCCAGACTTCGTGCTCATCC720
721GGCAGCATGCATTTGGCATGGCGGAGAATGAGGACTTCCG760
761CCACCTGATCATTGGTATGCAGTATGCAGGCCTCCCCAGC800
801ATCAACTCACTGGAATCCATATACAACTTCTGTGACAAGC840
841CATGGGTGTTTGCCCAGCTGGTCGCTATCTATAAGACACT880
881GGGAGGAGAAAAGTTCCCTCTCATTGAACAGACATACTAC920
921CCCAACCACAAAGAGATGCTGACACTGCCCACGTTCCCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。