基因總覽
SURF6（surfeit 6）是人類的蛋白質編碼基因，所屬蛋白質家族為 SURF6 family。其蛋白質產物被描述為可能在核仁中作為常存蛋白，參與核糖體生合成或組裝；這項功能描述標示為基於相似性推定，並非此處來源直接證實的作用。來源另指出，SURF6 蛋白在體外可結合 DNA 和 RNA，對 RNA 的結合能力較強。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372022 ★ | 133,328,776–133,336,188 | 5 |
| ENST00000929310 | 133,328,684–133,336,207 | 5 |
| ENST00001137282 | 133,328,684–133,336,207 | 5 |
| ENST00001064505 | 133,330,714–133,336,207 | 4 |
| ENST00000929311 | 133,331,010–133,336,207 | 5 |
| ENST00001009263 | 133,331,015–133,336,207 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SURF6 蛋白在體外能與 DNA 和 RNA 結合，且對 RNA 的結合能力較強。這項觀察描述的是體外核酸結合特性；來源未提供結合位置、分子機制或細胞內核酸結合結果，因此不能據此推定其在細胞中的具體作用方式。
來源也提出，SURF6 可能是核仁中的常存蛋白，參與核糖體生合成或組裝。這項描述註明為基於相似性推定，表示其功能屬於推測性註解；資料未進一步說明它參與核糖體形成的哪個步驟，也未提供可確立此作用的實驗條件或結果。因而目前可支持的功能範圍，限於可能涉及核糖體生合成或組裝，不能延伸為已確立的細胞內機制。
Promoter 與基因調控
>SURF6 ENST00000372022 GRCh38 chr9:133336088-133337188 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCCTCAGGCCATGACCTCTCTTTTCTCCTGCCCCTAGTGAGTTATTATAAAGACCACATCTTGTGTTAA AAATCGCAGTGTGGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGCAATCCCAGCACTATGGGAGGCGGAGGTGGGC GGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATA CAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTACACGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATT GCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGA GGGAGACTCCGTCACCGGGGTGGGGGAGGGAATCGTAGTGTGTAATTCTATTTTTCAGAGCAAAAGCCAC TGCCCAGGGGGTCTTCCTTGAACATGCAGGCTCCCTCCCGCCCAACACTTCTCCCTTTTCCCCTGGGCTT TCTTTGGCGCTCCCCTCACCTGACAGTCACACGCTTGCCAGGTTTATCAGTCACCTCTACGGCAGACACT CGCCGAGAACACATCTGTGTGTGTGACACACTGCTTGTGTCCCCTAGGACTGAACCTAGGGCCTGCCACG TGCCAGGCGCTCAGTCTGTGTCCGCCTGAGACCTGAGGCCCCCCACTCCAAAGGACGGAATGAATGTACT GCTGGTCATTCATTCATTTCGCCCCTACTCATGAGCGCCTGCTGTGTCGGGGTTGGGGGTGAGGGGAGCA CAGGAACACGTGCGGGACCGGGGTGATAGAGGCACTGAGGCCAGGCCCCGGGGGTGCCCTGCTGCACCGA CTCCGGGCGGAGATTGGCTGTCCTCGGCCCGCAATGCTGTGCGCCCCGCCCCGCGCGCCGCTTCCGGCGG AGTCAGGCTTGGCTAATCGAGCGCGCGGGCTGGCGGCTCGGCGTTCGTTTGGCCGCGCCTGCCCGTGTGG TGGTTTCCGGCGGAGGTGGTGAGAGTCGCACGCGCAGCGGGGAAGGTGTGAGTCGTGAACGGCCCGGGTC TCCGCCATGGCCTCTCTACTCGCCAAGGACGCCTACCTGCAGAGCCTGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SURF6_1 ↗ | 9:133,336,161 | 負股 | 133,336,151–133,336,210 |
| SURF6_3 ↗ | 9:133,340,432 | 負股 | 133,340,422–133,340,481 |
| SURF6_2 ↗ | 9:133,344,230 | 負股 | 133,344,220–133,344,279 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_93XWX5 · promoter · 133336178–133336678 · regulatory
ENSR9_85WSXM · enhancer · 133340415–133340568 · regulatory
· motif · 133334477–133334488 · motif
· motif · 133335875–133335895 · motif
· motif · 133336039–133336050 · motif
· motif · 133336039–133336050 · motif
· motif · 133336129–133336139 · motif
· motif · 133336154–133336166 · motif
· motif · 133336173–133336184 · motif
· motif · 133336214–133336225 · motif
· motif · 133336214–133336225 · motif
· motif · 133336281–133336290 · motif
· motif · 133336296–133336306 · motif
· motif · 133336405–133336414 · motif
· motif · 133336405–133336414 · motif
· motif · 133336405–133336414 · motif
· motif · 133336405–133336414 · motif
· motif · 133336555–133336564 · motif
· motif · 133336555–133336564 · motif
· motif · 133336555–133336564 · motif
· motif · 133336578–133336591 · motif
· motif · 133336578–133336591 · motif
· motif · 133336666–133336682 · motif
· motif · 133336666–133336682 · motif
· motif · 133336699–133336712 · motif
· motif · 133336724–133336735 · motif
· motif · 133340503–133340516 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：361 aa
SURF6 蛋白長 361 個胺基酸，屬於 SURF6 family。序列註解標示三段預測的無序區：胺基酸 20–106、125–230 與 299–334；另有兩個核定位訊號基序，分別位於 45–49 與 154–158。這些區域屬於序列特徵註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SURF6 蛋白定位於細胞核的核質與核仁，並見於核仁的顆粒組分。 來源未描述定位隨條件變化或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CSNK2A1P68400 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL22P35268 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SURF6 蛋白在體外可結合 DNA 與 RNA，且對 RNA 的結合能力較強。來源並提出，它可能是參與核糖體生合成或組裝的核仁常存蛋白；此功能描述屬於基於相似性的推定。 | 推論支持 | 證據與來源Binds to both DNA and RNA in vitro, with a stronger binding capacity for RNA. May represent a nucleolar constitutive protein involved in ribosomal biosynthesis or assembly (By similarity) |
| 細胞定位 | SURF6 蛋白定位於細胞核的核質與核仁，並位於核仁的顆粒組分。此筆定位資訊未提供特定條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGAGTCGCACGCGCAGCGGGGAAGGTGTGAGTCGTGAAC40GGCCCGGGTCTCCGCCATGGCCTCTCTACTCGCCAAGGAC80GCCTACCTGCAGAGCCTGGCCAAGAAGATCTGCTCCCATT120CGGCCCCGGAACAGCAGGCGCGCACGCGGGCTGGCAAAAC160TCAAGGCTCAGAAACTGCAGGGCCCCCAAAAAAGAAAAGG200AAGAAAACACAAAAGAAATTCCGGAAGCGAGAAGAGAAGG240CTGCTGAGCACAAGGCCAAGTCCTTGGGGGAGAAATCTCC280AGCAGCCTCTGGGGCCAGGAGGCCTGAGGCAGCCAAAGAG320GAAGCAGCTTGGGCTTCCAGCTCAGCAGGGAACCCTGCAG360ATGGCCTGGCCACTGAGCCTGAGTCTGTCTTTGCTCTGGA400TGTTCTGCGACAGCGACTGCATGAGAAGATCCAGGAGGCC440CGGGGCCAGGGCAGTGCCAAGGAGCTGTCCCCTGCCGCCT480TGGAGAAAAGGCGGCGGAGAAAGCAGGAACGGGACCGGAA520GAAGAGGAAGCGAAAGGAGCTGCGGGCGAAAGAGAAGGCC560AGGAAGGCTGAGGAGGCCACGGAGGCCCAGGAGGTGGTGG600AGGCAACCCCAGAGGGGGCCTGCACGGAGCCGCGGGAGCC640GCCCGGGCTGATCTTCAATAAGGTGGAGGTGAGCGAAGAC680GAGCCGGCCAGCAAGGCGCAGCGCAGAAAAGAGAAGAGGC720AGAGGGTGAAGGGGAACCTCACGCCGCTGACCGGGAGGAA760CTACCGGCAGCTGCTGGAGCGCCTGCAGGCACGGCAGAGC800CGGCTGGACGAGCTGCGCGGCCAGGATGAGGGGAAGGCGC840AGGAGCTGGAGGCGAAGATGAAGTGGACCAACCTCCTCTA880CAAGGCGGAGGGCGTGAAGATCCGTGACGACGAACGCCTG920CTGCAGGAGGCCCTGAAGCGCAAGGAGAAGCGCAGGGCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。