基因總覽
SURF2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 surfeit 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q34.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371964 ★ | 133,356,550–133,361,158 | 6 |
| ENST00000875735 | 133,356,520–133,362,917 | 6 |
| ENST00000875736 | 133,356,520–133,362,917 | 5 |
| ENST00000875737 | 133,356,520–133,362,917 | 6 |
| ENST00000875738 | 133,356,520–133,362,917 | 6 |
| ENST00000934434 | 133,356,520–133,361,169 | 6 |
| ENST00000934436 | 133,356,520–133,362,917 | 5 |
| ENST00000934437 | 133,356,520–133,362,917 | 5 |
| ENST00000934438 | 133,356,520–133,362,917 | 7 |
| ENST00001096703 | 133,356,520–133,362,917 | 4 |
| ENST00001135617 | 133,356,520–133,362,917 | 6 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SURF2 ENST00000371964 GRCh38 chr9:133355550-133356650 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTCAAAAAATAAAAAATAAGCAGCTACAGTTACTAAGTAGCTTAGT CAGGCACTAGTGGTTGTTGTGTTATGTAGAAAAATATATCAATTCAGTAATGGCTCACAGAGCTCTCTTA ACAGCTTTCCATTTTTACAACTCATCGTAAATGTAAAGAGGGAAGAATGTACACAGAAAGTGCCTTTAAG CTCTCAGAGGATGAGTTCCATCCGCTGAAAAGCACCAGGGGCCTTGCGGATACTATTTTTTTTTTTTTTT TTATAAAAAGGCAGGCCTGGGGCAGGCTTGCACAGCACTCTACACACGGCAAAACAGCCCTGTGCTGCAC ACTGAGAGGAACACGTAAGCCGCGGTGGTTAGATACGCTTTACTTTCAGAGCCCTGGGCTTTCAGCCTGG GCTGGCCACCCATTAGCTGGATGGGACGTTCGGAAGTAACTCTCGAGCCTTCTCTGTAACAGGGGAACGA CCAAGGAGCTACCTCTCGCGTTGTGAGGACAAAGCGCTCGCTACATGCCCGGCACACGACCACAATTCCA CTGAAAGCATTTTAATACGGAACTTGTCACTCCCAGGGAGCCTCCGCTCAGCCGGCAGTTGGTTCATTTC AATCCCCACGACAACCCTTCAAAGTGCAGGGCAGACAGCAGGTGGCTCTGCCCAGGCGCCTGGATCACAG CCCGGCCTGCAGCCCTCACCTGGGCGCGGGGAGACCCTGAGGACGCTCCTCCAGGCGGCGCTGGCCGGGG CCTGCGGACACGGACGGGCGGGCTGAGCTCCGGGACCCCTCCCCGCGCCCCGCACCCCGCACCCCGCACC CGGCGCTCACCCGTCCCAGCCCCGCCGCCCGCAGCCCCAGCTGCAACGCAGCCACCGCCGCCATCGCACC CGGCCCCGCGGGCGCTTCCGGGACGCAGGAAGCATCTGCATCCGGGGCGCCGCTGAGTCCCGCCCAGAGC CCCGCCCCCGGCTCCAGGTTCTGCGAGCGGCTTCCGCCGGGCTGCTCCGCGGGCGCGTCGGCCATGAGCG AGTTGCCGGGCGACGTGCGGGCGTTTCTGCGGGAGCACCCGAGCCTGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SURF2_1 ↗ | 9:133,356,578 | 正股 | 133,356,529–133,356,588 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_536CTL6 · CTCF_binding_site · 133352163–133352184 · regulatory
ENSR9_536CTMG · CTCF_binding_site · 133352440–133352461 · regulatory
ENSR9_536CW95 · CTCF_binding_site · 133356044–133356065 · regulatory
ENSR9_536CWB9 · CTCF_binding_site · 133356293–133356314 · regulatory
ENSR9_79SPKS · promoter · 133356475–133356560 · regulatory
ENSR9_536CWDS · CTCF_binding_site · 133356843–133356864 · regulatory
ENSR9_93XX77 · enhancer · 133360621–133361027 · regulatory
· motif · 133351946–133351954 · motif
· motif · 133352165–133352181 · motif
· motif · 133352441–133352452 · motif
· motif · 133352442–133352458 · motif
· motif · 133353013–133353030 · motif
· motif · 133353015–133353030 · motif
· motif · 133353022–133353030 · motif
· motif · 133353683–133353696 · motif
· motif · 133356046–133356062 · motif
· motif · 133356123–133356134 · motif
· motif · 133356295–133356311 · motif
· motif · 133356325–133356341 · motif
· motif · 133356445–133356455 · motif
· motif · 133356458–133356471 · motif
· motif · 133356472–133356481 · motif
· motif · 133356472–133356483 · motif
· motif · 133356472–133356483 · motif
· motif · 133356496–133356505 · motif
· motif · 133356530–133356543 · motif
· motif · 133356845–133356861 · motif
· motif · 133356895–133356908 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：256 aa
SURF2（Surfeit locus protein 2）屬於 SURF2 family，蛋白質長 256 個胺基酸。其第 133–256 位胺基酸區段註記為無序區；此區域註解來自 MobiDB-lite。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RPL5P46777 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTGCGAGCGGCTTCCGCCGGGCTGCTCCGCGGGCGCGTCG40GCCATGAGCGAGTTGCCGGGCGACGTGCGGGCGTTTCTGC80GGGAGCACCCGAGCCTGCGGCTCCAGACGGACGCCCGCAA120GGTGAGGTGCATCCTGACAGGTCACGAGCTGCCCTGCCGC160CTGCCGGAGCTCCAGGTCTACACCCGCGGCAAAAAGTACC200AGCGGCTGGTCCGCGCCTCCCCGGCCTTCGACTATGCAGA240GTTCGAGCCGCACATCGTGCCCAGCACCAAGAACCCGCAC280CAGTTGTTCTGCAAACTCACCCTGCGGCACATCAACAAGT320GCCCAGAACACGTGCTGAGGCACACCCAGGGCCGGCGGTA360CCAGCGAGCTCTGTGTAAATATGAAGAATGTCAGAAGCAA400GGGGTGGAGTACGTGCCTGCCTGCCTGGTGCACCGGAGGA440GGAGGAGGGAGGACCAGATGGACGGTGACGGGCCTCGCCC480GCGGGAAGCCTTCTGGGAGCCCACATCCAGTGATGAGGGG520GGAGCTGCAAGTGATGACAGCATGACAGACCTGTACCCAC560CTGAGCTATTCACCAGAAAGGACCTTGGAAGCACGGAGGA600TGGGGATGGCACTGATGACTTTTTGACAGACAAAGAGGAT640GAGAAGGCAAAGCCCCCAAGAGAGAAGGCCACTGATGAGG680GCAGGAGAGAGACGACCGTGTACCGAGGGCTGGTCCAGAA720GCGCGGGAAGAAGCAGTTGGGCTCGTTGAAAAAGAAGTTC760AAGAGTCATCACCGCAAACCCAAGAGCTTCAGCTCCTGTA800AACAGCCAGGTTAATAAAAGCACATGCCGTGAA833cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。