基因總覽
SUN2（Sad1 and UNC84 domain containing 2）是蛋白質編碼基因，產物為單次穿膜蛋白，具有 SUN 結構域。它是 LINC（LInker of Nucleoskeleton and Cytoskeleton）複合體的核心成分；此複合體由核內膜的 SUN domain-containing proteins 與核外膜的 KASH domain-containing nesprins 組成。SUN2 的蛋白質區段分布於核膜兩側，並具有可與 LMNA 結合的區域。這些特性使 SUN2 能參與核膜與細胞骨架之間的連結，也使其成為核膜相關機械力傳遞與細胞核定位研究中的重要分子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000689035 ★ | 38,734,734–38,755,998 | 18 |
| ENST00000870831 | 38,733,280–38,756,050 | 19 |
| ENST00000690927 | 38,733,290–38,755,471 | 18 |
| ENST00000956737 | 38,734,715–38,756,050 | 19 |
| ENST00000870848 | 38,734,716–38,756,050 | 18 |
| ENST00000870833 | 38,734,717–38,756,050 | 18 |
| ENST00000870835 | 38,734,717–38,756,050 | 19 |
| ENST00000870832 | 38,734,720–38,756,050 | 17 |
| ENST00000870839 | 38,734,721–38,756,050 | 19 |
| ENST00000956752 | 38,734,721–38,755,471 | 18 |
| ENST00000870834 | 38,734,722–38,756,050 | 18 |
| ENST00000405510 | 38,734,725–38,755,528 | 19 |
顯示 12/70 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SUN2 是 LINC 複合體的一部分，參與連結核纖層與細胞骨架。LINC 複合體建立的核內與細胞質間連結，有助於機械力穿越核膜傳遞，也與細胞核移動和定位有關。細胞核移動的一種方式中，SUN2 與 SYNE2 組成跨膜的 TAN lines，這些結構連接 F-actin 索，將細胞核耦聯至肌動蛋白向後流動，支持依賴肌動蛋白的核移動。
SUN2 是 interkinetic nuclear migration（INM）所需的成分，也參與大腦皮質神經元放射狀遷移及膠質細胞遷移中的核移動，以及中心體與細胞核的耦聯。在視網膜感光細胞前驅細胞中，核移動也需要 SUN2；此作用涉及與細胞質 dynein-dynactin 和 kinesin 馬達複合體的關聯，並可能涉及 B-type lamins。SUN1 與 SUN2 在這些過程中似乎具有部分或功能上的冗餘性。
在減數分裂期間，SUN1/2:KASH5 LINC 複合體將端粒連接至微管；SUN1 與 SUN2 似乎至少部分冗餘。SUN2 也參與減數分裂前期的染色體移動錨定，並與配子生成所需編碼及非編碼 RNA 的選擇性表現有關。端粒連接核膜及配子生成也需要 SUN2。
此外，SUN2 可能在內吞囊泡上作為 RAB5-GDP 受體，並參與 RAB5 活化。此項作用以「可能」描述，與其核膜相關功能的敘述有所不同。
Promoter 與基因調控
>SUN2 ENST00000689035 GRCh38 chr22:38755898-38756998 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGACTGTTCATCTGCCCTTAGAAGGGCTGGCACAGAAAGAGATTCATCCCAAGCTGTGCACCTGCTCTAT CTGTACAGTTGGCGGATGGGGAGCCAAGGAACAGGACCCCCGGAGTCAGGCAGCATTTTACTCAAACGCT GAGCACTCGTTCCAAGTCTGAGTAAGGTAGAAGAATGAGTGGCCAGCCCTGCCTTCCCACAGCTCAAGTG CAGCAAGCACCGTCCTTAAAACAGAAGAGCTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATACCTGTAATCCTAGTACTT TGGGAAGCCGAGGCGGGAGAATCACTGGAGCTCAGGAGTTCGTGACCAGCCTAGGCAAACATAGTGAGAT CTCGTCTCTATTTAAATAAAATAGAAAATCTGTTTAAAACAAACAAAAAATAGAAGAGCTGTCGTGAAAC TTGGGTGCTCTGGGTAAAGCTTGGGAAGAGGCAGGGCCTCCCAGCATGTCTGGAATCCCCAAATTAGCAA CCTGTTTCCTTGTCTGAAAAATGGGTGTAGAAATGGCCGGCTAAGAGGACAACGGCACTGGTGCCGGGTG TTGAGCAAGCCCTCGACAGCCTCACCGAGAGTGCACCAAGGGCCACCCGCGCGCTGCCGCTCCCAGGGCT CCCACCCTCCCCTCGGACGCCGGCCTGGTGAACCAGGCTGCAGGCGCGCGTGGGAGCGCTCAGAGCTGTC TCAGGTGTTCTGAGCCGCCAGATCGGGAGTCCAGTGCCCTGCTGAGCCCGAGCCCCAGCACAGGCTCCCG TCGCGTCCTCCCGCAGCCCGGGGTCCCCGCCCGCCCAGCGCCTCCCACGCGCGGACTCCTAGGCTGAGCG CGCAGGGCAGCGGGGCCCACGCGAGGGCGGGGCGAGCCGGGGCTTTGTGTTCAAACCGGCCAATGGGTGG CGGCGGTGGGCGGTGACGGCCGGCGGGGCCTGACCAATGGGCTGCGGCCTGTCAGCGTTGACTGACAGGC GCACACATACAGAGTCGGCCACACGCGCGCCGCCCGGCCCCACTCGCGCAGCGCGGGCCTCCGCCGGCCG CATTGTCCGCCCGCCCGCCTTGTCCCGCGTCGCCGCTCTTCGCGTGCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SUN2_2 ↗ | 22:38,754,958 | 負股 | 38,754,948–38,755,007 |
| SUN2_3 ↗ | 22:38,755,446 | 負股 | 38,755,436–38,755,495 |
| SUN2_1 ↗ | 22:38,755,998 | 負股 | 38,755,988–38,756,047 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_B9NMS · enhancer · 38753931–38754686 · regulatory
ENSR22_9KDBR · promoter · 38754687–38755187 · regulatory
ENSR22_B9NN3 · promoter · 38755518–38756489 · regulatory
ENSR22_5C55FC · CTCF_binding_site · 38756083–38756104 · regulatory
ENSR22_749JF9 · enhancer · 38757490–38757606 · regulatory
ENSR22_9KDCW · enhancer · 38758452–38758922 · regulatory
ENSR22_B9NNR · enhancer · 38760874–38761481 · regulatory
· motif · 38751908–38751923 · motif
· motif · 38751950–38751959 · motif
· motif · 38751950–38751961 · motif
· motif · 38751950–38751961 · motif
· motif · 38751950–38751963 · motif
· motif · 38752259–38752268 · motif
· motif · 38752259–38752270 · motif
· motif · 38752259–38752270 · motif
· motif · 38752259–38752272 · motif
· motif · 38752303–38752314 · motif
· motif · 38752489–38752502 · motif
· motif · 38752489–38752502 · motif
· motif · 38753088–38753101 · motif
· motif · 38753088–38753101 · motif
· motif · 38753540–38753551 · motif
· motif · 38753540–38753551 · motif
· motif · 38754109–38754124 · motif
· motif · 38754191–38754206 · motif
· motif · 38754260–38754273 · motif
· motif · 38754549–38754560 · motif
· motif · 38754585–38754600 · motif
· motif · 38754585–38754600 · motif
· motif · 38754603–38754613 · motif
· motif · 38754817–38754827 · motif
· motif · 38754946–38754959 · motif
· motif · 38755012–38755022 · motif
· motif · 38755319–38755329 · motif
· motif · 38755484–38755499 · motif
· motif · 38755484–38755499 · motif
· motif · 38755485–38755499 · motif
· motif · 38755486–38755499 · motif
· motif · 38755529–38755546 · motif
· motif · 38755580–38755595 · motif
· motif · 38755591–38755599 · motif
· motif · 38755678–38755694 · motif
· motif · 38755708–38755715 · motif
· motif · 38755912–38755928 · motif
· motif · 38756085–38756101 · motif
· motif · 38756126–38756136 · motif
· motif · 38756128–38756141 · motif
· motif · 38756176–38756189 · motif
· motif · 38758726–38758739 · motif
· motif · 38758778–38758791 · motif
· motif · 38758778–38758791 · motif
· motif · 38758857–38758870 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：717 aa
SUN2 蛋白質長 717 個胺基酸。其 N 端第 1–212 位位於核側，第 213–233 位為螺旋型跨膜區；第 234–717 位區段位於核周腔。C 端第 555–716 位包含 SUN 結構域。第 1–139 位區域被註記為 LMNA 結合區，第 1–66 位為無序區；第 507–717 位則足以支持與 SYNE1 及 SYNE2 的交互作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SUN2 位於核內膜及核膜，並被註記為單次穿膜的第二型膜蛋白；另有定位記錄顯示其位於胞內體膜。 資料列出這些膜區室，但未指出定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- COPB1P53618 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EMDP50402 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KASH5Q8N6L0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPNA2P52292 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMNAP02545 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NRMQ8IXM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAB5AP20339 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SYNE1Q8NF91 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- SYNE2Q8WXH0 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
- SYNE3Q6ZMZ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SYNE4Q8N205 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- 3aP0DTC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SUN2 是 LINC 複合體核心成分，與 SYNE2 形成 SUN2:SYNE2/KASH2 異源六聚體；其 SUN 結構域形成同源三聚體，是複合體形成的必要條件，三條 SYNE2/KASH2 肽鏈結合於相鄰 SUN 結構域的界面。SUN2 也與 SYNE1、SYNE3 交互作用，可能分別形成 LINC 複合體，並可能參與 SUN2:KASH5 複合體。另有與 A-type lamin、EMD、RAB5A、TMEM43 及 TMEM201 的交互作用記錄；與 lamins B1 和 C 的交互作用則幾乎無法檢出。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SUN2 是 LINC 複合體成分，參與連結核纖層與細胞骨架，並協助機械力跨核膜傳遞及細胞核移動、定位。SUN2 與 SYNE2 可形成 TAN lines，連接 F-actin 索並將細胞核耦聯至肌動蛋白向後流動。SUN2 參與 INM、神經元與膠質細胞遷移，以及視網膜感光細胞前驅細胞的核移動；後者涉及 dynein-dynactin、kinesin，且可能涉及 B-type lamins。減數分裂中，SUN1/2:KASH5 複合體連結端粒與微管；SUN2 也參與染色體移動、端粒核膜附著及配子生成。它可能另在內吞囊泡上受體化 RAB5-GDP 並參與 RAB5 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源As a component of the LINC (LInker of Nucleoskeleton and Cytoskeleton) complex, involved in the connection between the nuclear lamina and the cytoskeleton. The nucleocytoplasmic interactions established by the LINC complex play an important role in the transmission of mechanical forces across the nuclear envelope and in nuclear movement and positioning. Specifically, SYNE2 and SUN2 assemble in arrays of transmembrane actin-associated nuclear (TAN) lines which are bound to F-actin cables and couple the nucleus to retrograde actin flow during actin-dependent nuclear movement. Required for interkinetic nuclear migration (INM) and essential for nucleokinesis and centrosome-nucleus coupling during radial neuronal migration in the cerebral cortex and during glial migration. Required for nuclear migration in retinal photoreceptor progenitors implicating association with cytoplasmic dynein-dynactin and kinesin motor complexes, and probably B-type lamins; SUN1 and SUN2 seem to act redundantly. The SUN1/2:KASH5 LINC complex couples telomeres to microtubules during meiosis; SUN1 and SUN2 seem to act at least partial redundantly. Anchors chromosome movement in the prophase of meiosis and is involved in selective gene expression of coding and non-coding RNAs needed for gametogenesis. Required for telomere attachment to nuclear envelope and gametogenesis. May also function on endocytic vesicles as a receptor for RAB5-GDP and participate in the activation of RAB5 PMID 18396275 ↗ |
| 交互作用 | SUN2 是由核內膜 SUN domain-containing proteins 與核外膜 KASH domain-containing nesprins 組成的 LINC 複合體核心成分；SUN 與 KASH 蛋白可能廣泛互結，但成分表現差異可形成特定組合。至少含 SUN1/2 的核心複合體被提出為六聚體。SUN2 與 SYNE2/KASH2 形成異源六聚體，SUN 結構域同源三聚體是組裝條件；三條 SYNE2/KASH2 肽鏈結合在相鄰 SUN 結構域界面。SUN2 可能與 KASH5 組成複合體，也與 SYNE1、SYNE3 交互作用。另與 A-type lamin、EMD、RAB5A、TMEM43、TMEM201 交互作用；與 lamins B1 和 C 的交互作用幾乎無法檢出。 | 含實驗來源 | 證據與來源Core component of the LINC complex which is composed of inner nuclear membrane SUN domain-containing proteins coupled to outer nuclear membrane KASH domain-containing nesprins. SUN and KASH domain-containing proteins seem to bind each other promiscuously; however, differentially expression of LINC complex constituents is giving rise to specific assemblies. At least SUN1/2-containing core LINC complexes are proposed to be hexameric composed of three protomers of each KASH and SUN domain-containing protein. Interacts with SYNE2; the SUN2:SYNE2/KASH2 LINC complex is a heterohexamer; the homotrimeric cloverleave-like conformation of the SUN domain is a prerequisite for LINC complex formation in which three separate SYNE2/KASH2 peptides bind at the interface of adjacent SUN domains. Component of a probable SUN2:KASH5 LINC complex. Interacts with SYNE1 and SYNE3; probably forming respective LINC complexes. Interacts with A-type lamin. Interaction with lamins B1 and C is hardly detectable (By similarity). Interacts with EMD and RAB5A. Interacts with TMEM43. Interacts with TMEM201 PMID 10818110 ↗ · PMID 17132086 ↗ · PMID 18396275 ↗ · PMID 18845190 ↗ · PMID 21391237 ↗ · PMID 22632968 ↗ · PMID 22945352 ↗ · PMID 35311970 ↗ |
| 細胞定位 | SUN2 被記錄位於核內膜、核膜及胞內體膜，並註記為單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus inner membrane / Single-pass type II membrane protein; Nucleus envelope; Endosome membrane / Single-pass type II membrane protein PMID 15082709 ↗ · PMID 17132086 ↗ · PMID 17724119 ↗ · PMID 10818110 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACACGCGCGCCGCCCGGCCCCACTCGCGCAGCGCGGGCCT40CCGCCGGCCGCATTGTCCGCCCGCCCGCCTTGTCCCGCGT80CGCCGCTCTTCGCGTGCCCGCGCGCCCCGGGCCCGGCCGC120TGTGTCGCCCTGAGCGGAGCGCCGCCCGCGGGATCCCCAC160GCGGAAAGGGGGCGCGCCCCGGCGGCGGCCTGGCCTCGGA200CGCCCCCGGCCGGGCTAGAAGCCGCCGCGGCAGCAGATTC240TCTTCAGGGGAAGAGTCCACATCCCACCTCATCATGTCCC280GAAGAAGCCAGCGCCTCACGCGCTACTCCCAGGGTGACGA320TGACGGCAGCAGCAGCAGCGGAGGGAGCTCGGTGGCTGGG360AGTCAGAGCACCCTGTTTAAAGACAGTCCTCTCAGGACCT400TGAAGAGGAAATCCAGCAACATGAAGCGCCTGTCCCCAGC440GCCACAGCTGGGCCCGTCCTCTGATGCACACACCTCCTAC480TACAGTGAGTCGCTGGTCCACGAGTCCTGGTTCCCACCCA520GGAGCTCCCTGGAGGAACTGCATGGTGACGCCAACTGGGG560TGAGGACCTGCGGGTGCGGAGGAGGAGAGGCACGGGTGGC600TCAGAGAGCAGCAGGGCCAGCGGGCTTGTGGGGCGCAAGG640CCACCGAGGACTTCCTGGGCTCTTCCTCGGGCTACTCCTC680TGAGGACGACTACGTGGGCTACTCGGATGTGGACCAGCAG720AGTTCCAGCTCGCGGCTCCGAAGCGCCGTCTCACGGGCGG760GCTCCTTACTCTGGATGGTGGCCACTTCGCCAGGCCGGCT800CTTCAGACTTCTCTACTGGTGGGCTGGCACCACCTGGTAC840CGCCTGACCACAGCTGCCTCCCTCCTTGACGTCTTCGTTT880TAACCAGGCGCTTCTCGTCCCTGAAGACGTTCCTCTGGTT920CCTGCTGCCGCTGCTCTTGCTGACGTGCCTGACGTATGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。