基因總覽
SUMO2（small ubiquitin like modifier 2）是由蛋白質編碼基因 SUMO2 產生的 ubiquitin-like protein，屬於 ubiquitin family 的 SUMO subfamily。其蛋白質長 95 個胺基酸，具有 ubiquitin-like 結構域。SUMO2 可作為單體，也可形成以 lysine 相連的聚合鏈，並能共價接附於其他蛋白質。這些基本特性使它能作為蛋白質修飾分子；其修飾所涉及的細胞過程與作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000420826 ★ | 75,165,586–75,182,959 | 4 |
| ENST00001102280 | 75,165,586–75,182,991 | 4 |
| ENST00001134817 | 75,165,586–75,182,991 | 4 |
| ENST00000919116 | 75,167,716–75,182,991 | 4 |
| ENST00000919117 | 75,167,730–75,182,991 | 4 |
| ENST00000919118 | 75,167,730–75,182,991 | 5 |
| ENST00001102281 | 75,167,730–75,182,991 | 2 |
| ENST00001102283 | 75,167,730–75,182,991 | 4 |
| ENST00000970835 | 75,167,731–75,182,991 | 4 |
| ENST00001102282 | 75,167,732–75,182,991 | 4 |
| ENST00000897760 | 75,167,733–75,182,991 | 3 |
| ENST00001069754 | 75,167,733–75,182,991 | 3 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SUMO2 透過共價接附到受質蛋白質上，形成一種轉譯後修飾。這種接附可發生於蛋白質的 lysine 殘基，SUMO2 既可單獨接附，也可形成 lysine 相連的聚合鏈。形成共價鍵之前，SUMO2 必須先由 E1 複合體 SAE1-SAE2 活化，再連接至 E2 酵素 UBE2I；PIAS1-4、RANBP2、CBX4 或 ZNF451 等 E3 ligase 則可促進此修飾。
蛋白質上的 SUMO2 修飾參與多種細胞過程，包括核內運輸、DNA 複製與修復、有絲分裂及訊息傳遞。這些過程涉及不同的細胞活動，來源未進一步限定各項作用的具體機制或條件。SUMO2 因而可透過修飾受質蛋白質，參與上述細胞過程的調節。
SUMO2 聚合鏈也可能受到多聚泛素化；這類修飾可作為訊號，使已修飾的蛋白質進入蛋白酶體降解途徑。此外，SUMO2 也參與調節 SETX 的 sumoylation 狀態。來源未說明此調節的方向或更下游的作用結果，因此不宜據此推定其對 SETX 的具體影響。
Promoter 與基因調控
>SUMO2 ENST00000420826 GRCh38 chr17:75182859-75183959 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGTGTATGTTTTAACTGGATGCAACGAGGAAAGGATTAAATTGGCTGGAAGCTTGATTGTTGGGTAGTT CTCGCTTATGGATACTGTTTCCTCTTGGAAGACAGGCGATGAGTAAGGATCTCGTTGAATGAATACATGA ATATTTTCCCGTAGCTAGTCAAAGTCTAGGGTTACCAGCAGGACAGAAGAAGACACTGTAGGCCGGGCGC GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGA GACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACGAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGCGGGTACCTG TAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCTGTGAGC CGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACTGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAGAAGAAGAAG AAGAAGAAGAAGACACTGCATTTTAGGCAAGAGTCCGGTGGGAAGCAGGTTGAGATTGACTGAGAGGAAG TAACCATGGGAGGGCTGCTGGTCCACTGAATGAGAGAGATTTTTCCAGAACCTCATGCTGGGGCTTTGAT TTAGGAATCCCCTTCCTCCTCTAGTAAGTCTGCCTTCCCTGGCCTATGGCTTACGTCTAAAGCCTCGAGC CTCATCGTTCCCACCGAGGACCAGCTGGAAGCCATTTTGATTATGCTCCACCACGAAGGAGGACAATACA GCCCCGCCCAGAGCCAGGCGCGCCCCCGCGGCGGGCCGGGTGCGCGTGTCCGCGCCTCTTCCCGCCGGCC GGGCGGGCGCCTGGCCCAGGACGCGGTGGCGTGGGACGGGGGGTGGGGGTGGTTATGTAAGCGTTGCGCG CTCCCGCGAGGCGCCAGCCAATGGGAGGCTTCGGCTACTCGTGCTCGCGCACGCAGGGTGGGGGGAGGGA GCGCACGACGTGCGCGCACCCTCTCCCCTCGTCCACCGCTGCCGCCTCCTTCTTCTGCCGCTCCTGGTGC TGCTTGTGTGCTCGTTTGGTGCGGACCTGGTACCTCTTTTGTGAAGCGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SUMO2_2 ↗ | 17:75,168,160 | 負股 | 75,168,150–75,168,209 |
| SUMO2_1 ↗ | 17:75,182,959 | 負股 | 75,182,949–75,183,008 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：95 aa
SUMO2 蛋白質長 95 個胺基酸，屬於 ubiquitin family 的 SUMO subfamily。其第 16 至 95 個胺基酸區段註解為 ubiquitin-like 結構域。來源另指出 SUMO2 可形成單體或 lysine 相連的聚合鏈。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SUMO2 的定位註記為細胞核及核內的 PML body。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- BRCA1P38398 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CHD3Q12873 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOMEZQ8IX15-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYBP10242 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PELP1Q8IZL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PIAS4Q8N2W9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SENP1Q9P0U3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SENP2Q9HC62 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SP100P23497-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TANKQ92844 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TDGQ13569 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBE2IP63279 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- USP25Q9UHP3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- USPL1Q5W0Q7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZBTB33Q86T24 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB39O15060 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF496Q96IT1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Rnf4O88846 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- uspl1Q6DRC5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SUMO2 與 SAE2、UBE2I 及 ZNF451 有交互作用；來源並指出，三者可形成包含一個 ZNF451、一個 UBE2I/UBC9 分子及兩條 SUMO2 鏈的複合體。SUMO2 也會共價接附於多種蛋白質，並與 PELP1、USP25、SIMC1、CASP8AP2、RNF111、SOBP、MTA1、HINT1、GCNA 及 TINCR 交互作用。與 GCNA 和 TINCR 的關係分別涉及 GCNA 招募至 DPC 位點及 TINCR 蛋白質穩定性增加；來源另指出 SUMO2 與 USP25 的交互作用會使 USP25 發生 sumoylation。微生物感染情境下，SUMO2 與 Epstein-barr virus BGLF4 交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SUMO2 可作為單體或 lysine 相連的聚合鏈，共價接附至蛋白質；此修飾需經 SAE1-SAE2 活化並連接至 UBE2I，PIAS1-4、RANBP2、CBX4 或 ZNF451 等 E3 ligase 可促進反應。此修飾參與核內運輸、DNA 複製與修復、有絲分裂及訊息傳遞；聚合鏈的多聚泛素化可促使受修飾蛋白質進入蛋白酶體降解，SUMO2 亦參與調節 SETX 的 sumoylation 狀態。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ubiquitin-like protein that can be covalently attached to proteins as a monomer or as a lysine-linked polymer. Covalent attachment via an isopeptide bond to its substrates requires prior activation by the E1 complex SAE1-SAE2 and linkage to the E2 enzyme UBE2I, and can be promoted by an E3 ligase such as PIAS1-4, RANBP2, CBX4 or ZNF451. This post-translational modification on lysine residues of proteins plays a crucial role in a number of cellular processes such as nuclear transport, DNA replication and repair, mitosis and signal transduction. Polymeric SUMO2 chains are also susceptible to polyubiquitination which functions as a signal for proteasomal degradation of modified proteins. Plays a role in the regulation of sumoylation status of SETX PMID 18408734 ↗ · PMID 18538659 ↗ · PMID 21965678 ↗ · PMID 24105744 ↗ · PMID 26524494 ↗ · PMID 9556629 ↗ |
| 交互作用 | SUMO2 與 SAE2、UBE2I、ZNF451 及多種蛋白質交互作用，並可共價接附於蛋白質。含 ZNF451、UBE2I/UBC9 與兩條 SUMO2 鏈的複合體中，一條 SUMO2 鏈結合 UBE2I/UBC9 活性位點，另一條結合其另一區域。SUMO2 亦與 USP25、SIMC1、CASP8AP2、RNF111、SOBP、MTA1、HINT1、GCNA、TINCR 及 PELP1 有關；其中 GCNA 的招募與 DPC 位點相關，TINCR 交互作用可增加其蛋白質穩定性，與 USP25 的交互作用則使 USP25 發生 sumoylation。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with SAE2 and UBE2I. Interacts with ZNF451. Identified in a complex with ZNF451 and UBE2I/UBC9, where one ZNF451 interacts with one UBE2I/UBC9 and two SUMO2 chains, one bound to the UBE2I/UBC9 active site and the other to another region of the same UBE2I/UBC9 molecule. Covalently attached to a number of proteins. Interacts with PELP1. Interacts with USP25; the interaction sumoylates USP25. Interacts with SIMC1, CASP8AP2, RNF111 and SOBP (via SIM domains). Interacts with MTA1. Interacts with HINT1 (By similarity). Interacts with GCNA (via SIM domains); this interaction allows the GCNA recruitment to DPCs sites. Interacts with TINCR (via SUMO-interacting motif); the interaction increases TINCR protein stability PMID 12924945 ↗ · PMID 15479240 ↗ · PMID 16567619 ↗ · PMID 18538659 ↗ · PMID 21965678 ↗ · PMID 23086935 ↗ · PMID 26524494 ↗ · PMID 30914427 ↗ · PMID 36369429 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，SUMO2 與 Epstein-barr virus 的 BGLF4 有交互作用；來源未提供此交互作用的其他條件或功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SUMO2 的定位記錄為細胞核，以及細胞核內的 PML body；來源未提供其他定位條件或動態資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCCCCTCGTCCACCGCTGCCGCCTCCTTCTTCTGCCG40CTCCTGGTGCTGCTTGTGTGCTCGTTTGGTGCGGACCTGG80TACCTCTTTTGTGAAGCGGCAGCTGAGGAGACTCCGGCGC120TCGCCATGGCCGACGAAAAGCCCAAGGAAGGAGTCAAGAC160TGAGAACAACGATCATATTAATTTGAAGGTGGCGGGGCAG200GATGGTTCTGTGGTGCAGTTTAAGATTAAGAGGCATACAC240CACTTAGTAAACTAATGAAAGCCTATTGTGAACGACAGGG280ATTGTCAATGAGGCAGATCAGATTCCGATTTGACGGGCAA320CCAATCAATGAAACAGACACACCTGCACAGTTGGAAATGG360AGGATGAAGATACAATTGATGTGTTCCAACAGCAGACGGG400AGGTGTCTACTGAAAAGGGAACCTGCTTCTTTACTCCAGA440ACTCTGTTCTTTAAAGACCAAGATTACATTCTCAATTAGA480AAACTGCAATTTGGTTCCACCACATCCTGACTACTACCGT520ATAGTTTTCTCTATTCTTTCATTTCCCCCTTCCCCATTCC560TTTATTGTACATAAAGTAACTGGTATATGTGCACAAGCAT600ATTGCATTTTTTTTTTTTTTAACTAAACAGCCAATGGTAT640GTTTTGATTGACATCAAGTGGAGACGGGATGGGGAAAAAT680ACTGATTCTGTGAAAATACCCCCTTTCTCCATTAGTGGCA720TGCTCATTCAGCTCTTATCTTTATATTCCAGTAAGTTATT760TTGCTCTCACTGTTTTAACAAAAAAAAAAAACAACAACAT800AAAAATCCTTGCATACCTTGTTCAATTGGAGAATTTTAAT840GTTTTTCATTTATCATTGTAAAACCAAGGACAATTTTATA880ACTTTTTTGTACGTAGCTGTTACATGTAGGGCAATCTGTC920TTTAAGTAGGGATAAATTACTCTAAAACAAAAAAGAATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。