演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SULT2B1HSST2

sulfotransferase family 2B member 1

SULT2B1 編碼 sulfotransferase family 2B member 1,利用 PAPS 為硫酸基供體,參與膽固醇與類固醇的硫酸化,並與表皮膽固醇代謝及表皮分化調節相關。

Homo sapiens19q13.33UniProt O00204
OFFICIAL SYMBOL
SULT2B1
CHROMOSOME
19
UNIPROT
O00204
PDB / ALPHAFOLD
1Q1Q
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SULT2B1 是蛋白質編碼基因,其產物 sulfotransferase family 2B member 1 屬於 sulfotransferase 1 family。此蛋白質是一種硫酸基轉移酶,參與將硫酸基接合至底物的反應。來源列出的底物包括膽固醇及類固醇 pregnenolone、dehydroepiandrosterone(DHEA);其中一筆資料指出其可硫酸化 pregnenolone,但不硫酸化膽固醇,顯示不同來源對膽固醇底物活性的描述並不一致。蛋白質全長為 365 個胺基酸,C 端第 303 至 365 位被註記為無序區域。

Official symbol
SULT2B1
Gene name
sulfotransferase family 2B member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11459
UniProt
O00204
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HSST2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SULT2B1pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:48,552,140–48,599,425
Gene span
47,286 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000201586 ★48,552,172–48,599,4237
ENST0000114185248,552,172–48,599,4257
ENST0000032309048,575,540–48,599,4256

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SULT2B1 的產物利用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,催化硫酸基接合反應。其底物包括膽固醇以及類固醇 pregnenolone 和 dehydroepiandrosterone(DHEA);對類固醇而言,反應涉及 3β-hydroxyl group。來源描述其偏好膽固醇,同時也對 pregnenolone 與 DHEA 具有顯著活性。

不過,底物範圍的資料並不完全一致:一筆註解記載 SULT2B1 可硫酸化 pregnenolone、但不硫酸化膽固醇;其他資料則指出膽固醇是其優先底物,並列出膽固醇硫酸化反應。因此,膽固醇是否為底物的描述應保留來源間差異,不宜概括成一致結論。

列出的反應包括以 PAPS 為供體,將硫酸基轉移至膽固醇形成 cholesterol sulfate、至 pregnenolone 形成 pregnenolone sulfate,以及至 DHEA 形成 dehydroepiandrosterone 3-sulfate;另有 (24S)-hydroxycholesterol 轉為其 3-sulfate 的反應記錄。這些反應同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+),呈現其硫酸基轉移作用的底物與產物形式。

SULT2B1 也與表皮膽固醇代謝,以及表皮細胞增殖和分化的調節相關。這些資料指出其硫酸化功能與表皮生物學過程相連,但未提供足以將特定反應與增殖或分化結果逐一對應的機制細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 48552172 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SULT2B1 ENST00000201586 GRCh38 chr19:48551172-48552272 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTACCAGATCCTCCACCAGCAGCTGAGAGTGTCTCCCTCAGTCCTCACAACAGCCCGATGGGTGCCATTC
ACAGATGGGGAAACTAAGGCAAGATGAGCCTATGAGCAAGATGGTTCCCGGCCCCACAGCTGGGAGGCAC
TGGAGCTGGGATTTGAACCAGGGCTGTGACCTTCAGACTCTCACGCCCAACCATATCTGGCAGTTGTCTC
TCATATCTGTGTCTCTCCCTGTCCCTGACCTTTCTATGTATCTCTGTCTCTGCCCTCTGTATATCGCTGC
TGGGTCTCTCAGGGTCTCTGACCCCTGTGTGTCTCTGTCTCCTCTGGGTGTCCGTGTGTCTCTGTCTCCG
CCCTCCGTGTATCTCTGTTGCGTCTCTCAAGGTCTCTGGCCCCTGTGCATCTCAGTCCCCTCCTGGTCTC
TGTCTCCCATGCCCTCTGCCCTCTCCCTTTCTCCCTGGCTCCCGCCCTGTCTGTGCTGCCGTGGTCCTGG
CTGTGCCTCTGTCCCTGTGTCTGTTTCCAGGGTGCCCCTTACGCGTCAGCCCGTGAGGGCAAGTTTCTGT
CTGCCCCTTCCCCAGCGGTGGCCTAGTGCTTGGAACAGCGCCTGGCAGACAGGAGATGCTCAGTAAATAT
TTCTCAAATGAATAAAGGAATGAATGAGTGAATGAATGAATGAATGAATGAACTCGCTGAGATGGGCGAG
ATCAGCGCCATTTCCCAAATGAGCAACGTGGGCTCCAGGTGGGTGCCCACAGGCCCAGAACTGCCAGCCC
GGAAGGTTCTGGCGTGGGCTTGGCACTGACCCCCTGGACTCTGCCCCCAGCTGAGCACCAGACGCCAGGA
CGTGCCCATCACTGCTCCTCCCCGCCCTCAGAGCAGGGTGGCTCCCTCTGGCCTCTCCCCGCTGTTGGAG
GCGTGGGTAGCAGCTGGGAGAACCGGCTGGGTGCTGCCCCTCCCCTTGGGCCGGGCACGGAGTAGGCACC
TGGCGGGCTCCCCAGGTGGCAGACGCTGTCGCTGCGCACACCTGGCCTCTGTGCCGCCTGCTCCCTGCTC
GTCCTCCCCTCCCCACCCTCACCCACCTGCCATGGACGGGCCCGCCGAGCC
SULT2B1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SULT2B1_1 ↗19:48,552,172正股48,552,123–48,552,182

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9P9BL · promoter · 48551918–48552182 · regulatory

ENSR19_C6S4B · enhancer · 48553556–48554981 · regulatory

ENSR19_BCM6X · enhancer · 48556017–48556701 · regulatory

· motif · 48553896–48553903 · motif

· motif · 48554435–48554445 · motif

· motif · 48554608–48554618 · motif

· motif · 48554633–48554642 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:365 aa

1 aa365 aa功能區域
依 O00204 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SULT2B1 產物屬於 sulfotransferase 1 family,全長 365 個胺基酸。其第 303 至 365 位胺基酸區段被註記為無序區域;來源未列出其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered303–365 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1Q1Q…

PDB · 1Q1Q

X-ray · 2.91 A · A=24-365

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol;Microsome;Nucleus

SULT2B1 被記錄於細胞質、細胞質溶膠、微粒體及細胞核。 其 Ser-348 的磷酸化是轉移至細胞核所需的條件,顯示核定位與此修飾相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Microsome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HSST2SULT2B1ACYP2DDIT4LFLACC1KLHL8PRICKLE3RELSRP72SULT1A1SULT1B1SULT1C3ZNF497
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SULT2B1 相關變異被記載可導致 autosomal recessive congenital ichthyosis 14(ARCI14),屬於角化異常疾病,伴隨表皮分化與脫屑異常及全身皮膚鱗屑。表現型包括 lamellar ichthyosis 與 non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma,兩者可在同一患者或同一家族不同患者間重疊;來源並未提供特定變異的細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

9 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 9 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SULT2B1 產物以 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)為硫酸基供體,催化硫酸基接合,可作用於膽固醇及類固醇 pregnenolone、dehydroepiandrosterone(DHEA)的 3β-hydroxyl groups。資料指出其偏好膽固醇,但對 pregnenolone 與 DHEA 也有顯著活性;另與表皮膽固醇代謝及表皮增殖、分化調節相關。含實驗來源
證據與來源

Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) as sulfonate donor to catalyze the sulfate conjugation. Responsible for the sulfation of cholesterol. Catalyzes sulfation of the 3beta-hydroxyl groups of steroids, such as, pregnenolone and dehydroepiandrosterone (DHEA). Preferentially sulfonates cholesterol, while it also has significant activity with pregnenolone and DHEA. Plays a role in epidermal cholesterol metabolism and in the regulation of epidermal proliferation and differentiation

PMID 12145317 ↗ · PMID 16855051 ↗ · PMID 19589875 ↗ · PMID 21855633 ↗ · PMID 28575648 ↗ · PMID 9799594 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能此資料指出 SULT2B1 可硫酸化 pregnenolone,但不硫酸化膽固醇。含實驗來源
證據與來源

Sulfonates pregnenolone but not cholesterol

PMID 12145317 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性an alcohol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an alkyl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

an alcohol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an alkyl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12145317 ↗ · PMID 16855051 ↗ · PMID 19589875 ↗ · PMID 21855633 ↗ · PMID 9799594 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3beta-hydroxyandrost-5-en-17-one + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dehydroepiandrosterone 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

3beta-hydroxyandrost-5-en-17-one + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dehydroepiandrosterone 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12145317 ↗ · PMID 16855051 ↗ · PMID 21855633 ↗ · PMID 9799594 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(24S)-hydroxycholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (24S)-hydroxycholesterol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

(24S)-hydroxycholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (24S)-hydroxycholesterol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 19589875 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性cholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = cholesterol sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

cholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = cholesterol sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12145317 ↗ · PMID 12923182 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性pregnenolone + 3'-phosphoadenylyl sulfate = pregnenolone sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

pregnenolone + 3'-phosphoadenylyl sulfate = pregnenolone sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12145317 ↗ · PMID 12923182 ↗ · PMID 21855633 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SULT2B1 被記錄於細胞質、細胞質溶膠、微粒體與細胞核;Ser-348 磷酸化是其轉移至細胞核所需的條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; Microsome; Nucleus; Phosphorylation of Ser-348 is required for translocation to the nucleus

PMID 12923182 ↗ · PMID 16855051 ↗ · PMID 21855633 ↗ · PMID 28575648 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SULT2B1 相關變異被記載可導致 autosomal recessive congenital ichthyosis 14(ARCI14),一種角化異常疾病,會造成表皮分化與脫屑異常及全身皮膚鱗屑。主要表現型為 lamellar ichthyosis 與 non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma,同一患者或同一家族成員間可有表現型重疊。前者常在出生時伴隨類似膠膜的包覆,之後鱗屑遍布全身;後者以紅斑背景上的細白鱗屑為特徵,臀部、頸部與腿部可見較大的棕色鱗屑。含實驗來源
證據與來源

Ichthyosis, congenital, autosomal recessive 14 ARCI14 A form of autosomal recessive congenital ichthyosis, a disorder of keratinization with abnormal differentiation and desquamation of the epidermis, resulting in abnormal skin scaling over the whole body. The main skin phenotypes are lamellar ichthyosis (LI) and non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma (NCIE), although phenotypic overlap within the same patient or among patients from the same family can occur. Lamellar ichthyosis is a condition often associated with an embedment in a collodion-like membrane at birth; skin scales later develop, covering the entire body surface. Non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma characterized by fine whitish scaling on an erythrodermal background; larger brownish scales are present on the buttocks, neck and legs. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617571

PMID 28575648 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 9 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000201586 · 1,196 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGCTGTCGCTGCGCACACCTGGCCTCTGTGCCGCCTG40
41CTCCCTGCTCGTCCTCCCCTCCCCACCCTCACCCACCTGC80
81CATGGACGGGCCCGCCGAGCCCCAGATCCCGGGCTTGTGG120
121GACACCTATGAAGATGACATCTCGGAAATCAGCCAGAAGT160
161TGCCAGGTGAATACTTCCGGTACAAGGGCGTCCCCTTCCC200
201CGTCGGCCTGTACTCGCTCGAGAGCATCAGCTTGGCGGAG240
241AACACCCAAGATGTGCGGGACGACGACATCTTTATCATCA280
281CCTACCCCAAGTCAGGCACGACCTGGATGATCGAGATCAT320
321CTGCTTAATCCTGAAGGAAGGGGATCCATCCTGGATCCGC360
361TCCGTGCCCATCTGGGAGCGGGCACCCTGGTGTGAGACCA400
401TTGTGGGTGCCTTCAGCCTCCCGGACCAGTACAGCCCCCG440
441CCTCATGAGCTCCCATCTTCCCATCCAGATCTTCACCAAG480
481GCCTTCTTCAGCTCCAAGGCCAAGGTGATCTACATGGGCC520
521GCAACCCCCGGGACGTTGTGGTCTCCCTCTATCATTACTC560
561CAAGATCGCCGGGCAGTTAAAGGACCCGGGCACACCCGAC600
601CAGTTCCTGAGGGACTTCCTCAAAGGCGAAGTGCAGTTTG640
641GCTCCTGGTTCGACCACATTAAGGGCTGGCTTCGGATGAA680
681GGGCAAAGACAACTTCCTATTTATCACCTACGAGGAGCTG720
721CAGCAGGACTTACAGGGCTCCGTGGAGCGCATCTGTGGGT760
761TCCTGGGCCGTCCGCTGGGCAAGGAGGCACTGGGCTCCGT800
801CGTGGCACACTCAACCTTCAGCGCCATGAAGGCCAACACC840
841ATGTCCAACTACACGCTGCTGCCTCCCAGCCTGCTGGACC880
881ACCGTCGCGGGGCCTTCCTCCGGAAAGGGGTCTGCGGCGA920
921CTGGAAGAACCACTTCACGGTGGCCCAGAGCGAAGCCTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。